Aptamers for whole cell detection a

Aptamers for whole cell detection are selected mostly by the Cell-SELEX procedure. Alternatively, the use of specific cell surface epitopes as target during aptamer selections allows the development of aptamers with ability to bind whole cells. In this study, we integrated a formerly selected Protein A-binding aptamer PA#2/8 in an assay format called ELONA (Enzyme-Linked OligoNucleotide Assay) and evaluated the ability of the aptamer to recognise and bind to Staphylococcus aureus presenting Protein A on the cell surface. The full-length aptamer and one of its truncated variants could be demonstrated to specifically bind to Protein A-expressing intact cells of S. aureus, and thus have the potential to expand the portfolio of aptamers that can act as an analytical agent for the specific recognition and rapid detection of the bacterial pathogen. The functionality of the aptamer was found to be based on a very complex, but also highly variable structure. Two structural key elements were identified. The aptamer sequence contains several G-clusters allowing folding into a G-quadruplex structure with the potential of dimeric and multimeric assembly. An inverted repeat able to form an imperfect stem-loop at the 5′-end also contributes essentially to the aptameric function.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

Aptamers สำหรับการตรวจหาเซลล์ทั้งหมดจะถูกเลือกเป็นส่วนใหญ่ โดยขั้นตอนเซลล์ SELEX อีกวิธีหนึ่งคือ ใช้ epitopes ผิวเฉพาะเซลล์เป้าหมาย aptamer เลือกระหว่างช่วยให้การพัฒนาของ aptamers มีความสามารถในการผูกทั้งเซลล์ ในการศึกษานี้ เรารวมเดิมเลือกโปรตีน A ผูก aptamer PA ที่ #2/8 ในรูปแบบการทดสอบเรียกว่า ELONA (Enzyme-Linked OligoNucleotide Assay) และประเมินความสามารถของ aptamer สังเกต และผูกกับหมอเทศข้างลาย Staphylococcus นำเสนอ A โปรตีนบนผิวเซลล์ Aptamer แบบเต็มตัวและหนึ่งตัวแปรตัดอาจแสดงเฉพาะผูกโปรตีน A แสดงเซลล์เหมือนเดิมของ S. หมอเทศข้างลาย และทำให้ มีศักยภาพในการขยายผลงานของ aptamers ที่สามารถทำหน้าที่เป็นตัวแทนเฉพาะการรับรู้วิเคราะห์ และตรวจพบเชื้อโรคแบคทีเรียอย่างรวดเร็ว การทำงานของ aptamer ที่พบเพื่อเป็นไปตามความซับซ้อนมาก แต่โครงสร้างตัวแปรสูง ระบุองค์ประกอบที่สำคัญสองโครงสร้าง ลำดับ aptamer ประกอบด้วยคลัสเตอร์ต่าง ๆ G ให้พับลงในโครงสร้าง G quadruplex ด้วยศักยภาพของ dimeric และแอสเซมบลี multimeric ซ้ำการคว่ำสามารถฟอร์มไม่สมบูรณ์ลำต้นวงปลาย 5 ′ยังก่อให้เกิดหลักฟังก์ชัน aptameric

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

Aptamers สำหรับการตรวจหาเซลล์ทั้งหมดจะถูกเลือกโดยส่วนใหญ่เป็นเซลล์ SELEX ขั้นตอน อีกวิธีหนึ่งคือการใช้ที่เฉพาะเจาะจง epitopes เซลล์ผิวเป็นเป้าหมายในระหว่างการเลือก aptamer ช่วยให้การพัฒนาของ aptamers ที่มีความสามารถในการผูกทั้งเซลล์ ในการศึกษานี้เราบูรณาการที่เลือกก่อน aptamer โปรตีนที่มีผลผูกพัน PA # 2/8 ในรูปแบบการทดสอบที่เรียกว่า Elona (เอนไซม์ที่เชื่อมโยง oligonucleotide Assay) และประเมินผลความสามารถของ aptamer การรับรู้และผูกกับ Staphylococcus aureus นำเสนอโปรตีนบน เซลล์ผิว aptamer ยาวเต็มรูปแบบและเป็นหนึ่งในสายพันธุ์ที่ถูกตัดทอนมันอาจจะแสดงให้เห็นถึงเฉพาะผูกกับโปรตีนที่แสดงออกเหมือนเดิมเซลล์ของเชื้อ S. aureus และทำให้มีศักยภาพในการขยายผลงานของ aptamers ที่สามารถทำหน้าที่เป็นตัวแทนการวิเคราะห์เฉพาะ การรับรู้และการตรวจสอบอย่างรวดเร็วของการติดเชื้อแบคทีเรีย การทำงานของ aptamer ที่พบจะอยู่บนพื้นฐานที่มีความซับซ้อนมาก แต่ยังตัวแปรโครงสร้าง สององค์ประกอบสำคัญที่มีโครงสร้างที่ถูกระบุ ลำดับ aptamer มีหลายกลุ่ม G-ช่วยให้พับในโครงสร้าง G-quadruplex ที่มีศักยภาพในการชุมนุมและ dimeric multimeric ซ้ำกลับสามารถที่จะสร้างไม่สมบูรณ์ลำต้นวงที่ 5'-end ที่ยังมีส่วนช่วยเป็นหลักในการทำงานที่ aptameric

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

แอปตาเมอร์ การตรวจจับทั้งเซลล์ที่ถูกเลือกโดยเซลล์ซีเล็กซ์ ขั้นตอน อีกวิธีหนึ่งคือ การใช้เซลล์จากพื้นผิวที่เฉพาะเจาะจงเป็นเป้าหมายในการเลือก aptamer ช่วยให้การพัฒนาของแอปตาเมอร์ที่มีความสามารถในการผูกเรื่องเซลล์ ในการศึกษานี้เรารวมเดิมเลือกโปรตีน a-binding aptamer PA # 2 / 8 ในการทดสอบรูปแบบเรียกอีโลน่า ( เอนไซม์เชื่อมโยงซึ่ง assay ) และประเมินความสามารถของ aptamer จักผูกและ Staphylococcus aureus เสนอโปรตีนบนผิวเซลล์ การ aptamer เต็มตัวและหนึ่งในสายพันธุ์ที่สามารถตัดโดยเฉพาะผูกกับโปรตีน a-expressing ของเซลล์ของ S . aureus , และดังนั้นจึงมีศักยภาพที่จะขยายพอร์ตโฟลิโอของแอปตาเมอร์ที่สามารถเป็นตัวแทนเชิงวิเคราะห์สำหรับการรับรู้ที่เฉพาะเจาะจงและการตรวจหาเชื้อโรคแบคทีเรียอย่างรวดเร็ว การทำงานของ aptamer พบจะยึดที่ซับซ้อนมาก แต่ยังมีตัวแปรในเชิงโครงสร้าง สององค์ประกอบหลักของโครงสร้างมีการระบุ . การ aptamer ลำดับมีหลาย g-clusters ให้พับเป็นโครงสร้าง g-quadruplex กับศักยภาพของ multimeric ท้องเฟ้อ และประกอบ กลับย้ำสามารถแบบฟอร์มไม่สมบูรณ์ก้านห่วงที่ 5 ’ - จบยังก่อให้เกิดเป็นหลักกับฟังก์ชัน aptameric .