Breeding value evaluation for UK Li

Breeding value evaluation for UK Limousin beef cattle data was carried out by multiple-trait linear–threshold animal model with variance components assumed to be known. Polychotomous calving ease with five categories was analysed with two continuous traits: birth weight and gestation length. Field data consisted of 220,799 animals with observations with every possible combination of traits, and 270,035 animals in the pedigree. The threshold model was solved either with Newton Raphson or Expectation Maximisation algorithm, and solutions were compared to evaluation by a linear model with original and normalised scores. There were insignificant differences in solutions between the two algorithms for threshold model analyses. Furthermore, solutions of the continuous traits were similar by the threshold and linear models. For the categorical trait, correlations for random effects from the threshold and linear models were high. In case of normalised scores (original scores case in brackets) correlations with solutions from the threshold and linear model were 0.97 (0.94) and 0.97 (0.93) for direct and maternal genetic effects and 0.95 (0.89) for permanent maternal effects. Even so, at least one third of the top 1% ranking of bulls differed between the linear and the threshold models. Predictive abilities as correlations between estimated breeding values and pedigree indices were almost equal between the linear and threshold models for both continuous and categorical traits. In conclusion, despite the higher computational demand, the linear–threshold animal model can be seen worthwhile in the genetic evaluation of the national UK beef cattle data set.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

พันธุ์ประเมินค่าข้อมูลเนื้อวัว UK Limousin ถูกดำเนินการ โดยหลายติดขีดจำกัด – การเชิงเส้นรูปสัตว์ มีส่วนประกอบต่างถือว่าทราบ Polychotomous ง่าย calving มี 5 ประเภทคือ analysed มีลักษณะสองอย่างต่อเนื่อง: เกิดความยาวน้ำหนักและครรภ์ ข้อมูลของเขตข้อมูลประกอบด้วยสัตว์ 220,799 มีข้อสังเกตุกับทุก ๆ ชุดที่เป็นไปได้ของลักษณะ และสัตว์ 270,035 ในเลือด รูปแบบขีดจำกัดถูกแก้ไข ด้วย Raphson นิวตันหรืออัลกอริทึม Maximisation ความคาดหวัง และโซลูชั่นได้เปรียบเทียบการประเมิน โดยแบบจำลองเชิงเส้นกับคะแนนเดิม และ normalised มีความแตกต่างสำคัญในโซลูชั่นระหว่างอัลกอริทึม 2 สำหรับวิเคราะห์รูปแบบขีดจำกัด นอกจากนี้ โซลูชั่นของลักษณะต่อเนื่องได้เหมือนขีดจำกัดและแบบจำลองเชิงเส้น สำหรับติดแน่ชัด ความสัมพันธ์ในลักษณะสุ่มจากขีดจำกัดและรูปแบบเชิงเส้นได้สูง ในกรณี normalised คะแนน (คะแนนกรณีเดิมในวงเล็บ) ด้วยโซลูชั่นจำกัดและแบบจำลองเชิงสัมพันธ์ถูก 0.97 (0.94) และ 0.97 (0.93) ลักษณะทางพันธุกรรมโดยตรง และแม่และ 0.95 (0.89) สำหรับลักษณะพิเศษของแม่ถาวร มาก น้อยหนึ่งในสามของอันดับ 1% สูงสุดของวัวแตกต่างระหว่างแบบเส้นตรงและรูปแบบขีดจำกัด ความสามารถในการคาดการณ์เป็นความสัมพันธ์ระหว่างประเมินราคาค่าปรับปรุงพันธุ์ และสายเลือดดัชนีได้เกือบเท่ากันระหว่างรูปแบบเชิงเส้นและขีดจำกัดในลักษณะต่อเนื่อง และแน่ชัด เบียดเบียน แม้ มีการคำนวณความสูง แบบสัตว์เชิง – ขีดจำกัดสามารถมองเห็นคุ้มค่าในการประเมินพันธุกรรมแห่งชาติ UK วัวเนื้อข้อมูลชุดนั้น

