3.4. DNA barcoding of edible plants

3.4. DNA barcoding of edible plants
Plants are an essential element in human diet, both directly (cereals are the base of the food pyramid, followed by fruits and vegetables) and indirectly (plant products are used to feed cattle).Furthermore, several plants are used as food additives (e.g. soy). A reliable identification of crop species, as well as their origin and traceability,are key elements in the field of food safety. In the last 20 years
several PCR-methods have been tested on several crop cultivars, such as rice, corn, sorghum, barley, rye (Pasqualone et al., 1999; Ren, Zhu,Warndorff, Bucheli, & Shu, 2006; Salem et al., 2007; Terzi et al., 2005).Thesemethods are useful for both the producers, who are interested in protecting and certifying their crops (DeMattia, Imazio, Grassi, & Labra,2008; Labra et al., 2003; Ren et al., 2006), and consumers, who are interested in the quality and origin of their food. The increasing diffusion of genetically modified (GM) crops has further increased the demand for molecular techniques to track transgenes (Auer, 2003). In recent years, a multiplex DNA microarray chip for simultaneous identification of GMOs, based on regulations of different countries, has been developed (Leimanis et al., 2006; Nikolic, Taski-Ajdukovic, Jevtic, &Marinkovic, 2009), as well as similar systems devoted to the identification of plant species and cultivars (Agrimonti, Vietina, Pafundo, & Marmiroli, 2011; Xie,McNally, Li, Leung, & Zhu, 2006). However, as previously discussed, these molecular methods have a common limitation in their high species-specificity. Due to globalization, an increasing number of plants originating from different areas of the world are now offered to consumers, but there are not reliable, universal tools for their identification. DNA barcoding could be a reliable alternative to DNA fingerprinting approaches in plants identification,with a higher effectiveness/cost ratio. In fact, DNA barcoding does not require an
extensive knowledge of the genome of each organism, being based on the use of one or few universal markers (Hollingsworth et al., 2011).Nowadays, the research on DNA barcoding in the field of botany is
shifting from the analysis of the performance of different markers towards more practical applications. Among edible plants, this approach has been used to track spices (De Mattia et al., 2011). Species
