Our findings also imply that CRISPR

Our findings also imply that CRISPR spacers are actively acquired
in response to phages in the human gut. First, the large
number of unique phage-matching spacers we detected is suggestive
of the numerous events in which such interactions have occurred.
Second, we have identified cases in which the most recently
acquired spacers in the rapidly evolving CRISPR array
perfectly match a phage co-occurring in the same gut, at apparently
depressed levels (e.g., Fig. 3), as well as absolutely no conservation
of the most recently acquired spacer in a particular array
across individuals (Supplemental Table S3). Finally, our data suggest
that CRISPR spacers usually successfully exclude targeted
phages, while showing positive correlation of highly matching
spacers (thus also likely to be recently acquired) with targeted
phages about to be completely excluded. Combined, this evidence
suggests that there is an ongoing ‘‘immune’’ interaction between
phages and their bacterial hosts within the gut microbial community,
whose potential effect remains to be fully characterized. It
is possible that the rapid nature of this dynamic is what has made it
so difficult to capture in previous studies. Notably, although the
typical ecological manifestations of predatory interactions were
observed in numerous niches, past studies did not report on such
dynamics in the gut, and this study was not suited to examine it
directly due to the lack of time-series data.
It is also not entirely clear how to reconcile phage–bacteria
infection–resistance interactions through the CRISPR system with
the apparent abundance of lysogenic phages in the gut, which this
study also supports. This suggests there may be some form of
protection of the bacterial genome (harboring the prophage) from
the CRISPR system (Stern et al. 2010). A recent study (Edgar and
Qimron 2010) has shown that acquisition of spacers against a lysogenized
phage can lead to bacterial cell death but may also prevent
prophage induction and subsequent cell lysis to the benefit of
bacteria under certain circumstances. Spacers against a phage not
yet integrated were shown to prevent lysogenization (Edgar and
Qimron 2010). This study and our findings suggest the CRISPR
system may have important roles in regulating phage–bacteria
interactions even when they are not primarily lytic.
It is clear, therefore, that further study is warranted to unravel
the seemingly unique ecology of the human gut microbiome in
this respect. Our identification of the gut bacterial targets for more
than 130 phages, based on evidence for integration into the bacterial
host genome (Fig. 4) or on CRISPR-derived phage–host assignment
(Fig. 3), now opens the window for future, detailed timecourse
studies on the dynamic effect of phages on individual
bacterial species and on the gut microbial consortium as a whole.

