The diversity of the predominant ba

The diversity of the predominant bacteria in the human gastrointestinal tract was studied by using 16S
rRNA-based approaches. PCR amplicons of the V6 to V8 regions of fecal 16S rRNA and ribosomal DNA
(rDNA) were analyzed by temperature gradient gel electrophoresis (TGGE). TGGE of fecal 16S rDNA amplicons
from 16 individuals showed different profiles, with some bands in common. Fecal samples from two
individuals were monitored over time and showed remarkably stable profiles over a period of at least 6 months.
TGGE profiles derived from 16S rRNA and rDNA amplicons showed similar banding patterns. However, the
intensities of bands with similar mobilities differed in some cases, indicating a different contribution to the
total active fraction of the prominent fecal bacteria. Most 16S rRNA amplicons in the TGGE pattern of one
subject were identified by cloning and sequence analysis. Forty-five of the 78 clones matched 15 bands, and 33
clones did not match any visible band in the TGGE pattern. Nested PCR of amplified 16S rDNA indicated
preferential amplification of a sequence corresponding to 12 of the 33 nonmatching clones with similar
mobilities in TGGE. The sequences matching 15 bands in the TGGE pattern showed 91.5 to 98.7% homology
to sequences derived from different Clostridium clusters. Most of these were related to strains derived from the
human intestine. The results indicate that the combination of cloning and TGGE analysis of 16S rDNA
amplicons is a reliable approach to monitoring different microbial communities in feces.

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ความหลากหลายของเชื้อแบคทีเรียที่โดดเด่นในทางเดินอาหารของมนุษย์ได้รับการศึกษาโดยใช้ 16S
วิธี rRNA ตาม PCR amplicons ของ V6 เพื่อภูมิภาค V8 ของ 16S rRNA อุจจาระและดีเอ็นเอไรโบโซม
(rDNA) ได้รับการวิเคราะห์โดยอุณหภูมิลาดข่าวคราว (TGGE) TGGE ของอุจจาระ 16S rDNA amplicons
จาก 16 บุคคลที่แสดงให้เห็นรูปแบบที่แตกต่างกันกับวงดนตรีที่บางส่วนในการร่วมกัน ตัวอย่างอุจจาระจากสองบุคคลที่ถูกตรวจสอบเมื่อเวลาผ่านไปและแสดงให้เห็นรูปแบบที่มีเสถียรภาพอย่างน่าทึ่งในช่วงเวลาอย่างน้อย 6 เดือน. โปรไฟล์ TGGE มาจาก 16S rRNA และ amplicons rDNA แสดงให้เห็นรูปแบบแถบที่คล้ายกัน อย่างไรก็ตามความเข้มของวงดนตรีที่มีเคลื่อนที่ที่คล้ายกันแตกต่างกันในบางกรณีแสดงให้เห็นผลงานที่แตกต่างกันไปส่วนที่ใช้งานทั้งหมดของแบคทีเรียในอุจจาระที่โดดเด่น ส่วนใหญ่ 16S rRNA amplicons ในรูปแบบ TGGE หนึ่งเรื่องที่ถูกระบุโดยการโคลนและวิเคราะห์ลำดับ สี่สิบห้าของ 78 โคลนจับคู่วงดนตรีที่ 15 และ 33 โคลนไม่ตรงกับวงดนตรีที่มองเห็นใด ๆ ในรูปแบบ TGGE ที่ซ้อนกัน PCR ของ 16S rDNA ขยายชี้ให้เห็นการขยายสิทธิพิเศษลำดับที่สอดคล้องกันถึง 12 จาก 33 โคลน nonmatching คล้ายกับเคลื่อนที่ในTGGE ลำดับที่ตรงกับ 15 วงดนตรีในรูปแบบ TGGE แสดงให้เห็นว่าการที่คล้ายคลึงกัน 91.5 98.7% ลำดับที่ได้มาจากกลุ่ม Clostridium ที่แตกต่างกัน ส่วนใหญ่เหล่านี้มีความสัมพันธ์กับสายพันธุ์ที่ได้มาจากลำไส้ของมนุษย์ ผลการศึกษาพบว่าการรวมกันของการโคลนและการวิเคราะห์ TGGE ของ 16S rDNA amplicons เป็นวิธีการที่น่าเชื่อถือในการตรวจสอบกลุ่มจุลินทรีย์ที่แตกต่างกันในอุจจาระ

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ความหลากหลายของแบคทีเรียในระบบทางเดินอาหารของมนุษย์โดดโดยใช้ 16S rRNA
ตามแนว PCR amplicons ของ V6 V8 ของ 16S rRNA ในภูมิภาคและดีเอ็นเอ ( rDNA Protein )
) โดยใช้อุณหภูมิลาด gel electrophoresis ( tgge ) tgge ขี้ 16S rDNA amplicons
จาก 16 บุคคลที่มีโปรไฟล์ที่แตกต่างกัน บางวงเหมือนกัน10 ตัวอย่างจากบุคคลสองคน
ได้ตรวจสอบตลอดเวลา และพบโปรไฟล์อย่างคงที่ตลอดระยะเวลาอย่างน้อย 6 เดือน tgge 16S rRNA
โปรไฟล์มาจากและ amplicons rDNA พบคล้ายแถบลวดลาย อย่างไรก็ตาม
เข้มวง mobilities คล้ายคลึงกันในบางกรณี แสดงผลงานที่แตกต่างกัน
ส่วนการใช้งานทั้งหมดของเด่นที่เติมแบคทีเรีย ( ส่วนใหญ่สร้างขึ้นในรูปแบบของ amplicons tgge เรื่องหนึ่ง
ถูกระบุโดยการโคลนและวิเคราะห์ลำดับ สี่สิบห้าของ 78 โคลนกับ 15 วง และ 33
โคลนไม่ตรงกับวงดนตรีที่มองเห็นใด ๆ ใน tgge แบบแผน ที่ซ้อนกันของ 16S rDNA พบ
ขยาย PCRแบบพิเศษของลำดับที่ 12 ของ 33 nonmatching โคลน mobilities คล้ายกัน
ใน tgge . ลำดับ 15 วงที่ตรงกันใน tgge แบบแผนพบ 91.5 ถึง 98.7% เป็นลำดับ
จะมาจากกลุ่ม Clostridium แตกต่างกัน ส่วนใหญ่เหล่านี้มีความสัมพันธ์กับสายพันธุ์ที่ได้มาจาก
ลำไส้ของมนุษย์ผลการศึกษาพบว่า การรวมกันของการโคลนและการวิเคราะห์ tgge ของ 16S rDNA
amplicons เป็นวิธีที่เชื่อถือได้เพื่อตรวจสอบจุลินทรีย์ต่าง ๆในชุมชน
อุจจาระ