of the genus Mentha, Ocimum, Origanum, Salvia, Thymus and Rosmarinus were analyzed by using the core-barcode region (matK+rbcL), and the trnH-psbA intergenic spacer. With DNA barcoding, most common spices can be identified, with the exclusion of marjoram and oregano, which, belonging to the same genus Oregano, have an intraspecific diversity which is higher than interspecific,because of several cases of hybridization.DNA barcoding has shown high performances in discriminating basil species: matK and trnH-psbA were able to distinguish commercial basil (Ocimum basilicum L) from other Ocimum species, as well as different basil cultivars.DNA barcoding was also used to investigate the genetic relationships between wild and cultivated plants, as well as their origin. Nicolè et al. (2011) used DNA barcoding on bean germplasm (Phaseolus vulgaris L.) observing distinct haplotypes for bean accessions
corresponding to Mesoamerican or Andean areas. However,this study also highlighted the limits of approach in resolving genetic relationships between races and strictly related varieties.Bruni et al. (2010) evaluated the effectiveness of DNA barcoding in separating toxic from edible species, evidencing a clear molecular distinction between cultivated species of the genera Solanum (Solanum tuberosum L., Solanum lycopersicum L. group) and Prunus (Prunus armeniaca L., Prunus avium L., Prunus cerasus L., Prunus domestica L.) and their toxic congenerics. This study suggested that DNA barcoding could be used to distinguish edible species from their non-edible or toxic congenerics (Jaakola, Suokas, & Häggman, 2010).The limits of adopting universal barcode markers are evident at the cultivar level, where genetic variability is limited, and there are complications due to breeding events. To overcome these limits,
Kane and Cronk (2008) proposed the ultra-barcoding methodology,which is based on the sequence of the whole plastidial genome, together with large portions of the nuclear genome. This combination
provides enough information to evidence genetic diversity below the level of species, distinguishing hybrids from pure lines, hence it is far more sensitive than traditional DNA barcoding (Nock et al.,
2011; Parks, Cronn, & Liston, 2009; Steele & Pires, 2011). Kane and Cronk (2008) evaluated the effectiveness of ultra-barcoding on cocoa (Theobroma cacao L.), and found several plastidial and nuclear
