To investigate genetic relatedness

To investigate genetic relatedness among different H. acinonychis isolates, we compared 16S rRNA genes and RAPD fingerprint typing patterns of our five isolates (SB-1 and SB-5) with those of two other H. acinonychis strains from a Sumatran tiger maintained in captivity in a German zoo [61]. RFLP of the 16S rRNA PCR products yielded identical fragment patterns (Fig. S4A–D). The nucleotide sequence of the 16S rRNA gene was also highly similar between isolates from Bengal and Sumatran tigers (accession number AF057163) (Fig. 3, bottom). Thus, we next scored RAPD fingerprint patterns, which are more effective than the focused analysis of individual genes at discriminating between related strains. The RAPD patterns were also almost identical between our five strains and those from the Bengal and Sumatran tigers (Fig. S5A–C), indicating that very closely related H. acinonychis strains have colonized different tiger subspecies from very different geographic locations.

Next, we compared the RAPD fingerprint patterns of our H. acinonychis strain SB-1 with those of strains from other big cats: namely three cheetahs from a US zoo, two lions, one lion-tiger hybrid and another tiger housed at a European circus (Table 1). The results show that the fingerprinting patterns of our isolates from the Bengal tiger are also very similar to those of the cheetah and lion isolates, which were categorised in group I [33], while are distinct from those of the lion-tiger hybrid and other tiger isolates, classified as group II H. acinonychis (Fig. 4C and Fig. S6A–C) [33].

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

การสอบสวน relatedness พันธุกรรมระหว่าง H. แตกแยก acinonychis เราเปรียบเทียบยีน 16S rRNA และ RAPD ลายพิมพ์รูปแบบของเราห้าแยก (SB 1 และ SB-5) กับของสอง H. acinonychis สายพันธุ์อื่น ๆ จากเสือสุมาตราที่รักษาในกรงเลี้ยงในสวนสัตว์เยอรมัน [61] RFLP ของ 16S rRNA PCR ผลิตภัณฑ์ให้ผลเหมือนกันส่วนรูป (มะเดื่อ S4A–D) ลำดับนิวคลีโอไทด์ยีน 16S rRNA ก็คล้ายกันสูงระหว่างที่แยกได้จากเสือเบงกอลและสุมาตรา (เลขทะเบียน AF057163) (รูป 3 ล่าง) ดังนั้น เราถัดไปประตูลายลาย RAPD ซึ่งมีประสิทธิภาพมากกว่าการวิเคราะห์เน้นของแต่ละยีนที่เหยียดพวกผิวระหว่างสายพันธุ์ที่เกี่ยวข้อง รูปแบบอาร์เอพีดีก็เหมือนกับสายพันธุ์ของเราห้าจากเสือเบงกอลและสุมาตรา (มะเดื่อ S5A–C), ระบุว่า H. acinonychis สายพันธุ์ที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดมี colonized ชนิดย่อยของเสือที่แตกต่างจากตำแหน่งที่ตั้งทางภูมิศาสตร์ที่แตกต่างกันมากถัดไป เราสามารถเปรียบเทียบรูปแบบของลายนิ้วมือ RAPD ของสายพันธุ์ของเรา acinonychis H. SB-1 กับของสายพันธุ์จากแมวใหญ่อื่น ๆ: ได้แก่สามเสือชีตาห์ จากสวนสัตว์สหรัฐฯ สิงโตสอง ไฮบริสิงโตเสือหนึ่งเสืออื่นณโรงละครสัตว์ในยุโรป (ตารางที่ 1) ผลแสดงว่า รูปแบบการ fingerprinting ของเราแยกจากเบงกอลที่มีลักษณะคล้ายกับของเสือชีต้าและสิงโตแยก เสือซึ่งถูกจัดหมวดหมู่ในกลุ่ม [33], ในขณะที่จะแตกต่างจากไฮบริสิงโตเสือและอื่น ๆ เสือแยก จัดเป็นกลุ่ม acinonychis II H. (รูปที่ 4C และมะเดื่อ S6A–C) [33]

