Fungi are an important source of en

Fungi are an important source of enzymes for saccharification of plant polysaccharides and production of
biofuels. Understanding of the regulation and induction of expression of genes encoding these enzymes
is still incomplete. To explore the induction mechanism, we analysed the response of the industrially
important fungus Aspergillus niger to wheat straw, with a focus on events occurring shortly after exposure
to the substrate. RNA sequencing showed that the transcriptional response after 6 h of exposure to wheat
straw was very different from the response at 24 h of exposure to the same substrate. For example, less than
half of the genes encoding carbohydrate active enzymes that were induced after 24 h of exposure to wheat
straw, were also induced after 6 h exposure. Importantly, over a third of the genes induced after 6 h of exposure
to wheat straw were also induced during 6 h of carbon starvation, indicating that carbon starvation is
probably an important factor in the early response to wheat straw. The up-regulation of the expression of a
high number of genes encoding CAZymes that are active on plant-derived carbohydrates during early carbon
starvation suggests that these enzymes could be involved in a scouting role during starvation, releasing
inducing sugars from complex plant polysaccharides. We show, using proteomics, that carbon-starved cultures
indeed release CAZymes with predicted activity on plant polysaccharides. Analysis of the enzymatic
activity and the reaction products, indicates that these proteins are enzymes that can degrade various plant
polysaccharides to generate both known, as well as potentially new, inducers of CAZymes.
2014 The Authors. Published by Elsevier Inc. This is an open access article under the CC BY license

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

เชื้อราจะเป็นแหล่งที่สำคัญของเอนไซม์ saccharification ของสารพืชและผลิตเชื้อเพลิงชีวภาพ เข้าใจกฎระเบียบและการเหนี่ยวนำในการแสดงออกของยีนเอนไซม์เหล่านี้เข้ารหัสยังไม่สมบูรณ์ การสำรวจกลไกการเหนี่ยวนำ เราวิเคราะห์การตอบสนองของการทัดสำคัญเชื้อรา Aspergillus ไนเจอร์กับฟางข้าวสาลี กับเหตุการณ์ที่เกิดขึ้นหลังจากสัมผัสพื้นผิว RNA ลำดับแสดงให้เห็นว่าการตอบสนอง transcriptional หลัง 6 ชม.ของการสัมผัสกับข้าวสาลีฟางถูกแตกต่างจากการตอบสนองที่ 24 ชม.ของการสัมผัสกับพื้นผิวเดียวกัน ตัวอย่างเช่น น้อยกว่าครึ่งหนึ่งของยีนเข้ารหัสใช้งานเอนไซม์คาร์โบไฮเดรตที่ได้หลังจาก 24 ชม.ของการสัมผัสกับข้าวสาลีฟาง นำหลังจาก 6 ชม. สำคัญ มากกว่าหนึ่งในสามของยีนที่เกิดหลังจาก 6 ชม.ของการสัมผัสการฟางข้าวสาลียังนำระหว่าง 6 h ของคาร์บอนความอดอยาก แสดงว่า คาร์บอนอดอยู่อาจจะเป็นปัจจัยสำคัญในการตอบสนองก่อนที่ฟางข้าวสาลี การควบคุมค่าของนิพจน์ของการจำนวนยีนเข้ารหัส CAZymes ที่ใช้งานอยู่บนได้มาจากพืชคาร์โบไฮเดรตระหว่างคาร์บอนต้น สูงอดแสดงให้เห็นว่า เอนไซม์เหล่านี้สามารถมีส่วนร่วมทำหน้าที่สอดแนมระหว่างความอดอยาก ปล่อยกระตุ้นให้เกิดน้ำตาลจากพืชซับซ้อนไรด์ เราแสดง ใช้โปรตีโอมิกส์ ที่คาร์บอน starved วัฒนธรรมแน่นอนปล่อย CAZymes มีกิจกรรมที่คาดการณ์บนพืชไรด์ วิเคราะห์การที่เอนไซม์กิจกรรมและผลิตภัณฑ์ปฏิกิริยา บ่งชี้ว่า โปรตีนเหล่านี้เป็นเอนไซม์ที่สามารถย่อยสลายพืชต่าง ๆไรด์เพื่อสร้างทั้งสองรู้จักกัน เป็น ใหม่อาจ inducers CAZymes 2014 ผู้เขียน เผยแพร่ โดย Elsevier อิงค์ บทความเปิดเข้าภายใต้ใบอนุญาตโดย CC