SNPs, which were useful to identify different cultivars. This technique is promising, but it is difficult to apply on a large scale due to its high costs, and its excessive species-specificity.Nowadays, there are no technical limitations to the application of DNA barcoding for the traceability of plant raw materials. However,the reduced genetic diversity at cultivar level often requires the analysis of large portions of the genome, which currently have a too high cost/effectiveness ratio to be widely used. Furthermore, this approach is contrary to the basic DNA barcoding methodology, which requires the analysis of short and universal DNA regions only.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

3.4 บาร์โค้ดดีเอ็นเอของพืชกินได้
พืชเป็นองค์ประกอบที่สำคัญในอาหารของมนุษย์ทั้งทางตรง (ธัญพืชเป็นฐานของปิรามิดอาหารตามด้วยผักและผลไม้) และทางอ้อม (ผลิตภัณฑ์พืชที่ใช้ในการเลี้ยงวัว). นอกจากนี้พืชหลาย ใช้เป็นวัตถุเจือปนอาหาร (เช่นถั่วเหลือง) ประชาชนที่เชื่อถือได้ของสายพันธุ์พืชได้เป็นอย่างดีเป็นที่มาและตรวจสอบย้อนกลับของพวกเขาเป็นองค์ประกอบสำคัญในด้านความปลอดภัยของอาหาร ในช่วง 20 ปีที่หลาย pcr
วิธีการได้รับการทดสอบในพันธุ์พืชหลายอย่างเช่นข้าวข้าวโพดข้าวฟ่างข้าวบาร์เลย์, ข้าวไร (Pasqualone et al, 1999;. เรเน, zhu, warndorff, bucheli, & shu 2006; salem et al, 2007;... Terzi et al, 2005) thesemethods มีประโยชน์สำหรับทั้งผู้ผลิตที่มีความสนใจในการปกป้องและการรับรองพืชผลของพวกเขา (demattia,Labra imazio, Grassi, & 2008; Labra et al, 2003;.. ren, et al, 2006) และผู้บริโภคที่มีความสนใจในคุณภาพและแหล่งที่มาของอาหารของพวกเขา แพร่ที่เพิ่มขึ้นของการดัดแปลงทางพันธุกรรม (จีเอ็ม) พืชได้เพิ่มขึ้นต่อไปความต้องการสำหรับเทคนิคโมเลกุลในการติดตาม transgenes (Auer, 2003) ในปีที่ผ่านมาชิป dna multiplex microarray พร้อมกันเพื่อระบุตัวตนของ GMOs,ขึ้นอยู่กับกฎระเบียบของประเทศที่แตกต่างกันได้รับการพัฒนา (leimanis et al, 2006;. Nikolic, taski-ajdukovic, jevtic, & Marinkovic, 2009) ระบบที่คล้ายกันทุ่มเทให้กับการระบุตัวตนของพันธุ์พืชและพันธุ์เช่นเดียวกับที่ (agrimonti, vietina , pafundo, & marmiroli, 2011; Xie, เนลลี, li, ตำลึง, & zhu, 2006) แต่ตามที่กล่าวไว้ก่อนหน้านี้วิธีการโมเลกุลเหล่านี้มีข้อ จำกัด ที่พบในสายพันธุ์ที่เฉพาะเจาะจงสูงของพวกเขา เนื่องจากโลกาภิวัตน์จำนวนที่เพิ่มขึ้นของพืชที่มาจากพื้นที่ต่างๆของโลกในขณะนี้มีการเสนอให้กับผู้บริโภค แต่มีไม่น่าเชื่อถือเครื่องมือสากลสำหรับการระบุตัวตนของพวกเขา dna บาร์โค้ดอาจจะเป็นทางเลือกที่น่าเชื่อถือให้กับวิธีการพิมพ์ลายนิ้วมือดีเอ็นเอในการระบุพืชมีอัตราส่วนประสิทธิภาพ / ค่าใช้จ่ายที่สูงขึ้น ในความเป็นจริงดีเอ็นเอบาร์โค้ดไม่จำเป็นต้องมีความรู้กว้างขวาง
ของจีโนมของแต่ละสิ่งมีชีวิตที่อยู่บนพื้นฐานของการใช้หนึ่งหรือสองสามเครื่องหมายสากล (Hollingsworth และคณะ. 2011). ปัจจุบันงานวิจัยเกี่ยวกับดีเอ็นเอบาร์โค้ดในด้านการ พฤกษศาสตร์เป็น
ขยับจากการวิเคราะห์ประสิทธิภาพการทำงานของเครื่องหมายที่แตกต่างกันที่มีต่อการใช้งานจริงมากขึ้นในหมู่พืชกินได้วิธีการนี​​้ได้รับการใช้ในการติดตามเครื่องเทศ (เด Mattia et al,. 2011)
