MethodsThe score statisticLet yk an

Methods
The score statistic
Let yk and yl be the phenotypic values of individuals k and
l, respectively, in a pedigree. It is assumed that there is no
locus-specific dominance effect. Then conditional on the
number of alleles shBMC Genetics 2003, 4 http://www.biomedcentral.com/1471-2156/4/s1/S77
Page 2 of 4
(page number not for citation purposes)
Under the null hypothesis, the segregation parameters are
independent of the linkage parameter [1], a property useful
for deriving the score statistic. Let ni be the number of
individuals in pedigree i and be a
vector of phenotypic values in pedigree i whose mean is
denoted by μi. The mean μi may depend on other covariates
in a linear or nonlinear fashion [5]. Define Σi0 =
(Cov(yik,yil)), , and
where and are the vectors of the probabilities
that IBD = 1 and 2, respectively, for all the relative pairs in
pedigree i. The score statistic, denoted by S, is defined as S
= b2/Var(b) if b > 0; S = 0 otherwise, where b = Σi (πi -
E(πi))t(vi - E(vi)) and, for sibship data, Var(b) =
Var(π)ΣiΣk

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

วิธีการสถิติคะแนนให้วายและ yl เป็นค่าไทป์ของบุคคล k และl ตามลำดับ ในสายเลือด จึงสันนิษฐานว่า มีความไม่ปกครองเฉพาะโลกัสโพลผลการ แล้วแบบมีเงื่อนไขในการจำนวน alleles shBMC พันธุศาสตร์ 2003, 4 http://www.biomedcentral.com/1471-2156/4/s1/S77หน้า 2 ของ 4(หมายเลขหน้าไม่สำหรับวัตถุประสงค์ในการอ้างอิง)ภายใต้สมมติฐานว่าง การแบ่งแยกเป็นอิสระของการเชื่อมโยงพารามิเตอร์ [1], คุณสมบัติที่มีประโยชน์สำหรับบริษัทฯ สถิติคะแนน Ni เป็นจำนวนให้บุคคลในสายเลือดผมและการเวกเตอร์ของค่าไทป์ในสายเลือดผมหมายถึงอยู่สามารถบุ โดย μi Μi หมายถึงขึ้น covariates อื่น ๆในแบบเชิงเส้น หรือไม่เชิงเส้น [5] กำหนด Σi0 =(Cov(yik,yil)),, และที่และเวกเตอร์ของกิจกรรมที่ที่ IBD = 1 และ 2 ตามลำดับ สำหรับญาติคู่ในเลือดฉัน สถิติคะแนน สามารถบุ โดย S ถูกกำหนดเป็น S= b2/Var(b) ถ้า b > 0 S = 0 หรือที่ b = Σi (πi -T E(πi)) (vi - E(vi)) และ สำหรับ ข้อมูล sibship, Var(b) =ΣiΣk Var (π)วัง [4] สำหรับอภิปรายเพิ่มเติมในการคำนวณของ b และVar(b) สถิติคะแนน S asymptotically กระจายเป็น0.5 Χ0Χ1 2 + 0.52 [1,4] สำหรับข้อมูล sibship, S จะเท่ากับสถิติใน [2] ซึ่งสันนิษฐาน effect.ared ปกครองไม่เหมือนกัน โดยเชื้อสาย (IBD) โดย kl และ t เป็น putative โลกัสโพล เรามี [4]โดยที่ Φkl คือ สัมประสิทธิ์ญาติระหว่างแต่ละ kและ l แต่ละรายการ ผลต่างสามารถเนื่องจากโลกัสโพลt และ 1 {τ = k } เป็นฟังก์ชันบ่งชี้ซึ่งเท่ากับ 1 เมื่อΤ = k และเท่ากับ 0 เป็นอย่างอื่น คือระยะแรก Cov(yk,yl)ทั้งหมดถูกกำหนด โดยพารามิเตอร์การแบ่งแยกหมายถึง ผลต่างสามารถรวม ปกครองรวมผลต่าง ผลต่างของผลกระทบสิ่งแวดล้อม ฯลฯพารามิเตอร์เหล่านี้สามารถประเมินไว้ล่วงหน้าโดยใช้ไทป์ข้อมูลเฉพาะ ขึ้นอยู่กับระยะเวลาที่เหลือเท่านั้นโครงสร้างสายเลือด Φkl และพารามิเตอร์เชื่อมโยง(เช่น,) มีสมมุติฐานที่น่าสนใจ