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ผลการวิจัยของเรายังหมายความว่าอวกาศ CRISPR จะได้รับอย่างแข็งขัน
ในการตอบสนองต่อ phages ในลำไส้ของมนุษย์ ครั้งแรกที่มีขนาดใหญ่
จำนวนอวกาศทำลายจุลินทรีย์จับคู่ที่ไม่ซ้ำกันเราตรวจพบจะมีการชี้นำ
ของเหตุการณ์ต่าง ๆ นานาที่มีปฏิสัมพันธ์ดังกล่าวได้เกิดขึ้น.
ประการที่สองเราได้ระบุกรณีที่มากที่สุดเมื่อเร็ว ๆ นี้
ได้มาในอวกาศอาร์เรย์การพัฒนาอย่างรวดเร็ว CRISPR
สมบูรณ์ตรงร่วมทำลายจุลินทรีย์ -occurring ในลำไส้เดียวกันที่เห็นได้ชัด
ระดับต่ำ (เช่นรูปที่. 3) เช่นเดียวกับอย่างไม่มีการอนุรักษ์
ของ spacer มากที่สุดเมื่อเร็ว ๆ นี้ได้มาในอาร์เรย์โดยเฉพาะอย่างยิ่ง
ข้ามบุคคล (เพิ่มเติมตาราง S3) สุดท้ายข้อมูลของเราแสดงให้เห็น
ว่าอวกาศ CRISPR มักจะประสบความสำเร็จไม่รวมที่กำหนดเป้าหมาย
phages ขณะที่แสดงความสัมพันธ์เชิงบวกของการจับคู่สูง
อวกาศ (จึงยังมีแนวโน้มที่จะได้มาเมื่อเร็ว ๆ นี้) ด้วยการกำหนดเป้าหมาย
ฟาจจะได้รับการยกเว้นอย่างสมบูรณ์ รวมหลักฐานนี้
แสดงให้เห็นว่ามีอย่างต่อเนื่อง '' ภูมิคุ้มกัน '' ปฏิสัมพันธ์ระหว่าง
phages และไพร่พลแบคทีเรียของพวกเขาภายในลำไส้ชุมชนของจุลินทรีย์
ที่มีผลกระทบที่อาจเกิดขึ้นยังคงที่จะโดดเด่นอย่างเต็มที่ มัน
เป็นไปได้ว่าธรรมชาติอย่างรวดเร็วของแบบไดนามิกนี้เป็นสิ่งที่ได้ทำให้มัน
จึงยากที่จะจับภาพในการศึกษาก่อนหน้า ยวดแม้ว่า
อาการของระบบนิเวศโดยทั่วไปของการมีปฏิสัมพันธ์ที่กินสัตว์ที่ถูก
ตั้งข้อสังเกตในซอกหลายการศึกษาที่ผ่านมาไม่ได้รายงานเกี่ยวกับการดังกล่าว
พลวัตในลำไส้และการศึกษานี้ไม่เหมาะกับการตรวจสอบ
โดยตรงเนื่องจากการขาดของข้อมูลอนุกรมเวลา.
มันเป็น ยังไม่ชัดเจนว่าจะคืนดีทำลายจุลินทรีย์แบคทีเรีย
ปฏิสัมพันธ์การติดเชื้อต้านทานผ่านระบบ CRISPR กับ
ความอุดมสมบูรณ์ชัดเจนของฟาจ lysogenic ในลำไส้ซึ่งนี้
ยังสนับสนุนการศึกษา นี้แสดงให้เห็นว่าอาจจะมีรูปแบบของ
การป้องกันของจีโนมของเชื้อแบคทีเรีย (เยิ้ม prophage) จาก
ระบบ CRISPR (สเติร์น et al. 2010) ผลการศึกษาล่าสุด (เอ็ดการ์และ
Qimron 2010) ได้แสดงให้เห็นการเข้าซื้อกิจการของอวกาศกับ lysogenized ที่
ทำลายจุลินทรีย์ที่สามารถนำไปสู่การตายของเซลล์แบคทีเรีย แต่ยังอาจป้องกันไม่ให้
เหนี่ยวนำ prophage และสลายเซลล์ที่ตามมาเพื่อประโยชน์ของ
แบคทีเรียภายใต้สถานการณ์บางอย่าง Spacers กับทำลายจุลินทรีย์ไม่
บูรณาการยังได้รับการแสดงเพื่อป้องกัน lysogenization (เอ็ดการ์และ
Qimron 2010) การศึกษาครั้งนี้และผลการวิจัยของเราแสดงให้เห็น CRISPR
ระบบอาจจะมีบทบาทสำคัญในการควบคุมการทำลายจุลินทรีย์แบคทีเรีย
ปฏิสัมพันธ์แม้ว่าพวกเขาจะไม่ได้ lytic ส่วนใหญ่.
เป็นที่ชัดเจนดังนั้นที่ศึกษาต่อไปคือการรับประกันที่จะคลี่คลาย
นิเวศวิทยาที่ไม่ซ้ำกันดูเหมือนของ microbiome ลำไส้ของมนุษย์ในการ
แง่นี้ บัตรประจำตัวของเราเป้าหมายของแบคทีเรียในลำไส้มานาน
กว่า 130 phages บนพื้นฐานของหลักฐานสำหรับการรวมเข้าแบคทีเรีย
จีโนมโฮสต์ (รูปที่. 4) หรือที่ได้รับมอบหมาย CRISPR มาทำลายจุลินทรีย์ที่เป็นเจ้าภาพ
(รูปที่. 3) ตอนนี้เปิดหน้าต่างสำหรับอนาคต timecourse รายละเอียด
การศึกษาเกี่ยวกับผลกระทบแบบไดนามิกของฟาจในแต่ละ
สายพันธุ์ของเชื้อแบคทีเรียและจุลินทรีย์ในลำไส้สมาคมรวม