สายพันธุ์ของพืชและสัตว์ Mentha, Ocimum, Origanum, ซัลเวียไทมัสและ Rosmarinus วิเคราะห์โดยใช้ภูมิภาคแกนบาร์โค้ด (matk rbcl) และ trnh-psbA spacer intergenic ด้วยดีเอ็นเอบาร์โค้ดเครื่องเทศที่พบมากที่สุดสามารถระบุได้ด้วยการยกเว้นของมินท์และออริกาโนที่ที่เป็นของออริกาโนประเภทเดียวกันมีความหลากหลายสำนวนซึ่งสูงกว่า interspecific เพราะหลายกรณีที่ hybridization.dna บาร์โค้ดได้แสดงให้เห็นในการจำแนกสายพันธุ์โหระพาแสดงสูง matk และ trnh-psbA มีโอกาสที่จะเห็นความแตกต่างในเชิงพาณิชย์โหระพา (Ocimum basilicum ลิตร ) จากสายพันธุ์อื่น ๆ Ocimum เป็นสายพันธุ์ที่แตกต่างกันโหระพาdna บาร์โค้ดยังถูกใช้ในการตรวจสอบความสัมพันธ์ทางพันธุกรรมระหว่างพืชป่าและปลูกเป็นอย่างดีเป็นที่มาของ นิโคลและอัล (2011) ที่ใช้ดีเอ็นเอบาร์โค้ดบนเชื้อพันธุกรรมถั่ว (phaseolus vulgaris ลิตร.) การสังเกตพบ haplotype แตกต่างกันสำหรับถั่ว accessions
สอดคล้องกับ Mesoamerican หรือพื้นที่แอนเดียน อย่างไรก็ตามการศึกษาครั้งนี้ยังเน้นข้อ จำกัด ของวิธีการในการแก้ไขปัญหาความสัมพันธ์ทางพันธุกรรมระหว่างการแข่งขันและที่เกี่ยวข้องอย่างเคร่งครัด varieties.bruni ตอัล (2010) การประเมินประสิทธิผลของดีเอ็นเอบาร์โค้ดในการแยกสารพิษจากสายพันธุ์กินหลักฐานแสดงความแตกต่างที่ชัดเจนระหว่างโมเลกุลชนิดปลูกมะเขือจำพวก (Solanum tuberosum ลิตร. มะเขือลิตร lycopersicumกลุ่ม) และ Prunus (Prunus armeniaca ลิตร. Prunus avium ลิตร. Prunus ลิตร cerasus. ลิตร Prunus domestica.) และ congenerics พิษของพวกเขา การศึกษาครั้งนี้ชี้ให้เห็นว่าดีเอ็นเอบาร์โค้ดสามารถใช้ในการแยกแยะความแตกต่างชนิดที่กินได้จาก congenerics ไม่กินหรือเป็นพิษของพวกเขา (Jaakola, suokas, &häggman, 2010). ข้อ จำกัด ของการใช้เครื่องหมายบาร์โค้ดสากลจะเห็นได้ชัดในระดับพันธุ์ที่ที่ความแปรปรวนทางพันธุกรรมมี จำกัด และมีภาวะแทรกซ้อนเนื่องจากเหตุการณ์การผสมพันธุ์ ที่จะเอาชนะข้อ จำกัด เหล่านี้
kane และ cronk (2008) เสนอวิธีการอัลตร้าบาร์โค้ดซึ่งจะขึ้นอยู่กับลำดับของจีโนม plastidial ทั้งร่วมกับส่วนใหญ่ของจีโนมนิวเคลียร์ ชุดนี้
ให้ข้อมูลมากพอที่จะมีหลักฐานความหลากหลายทางพันธุกรรมที่ต่ำกว่าระดับของสายพันธุ์แตกต่างจากสายพันธุ์บริสุทธิ์ด้วยเหตุนี้มันอยู่ไกลมากขึ้นมีความละเอียดอ่อนกว่าดีเอ็นเอบาร์โค้ดแบบเดิม (Nock และคณะ, 2011
. liston สวนสาธารณะ cronn, &, 2009; สตี Pires & 2011) kane และ cronk (2008) การประเมินประสิทธิผลของการอัลตร้าบาร์โค้ดบนโกโก้ (Theobroma โกโก้ลิตร.) และพบ SNPs plastidial และนิวเคลียร์
หลายอย่างซึ่งเป็นประโยชน์ในการระบุสายพันธุ์ที่แตกต่างกันเทคนิคนี้มีแนวโน้ม แต่มันเป็นเรื่องยากที่จะนำไปใช้ในขนาดใหญ่เนื่องจากค่าใช้จ่ายสูงและชนิด specificity.nowadays ของมันมากเกินไปจะไม่มีข้อ จำกัด ทางเทคนิคในการประยุกต์ใช้บาร์โค้ด dna เพื่อตรวจสอบย้อนกลับของวัตถุดิบพืช แต่ความหลากหลายทางพันธุกรรมลดลงในระดับพันธุ์มักจะต้องใช้การวิเคราะห์ส่วนใหญ่ของจีโนมที่ซึ่งขณะนี้มีอัตราส่วนค่าใช้จ่าย / ประสิทธิผลสูงเกินไปที่จะได้รับการใช้กันอย่างแพร่หลาย นอกจากนี้วิธีการนี​​้เป็นวิธีการที่ขัดกับดีเอ็นเอบาร์โค้ดพื้นฐานที่ต้องใช้การวิเคราะห์ระยะสั้นและสากลภูมิภาค dna เพียง.

