peptide mass fingerprinting (http:/

peptide mass fingerprinting (http://www.matrixscience.com/cgi/search_form.pl
?FORMVER=2&SEARCH=PMF), a search engine that employs MS data to identify proteins
from the NCBInr database. The taxonomy for these searcheswas limited to Rattus
norvegicus. The database allowed up to one missed cleavage, and the mass tolerance
was set as 75 ppm peptide limited by fixed modification of carbamidomethyl
and variable modification of oxidation with monoisotopic values. Mascot reported
the molecular weight search (MOWSE) score, which is calculated by −10 × log10 (P),
where P is the probability that the observed match is a random event. The p value
is limited by the size of the sequence database being searched (limited by taxonomy),
the conditions, and the settings of the trypsin digestion. Each calculated value
that falls within a given mass tolerance of an experimental value counts as a match.
The accepted threshold is that an event is significant when it would be expected
to occur at random with a frequency of 61 was regarded as significant

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

peptide mass fingerprinting (http://www.matrixscience.com/cgi/search_form.pl?FORMVER=2&SEARCH=PMF), a search engine that employs MS data to identify proteinsfrom the NCBInr database. The taxonomy for these searcheswas limited to Rattusnorvegicus. The database allowed up to one missed cleavage, and the mass tolerancewas set as 75 ppm peptide limited by fixed modification of carbamidomethyland variable modification of oxidation with monoisotopic values. Mascot reportedthe molecular weight search (MOWSE) score, which is calculated by −10 × log10 (P),where P is the probability that the observed match is a random event. The p valueis limited by the size of the sequence database being searched (limited by taxonomy),the conditions, and the settings of the trypsin digestion. Each calculated valuethat falls within a given mass tolerance of an experimental value counts as a match.The accepted threshold is that an event is significant when it would be expectedto occur at random with a frequency of <5%. In this study, a protein match with ascore of >61 was regarded as significant

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

เปปไทด์ลายนิ้วมือมวล (http://www.matrixscience.com/cgi/search_form.pl
? FORMVER = 2 & Search = PMF) ซึ่งเป็นเครื่องมือค้นหาที่ใช้ข้อมูล MS เพื่อระบุโปรตีน
จากฐานข้อมูล NCBInr อนุกรมวิธานสำหรับ searcheswas เหล่านี้ จำกัด ให้ Rattus
norvegicus ฐานข้อมูลที่ได้รับอนุญาตถึงหนึ่งที่ไม่ได้รับความแตกแยกและความอดทนมวล
ได้รับการกำหนดให้เป็นเปปไทด์ 75 พีพีเอ็ม จำกัด โดยการปรับเปลี่ยนคงที่ของ carbamidomethyl
และการเปลี่ยนแปลงตัวแปรของการเกิดออกซิเดชันที่มีค่า monoisotopic มิ่งขวัญรายงาน
การค้นหาที่มีน้ำหนักโมเลกุล (MOWSE) คะแนนซึ่งคำนวณโดย -10 × log10 (P),
ที่ P คือความน่าจะเป็นที่สังเกตเห็นการจับคู่เป็นเหตุการณ์สุ่ม ค่าพี
ถูก จำกัด ด้วยขนาดของฐานข้อมูลลำดับการค้นหา (จำกัด ตามอนุกรมวิธาน)
เงื่อนไขและการตั้งค่าของการย่อยอาหาร trypsin แต่ละค่าคำนวณ
ที่อยู่ภายในความอดทนมวลที่กำหนดของการนับมูลค่าการทดลองขณะที่การแข่งขัน.
เกณฑ์ได้รับการยอมรับว่าเป็นเหตุการณ์ที่มีความสำคัญเมื่อมันจะคาดว่า
จะเกิดขึ้นโดยการสุ่มกับความถี่ของ <5% ในการศึกษานี้ตรงกับโปรตีนที่มี
คะแนน> 61 ได้รับการยกย่องเป็นอย่างมีนัยสำคัญ

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

เปปไทด์มวลพิมพ์ลายนิ้วมือ ( http : / / www.matrixscience . com / cgi / search_form . PL
? formver = 2 &ค้นหา = PMF ) , เครื่องมือค้นหาที่ใช้ MS ข้อมูลระบุโปรตีน
จาก ncbinr ฐานข้อมูล อนุกรมวิธานสำหรับ searcheswas กัดตัว
norvegicus . ฐานข้อมูลอนุญาตถึงพลาดหนึ่งตัว และมวลความอดทน
ถูกตั้งค่าเป็น 75 ppm เปปไทด์ จำกัด โดยแก้ไขปรับเปลี่ยน carbamidomethyl
และการปรับเปลี่ยนตัวแปรของการออกซิเดชันด้วยค่า monoisotopic . สำหรับรายงาน
ค้นหาน้ำหนักโมเลกุล ( mowse ) คะแนน ซึ่งคำนวณโดย− 10 × LN ( P )
ที่ p คือความน่าจะเป็นที่สังเกตตรงเป็นเหตุการณ์สุ่ม ส่วนค่า P
ถูกจำกัดด้วยขนาดของลำดับฐานข้อมูลการค้นหา ( จำกัดโดยอนุกรมวิธาน )
เงื่อนไข , และการตั้งค่าของเอนไซม์ย่อยอาหารแต่ละคำนวณค่า
ที่อยู่ภายในให้สื่อมวลชนทดลองความอดทนของมูลค่านับเป็นการแข่งขัน
ยอมรับเกณฑ์คือเหตุการณ์สำคัญที่คาดว่าจะเกิดขึ้น
สุ่มด้วยความถี่ < 5 % ในการศึกษานี้ ตรงกับโปรตีนกับ
คะแนน > 61 ถือเป็นอย่างมีนัยสำคัญ