(i)(ii)(iii) (iv)(v)DATA is a gene

(i)
(ii)
(iii) (iv)
(v)
DATA is a gene expression data matrix with samples in columns. The first row contains the information of the experimental condition of each sample. The remaining rows contain gene expression.
GS is a binary matrix coded 0 or 1 with genes in rows. Each column represents a predefined gene set, with row equal to 1 indicating that the gene is in the gene set, and 0 otherwise.
Alpha is the significance level.
nbPerm specifies the number of permutations, and at
least 5,000 is recommended.
MCP specifies one of three multiple comparison methods, Dunnett = 1, Tukey = 2, and sequential pairwise comparison = 3. MCP can be ignored when the number of experimental conditions is 2.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

(i)(ii)(iii) (iv)(v)ข้อมูลเมตริกซ์ข้อมูลนิพจน์ยีน ด้วยตัวอย่างในคอลัมน์ได้ แถวแรกประกอบด้วยรายละเอียดของเงื่อนไขการทดลองของแต่ละอย่าง แถวที่เหลือประกอบด้วยยีนGS เป็นไบนารีเมทริกซ์รหัส 0 หรือ 1 ด้วยยีนในแถว แต่ละคอลัมน์แสดงถึงชุดยีนที่กำหนดไว้ล่วงหน้า แถวเท่ากับ 1 แสดงที่ยีนอยู่ในชุดยีน และอื่น ๆ 0อัลฟ่าระดับนัยสำคัญได้nbPerm ระบุหมายเลขสับ และที่ขอแนะนำให้อย่างน้อย 5000MCP ระบุหนึ่งในสามวิธีเปรียบเทียบหลาย Dunnett = 1, Tukey = 2 และตามลำดับเปรียบเทียบแพร์ไวส์ = 3 MCP สามารถละเว้นได้เมื่อจำนวนเงื่อนไขทดลอง 2

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

(i)
(ii)
(iii) (iv)
(V)
ข้อมูลเป็นเมทริกซ์ข้อมูลการแสดงออกของยีนที่มีตัวอย่างในคอลัมน์ แถวแรกมีข้อมูลของสภาพการทดลองของกลุ่มตัวอย่างแต่ละ แถวที่เหลือมีการแสดงออกของยีน.
GS เป็นเมทริกซ์รหัสไบนารี 0 หรือ 1 กับยีนในแถว คอลัมน์แต่ละชุดของยีนที่กำหนดไว้ล่วงหน้ากับแถวเท่ากับ 1 แสดงให้เห็นว่ายีนที่อยู่ในชุดของยีนและ 0 เป็นอย่างอื่น.
อัลฟาเป็นระดับความสำคัญ.
nbPerm
ระบุจำนวนของพีชคณิตและในน้อย5,000 ขอแนะนำ.
MCP ระบุหนึ่ง สามวิธีการเปรียบเทียบหลาย Dunnett = 1 Tukey = 2 และลำดับการเปรียบเทียบจากจำนวน = 3 MCP สามารถปฏิเสธเมื่อจำนวนของเงื่อนไขการทดลองคือ 2

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

( ผม )

( 2 ) ( 3 ) ( 4 ) ( 5 )

ข้อมูลเป็นข้อมูลการแสดงออกของยีนเมทริกซ์ตัวอย่าง ในคอลัมน์ แถวแรกมีรายละเอียดของเงื่อนไขการทดลองของแต่ละตัวอย่าง แถวที่เหลือมีการแสดงออกของยีน
GS เป็นเมทริกซ์ที่ไบนารีรหัส 0 หรือ 1 กับยีนในแถว แต่ละคอลัมน์เป็นยีนที่กำหนดไว้ล่วงหน้าชุด กับแถวเท่ากับ 1 แสดงว่ายีนเป็นยีนที่กำหนดไว้และ 0
มิฉะนั้น .เราเป็นระดับความสำคัญ .
nbperm ระบุหมายเลขลำดับ และอย่างน้อย 5 , 000 แนะนำ
.
MCP ระบุหนึ่งจากสามวิธีเปรียบเทียบหลาย Dunnett = 1 คู่ = 2 , และลำดับขั้นตอนการเปรียบเทียบ = 3 MCP สามารถถูกละเว้น เมื่อตัวเลขของเงื่อนไขการทดลองเป็น 2