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

3.4 การโค้ดีเอ็นเอของพืชกิน
พืชเป็นองค์ประกอบสำคัญในอาหารมนุษย์ ทั้งโดยตรง (ธัญญาหารเป็นฐานของปิรามิดอาหาร ตาม ด้วยผักและผลไม้) และทางอ้อม (ผลิตภัณฑ์พืชใช้เลี้ยงวัว)นอกจากนี้ พืชต่าง ๆ ใช้เป็นวัตถุเจือปนอาหาร (เช่นถั่วเหลือง) รหัสที่น่าเชื่อถือของพืช พันธุ์ เป็นจุดเริ่มต้นของพวกเขา และ ติดตามมีองค์ประกอบสำคัญด้านความปลอดภัยของอาหาร ใน 20 ปี
หลายวิธี PCR ได้ทดสอบบนพืชพันธุ์ต่าง ๆ ข้าว ข้าวโพด ข้าวฟ่าง ข้าว บาร์เลย์ ข้าวไรย์ (Pasqualone et al., 1999 เร็น ซู Warndorff, Bucheli & ชู 2006 -Salem et al., 2007 Terzi et al., 2005)Thesemethods มีประโยชน์สำหรับทั้งการผลิต ที่มีความสนใจในการปกป้อง และได้รับการรับรองของพืช (DeMattia Labra Imazio, Grassi & 2008 Labra และ al., 2003 เร็นและ al., 2006), และ ผู้ บริโภคมีความสนใจในคุณภาพและจุดกำเนิดของอาหาร แพร่เพิ่มพืชผลดัดแปลงพันธุกรรม (จีเอ็ม) ได้เพิ่มเติมเพิ่มความต้องการเทคนิคโมเลกุลเพื่อติดตาม transgenes (Auer, 2003) ในปีที่ผ่านมา multiplex DNA microarray ปซึ่งสำหรับการดัดแปลงพันธุกรรม พร้อมระบุ ตามข้อบังคับของประเทศต่าง ๆ ได้รับการพัฒนา (Leimanis และ al., 2006 Nikolic, Taski-Ajdukovic, Jevtic, &Marinkovic, 2009), ระบบคล้ายเป็นเช่นทุ่มเทเพื่อการระบุของชนิดพืชและพันธุ์ (Agrimonti, Vietina, Pafundo & Marmiroli, 2011 เจีย McNally, Li เหลียง & Zhu, 2006) อย่างไรก็ตาม กล่าวว่าก่อนหน้านี้ วิธีการระดับโมเลกุลเหล่านี้มีข้อจำกัดทั่วไปใน species-specificity ของพวกเขาสูง เนื่องจากโลกาภิวัตน์ การเพิ่มจำนวนพืชที่มาจากพื้นที่ต่าง ๆ ของโลกจะนำเสนอให้ผู้บริโภคขณะนี้ แต่ไม่มีเครื่องมือที่เชื่อถือได้ สากลสำหรับรหัสของพวกเขา โค้ดีเอ็นเออาจเป็นทางเลือกที่เชื่อถือได้เพื่อใช้ในการระบุพืช ลายพิมพ์ดีเอ็นเอมีประสิทธิผล/ต้นทุนที่สูงกว่าอัตราการ ในความเป็นจริง โค้ดีเอ็นเอไม่ต้องการ
ความรู้ที่กว้างขวางของกลุ่มของสิ่งมีชีวิตแต่ละ เป็นไปตามการใช้เครื่องเดียว หรือน้อยสากลหมาย (Hollingsworth et al., 2011)ปัจจุบัน การวิจัยในซอฟต์แวร์ดีเอ็นเอในด้านพฤกษศาสตร์จะ
ขยับจากการวิเคราะห์ประสิทธิภาพของเครื่องหมายต่าง ๆ ไปประยุกต์ใช้งานจริงมากขึ้น ระหว่างกินพืช วิธีการนี้ได้ถูกใช้ในการติดตามเครื่องเทศ (เด Mattia et al., 2011) พันธุ์
