Nineteen SSR primers (Mir et al., 2

Nineteen SSR primers (Mir et al., 2008, 2009) were used for screening eight genotypes of both species of jute. Of these, six SSR primers (Table 2) produced clear polymorphic bands in this study. PCR reactions were performed in 10 μL reaction volumes containing approximately 20 ng of jute template DNA, 1X PCR buffer [(750 mM Tris-HCl (pH 8.8 at 25°C), 200 mM (NH4)2SO4 0.1% (v/v)], 1.5 mM MgCl2, 0.1 mM dNTPs, 0.5 μM of each primer and 0.3 unit of Taq DNA polymerase (Fermentas; Burlington, Ontario Canada). The reaction mixture was subjected to PCR amplification in a T1 Thermocycler (Biometra; Goettingen, Germany) using a PCR program of: preheating for 2 min at 94 °C; 30 cycles, each for 30 s at 94 °C (denaturation), 30 s at the annealing temperature of a particular primer pair (ranges were 56–60 °C), and 30 s at 72 °C for 1 min (extension) and a final extension at 72 °C for 5 min followed by cooling at 16 °C for an indefinite time.

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ไพรเมอร์เก้า SSR (Mir et al., 2008, 2009) ถูกนำมาใช้สำหรับการคัดกรองแปดยีนของทั้งสองสายพันธุ์ของปอกระเจา ของเหล่านี้หก SSR ไพรเมอร์ (ตารางที่ 2) วงดนตรีที่ผลิต polymorphic ที่ชัดเจนในการศึกษานี้ ปฏิกิริยา PCR ได้ดำเนินการในปริมาณปฏิกิริยา 10 ไมโครลิตรที่มีประมาณ 20 NG ดีเอ็นเอปอแม่ 1X PCR บัฟเฟอร์ [(750 มิลลิ Tris-HCl (pH 8.8 ที่ 25 ° C) 200 มิลลิเมตร (NH4) 2SO4 0.1% (v / v) ] 1.5 มิลลิ MgCl2 0.1 มิลลิ dNTPs, 0.5 ไมครอนของแต่ละไพรเมอร์และ 0.3 หน่วย Taq DNA Polymerase. (Fermentas; เบอร์ลิงตันนแทรีโอแคนาดา) ผสมปฏิกิริยาถูกยัดเยียดให้ขยาย PCR ใน T1 thermocycler (Biometra; Goettingen, เยอรมนี) การใช้โปรแกรมของ PCR: อุ่นเป็นเวลา 2 นาทีที่ 94 ° C; 30 รอบละ 30 วินาทีที่ 94 ° C (denaturation), 30 วินาทีที่อุณหภูมิการหลอมของคู่ไพรเมอร์โดยเฉพาะอย่างยิ่ง (ช่วงที่มี 56-60 ° C) และ 30 วินาทีที่ 72 องศาเซลเซียสเป็นเวลา 1 นาที (ส่วนขยาย) และขยายสุดท้ายที่ 72 องศาเซลเซียสเป็นเวลา 5 นาทีตามด้วยการระบายความร้อนที่ 16 องศาเซลเซียสเป็นเวลาที่ไม่แน่นอน

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

สิบเก้า SSR PCR ( Mir et al . , 2008 , 2009 ) ที่ใช้ในการคัดกรองแปดพันธุ์ทั้งสองชนิดของปอกระเจา ของเหล่านี้ , ไพรเมอร์ 6 SSR ( ตารางที่ 2 ) ผลิตวงดนตรีจำนวนที่ชัดเจนในการศึกษา ปฏิกิริยา PCR ได้ใน 10 μ L ปฏิกิริยาปริมาณที่มีประมาณ 20 นาโนดีเอ็นเอแม่แบบปอ , 1x PCR buffer [ ( HCl หรือ 750 มม. ( 8.8 pH ที่ 25 ° C ) , 200 มม. ( NH4 ) 2so4 0.1 เปอร์เซ็นต์ ( v / v ) ] , 1.5 มม. ชุด 0.1 มม. dntps 0.5 μม. ไพรเมอร์ของแต่ละหน่วยและ 0.3 ของดีเอ็นเอพอลิเมอเรส ทัค ( fermentas ; Burlington Ontario Canada ) ปฏิกิริยา PCR แบบผสมภายใต้ใน T1 เทอมอไซเคล ์ ( biometra ; เกิททิงเกน , เยอรมนี ) โดยใช้เทคนิคโปรแกรม : ระบบสำหรับ 2 นาทีที่ 94 ° C ; 30 รอบละ 30 วินาทีที่ 94 ° C ( s ) , 30 เผาที่อุณหภูมิของคู่หลักโดยเฉพาะ ( ช่วงจำนวน 56 – 60 ° C ) , และ 30 s 72 ° C เป็นเวลา 1 นาที ( นามสกุล ) นามสกุล สุดท้ายที่ 72 ° C เป็นเวลา 5 นาที ตามด้วยความเย็นที่ 16 ° C เวลาไม่แน่นอน