AbstractDue to their potential role

Abstract
Due to their potential roles in pathogen defense, genes encoding nucleotide-binding site (NBS) domain have been
particularly surveyed in many angiosperm genomes. Two typical classes were found: one is the TIR-NBS-LRR (TNL) class and
the other is the CC-NBS-LRR (CNL) class. It is seldom known, however, what kind of NBS-encoding genes are mainly present
in other plant groups, especially the most ancient groups of land plants, that is, bryophytes. To fill this gap of knowledge, in
this study, we mainly focused on two bryophyte species: the moss Physcomitrella patens and the liverwort Marchantia
polymorpha, to survey their NBS-encoding genes. Surprisingly, two novel classes of NBS-encoding genes were discovered.
The first novel class is identified from the P. patens genome and a typical member of this class has a protein kinase (PK)
domain at the N-terminus and a LRR domain at the C-terminus, forming a complete structure of PK-NBS-LRR (PNL),
reminiscent of TNL and CNL classes in angiosperms. The second class is found from the liverwort genome and a typical
member of this class possesses an a/b-hydrolase domain at the N-terminus and also a LRR domain at the C-terminus
(Hydrolase-NBS-LRR, HNL). Analysis on intron positions and phases also confirmed the novelty of HNL and PNL classes, as
reflected by their specific intron locations or phase characteristics. Phylogenetic analysis covering all four classes of NBSencoding
genes revealed a closer relationship among the HNL, PNL and TNL classes, suggesting the CNL class having a more
divergent status from the others. The presence of specific introns highlights the chimerical structures of HNL, PNL and TNL
genes, and implies their possible origin via exon-shuffling during the quick lineage separation processes of early land plants

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

นามธรรม
เนื่องจากบทบาทของพวกเขาที่มีศักยภาพในการป้องกันเชื้อโรครหัสพันธุกรรมเบื่อหน่ายผูกพันเว็บไซต์โดเมน (nbs) ได้รับ
โดยเฉพาะอย่างยิ่งการสำรวจในจีโนมของพืชชั้นสูงมาก สองชั้นโดยทั่วไปพบว่าหนึ่งคือ Tir-nbs-LRR ชั้น (TNL)
และอื่น ๆ ที่เป็น CC-nbs-LRR ชั้น (CNL) มันไม่ค่อยเป็นที่รู้จักกัน แต่สิ่งที่ชนิดของยีน nbs เข้ารหัสเป็น
ปัจจุบันส่วนใหญ่อยู่ในกลุ่มพืชอื่น ๆโดยเฉพาะอย่างยิ่งกลุ่มที่เก่าแก่ที่สุดของพืชที่ดิน, ที่อยู่, bryophytes เพื่อเติมช่องว่างของความรู้นี้ใน
การศึกษานี้เราส่วนใหญ่เน้นสองชนิดพืชชั้นต่ำ: มอส Physcomitrella patens และ liverwort marchantia
polymorpha, การสำรวจยีน nbs การเข้ารหัสของพวกเขา น่าแปลกใจที่สองชั้นเรียนใหม่ของยีน nbs การเข้ารหัสที่ถูกค้นพบ.
นวนิยายชั้นแรกจะถูกระบุจาก ppatens จีโนมและสมาชิกปกติของชั้นนี้มีโปรตีนไคเนส (PK) โดเมน
ที่ n-ปลายทางและโดเมน LRR ที่ C-ปลายทางกลายเป็นโครงสร้างที่สมบูรณ์ของ PK-nbs-LRR (PNL)
ชวนให้นึกถึง เรียน TNL และ CNL ใน Angiosperms ชั้นสองจะพบจากจีโนม liverwort ทั่วไปและ
สมาชิกของชั้นนี้มีคุณสมบัติโดเมน / b-ไฮโดรเลสที่สถานี n-และโดเมน LRR ที่ C-ปลายทาง
(hydrolase-nbs-LRR, hnl) การวิเคราะห์ในตำแหน่ง intron และขั้นตอนยังยืนยันความแปลกใหม่ของการเรียน hnl และ PNL เป็น
สะท้อนจากสถานที่ของพวกเขาที่เฉพาะเจาะจง intron หรือลักษณะเฟส phylogenetic วิเคราะห์ที่ครอบคลุมทั้งสี่ชั้นของ nbsencoding
ยีนเผยให้เห็นถึงความสัมพันธ์ที่ใกล้ชิดระหว่างเรียน hnl, PNL และ TNL บอกชั้น CNL มี
สถานะอื่น ๆ ที่แตกต่างกันจากคนอื่น ๆ การปรากฏตัวของ introns เฉพาะไฮไลท์ของโครงสร้างฝันลมๆแล้งๆของ hnl, PNL และ TNL ยีน
และหมายถึงต้นกำเนิดที่เป็นไปได้ของพวกเขาผ่านทางเอกซ์ซอน-สับในระหว่างกระบวนการแยกเชื้อสายรวดเร็วของพืชต้น