ของพืชสกุล Mentha สกุลกะเพรา-โหระพา Origanum, Salvia ต่อมไทมัส และ Rosmarinus ได้วิเคราะห์ โดยใช้บาร์โค้ดหลักภูมิภาค (matK rbcL), และเป็นตัวเว้นวรรค intergenic trnH-psbA กับซอฟต์แวร์ดีเอ็นเอ เครื่องเทศทั่วสามารถระบุ มีข้อยกเว้นที่ marjoram และออริกาโน ที่ ของพืชสกุลเดียวกับออริกาโน มีความหลากหลายเป็น intraspecific ซึ่งจะสูงกว่า interspecific มีหลายกรณีที่ hybridizationโค้ดีเอ็นเอได้แสดงสมรรถนะสูงในรับการจำแนกชนิดโหระพา: matK และ trnH psbA ถูกต้องแยกพาณิชย์โหระพา (สกุลกะเพรา-โหระพา basilicum L) จากอื่น ๆ พันธุ์สกุลกะเพรา-โหระพา ตลอดจนพันธุ์โหระพาต่างกันนอกจากนี้ยังใช้ซอฟต์แวร์ดีเอ็นเอเพื่อตรวจสอบความสัมพันธ์ทางพันธุกรรมระหว่างป่า และปลูกพืช เป็นจุดกำเนิดของ Nicolè et al. (2011) ใช้ซอฟต์แวร์ดีเอ็นเอในถั่ว germplasm (เขียว vulgaris L.) สังเกตว่า haplotypes สำหรับถั่ว accessions
ที่สอดคล้องกับพื้นที่ในอเมริกากลางหรือ Andean อย่างไรก็ตามการศึกษานี้ยังเน้นข้อจำกัดของวิธีการในการแก้ไขความสัมพันธ์ทางพันธุกรรมระหว่างเชื้อชาติและสายพันธุ์ที่เกี่ยวข้องอย่างเคร่งครัดบรูนี et al. (2010) ประเมินประสิทธิผลของซอฟต์แวร์ดีเอ็นเอในการแยกสารพิษจากกินพันธุ์ การขอแบ่งแยกสกุล Solanum (Solanum tuberosum L., Solanum lycopersicum L. พันธุ์ปลูกล้างโมเลกุล กลุ่ม) และนาง (นาง armeniaca L. นาง avium L. นาง cerasus L. พลัม L.) และ congenerics ความเป็นพิษ การศึกษานี้แนะนำว่า สามารถใช้ซอฟต์แวร์ดีเอ็นเอเพื่อแยกชนิดกินจาก congenerics ของพวกเขาไม่กิน หรือเป็นพิษ (Jaakola, Suokas & Häggman, 2010)ขีดจำกัดของการใช้เครื่องหมายบาร์โค้ดสากลจะเห็นได้ชัดในระดับ cultivar ซึ่งความแปรผันทางพันธุกรรมถูกจำกัด และมีภาวะแทรกซ้อนเนื่องจากเหตุการณ์การปรับปรุงพันธุ์ เพื่อเอาชนะข้อจำกัดเหล่านี้,
เคนและ Cronk (2008) เสนอวิธีอัลตร้าโค้ ซึ่งขึ้นอยู่กับลำดับของจีโนมทั้ง plastidial กับส่วนใหญ่ของกลุ่มนิวเคลียร์ ชุดนี้
ให้ข้อมูลเพียงพอหลักฐานความหลากหลายทางพันธุกรรมต่ำกว่าระดับชนิด แยกลูกผสมจากบรรทัดบริสุทธิ์ จึงสำคัญมากกว่าโค้ดีเอ็นเอแบบดั้งเดิม (หมุนนกร้อยเอ็ด al.,
2011 สวน Cronn &สตัน 2009 Steele & Pires, 2011) เคนและ Cronk (2008) ประเมินประสิทธิผลของอัลตร้าซอฟต์แวร์ในโกโก้ (Theobroma cacao L.), และพบหลาย plastidial และนิวเคลียร์
SNPs ซึ่งมีประโยชน์ในการระบุพันธุ์แตกต่างกัน เทคนิคนี้แจ่ม แต่ก็ยากที่จะใช้ในพื้นที่ขนาดใหญ่เป็นต้นทุนสูง และ species-specificity ของมากเกินไปในปัจจุบัน มีไม่จำกัดเทคนิคการใช้ซอฟต์แวร์ดีเอ็นเอสำหรับการติดตามผลของโรงงานวัตถุดิบ อย่างไรก็ตาม ความหลากหลายทางพันธุกรรมลดลงระดับ cultivar มักต้องการวิเคราะห์ส่วนใหญ่ของกลุ่ม ซึ่งปัจจุบันมีอัตราต้นทุนประสิทธิภาพสูงเกินไปที่จะใช้กันอย่างแพร่หลาย นอกจากนี้ วิธีการนี้จะขัดกับพื้นฐานดีเอ็นเอซอฟต์แวร์วิธี ซึ่งต้องวิเคราะห์ในระยะสั้น และสากลดีเอ็นเอภูมิภาคเท่านั้น

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

3.4 . barcoding ดีเอ็นเอของพันธุ์ไม้ต่างๆ บริโภค
พันธุ์ไม้ต่างๆเป็นองค์ประกอบสำคัญในการรับประทานอาหารของมนุษย์ทั้งสองโดยตรง(ธัญพืชมีฐานของพีระมิดอาหารตามด้วยผักและผลไม้)และโดยอ้อม(สินค้าโรงงานมีการใช้ในการเลี้ยงสัตว์)..ยิ่งไปกว่านั้นยังมีการใช้พันธุ์ไม้หลายชนิดเป็นอาหาร(เช่นถั่วเหลือง) การระบุตัวตนที่น่าเชื่อถือของสายพันธุ์พืชและที่มาของพวกเขาและสืบค้นย้อนกลับเป็นส่วนประกอบสำคัญในฟิลด์ที่อยู่ในความ ปลอดภัย ด้านอาหาร ใน 20 ปี
