It was found that the two selected

It was found that the two selected primers were able to amplify the
16S rDNA fragment of each LAB isolate resulting in an amplicon of
approximately 1463 bp in size (data not shown). The two chosen
tetrameric enzymes (either Acc II or Hae III) for restriction digestions
of the amplicons were able to differentiate all 762 LAB isolates into 6
restriction patterns. These patterns, or ARDRA profiles, were assigned
A, B, C, D, E, and F as shown in Fig. 1 and listed in Table 1. Representative
isolates from each profile were analyzed for their 16S rDNA sequences.
Homology searches of the sequences revealed (with 99–100%
homology) that profile A belonged to Lactococcus garvieae, profile B
belonged to Streptococcus bovis, profile C belonged to Weissella cibaria,
profile D belonged to Pediococcus pentosaceus, profile E belonged to
Lactobacillus plantarum, and profile F belonged to Lactobacillus
fermentum. These sequences were deposited into the GenBank
database. Their sequence accession numbers are shown in Table 1.
The frequency of isolation of each species from the 100 isolates taken
at each sample time is listed in Table 2.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

พบว่า ไพรเมอร์เลือกที่สองก็สามารถขยายการ16S rDNA ส่วนของแต่ละห้องปฏิบัติแยกเกิดขึ้นในการ amplicon ของประมาณ 1463 bp ขนาด (ข้อมูลไม่แสดง) เลือกสองtetrameric เอนไซม์ (บัญชี II หรือ III แฮ่) สำหรับ digestions จำกัดของ amplicons มีความสามารถแตกต่างทั้งหมด 762 ห้องปฏิบัติแยกเป็น 6รูปแบบจำกัด กำหนดเหล่านี้รูปแบบ หรือโพรไฟล์ ARDRAA, B, C, D, E และ F แสดงใน Fig. 1 และแสดงไว้ในตารางที่ 1 ตัวแทนแยกจากแต่ละโพรไฟล์ได้วิเคราะห์ของ 16S rDNA ลำดับค้นหา homology ลำดับเปิดเผยกับ 99 – 100%homology) ว่า ค่า A เป็นสมาชิก Lactococcus garvieae ส่วนกำหนดค่า Bเป็นสมาชิกบริษัทอุณหภูมิ ค่า C เป็นสมาชิก Weissella cibariaค่า D เป็นสมาชิก Pediococcus pentosaceus ประวัติอีเป็นสมาชิกแลคโตบาซิลลัส plantarum และค่า F เป็นสมาชิกแลคโตบาซิลลัสfermentum ลำดับเหล่านี้ได้ฝากเข้าใน GenBankฐานข้อมูล ความหมายเลขทะเบียนลำดับที่แสดงในตารางที่ 1ความถี่ของการแยกแต่ละชนิดจาก 100 แยกมาในตัวอย่างแต่ละ ครั้งจะแสดงในตารางที่ 2

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

มันก็พบว่าทั้งสองไพรเมอร์ที่เลือกก็สามารถที่จะขยายส่วน 16S rDNA ของแต่ละ LAB แยกส่งผลให้ amplicon ของประมาณ1,463 bp ในขนาด (ไม่ได้แสดงข้อมูล) ทั้งสองได้รับการแต่งตั้งเอนไซม์ tetrameric (ทั้ง Acc II หรือ Hae III) สำหรับการย่อยข้อ จำกัด ของ amplicons ก็สามารถที่จะแยกความแตกต่างทั้งหมด 762 LAB แยกออกเป็น 6 รูปแบบข้อ จำกัด รูปแบบเหล่านี้หรือโปรไฟล์ ARDRA ซึ่งได้รับมอบหมายA, B, C, D, E, F และดังแสดงในรูป ที่ 1 และที่ระบุไว้ในตารางที่ 1 แทนแยกจากโปรไฟล์ของแต่ละวิเคราะห์ของพวกเขาสำหรับ16S rDNA ลำดับ. ค้นหาคล้ายคลึงกันของลำดับเปิดเผย (มี 99-100% ที่คล้ายคลึงกัน) รายละเอียดว่าเป็น Lactococcus garvieae, B รายละเอียดเป็น Streptococcus bovis รายละเอียด C เป็น Weissella cibaria, D รายละเอียดเป็น Pediococcus pentosaceus อีรายละเอียดเป็นplantarum แลคโตบาซิลลัสและ F รายละเอียดเป็น Lactobacillus fermentum ลำดับเหล่านี้ถูกฝากเข้า GenBank ฐานข้อมูล หมายเลขภาคยานุวัติลำดับของพวกเขาจะแสดงให้เห็นในตารางที่ 1 ความถี่ของการแยกของแต่ละสายพันธุ์จาก 100 แยกดำเนินการในแต่ละช่วงเวลาตัวอย่างแสดงไว้ในตารางที่2

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

พบว่าทั้งสองเลือกไพรเมอร์สามารถขยาย
16S rDNA เบสของแต่ละห้องปฏิบัติการแยกเป็นผลของ
ประมาณจังและ BP ในขนาด ( ข้อมูลไม่แสดง ) 2 เลือก
tetrameric เอนไซม์ ( ทั้ง 2 บัญชี หรือแฮ III ) สำหรับข้อ จำกัด digestions
ของ amplicons สามารถแยกแยะทั้งหมด 762 ปฏิบัติการแยกเป็น 6
จำกัดรูปแบบ รูปแบบเหล่านี้หรือ ardra โปรไฟล์ที่ได้รับมอบหมาย
A , B , C , D , E และ F ดังแสดงในรูปที่ 1 และ ที่ระบุไว้ในตารางที่ 1 ตัวแทน
แยกจากวิเคราะห์แต่ละโปรไฟล์ของ 16S rDNA ลำดับ ลำดับการค้นหาของลำดับ
เปิดเผย ( 99 ) 100 %
homology ) ที่โปรไฟล์ของแลคโตค คัส garvieae โปรไฟล์ของ Streptococcus B
bovis โปรไฟล์ C เป็นของ weissella cibaria
,โปรไฟล์ของโปรไฟล์ใน 3 D , E เป็นของ
Lactobacillus plantarum และโปรไฟล์ F เป็นของ Lactobacillus
fermentum . ลำดับเหล่านี้ฝากเงินเข้าขนาด
ฐานข้อมูล หมายเลขลำดับของการแสดงในตารางที่ 1 .
ความถี่ของการแยกของแต่ละชนิด จาก 100 สายพันธุ์ถ่าย
แต่ละตัวอย่างเวลาอยู่ในรางที่ 2