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

นามธรรม
เนื่องจากบทบาทของพวกเขามีศักยภาพในการศึกษาป้องกัน การเข้ารหัสโดเมนของไซต์ (NBS) ผูกนิวคลีโอไทด์ของยีน
สำรวจโดยเฉพาะอย่างยิ่งใน genomes angiosperm หลาย 2 ชั้นโดยทั่วไปพบ: LRR เทิร์นานอกไซด์ (TNL) คลาสเป็นหนึ่ง และ
LRR CC-ไซด์ (CNL) คลาสเป็นอีก เป็นที่รู้จักกันแทบ ไร ไซด์เข้ารหัสยีนชนิดใดมีอยู่ส่วนใหญ่
กลุ่มพืช โดยเฉพาะอย่างยิ่งโบราณที่สุดกลุ่มที่ดินพืช นั่นคือ bryophytes เพื่อเติมช่องว่างของความรู้ ใน
การศึกษานี้ เราส่วนใหญ่เน้นสองชนิด bryophyte: มอ Physcomitrella liverwort Marchantia และก้ามปูแดง
polymorpha สำรวจของยีนไซด์เข้า จู่ ๆ 2 ประเภทนวนิยายของยีนเข้าไซด์พบ
นวนิยายชั้นถูกระบุจากแป้น p ก้ามปูแดงจีโนมและสมาชิกทั่วไปของคลาสนี้ได้มีโปรตีน kinase (PK)
โดเมนโดเมน LRR ที่ตัว C-นัส ขึ้นรูปโครงสร้างที่สมบูรณ์ของ LRR PK-ไซด์ (PNL), และ N-นัส
ของคลา TNL และ CNL ใน angiosperms ชั้นสองพบจากจีโนม liverwort และต่อไป
สมาชิกระดับนี้มีโดเมนเป็น a/b-hydrolase ที่ N-นัส และโดเมน LRR ที่ C-นัส
(Hydrolase ไซด์ LRR, HNL) วิเคราะห์ตำแหน่ง intron และระยะยังยืนยันนวัตกรรมของ HNL และ PNL ชั้น เป็น
สะท้อน intron เฉพาะตำแหน่งหรือระยะลักษณะของพวกเขา วิเคราะห์ phylogenetic ครอบคลุมชั้น 4 ทั้งหมดของ NBSencoding
ยีนเปิดเผยความสัมพันธ์ใกล้ชิดระหว่าง HNL, PNL และ TNL คลา แนะนำระดับ CNL ที่มีมากขึ้น
ขันติธรรมสถานะจากผู้อื่น ของ introns เฉพาะเน้นโครงสร้าง chimerical HNL, PNL และ TNL
ยีน และหมายถึงจุดเริ่มต้นของพวกเขาได้ผ่าน exon สลับในระหว่างกระบวนการแยกลินเนจด่วนที่ดินต้นพืช

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

เป็นนามธรรม
เนื่องจากบทบาท ศักยภาพ ของตนเองในการป้องกันเชื้อยีนการเข้ารหัส nucleotide - มีผลผูกพันทางเว็บไซต์( NBS )โดเมนได้รับการ
โดยเฉพาะสำรวจใน genomes angiosperm จำนวนมาก. สองชั้นแบบดั้งเดิมก็พบว่าเป็นระดับ First Class tir - NBS - lrr (, tnl ,)และ
อื่นๆที่มี Class CC NBS - lrr ( cnl ) เป็นที่รู้จักกันดีแต่ถึงอย่างไรก็ตามยังไม่ค่อยยีนชนิดใดของประชากร - การเข้ารหัสเป็นหลักในปัจจุบัน
ในกลุ่มพืชอื่นๆโดยเฉพาะกลุ่มที่เก่าแก่มากที่สุดของพันธุ์ไม้ที่ดินที่เป็น bryophytes การเติมน้ำลงในช่องว่างของความรู้นี้
ซึ่งจะช่วยในการศึกษานี้เราเน้นไปที่สองสายพันธุ์ bryophyte patens physcomitrella มอสและ polymorpha marchantia
liverwort ยีนที่เป็นผลจากการสำรวจความคิดเห็น NBS - การเข้ารหัสของพวกเขา อย่างน่าอัศจรรย์ใจสองชั้นเรียนเขียนนวนิยายเรื่องของยีน NBS - การเข้ารหัสมีการตรวจพบ.
Class นวนิยายเรื่องแรกที่จะมีการระบุจาก P .patens ยีนและตามแบบอย่างของโรงแรมแห่งนี้มีที่โปรตีน kinase ( PK )
โดเมนที่ N - สถานีปลายทางและ lrr โดเมนที่ C - สถานีปลายทาง,สร้างที่สมบรูณ์แบบโครงสร้างของ PK - NBS - lrr ( pnl ),
ชวนให้ระลึกถึงของ, tnl ,และ cnl เรียนใน angiosperms . ที่สองที่พบได้จากยีนที่ liverwort
ตามมาตรฐานและแบบดั้งเดิมสมาชิกในระดับนี้มีโดเมน/ B - hydrolase ที่ N - สถานีปลายทางและยังเป็นสมาชิกของโดเมน lrr ใน C - สถานีปลายทางที่
( hydrolase - NBS - lrr HNL ) การวิเคราะห์ในระยะต่อไปและการวางตำแหน่ง intron นอกจากนั้นยังได้รับการยืนยันความแปลกใหม่ของ HNL pnl ชั้นเรียนและ
ซึ่งจะช่วยสะท้อนถึงลักษณะการหรือตำแหน่ง intron เฉพาะของตน การวิเคราะห์ phylogenetic ครอบคลุมสี่ชั้นเรียนทั้งหมดของ nbsencoding
ตามมาตรฐานยีนเผยให้เห็นความสัมพันธ์ที่อยู่ท่ามกลาง HNL pnl , tnl ,และชั้นเรียนที่แนะนำ Class cnl ที่มีสถานะเพิ่มเติม
แตกออกไปจากคนอื่นได้ การมีอยู่ของ introns เฉพาะความโดดเด่นของโครงสร้างความผันของ HNL pnl ยีน, tnl ,
และหมายถึงที่มาเป็นไปได้ผ่าน exon - สลับในระหว่างกระบวนการการแยกพันธุ์อย่างรวดเร็วของพันธุ์ไม้ที่ดินช่วงต้น