3. ResultsA total of 762 LAB isolat

3. Results
A total of 762 LAB isolates were recovered and purified from
samples 1 to 9. All isolates were primarily confirmed to belong to the
LAB group as they manifested Gram-positive, no catalase activity, and
positive results for glucose fermentative ability (data not shown). Of
these, only two LAB isolates were recovered from sample 1. One
hundred LAB isolates were recovered each from samples 2 to 8, and 60
LAB isolates were recovered from sample 9 as listed in Table 2.
It was found that the two selected primers were able to amplify the
16S rDNA fragment of each LAB isolate resulting in an amplicon of
approximately 1463 bp in size (data not shown). The two chosen
tetrameric enzymes (either Acc II or Hae III) for restriction digestions
of the amplicons were able to differentiate all 762 LAB isolates into 6
restriction patterns. These patterns, or ARDRA profiles, were assigned
A, B, C, D, E, and F as shown in Fig. 1 and listed in Table 1. Representative
isolates from each profile were analyzed for their 16S rDNA sequences.
Homology searches of the sequences revealed (with 99–100%
homology) that profile A belonged to Lactococcus garvieae, profile B
belonged to Streptococcus bovis, profile C belonged to Weissella cibaria,
profile D belonged to Pediococcus pentosaceus, profile E belonged to
Lactobacillus plantarum, and profile F belonged to Lactobacillus
fermentum. These sequences were deposited into the GenBank
database. Their sequence accession numbers are shown in Table 1.
The frequency of isolation of each species from the 100 isolates taken
at each sample time is listed in Table 2.
Only two isolates of LAB (Lc. garvieae and S. bovis) were recovered
from the raw materials after mixing (sample 1). Subsequently, thirty
seven isolates out of 762 LAB isolates were found to be S. bovis (9, and
28 isolates from samples 2 to 3 taken during the initial stage of
fermentation). Thus, only 38 isolates recovered from samples 1 to 3
were identified as S. bovis. Lc. garvieae grew during the subsequent
6 h storage of the ingredient mix and represented 88% of the LAB
isolates at this time. Less frequent isolations of S. bovis and W. cibaria
were recorded at this stage. Lc. garvieae was also dominant (56%) in
the mix after freezing, followed by S. bovis (28%) and W. cibaria (16%).
During fermentation, Lc. garvieae progressively disappeared from
samples 4 to 7 and represented 13, 13, 2, and 4% of the isolates,
respectively. W. cibaria was first recovered from sample 2 at 3% then
increased its frequency to 16% in sample 3.
W. cibaria was found to be the dominant species in sample 4,
representing 85% of the isolates. However, its isolation frequency
subsequently decreased during fermentation (samples 5 to 9), and it
was present at only 1.6% of the isolates in sample 9. P. pentosaceus and
Lb. plantarum were both first isolated at 1% frequency in sample 4 and
then became predominant in samples 5 and 6 at frequencies of 30%, 29%
and 29%, 57%, respectively. Thereafter, the incidence of P. pentosaceus
declined to about 8% in sample 9.
The final stages of the fermentation were dominated by Lb.