หลาย pcr - วิธีการได้รับการได้รับการทดสอบแล้วกับพืชหลาย cultivars ,เช่นข้าว,ข้าวโพด,ข้าว,ข้าวบาร์เลย์,ข้าวไรย์( pasqualone et al ., 1999 ; number หรือ REN ,ระบบ, warndorff , bucheli ,&& Beauty , 2006 ,เซเลม et al ., 2007 ; terzi et al ., 2005 ) thesemethods จะมีประโยชน์สำหรับทั้งผู้ผลิต,ผู้ที่มีความสนใจในการป้องกันและรับรองของพืช( demattia ,imazio Grassi & labra, 2008 labra et al . 2003 REN et al . 2006 )และ ผู้บริโภค ที่มีความสนใจในแหล่งกำเนิดและ คุณภาพ ของอาหารของตน. แพร่ที่เพิ่มมากขึ้นของพืชดัดแปลงพันธุกรรม(จีเอ็มโอ)มีความต้องการที่เพิ่มขึ้นสำหรับเทคนิคระดับโมเลกุลเพื่อติดตาม transgenes ( auer 2003 )เพิ่มเติม ในช่วงหลายปีที่ผ่านมาดีเอ็นเอแบบมัลติเพล็กซ์ที่ microarray ชิปสำหรับการระบุตัวตนของทดลองปลูกจีเอ็มโอพร้อมกันตามกฎระเบียบของประเทศต่างๆได้มีการพัฒนา( leimanis et al . 2006 nikolic taski-ajdukovic jevtic &marinkovic 2009 )และเป็นระบบเดียวกันได้อุทิศตัวเพื่อการแสดงตนของสายพันธุ์และพันธุ์พืช cultivars ( agrimonti vietina pafundo & marmiroli 2011 เห mcnally Li leung & Zhu Asian 2006 ) แต่ถึงอย่างไรก็ตามยังเป็นที่ อภิปรายวิธีการโมเลกุลเหล่านี้มีการจำกัดร่วมกันในระดับสูงสายพันธุ์ - พวกเขาเพียงนำเสนอ เนื่องจากโลกา ภิวัตน์ การเพิ่มขึ้นของจำนวนพันธุ์ไม้การเริ่มต้นจากบริเวณที่แตกต่างกันไปของโลกที่จัดให้บริการสำหรับผู้ใช้ได้ในทันทีแต่ไม่มีเครื่องมือ Universal และเชื่อถือได้สำหรับการระบุตัวตนของพวกเขา barcoding ดีเอ็นเอจะเป็นทางเลือกที่น่าเชื่อถือในดีเอ็นเอ fingerprinting แนวทางในการระบุพันธุ์ไม้ต่างๆพร้อมด้วย ประสิทธิภาพ ที่สูงขึ้นและอัตราค่าใช้จ่าย. ในความเป็นจริงแล้ว,ดีเอ็นเอ barcoding ไม่จำเป็นต้องใช้
ที่หลากหลายความรู้ของยีนของแต่ละระบบทางร่างกาย,ได้รับการวางอยู่บนที่ใช้ของหนึ่งหรือไม่กี่ Universal ประกบสองตัว( hollingsworth et al ., 2011 )ในปัจจุบัน,การวิจัยในดีเอ็นเอ barcoding ในฟิลด์ของพฤกษศาสตร์คือ
ซึ่งจะช่วยเปลี่ยนจากการวิเคราะห์ ประสิทธิภาพ ของเครื่องทำเครื่องหมายไปยังเชิงปฏิบัติมากกว่าแอปพลิเคชัน.ในพืชที่รับประทานวิธีนี้ได้ถูกนำมาใช้เพื่อติดตามเครื่องเทศ( de mattia et al . 2011 ) สะพันธุ์
ของกะที่โหระพา origanum Salvia Condos thymus rosmarinus และยังนำมาวิเคราะห์หาโดยการใช้หลัก - บาร์โค้ด ภูมิภาค ( rbcl matk )และ spacer graphic trnh - psba intergenic ได้ พร้อมด้วยเครื่องเทศ barcoding ดีเอ็นเอโดยทั่วไปจะสามารถระบุได้ด้วยการแยกของออริกาโนและมินท์ซึ่งเป็นของกะเดียวกันที่มีความหลากหลาย intraspecific ออริกาโนซึ่งมีการปรับตัวสูงขึ้นกว่า interspecific เพราะของหลายกรณีของ hybridization .