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

เชื้อราเป็นแหล่งสำคัญของเอนไซม์สำหรับ saccharification ของ polysaccharides โรงงานและการผลิต
เชื้อเพลิงชีวภาพ ความเข้าใจในการควบคุมและการชักนำของการแสดงออกของยีนเอนไซม์เหล่านี้
ยังคงไม่สมบูรณ์ การสำรวจกลไกเหนี่ยวนำเราวิเคราะห์การตอบสนองของอุตสาหกรรม
สำคัญเชื้อรา Aspergillus ไนเจอร์ฟางข้าวสาลีให้ความสำคัญกับเหตุการณ์ที่เกิดขึ้นไม่นานหลังจากที่สัมผัส
กับพื้นผิว RNA ลำดับแสดงให้เห็นว่าการตอบสนองการถอดรหัสหลังจาก 6 ชั่วโมงจากการสัมผัสกับข้าวสาลี
ฟางแตกต่างอย่างมากจากการตอบสนองเวลา 24 ชั่วโมงจากการสัมผัสกับสารตั้งต้นเดียวกัน ยกตัวอย่างเช่นน้อยกว่า
ครึ่งหนึ่งของยีนที่เข้ารหัสเอนไซม์ที่ใช้งานคาร์โบไฮเดรตที่ถูกเหนี่ยวนำให้เกิดหลังจาก 24 ชั่วโมงของการสัมผัสกับข้าวสาลี
ฟางก็ถูกเหนี่ยวนำให้เกิดหลังจากการสัมผัส 6 ชั่วโมง ที่สำคัญกว่าหนึ่งในสามของยีนที่เหนี่ยวนำให้เกิดหลังจาก 6 ชั่วโมงของการเปิดรับ
ฟางข้าวสาลียังถูกเหนี่ยวนำให้เกิดในช่วง 6 ชั่วโมงจากความอดอยากคาร์บอนแสดงให้เห็นว่าความอดอยากคาร์บอน
อาจจะเป็นปัจจัยสำคัญในการตอบสนองเร็วฟางข้าวสาลี ขึ้นการควบคุมการแสดงออกของการเป็น
จำนวนมากของยีนที่ควบคุมการ CAZymes ที่มีใช้งานอยู่บนคาร์โบไฮเดรตได้มาจากพืชในช่วงต้นคาร์บอน
อดอยากแสดงให้เห็นว่าเอนไซม์เหล่านี้อาจจะมีส่วนร่วมในบทบาทหัวเราะเยาะในช่วงอดอยากปล่อย
น้ำตาลชักนำจาก polysaccharides พืชที่ซับซ้อน เราจะแสดงโดยใช้โปรตีนที่วัฒนธรรมคาร์บอนหิวโหย
แน่นอนปล่อย CAZymes ด้วยกิจกรรมที่คาดการณ์ไว้ใน polysaccharides พืช การวิเคราะห์เอนไซม์
กิจกรรมและผลิตภัณฑ์ปฏิกิริยาแสดงให้เห็นว่าโปรตีนเหล่านี้มีเอนไซม์ที่สามารถย่อยสลายพืชต่างๆ
polysaccharides ที่จะสร้างทั้งที่รู้จักกันเช่นเดียวกับที่อาจเกิดขึ้นใหม่ปฏิกิริยาของ CAZymes.
2014 ผู้เขียน เผยแพร่โดยเอลส์อิงค์นี้เป็นบทความการเข้าถึงเปิดภายใต้สัญญาอนุญาตของ CC