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ผลการวิจัยของเรายังแสดงให้เห็นว่า crispr spacers อย่างได้มา
ในการตอบสนองต่อฟาจในลำไส้ของมนุษย์ แรก จํานวนเฉพาะคู่ใหญ่
ฟา spacers เราพบคือการชี้นํา
เหตุการณ์มากมายซึ่งปฏิกิริยาดังกล่าวเกิดขึ้น .
2 เราได้ระบุกรณี ซึ่งส่วนใหญ่เพิ่งได้รับ spacers ในการพัฒนาอย่างรวดเร็ว

crispr เรย์สมบูรณ์ตรงกับเฟจ CO ที่เกิดขึ้นในอุทรเดียวกัน ที่เห็นได้ชัด
ระดับหดหู่เช่น ( รูปที่ 3 ) รวมทั้งไม่มีการอนุรักษ์
ของส่วนใหญ่เพิ่งซื้อ Spacer ในโดยเฉพาะเรย์
ข้ามบุคคล ( ตาราง S3 เพิ่มเติม ) ในที่สุด ข้อมูลที่แนะนำ
crispr spacers มักจะประสบความสำเร็จรวม
จเป้าหมายในขณะที่แสดงความสัมพันธ์ทางบวกสูง
ที่ตรงกันspacers ( ซึ่งน่าจะเพิ่งได้มา ) ด้วยเป้าหมาย
จจะสมบูรณ์รวม . รวมหลักฐาน
เห็นว่ามีอย่างต่อเนื่อง ' ' ' 'immune ปฏิสัมพันธ์ระหว่าง
ฟาจและแบคทีเรียภายในลำไส้ของจุลินทรีย์โฮสต์ที่มีศักยภาพชุมชน ,
ผลยังคงต้องเต็มที่เพียง มันเป็นไปได้ว่าธรรมชาติ
อย่างรวดเร็วแบบไดนามิกนี้เป็นสิ่งที่ทำให้มัน
จึงยากที่จะจับในการศึกษาก่อนหน้านี้ . อย่างไรก็ตาม แม้ว่าอาการโดยทั่วไปของระบบนิเวศปฏิสัมพันธ์ล่า

สังเกตได้ใน niches หลายที่ผ่านมาการศึกษามิได้รายงานการเปลี่ยนแปลงดังกล่าว
ในลำไส้ และการศึกษานี้ไม่เหมาะกับการตรวจสอบ
โดยตรงเนื่องจากการขาดของข้อมูลอนุกรมเวลา .
ยังไม่ได้ทั้งหมดชัดเจนว่าจะกระทบแบคทีเรีย–ฟา
- การติดเชื้อต้านทานการปฏิสัมพันธ์ผ่านระบบ crispr กับ
ความอุดมสมบูรณ์ปรากฏของไลโซจีนิกฟาจในลำไส้ ซึ่งการศึกษานี้
ยังสนับสนุน ซึ่งชี้ให้เห็นว่าอาจจะมีบางรูปแบบของการป้องกันของจีโนมของแบคทีเรีย (

prophage กรมเจ้าท่า ) จากระบบ crispr ( Stern et al . 2010 ) การศึกษาล่าสุด ( เอ็ดการ์ และ
qimron 2010 ) ได้แสดงให้เห็นว่าการ spacers กับ lysogenized
ว่าสามารถนำแบคทีเรียเซลล์ตาย แต่ยังอาจป้องกันการเสื่อมของเซลล์และ prophage

ตามมาเพื่อประโยชน์ของแบคทีเรียภายใต้สถานการณ์บางอย่าง spacers กับฟาไม่ยังถูกแสดงเพื่อป้องกัน
รวม lysogenization ( เอ็ดการ์ และ
qimron 2010 ) การศึกษาและการค้นพบของเราแนะนำระบบ crispr
อาจจะมีบทบาทสำคัญในการควบคุมแบคทีเรีย–ฟา
ปฏิสัมพันธ์แม้ว่าพวกเขาจะไม่เป็นหลักไลติค .
มันชัดเจน ดังนั้น รับรองว่าจะศึกษาต่อเพื่อคลี่คลาย
ระบบนิเวศเฉพาะดูเหมือนของไมโครไบโไส้มนุษย์
ส่วนนี้ ของเราตัวลำไส้แบคทีเรียเป้าหมายมากขึ้น
กว่า 130 จ หลักฐาน เพื่อบูรณาการเข้าไปในจีโนมแบคทีเรีย
( รูปที่ 4 ) โฮสต์หรือ crispr ได้มาเฟจ–เจ้าภาพงาน
( รูปที่ 3 )ตอนนี้เปิดหน้าต่าง เพื่ออนาคตของ timecourse
การศึกษาผลแบบไดนามิกของฟาจในแต่ละชนิด แบคทีเรียในลำไส้
และกลุ่มจุลินทรีย์ที่เป็นทั้ง