In the course of a longitudinal study elucidating the dynamics of Arcobacter populations in pigs,
16 isolates of Gram-reaction-negative, rod-shaped, slightly curved, non-spore-forming bacteria
were grouped by amplified fragment length polymorphism analysis into a distinct phenon within
the genus Arcobacter. Fragments were generated for all isolates in a genus-specific PCR assay,
but no amplicon was obtained in a species-specific multiplex-PCR test. Numerical analysis of the
whole-cell protein profiles also showed that all isolates clustered in a single group that was
distinct from related members of the genus Arcobacter. DNA–DNA hybridizations between two
representative strains, designated 64T and 122, of the isolates obtained exhibited a mean DNA–
DNA relatedness of 72 %. DNA–DNA hybridizations between strains 64T and 122 and reference
strains of other animal-related bacteria of the genus Arcobacter revealed binding values of 47%
or less. The DNA G+C contents of the two representative strains were 28.5 and 28.4 mol%,
respectively, and analysis of three marker genes identified Arcobacter cryaerophilus, A. thereius,
A. cibarius and A. skirrowii as their closest phylogenetic neighbours. Strains 64T and 122 could
be distinguished from other members of the genus Arcobacter by means of biochemical tests for
catalase and urease activities, nitrate reduction, indoxyl acetate hydrolysis, lack of growth at
37 6C, growth in 2% (w/v) NaCl, growth on 0.1% sodium deoxycholate and non-supplemented
Campylobacter charcoal-deoxycholate base medium and resistance to cephalothin (32 mg l”1)
and cefoperazone (64 mg l”1). Additionally, a PCR assay was developed for the detection and
identification of strains 64T and 122, which represent a novel species of the genus Arcobacter, for
which the name Arcobacter trophiarum sp. nov. is proposed. The type strain is strain 64T (5LMG
25534T 5CCUG 59229T).
ในช่วงของการศึกษาที่ตามยาวสถานะที่ Dynamics ของ arcobacter ประชากรในสุกร,
16 แยกของกรัม - ปฏิกริยา - ลบ,ไม้ - รูปทรง,ความโค้งเล็กน้อยและไม่มีสปอร์ - สร้างแบคทีเรีย
ซึ่งจะช่วยได้จัดกลุ่มตามความยาว polymorphism สักเท่าไหร่แอมพลิฟายในการวิเคราะห์ที่ชัดเจน phenon ภายใน
ซึ่งจะช่วยให้พืช arcobacter . เศษถูกสร้างขึ้นสำหรับแยกทั้งหมดในสอบ pcr กะ - เฉพาะที่
แต่ไม่มี amplicon ได้ในการทดสอบสายพันธุ์ - เฉพาะแบบมัลติเพล็กซ์ - pcr ที่ การวิเคราะห์ตัวเลขของส่วนกำหนดค่าโปรตีน
ทั้งหมด - บริการข้อมูลของสถานีฐานที่ยังพบว่าทั้งหมดแยกกระจัดกระจายอยู่ในกลุ่มเดียวกันที่
แตกต่างจากสมาชิกที่เกี่ยวข้องของพืชที่ arcobacter hybridizations ดีเอ็นเอ - ดีเอ็นเอระหว่างพันธุ์สอง
ตัวแทนที่ได้รับมอบหมาย 64 T และ 122 จากที่แยกได้รับมาดีเอ็นเอว่า -
relatedness ดีเอ็นเอของ 72% . hybridizations ดีเอ็นเอ - ดีเอ็นเอระหว่าง arcobacter พันธุ์ 64 T และ 122 และการอ้างอิง
ซึ่งจะช่วยด้านพันธุ์สัตว์ของเชื้อแบคทีเรียที่เกี่ยวข้องกับพืชอื่นๆในที่เปิดเผยค่ามีผลผูกพันของ 47%
หรือน้อยกว่า ดีเอ็นเอ G C เนื้อหาของสองพันธุ์ตัวแทนที่เป็น 28.5 และ Website : www . mol : 28.4%
ตามลำดับและการวิเคราะห์ของสามยีนเครื่องหมายระบุ arcobacter cryaerophilus thereius A .
A . cibarius และ A .skirrowii เป็นเพื่อนบ้าน phylogenetic อยู่ใกล้ที่สุดของพวกเขา พันธุ์ 64 T และ 122 ไม่สามารถ
ซึ่งจะช่วยได้แยกจากกันสมาชิกของกะ arcobacter โดยการใช้การทดสอบทางชีวเคมี
catalase urease และกิจกรรม,ดินประสิวลดลง, indoxyl หลักด้วยเช่นอะคีเทต,ขาดการขยายตัวที่
376 c ,การขยายตัวใน 2% ( w / v ) NaCl ,การขยายตัวที่ 0.1% โซเดียม deoxycholate และไม่เสริม
การต่อต้านและขนาดกลางฐานสีเทาเข้ม - deoxycholate ถึงความเจ็บไข้ได้ป่วยสาเหตุมาเพื่อ cephalothin ( 32 L มก." 1 )
และ cefoperazone ( 64 มก. L " 1 ) นอกจากนี้ยังพยายาม pcr ซึ่งได้รับการพัฒนาขึ้นสำหรับการตรวจจับและการระบุตัวตนที่
ซึ่งจะช่วยในด้านพันธุ์ 64 T และ 122 ซึ่งเป็นตัวแทน arcobacter สายพันธุ์ของพืชที่ใหม่ที่สำหรับ
ซึ่งจะช่วยซึ่งพ.ย. trophiarum arcobacter sp .ชื่อนี้ได้.เสนอ ดึงพิมพ์ที่เป็นสายพันธุ์ 64 t ( 5 แอลเอ็มจี
ตามมาตรฐาน25534 T 5 CCUG )ทัน 59229 T )
การแปล กรุณารอสักครู่..