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

การประเมินค่าการผสมพันธุ์สำหรับสหราชอาณาจักรมูข้อมูลการเลี้ยงโคเนื้อได้ดำเนินการโดยหลายลักษณะเชิงเส้นเกณฑ์แบบสัตว์ที่มีองค์ประกอบความแปรปรวนสันนิษฐานว่าเป็นที่รู้จัก ความสะดวกหลุด Polychotomous กับห้าประเภทได้รับการวิเคราะห์ที่มีสองลักษณะต่อเนื่อง: น้ำหนักแรกคลอดและระยะเวลาในการตั้งครรภ์ ข้อมูลภาคสนามประกอบด้วย 220,799 สัตว์ที่มีข้อสังเกตที่มีการรวมที่เป็นไปได้ในลักษณะที่ทุกคนและ 270,035 สัตว์ที่อยู่ในสายเลือด รูปแบบเกณฑ์ได้รับการแก้ไขอย่างใดอย่างหนึ่งกับนิวตันราฟสันหรือความคาดหวังของอัลกอริทึม Maximisation และการแก้ปัญหาที่ถูกเมื่อเทียบกับการประเมินโดยแบบจำลองเชิงเส้นที่มีคะแนนเดิมและปกติ มีความแตกต่างที่ไม่มีนัยสำคัญในการแก้ปัญหาระหว่างสองอัลกอริทึมสำหรับการวิเคราะห์รูปแบบการเกณฑ์ นอกจากนี้การแก้ปัญหาในลักษณะที่มีความคล้ายคลึงกันอย่างต่อเนื่องโดยเกณฑ์และรูปแบบเชิงเส้น สำหรับลักษณะเด็ดขาดสัมพันธ์สำหรับผลการสุ่มจากเกณฑ์และรูปแบบเชิงเส้นสูง ในกรณีของคะแนนปกติ (คะแนนเดิมกรณีในวงเล็บ) ความสัมพันธ์กับการแก้ปัญหาจากเกณฑ์และรูปแบบเชิงเส้นเป็น 0.97 (0.94) และ 0.97 (0.93) สำหรับผลกระทบทางพันธุกรรมโดยตรงและมารดาและ 0.95 (0.89) สำหรับผลกระทบของมารดาถาวร ดังนั้นแม้ไม่น้อยกว่าหนึ่งในสามของการจัดอันดับ 1% ของวัวแตกต่างกันระหว่างเส้นและรูปแบบเกณฑ์ ความสามารถในการคาดการณ์เป็นความสัมพันธ์ระหว่างค่าการผสมพันธุ์ประมาณและดัชนีสายเลือดเท่ากับเกือบระหว่างเส้นและรูปแบบเกณฑ์สำหรับทั้งสองลักษณะต่อเนื่องและเด็ดขาด สรุปได้ว่าแม้จะมีความต้องการการคำนวณที่สูงกว่าเกณฑ์เชิงเส้นสัตว์แบบสามารถมองเห็นได้ที่คุ้มค่าในการประเมินผลทางพันธุกรรมของเนื้อวัวแห่งชาติสหราชอาณาจักรชุดข้อมูล

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

การประเมินคุณค่าการผสมพันธุ์สำหรับ UK ข้อมูลลิมูซีนโคถูกดำเนินการโดยหลายลักษณะและรูปแบบเชิงเส้นขององค์ประกอบความแปรปรวน สัตว์ที่ถือว่าเป็นที่รู้จัก polychotomous คลอดง่ายด้วย 5 ประเภท จำนวนที่มีสองลักษณะที่ต่อเนื่อง : น้ำหนักและความยาวของทารก เขตข้อมูลประกอบด้วย 220799 สัตว์ ด้วยการสังเกตกับทุกชุดได้ในลักษณะ270035 และสัตว์ในสายเลือด ธรณีประตูแบบนิวตันราฟสัน หรือแก้ไขได้ ด้วยการมีจำนวนสูงสุดของความคาดหวัง และโซลูชั่นการเปรียบเทียบกับการประเมินโดยแบบจำลองเชิงเส้นกับต้นฉบับและการให้คะแนน มีความแตกต่างเล็กน้อยในการแก้ปัญหาระหว่างสองขั้นตอนวิธีสำหรับเกณฑ์รูปแบบองค์ประกอบ นอกจากนี้โซลูชั่นของลักษณะที่ต่อเนื่องกัน โดยรุ่นเกณฑ์ และเชิงเส้น สำหรับลักษณะเด็ดขาด , ความสัมพันธ์สำหรับสุ่มผลจากแบบจำลองเกณฑ์และเส้นมีสูง ในกรณีของการให้คะแนน ( กรณีคะแนนเดิมในวงเล็บ ) ความสัมพันธ์กับโซลูชั่นจากเกณฑ์ และแบบเชิงเท่ากับ 0.97 ( 0.94 ) และ 0.97 ( 0.93 ) โดยตรง และผลทางพันธุกรรมของมารดา และ 095 ( 0.89 ) สำหรับผลของมารดา ถาวร แต่อย่างน้อยหนึ่งในสามของ 1% อันดับของวัวที่แตกต่างกันระหว่างแบบเชิงเส้น และเพดานรุ่น ความสามารถในการทำนาย เช่น ความสัมพันธ์ระหว่างค่าการผสมพันธุ์ในสายเลือด ) และดัชนีเกือบเท่ากันระหว่างโมเดลเชิงเส้นและกำหนดคุณลักษณะทั้งต่อเนื่องและเด็ดขาด สรุปแม้จะสูงกว่าการคำนวณความต้องการรูปแบบและเกณฑ์สัตว์เชิงเส้นที่สามารถเห็นได้คุ้มค่าในการประเมินทางพันธุกรรมของโคเนื้อแห่งชาติสหราชอาณาจักรชุดข้อมูล