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

เพื่อตรวจสอบความสัมพันธ์ทางพันธุกรรมของที่แตกต่างกันเอชไอโซเลท acinonychis เราเมื่อเทียบกับยีน 16S rRNA และ RAPD รูปแบบลายนิ้วมือพิมพ์ห้าสายพันธุ์ของเรา (SB-1 และ SB-5) กับของอีกสองสายพันธุ์เอช acinonychis จากเสือสุมาตราเก็บรักษาไว้ในกรง ในสวนสัตว์เยอรมัน [61] RFLP ของผลิตภัณฑ์ 16S rRNA PCR ให้ผลรูปแบบชิ้นส่วนที่เหมือนกัน (รูป. S4A-D) ลำดับเบสของยีน 16S rRNA ก็ยังคล้ายกันอย่างมากระหว่างสายพันธุ์จากเบงกอลเสือโคร่งสุมาตรา (ภาคยานุวัติจำนวน AF057163) (รูปที่ 3. ด้านล่าง) ดังนั้นเราจึงทำแต้ม RAPD รูปแบบลายนิ้วมือซึ่งมีประสิทธิภาพมากกว่าการวิเคราะห์เน้นของยีนของแต่ละบุคคลที่แบ่งแยกระหว่างสายพันธุ์ที่เกี่ยวข้องต่อไป รูปแบบดีเอ็นเอก็มีเกือบจะเหมือนกันระหว่างห้าสายพันธุ์และผู้ที่มาจากเบงกอลเสือโคร่งสุมาตรา (รูป. S5A-C) ของเราแสดงให้เห็นว่าที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดเอช acinonychis สายพันธุ์ที่มีอาณานิคมเสือย่อยที่แตกต่างจากที่ตั้งทางภูมิศาสตร์ที่แตกต่างกันมาก. ต่อไปเรา เมื่อเทียบกับรูปแบบดีเอ็นเอลายนิ้วมือของเอชของเรา acinonychis ความเครียด SB-1 กับบรรดาสายพันธุ์จากแมวใหญ่อื่น ๆ : คือสามเสือชีตาห์จากสวนสัตว์สหรัฐสิงโตสองตัวไฮบริดหนึ่งสิงโตเสือและเสืออีกตั้งอยู่ที่วงเวียนยุโรป (ตารางที่ 1 ) ผลการศึกษาพบว่ารูปแบบการพิมพ์ลายนิ้วมือของเชื้อของเราจากเสือโคร่งนี้ยังมีลักษณะคล้ายกันมากกับของเสือชีตาห์และสิงโตแยกซึ่งถูกแบ่งออกเป็นกลุ่มที่ [33] ในขณะที่มีความแตกต่างจากบรรดาไฮบริดสิงโตเสือและอื่น ๆ เสือแยกจำแนกเป็นกลุ่มที่สองเอช acinonychis (รูป. 4C และรูป. S6a-C) [33]

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ศึกษาสัมพันธ์ทางพันธุกรรมของสายพันธุ์ที่แตกต่างกัน . acinonychis เราเทียบเบส 16S rRNA ยีนและลายนิ้วมือที่พิมพ์ด้วยรูปแบบของเรา 5 ไอโซเลต ( sb-1 และ sb-5 ) กับพวกอีกสองชั่วโมง acinonychis สายพันธุ์จากสุมาตราเสือไว้เป็นเชลยในเยอรมันสวนสัตว์ [ 61 ] รวมของผลิตภัณฑ์รูปแบบเบส 16S rRNA PCR ให้ผลออกมาเหมือนกัน ( รูปที่ s4a ( D ) จากลำดับนิวคลีโอไทด์ของยีน 16S rRNA เป็นอย่างสูงที่คล้ายคลึงกันระหว่างไอโซเลตจากเบงกอล และสุมาตราเสือ ( หมายเลขภาคยานุวัติ af057163 ) ( รูปที่ 3 ด้านล่าง ) ดังนั้น เราต่อไปได้ด้วยลายนิ้วมือแบบ ซึ่งจะมีประสิทธิภาพมากกว่าเน้นการวิเคราะห์ยีนแต่ละตัวที่จำแนกระหว่างสายพันธุ์ ด้วยลวดลายที่ยังเกือบจะเหมือนกันระหว่างห้าสายพันธุ์ของเรา และ จาก เสือเบงกอล และกระซู่ ( รูปที่ s5a ( C ) แสดงว่าที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิด . acinonychis สายพันธุ์ชนิดย่อยมีเมืองขึ้นเสือแตกต่างจากแตกต่างกันมากทางภูมิศาสตร์สถานที่ต่อไปเราเทียบลายนิ้วมือด้วยรูปแบบของเรา . acinonychis เมื่อย sb-1 ที่มีสายพันธุ์แมวใหญ่อื่น ๆคือ สามเสือจากสวนสัตว์เราสิงโตสิงโตลูกผสม 2 , เสือและเสืออีกตัวที่ละครที่ยุโรป ( ตารางที่ 1 ) ผลการวิจัยพบว่า รูปแบบของลายพิมพ์ดีเอ็นเอของเราแยกจากเสือโคร่งจะคล้ายกันมากกับที่ของเสือและสิงโตสายพันธุ์ซึ่งถูกแบ่งในกลุ่มฉัน [ 33 ] , ในขณะที่จะแตกต่างจากพวกสิงโต เสือ และเสืออื่น ๆลูกผสมสายพันธุ์แบ่งเป็น กลุ่ม เอช acinonychis ( ภาพที่ 4C และมะเดื่อ s6a ( c ) [ 33 ]