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

วิธีสถิติคะแนนให้YK ลิตรตามลำดับในสายเลือด มันจะสันนิษฐานว่าไม่มีผลกระทบต่อการปกครองสถานที่เฉพาะ Methods
The score statistic
Let yk and yl be the phenotypic values of individuals k and
l, respectively, in a pedigree. It is assumed that there is no
locus-specific dominance effect. Then conditional on the
number of alleles shBMC Genetics 2003, 4 http://www.biomedcentral.com/1471-2156/4/s1/S77
Page 2 of 4
(page number not for citation purposes)
Under the null hypothesis, the segregation parameters are
independent of the linkage parameter [1], a property useful
for deriving the score statistic. Let ni be the number of
individuals in pedigree i and be a
vector of phenotypic values in pedigree i whose mean is
denoted by μi. The mean μi may depend on other covariates
in a linear or nonlinear fashion [5]. Define Σi0 =
(Cov(yik,yil)), , and
where and are the vectors of the probabilities
that IBD = 1 and 2, respectively, for all the relative pairs in
pedigree i. The score statistic, denoted by S, is defined as S
= b2/Var(b) if b > 0; S = 0 otherwise, where b = Σi (πi -
E(πi))t(vi - E(vi)) and, for sibship data, Var(b) =
Var(π)ΣiΣkWang [4] for more discussion on the calculation of b and
Var(b). The score statistic S is asymptotically distributed as
0.5 χ0
2 + 0.5 χ1
2 [1,4]. For sibship data, S is equivalent to
the statistic in [2] that assumes no dominance effect.ared identical by descent (IBD) by k
and l at a putative locus t, we have [4]
where Φkl is the kinship coefficient between individual k
and individual l, is the additive variance due to locus
t, and 1{τ=k} is the indicator function which equals 1 when
τ = k and equals 0 otherwise. The first term, Cov(yk,yl), is
completely determined by the segregation parameters,
such as means, the total additive variance, the total dominance
variance, the variance of environmental effect, etc.
These parameters can be estimated beforehand using phenotypic
data only. The remaining term depends only on
the pedigree structure through Φkl and the linkage parameter
(i.e., ). The hypotheses of interest are

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

วิธีการให้คะแนนสถิติ

และเป็นค่า YL YK ฟีโนไทป์ของบุคคลและ K
l ตามลำดับ ในสายเลือด เป็นสันนิษฐานว่าไม่มี
ความเชื่อเฉพาะ dominance effect แล้วเงื่อนไข
จำนวนอัลลีล shbmc พันธุศาสตร์ 2003 4 http : / / www.biomedcentral . com / 1471-2156 / 4 / S1 / s77
4
2 หน้า ( เลขหน้าไม่มีการอ้างอิง )
ภายใต้สมมติฐาน nullแยกค่า
อิสระของพารามิเตอร์การเชื่อมโยง [ 1 ] , คุณสมบัติที่มีประโยชน์
สำหรับ deriving คะแนนสถิติ ให้ฉันเป็นหมายเลขของ
บุคคลในสายเลือด และ เป็นเวกเตอร์ของค่าคุณสมบัติในสายเลือด

ผมซึ่งหมายความว่าแทน โดยμ . หมายถึงμผมอาจขึ้นอยู่กับ
ความรู้อื่น ๆ ในเส้นหรือเส้นแฟชั่น [ 5 ] นิยามΣ i =
( COV ( วันนี้ ยิว , ,
) ) และที่และเป็นพาหะของความน่าจะเป็น
ว่า IBD = 1 และ 2 ตามลำดับ สำหรับบรรดาญาติคู่
สายเลือดฉันคะแนนสถิติเขียนแทนด้วย S จะหมายถึง S
= B2 / var ( B ) ถ้า B > 0 ; s = 0 เป็นอย่างอื่นที่ B = Σผม ( πฉัน -
E ( π i ) T ( 6 - E ( VI ) และสำหรับข้อมูล sibship var ( B ) =
var ( π ) ΣผมΣ K < lvar ( wikwil ) เห็นวังและหวง [ 2 ]
วัง [ 4 ] สำหรับการสนทนาเพิ่มเติมเกี่ยวกับการคำนวณและ
Bวาร์ ( B ) คะแนนเป็นสถิติของ asymptotically กระจายเป็น
0
2 χ 0.5 0.5 χ 1
2 [ 1 , 4 ] สำหรับข้อมูล sibship S เทียบเท่ากับสถิติใน
[ 2 ] ที่ถือว่าไม่เด่น effect.ared เหมือนกันโดยโคตร ( IBD ) โดย k
และที่ซึ่งตนไม่ได้ [ 4 ]
ที่Φ KL เป็นเครือญาติระหว่างค่า k ของแต่ละบุคคลและแต่ละ
L , เป็นสารเติมแต่งความแปรปรวนเนื่องจาก -
T ,1 { τ = k } เป็นตัวบ่งชี้ฟังก์ชันซึ่งมีค่าเท่ากับ 1 เมื่อ
τ = K มีค่าเท่ากับ 0 หรือไม่ ในระยะแรก ปก ( YK , YL ) ,
กำหนดอย่างสมบูรณ์โดยการแยกพารามิเตอร์
เช่นค่าเฉลี่ย ความแปรปรวนแบบรวมการปกครอง
รวม ความแปรปรวนของผลกระทบด้านสิ่งแวดล้อม ฯลฯ
พารามิเตอร์เหล่านี้สามารถประมาณไว้ล่วงหน้าโดยใช้ข้อมูลฟีโนไทป์
เท่านั้น ที่เหลือขึ้นอยู่กับ
สายเลือดและโครงสร้างจาก KL Φเชื่อมโยงพารามิเตอร์
( เช่น ) สมมติฐานที่น่าสนใจคือ