plantarum that gave isolation frequencies as high as 70–90% from
samples 7 to 9. Lb. fermentum was occasionally recovered from
samples 6 to 8, but at low frequencies (about 1%)

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

3. ผลลัพธ์ทั้งหมด 762 แล็บแยกถูกกู้ และบริสุทธิ์จากตัวอย่างที่ 1 ถึง 9 ทั้งหมดแยกเป็นหลักได้รับการยืนยันอยู่ห้องปฏิบัติกลุ่มฐานะแบคทีเรีย กิจกรรมไม่คา และผลบวกความสามารถหมักน้ำตาลกลูโคส (ไม่แสดงข้อมูล) ของเหล่านี้ เพียงสองห้องปฏิบัติแยกถูกกู้คืนจากตัวอย่าง 1 หนึ่งแยกห้องปฏิบัติการร้อยถูกกู้คืนจากจากตัวอย่างที่ 2-8 และ 60ห้องปฏิบัติแยกถูกกู้คืนจากตัวอย่างที่ 9 ตามที่แสดงในตารางที่ 2พบว่า ไพรเมอร์เลือกที่สองได้มีการขยายตัว16S rDNA ส่วนของ LAB แต่ละแยกในการ amplicon ของประมาณ bp 1463 ขนาด (ไม่แสดงข้อมูล) เลือกสองเอนไซม์ tetrameric (Acc II หรือ III แฮ่) สำหรับ digestions จำกัดของ amplicons ได้มีการแยกความแตกต่างทั้งหมด 762 ห้องปฏิบัติแยกออกเป็น 6รูปแบบการจำกัด กำหนดรูปแบบเหล่านี้ หรือโพรไฟล์ ARDRAA, B, C, D, E และ F แสดงในรูปที่ 1 และรายการที่ปรากฏในตารางที่ 1 ตัวแทนแยกจากแต่ละโพรไฟล์ได้วิเคราะห์ของ 16S rDNA ลำดับค้นหา homology (99 – 100% ที่มีการเปิดเผยลำดับhomology) โพรไฟล์ A เป็น Lactococcus garvieae ดูรายละเอียด Bเป็นอุณหภูมิ bovis โพรไฟล์ C เป็น Weissella cibariaโพรไฟล์ D เป็น Pediococcus pentosaceus โปรไฟล์อีเคยเป็นแลคโตบาซิลลัส และโปรไฟล์ F เป็นแลคโตบาซิลลัสfermentum ลำดับเหล่านี้ได้นำฝากเข้าใน GenBankฐานข้อมูล หมายเลขทะเบียนลำดับที่แสดงในตารางที่ 1ความถี่ของการแยกแต่ละสายพันธุ์จาก 100 แยกดำเนินการที่แต่ละอย่าง เวลาแสดงอยู่ในตารางที่ 2แยกได้สองเท่าของห้องปฏิบัติการ (Lc. garvieae และ S. bovis) ถูกกู้คืนจากวัตถุดิบหลังผสม (ตัวอย่าง 1) ต่อมา สามสิบที่แยกได้จากแล็บ 762 แยกเจ็ดพบว่า S. bovis (9 และ28 ที่แยกได้จากตัวอย่าง 2-3 ถ่ายระหว่างระยะแรกของหมัก) ดังนั้น แยก 38 หายจากตัวอย่าง 1 ถึง 3ถูกระบุเป็น S. bovis Lc. garvieae เติบโตในระหว่างที่ตามมา6 h เก็บของส่วนผสมผสม และแสดง 88% ของห้องปฏิบัติการแยกในเวลานี้ บ่อยน้อยเนื่อ ของ S. bovis และ วัตต์ cibariaมีบันทึกในขั้นตอนนี้ Lc. garvieae ก็โดดเด่น (56%) ในหลังจากแช่แข็ง การผสมผสานตาม โดย S. bovis (28%) และ วัตต์ cibaria (16%)ระหว่างการหมัก Lc. garvieae ทุกทีหายไปจากตัวอย่าง 4-7 และเป็นตัวแทน 13, 13, 2 และ 4% ของแยกตามลาดับ วัตต์ cibaria แรกกู้คืนได้จากตัวอย่างที่ 2 ที่ 3% แล้วเพิ่มความถี่เป็น 16% ในตัวอย่างที่ 3วัตต์ cibaria พบว่าเป็นสายพันธุ์ที่โดดเด่นในตัวอย่างที่ 4คิดเป็น 85% ของการแยก อย่างไรก็ตาม ความถี่แยกต่อมาลดลงในระหว่างการหมัก (ตัวอย่าง 5-9), และมันถูกอยู่ที่เพียง 1.6% ของการแยกในตัวอย่างที่ 9 P. pentosaceus และบาซิลลัสปอนด์ถูกทั้งสองครั้งแรกแยกความถี่ 1% ในตัวอย่างที่ 4 และจากนั้น ก็โดดเด่นในตัวอย่างที่ 5 และ 6 ที่ความถี่ 30%, 29%และ 29%, 57% ตามลำดับ หลังจากนั้น อุบัติการณ์ของ P. pentosaceusลดลงประมาณ 8% ในตัวอย่างที่ 9ในขั้นตอนสุดท้ายของการหมักถูกครอบงำ โดยปอนด์บาซิลลัสที่แยกความถี่ได้สูงถึง 70 – 90% จากตัวอย่าง 7 ถึง 9 Fermentum ปอนด์อาจกู้คืนได้จากตัวอย่าง 6 8 แต่ ความถี่ต่ำ (ประมาณ 1%)