ดีเอ็นเอ barcoding มีแสดงการแสดงระดับสูงในสายพันธุ์ที่แตกต่างกันไป matk ใบโหระพาและ trnh - psba ก็สามารถสร้างความแตกต่างทางการค้าใบโหระพา(โหระพาแมงลัก L )จากอีกสายพันธุ์โหระพาและใบโหระพา cultivars แตกต่างกันbarcoding ดีเอ็นเอได้ถูกนำมาใช้ในการสืบสวนสอบสวนความสัมพันธ์ทางพันธุกรรมที่อยู่ระหว่างพันธุ์ไม้ป่าและอบรมบ่มนิสัยเป็นอย่างดีเป็นที่มาของเขาด้วย nicolè et al . ( 2011 )ที่ใช้ barcoding ดีเอ็นเอเชื้อในเมล็ดกาแฟ(ถั่วผีช่วยละลายแอล.)สังเกต haplotypes โดดเด่นสำหรับรัฐเมล็ดกาแฟ
ที่เกี่ยวข้องในพื้นที่เทือกเขาแอนดิส mesoamerican หรือ แต่ถึงอย่างไรก็ตามการศึกษานี้ยังมีข้อจำกัดที่ถูกไฮไลท์ให้เด่นชัดขึ้นมาในการแก้ไขความสัมพันธ์ทางพันธุกรรมระหว่างเชื้อชาติและความหลากหลายที่เกี่ยวข้องอย่างเคร่งครัด. bruni et al . ( 2010 )ได้รับการประเมิน ประสิทธิภาพ ของ barcoding ดีเอ็นเอในการแยกสายพันธุ์เห็ดพิษจากหลักฐานความแตกต่างระดับโมเลกุลชัดเจนระหว่างสายพันธุ์ปลูกหมากเหลืองมะแว้ง(มะแว้ง tuberosum L .มะอึก lycopersicum แอลได้กลุ่ม)และ( Tree - fern )(( Tree - fern ) armeniaca แอล( Tree - fern ) avium แอล( Tree - fern ) cerasus แอล( Tree - fern ) domestica แอล)และ congenerics พิษของพวกเขา. การศึกษานี้แนะนำว่า barcoding ดีเอ็นเอสามารถใช้ในการแยกสายพันธุ์เห็ดจากสิ่งที่ไม่ใช่ บริโภค หรือเป็นพิษ congenerics ( jaakola suokas & häggman 2010 )จำกัดที่ใช้ทำบาร์โค้ดทั่วไปเป็นอย่างเห็นได้ชัดในระดับ cultivar ได้ที่ตั้งได้ทางพันธุกรรมมีจำนวนจำกัดและมีโรคแทรกซ้อนเนื่องจากมีการจัดงานการผสมพันธุ์ ในการเอาชนะข้อจำกัดเหล่านี้
kane และ cronk ( 2008 )ที่เสนอวิธีการ Ultra - barcoding ซึ่งอยู่บนพื้นฐานตามลำดับที่ของยีน plastidial ทั้งหมดรวมกันพร้อมด้วยส่วนขนาดใหญ่ของยีนนิวเคลียร์ การผสมผสานนี้
ซึ่งจะช่วยจัดให้บริการข้อมูลที่เพียงพอเพื่อความหลากหลายทางพันธุกรรม,หลักฐานด้านล่างระดับของสายพันธุ์ความโดดเด่นจากสายยางพันธุ์ดีบริสุทธิ์ดังนั้นจึงเป็นไปได้มากกว่าแบบดั้งเดิมดีเอ็นเอ barcoding ( nock et al .
2011 อุทยาน cronn & liston 2009 Steele & pires 2011 ) kane และ cronk ( 2008 )ได้รับการประเมิน ประสิทธิภาพ ของ Ultra - barcoding ในโกโก้( theobroma ต้นโกโก้แอล)และพบว่า snps plastidial และนิวเคลียร์
หลายแห่งซึ่งมีประโยชน์ในการระบุ cultivars แตกต่างกันเทคนิคนี้เป็นดาวรุ่งแต่มันเป็นเรื่องยากที่จะนำไปใช้ในพื้นที่ขนาดใหญ่ที่มีต้นทุนสูงมากเกินไปและพันธุ์ไม้แบบ Mainstream )เพียงเท่านั้น.ปัจจุบันมีไม่มีข้อจำกัดทางด้านเทคนิคในแอปพลิเคชันของ barcoding ดีเอ็นเอเพื่อสืบค้นย้อนกลับของวัตถุดิบโรงงาน แต่ถึงอย่างไรก็ตามความหลากหลายทางพันธุกรรมลดลงในระดับ cultivar มักจะต้องมีการวิเคราะห์ของส่วนขนาดใหญ่ของยีนซึ่งในปัจจุบันมีอัตราส่วนราคาต่อ ประสิทธิภาพ สูงเกินไปที่จะใช้กันอย่างแพร่หลาย ยิ่งไปกว่านั้นซึ่งวิธีการนี้เป็นการขัดต่อดีเอ็นเอพื้นฐานที่ barcoding วิธีการซึ่งจะต้องมีการวิเคราะห์ของแต่ละ ภูมิภาค ดีเอ็นเอไปถึงได้ไม่ไกลนักและ Universal เท่านั้น.