Figure 1 Principal components analy

Figure 1 Principal components analyses (PCA) of steady-state chemostat cultures. The x and y axes represent the two main principal components (PC1, PC2), the groups responsible for the majority of the variance in each global dataset (see Materials and methods). PCA and growth-rate trends (dashed lines) at the (a) transcriptome (mRNA) level and (b) proteome level. (c,e) PCA and trends at the (c) endometabolome and (e) exometabolome level, respectively. (d,f) Same as (c) and (e) for carbon-sufficient chemostat series (N-, P- and S- limited series; see text for explanation). Each symbol represents a culture condition, colored as follows: red, carbon (C) limitation; blue, nitrogen (N) limitation; yellow, phosphate (P) limitation; green, sulfate (S) limitation. The symbol shape indicates the specific growth rate, µ, of the culture: ovals, µ = 0.07/h; triangles, µ = 0.1/h; rectangles, µ = 0.2/h. The circle round the blue ovals includes chemostat series exhibiting pseudohyphal growth (see text). As a test of reproducibility, for each nutrient-limiting condition, one of the three µ = 0.07/h exometabolome samples was analyzed in triplicate.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ตัวเลข 1 หลักวิเคราะห์ส่วนประกอบ (PCA) วัฒนธรรม chemostat-ท่อน X และ y แกนแสดงถึงสองหลักส่วนประกอบหลัก (PC1, PC2), กลุ่มรับผิดชอบส่วนใหญ่ของความแปรปรวนในแต่ละชุดข้อมูลสากล (ดูวัสดุและวิธีการ) PCA และอัตราการเติบโตแนวโน้ม (เส้นประ) ในระดับ (ก) transcriptome (mRNA) และ (ข) proteome ระดับ (c, e) PCA และแนวโน้มที่ exometabolome endometabolome และ (e) (c) ระดับ ตามลำดับ (d, f) เหมือน (c) และ (e) สำหรับชุด chemostat คาร์บอนเพียงพอ (N- P - และ S จำกัด เห็นข้อความอธิบาย) แต่ละสัญลักษณ์แสดงถึงสภาพวัฒนธรรม สีดังนี้: สีแดง ข้อจำกัดของคาร์บอน (C) สีฟ้า ไนโตรเจน (N) จำกัด สีเหลือง ฟอสเฟต (P) จำกัด สีเขียว ซัลเฟต (S) จำกัด รูปร่างสัญลักษณ์บ่งชี้อัตราการเติบโตเฉพาะ เขต วัฒนธรรม: วงรี เขต = 0.07/h สามเหลี่ยม เขต = 0.1/h สี่เหลี่ยม เขต = 0.2/h วงกลมวงรีสีน้ำเงินรวมชุด chemostat อย่างมีระดับเติบโต pseudohyphal (โปรดดูข้อความ) เป็นการทดสอบ reproducibility สำหรับแต่ละสารจำกัดเงื่อนไข เขตสามหนึ่ง = 0.07/h มีวิเคราะห์ตัวอย่าง exometabolome ใน triplicate

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

รูปที่ 1 ส่วนประกอบหลักวิเคราะห์ (PCA) ของวัฒนธรรม chemostat มั่นคงของรัฐ แกน x และและเป็นตัวแทนของทั้งสององค์ประกอบหลักหลัก (PC1, PC2) กลุ่มที่รับผิดชอบในส่วนใหญ่ของความแปรปรวนในแต่ละชุดข้อมูลทั่วโลก (ดูวัสดุและวิธีการ) PCA และแนวโน้มการเจริญเติบโตอัตรา (เส้นประ) ที่ (ก) ยีน (mRNA) ระดับและ (ข) ระดับโปรตีน (C, E) PCA และแนวโน้มที่ (c) endometabolome และ (จ) ระดับ exometabolome ตามลำดับ (D, F) เช่นเดียวกับ (ค) และ (จ) สำหรับชุด chemostat คาร์บอนเพียงพอ (N-, P- และ S-จำกัด ชุดดูข้อความสำหรับคำอธิบาย) สัญลักษณ์แต่ละสภาพวัฒนธรรมสีดังนี้สีแดงคาร์บอน (C) ข้อ จำกัด ; สีฟ้า, ไนโตรเจน (N) ข้อ จำกัด ; สีเหลือง, ฟอสเฟต (P) ข้อ จำกัด ; สีเขียว, ซัลเฟต (S) ข้อ จำกัด รูปร่างสัญลักษณ์บ่งบอกถึงอัตราการเจริญเติบโตเฉพาะμของวัฒนธรรม: นิ้วก้อย, μ = 0.07 / h; สามเหลี่ยมμ = 0.1 / h; สี่เหลี่ยม, μ = 0.2 / ชั่วโมง วงกลมรอบวงรีสีฟ้ารวมถึงชุดการแสดงการเจริญเติบโต chemostat pseudohyphal (ดูข้อความ) ในขณะที่การทดสอบซ้ำสำหรับแต่ละสภาพสารอาหาร จำกัด ซึ่งเป็นหนึ่งในสามμ = 0.07 / h ตัวอย่าง exometabolome ถูกวิเคราะห์ในเพิ่มขึ้นสามเท่า

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

รูปที่ 1 องค์ประกอบหลัก ( PCA ) จากการวิเคราะห์ภายใต้การเพาะเลี้ยงแบบต่อเนื่อง วัฒนธรรม ส่วนแกน X และแกน Y แสดงหลัก 2 ส่วนประกอบหลัก ( PC pc2 , ) , กลุ่มที่รับผิดชอบส่วนใหญ่ของความแปรปรวนในแต่ละทั่วโลก ( ดูข้อมูลวัสดุและวิธีการ ) PCA และอัตราการเจริญเติบโตแนวโน้ม ( เส้นประ ) ที่ ( ) ทราน ริปโตม ( mRNA ) ระดับ และ ( ข ) ระดับโปรตีน . ( CE ) PCA และแนวโน้มที่ ( c ) endometabolome และ ( e ) ระดับ exometabolome ตามลำดับ ( D , F ) เหมือน ( C ) และ ( E ) สำหรับคาร์บอนที่เพียงพอการเพาะเลี้ยงแบบต่อเนื่อง ชุด ( N , P และ S - จำกัดชุด เห็นข้อความสำหรับคำอธิบาย ) แต่ละสัญลักษณ์แสดงถึงวัฒนธรรม สภาพสีดังนี้ : สีแดง คาร์บอน ( C ) จำกัด น้ำเงิน ไนโตรเจน ( N ) จำกัด ; สีเหลือง ฟอสเฟต ( P ) จำกัด ; สีเขียว , ซัลเฟต ( s ) มีข้อจำกัดสัญลักษณ์รูปแสดงอัตราการเจริญเติบโตจำเพาะµของวัฒนธรรม : วงรีµ = 0.07/h ; สามเหลี่ยม , สี่เหลี่ยม , µ 0.1/h µ = ; = 0.2/h วงกลมรอบวงรีสีฟ้า ประกอบด้วย ชุดการเพาะเลี้ยงแบบต่อเนื่อง ซึ่ง pseudohyphal ( เห็นข้อความ ) เป็นการทดสอบของยา แต่ละธาตุอาหารจำกัดเงื่อนไข ของทั้งสามµ = 0.07/h exometabolome ตัวอย่างวิเคราะห์ทั้งสามใบ