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

3. ผล
รวมเป็น 762 สายพันธุ์ LAB ถูกกู้คืนและบริสุทธิ์จาก
ตัวอย่างที่ 1 ถึง 9 สายพันธุ์ทั้งหมดได้รับการยืนยันเป็นหลักในการเป็นสมาชิกของ
กลุ่ม LAB ที่พวกเขาประจักษ์แกรมบวกไม่มีกิจกรรม catalase และ
ผลในเชิงบวกสำหรับความสามารถในการหมักน้ำตาลกลูโคส (ข้อมูล ไม่แสดง) ของ
เหล่านี้เพียงสองสายพันธุ์ LAB ถูกกู้คืนจากกลุ่มตัวอย่าง 1 หนึ่ง
ร้อยสายพันธุ์ LAB หายจากแต่ละตัวอย่าง 2-8 และ 60
สายพันธุ์ LAB ถูกกู้คืนจากกลุ่มตัวอย่างที่ 9 ตามที่ระบุไว้ในตารางที่ 2
พบว่าทั้งสองไพรเมอร์ที่เลือกได้ สามารถที่จะขยาย
ชิ้นส่วน 16S rDNA ของแต่ละแยก LAB ผลใน amplicon ของ
ประมาณ 1,463 bp ในขนาด (ไม่ได้แสดงข้อมูล) ทั้งสองได้รับการแต่งตั้ง
tetrameric เอนไซม์ (ทั้ง Acc II หรือแฮ III) สำหรับการย่อยข้อ จำกัด
ของ amplicons ก็สามารถที่จะแยกความแตกต่างทั้งหมด 762 LAB ที่แยกออกเป็น 6
รูปแบบการ จำกัด รูปแบบเหล่านี้หรือโปรไฟล์ ARDRA ซึ่งได้รับมอบหมาย
A, B, C, D, E, F และดังแสดงในรูป 1 และแสดงในตารางที่ 1 ตัวแทน
แยกจากแต่ละโปรไฟล์ได้วิเคราะห์หาลำดับ 16S rDNA ของพวกเขา.
ค้นหาคล้ายคลึงกันของลำดับเปิดเผย (มี 99-100%
ที่คล้ายคลึงกัน) รายละเอียดของ A เป็น Lactococcus garvieae โปรไฟล์ B
เป็น Streptococcus bovis โปรไฟล์ C เป็น Weissella cibaria,
รายละเอียด D เป็น Pediococcus pentosaceus โปรไฟล์ E เป็น
Lactobacillus plantarum และรายละเอียด F เป็น Lactobacillus
fermentum ลำดับเหล่านี้มีเงินเข้ามาใน GenBank
ฐานข้อมูล หมายเลขภาคยานุวัติลำดับของพวกเขาจะแสดงในตารางที่ 1.
ความถี่ของการแยกของแต่ละชนิดจาก 100 แยกดำเนินการ
ในแต่ละช่วงเวลาตัวอย่างที่ระบุไว้ในตารางที่ 2
เพียงสองสายพันธุ์ของ LAB (Lc. garvieae และ S. bovis) ได้รับการกู้คืน
จาก วัตถุดิบหลังจากผสม (ตัวอย่าง 1) ต่อมาสามสิบ
เจ็ดไอโซเลทจาก 762 สายพันธุ์ LAB พบว่ามีเอส bovis (9, และ
28 แยกจากตัวอย่าง 2-3 ดำเนินการในช่วงระยะแรกของการ
หมัก) ดังนั้นเพียง 38 สายพันธุ์หายจากตัวอย่างที่ 1 ถึง 3
ถูกระบุว่าเป็นเอส bovis LC garvieae เติบโตในช่วงที่ตามมา
การจัดเก็บ 6 ชั่วโมงของการผสมส่วนผสมและเป็นตัวแทน 88% ของห้องปฏิบัติการ
ที่แยกได้ในขณะนี้ isolations บ่อยน้อยของ บริษัท เอสดับบลิว bovis และ cibaria
ถูกบันทึกไว้ในขั้นตอนนี้ LC garvieae ก็ยังโดดเด่น (56%) ใน
การผสมหลังจากแช่แข็งตามด้วยเอส bovis (28%) และดับบลิว cibaria (16%).
ในระหว่างการหมัก Lc garvieae ก้าวหน้าหายไปจาก
ตัวอย่างที่ 4-7 และเป็นตัวแทน 13, 13, 2 และ 4% ของเชื้อที่
ตามลำดับ ดับบลิว cibaria หายตัวอย่างแรกจาก 2 ที่ 3% แล้ว
เพิ่มขึ้นความถี่ถึง 16% ในกลุ่มตัวอย่าง 3.
ดับเบิลยู cibaria ถูกพบว่าเป็นสายพันธุ์ที่โดดเด่นในกลุ่มตัวอย่างที่ 4
คิดเป็น 85% ของเชื้อ อย่างไรก็ตามความถี่แยก
ลดลงมาระหว่างการหมัก (ตัวอย่าง 5-9) และมัน
อยู่ที่เพียง 1.6% ของเชื้อในตัวอย่าง 9. P. pentosaceus และ
ปอนด์ plantarum ทั้งสองแยกแรกที่ความถี่ 1% ในกลุ่มตัวอย่างที่ 4 และ
แล้วก็กลายเป็นที่โดดเด่นในตัวอย่างที่ 5 และ 6 ที่ความถี่ 30%, 29%
และ 29%, 57% ตามลำดับ หลังจากนั้นเป็นต้นมาอุบัติการณ์ของ P. pentosaceus
ปฏิเสธที่จะประมาณ 8% ในกลุ่มตัวอย่าง 9.
ขั้นตอนสุดท้ายของการหมักที่ถูกครอบงำโดย Lb.
plantarum ที่ให้ความถี่การแยกสูงที่สุดเท่าที่ 70-90% จาก
กลุ่มตัวอย่างที่ 7 ถึง 9 ปอนด์ บางครั้ง fermentum หายจาก
ตัวอย่าง 6-8 แต่ความถี่ต่ำ (ประมาณ 1%)

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

3 . ผลลัพธ์ทั้งหมด 762 Lab ไอโซเลทและบริสุทธิ์จากหายตัวอย่างที่ 1 ถึง 9 ทุกสายพันธุ์เป็นหลัก ยืนยันว่าเป็นของห้องปฏิบัติการกลุ่มพวกเขาประจักษ์ แกรมบวก ไม่สามารถกิจกรรมผลลัพธ์ที่เป็นบวกสำหรับความสามารถวิศวกรรมเคมี กลูโคส ( ข้อมูลไม่แสดง ) ของเหล่านี้ , เพียงสองห้องปฏิบัติการเชื้อที่พบจากตัวอย่างที่ 1 หนึ่งแล็บกู้แต่ละสายพันธุ์เป็นร้อยจากตัวอย่างที่ 2 ถึง 8 และ 60ห้องปฏิบัติการเชื้อที่พบจากตัวอย่าง 9 ตามที่ระบุไว้ในตารางที่ 2พบว่าทั้งสองเลือกไพรเมอร์สามารถขยายชิ้นส่วน 16S rDNA ของแต่ละห้องปฏิบัติการแยกที่เกิดขึ้นในและของประมาณจัง BP ในขนาด ( ข้อมูลไม่แสดง ) 2 เลือกtetrameric เอนไซม์ ( บัญชี 2 หรือ 3 ข้อ จำกัด digestions แฮ )ของ amplicons สามารถแยกแยะทั้งหมด 762 ปฏิบัติการแยกเป็น 6รูปแบบการเรียน รูปแบบเหล่านี้หรือ ardra โปรไฟล์ ได้รับมอบหมายA , B , C , D , E และ F ดังแสดงในรูปที่ 1 และ ที่ระบุไว้ในตารางที่ 1 ตัวแทนที่แยกได้จากแต่ละโปรไฟล์ของ 16S rDNA วิเคราะห์ลำดับดีเอ็นเอตัวค้นหาของลำดับข้อมูล ( 99 - 100 %ลำดับ ) รายละเอียดของแลคโตค คัส garvieae รายละเอียดขเป็นเชื้อแบคทีเรีย bovis โปรไฟล์ของ weissella cibaria C ,โปรไฟล์ของโปรไฟล์ใน 3 D , E ของLactobacillus plantarum และโปรไฟล์ F เป็นของแลกโตบาซิลลัสfermentum . ลำดับเหล่านี้ฝากเงินเข้าขนาดฐานข้อมูล เปลี่ยนลำดับของตัวเลขแสดงดังตารางที่ 1ความถี่ของการแยกของแต่ละชนิด จาก 100 สายพันธุ์ถ่ายในแต่ละตัวอย่างเวลาอยู่ในรางที่ 2เพียงสองสายพันธุ์ของแล็บ ( LC . garvieae และ S . bovis ) หายจากวัตถุดิบหลังจากที่ผสมตัวอย่าง ( 1 ) ต่อมา สามสิบเจ็ดสายพันธุ์ของเชื้อพบว่ามีห้องปฏิบัติการที่ต้อง bovis ( 9 , และ S .28 สายพันธุ์จากตัวอย่างที่ 2 ถ่ายในตอนเริ่มต้นของการหมัก ) ดังนั้น เพียง 38 ไอโซเลตหายจากตัวอย่าง 1ที่ถูกระบุว่าเป็นเอส bovis . LC . garvieae เติบโตในช่วงต่อมา6 H กระเป๋าของส่วนประกอบผสม และเป็นตัวแทนร้อยละ 88 ของแล็บไอโซเลท ในเวลานี้ น้อยลง isolations S . bovis cibaria และที่ถูกบันทึกไว้ในขั้นตอนนี้ LC . garvieae ก็เด่น ( 56 )ผสมหลังจากแช่แข็ง , ตาม โดย bovis ( 28% ) และ cibaria ( 16% )ในระหว่างการหมัก LC . garvieae ค่อยๆหายไปจากตัวอย่างที่ 4 และ 7 แทน 13 , 13 , 2 และ 4 % ของเชื้อตามลำดับ . cibaria ก่อนหายจากกลุ่มตัวอย่าง 2 ใน 3 % แล้วความถี่ที่เพิ่มขึ้นของร้อยละ 16 ในตัวอย่างที่ 3. cibaria พบเป็นชนิดเด่นในตัวอย่างที่ 4แสดง 85 % ของเชื้อ อย่างไรก็ตาม ความถี่ของการแยกของต่อมาลดลงในระหว่างการหมัก ( ตัวอย่าง 5 - 9 ) และอยู่ที่เพียงร้อยละ 1.6 ของเชื้อในตัวอย่าง 9 และ P . pentosaceusปอนด์ plantarum ทั้งคู่ก่อนแยกที่ความถี่ 1 % ในตัวอย่างที่ 4 และจากนั้นก็โดดในตัวอย่างที่ 5 และ 6 ที่ความถี่ 30 % , 30 %และ 29% 57 เปอร์เซ็นต์ ตามลำดับ หลังจากนั้น อุบัติการณ์ของการพบหน้าลดลงประมาณร้อยละ 8 ในตัวอย่าง 9ขั้นตอนสุดท้ายของการหมักเป็น dominated โดยปอนด์กรดที่ให้ความถี่แยกสูง 70 – 90 % จากตัวอย่างที่ 7 ถึง 9 fermentum คือบางครั้งหายจากปอนด์ตัวอย่างที่ 6 ถึง 8 แต่ที่ความถี่ต่ำ ( ประมาณ 1% )