We present the sequence of the 26S

We present the sequence of the 26S rRNA of the yeast Saccharomyces carlsbergensis as inferred from the gene sequence. The molecule is 3393 nucleotides long and consists of 48% G+C; 30 of the 43 methyl groups can be located in the sequence. Starting from the recently proposed structure of E. coli 23S rRNA (see ref. 25) we constructed a secondary structure model for yeast 26S rRNA. This structure is composed of 7 domains closed by long-range base pairings as n the bacterial counterpart. Most domains show considerable conservation of the overall structure; unpaired regions show extended sequence homology and the base-paired regions contain many compensating base pair changes. The extra length of the yeast molecule is due to a number of insertions in most of the domains, particularly in domain II. Domain VI, which is extremely conserved, is probably part of the ribosomal A site. alpha-Sarcin, which apparently inhibits the EF-1 dependent binding of aminoacyl-tRNA, causes a cleavage between position 3025 and 3026 in a conserved loop structure, just outside domain VI. Nearly all of the located methyl groups, like in E. coli, are present in domain II, V and VI and clustered to a certain extent mainly in regions with a strongly conserved primary structure. The only three methyl groups of 26S rRNA which are introduced relatively late during the processing are found in single stranded loops in domain VI very close to positions which have been shown in E. coli 23S rRNA to be at the interface of the ribosome.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

เรานำเสนอลำดับของ rRNA 26S ของยีสต์ Saccharomyces carlsbergensis ที่สรุปจากลำดับยีน โมเลกุลของนิวคลีโอไทด์ยาว 3393 และประกอบด้วย 48% G + C 30 กลุ่มเมธิล 43 สามารถจะอยู่ในลำดับที่ เริ่มต้นจากโครงสร้างการนำเสนอเมื่อเร็ว ๆ นี้ของ E. coli 23S rRNA (ดูรหัส 25) เราสร้างแบบจำลองโครงสร้างรองสำหรับยีสต์ 26S rRNA โครงสร้างนี้ประกอบด้วยโดเมน 7 ปิด โดยระยะไกลฐานรณุเป็น n คล้ายแบคทีเรีย โดเมนส่วนใหญ่แสดงโครงสร้าง การอนุรักษ์อย่างมาก ภูมิภาค unpaired แสดงลำดับขยาย homology และภูมิภาคจับฐานประกอบด้วยการเปลี่ยนแปลงฐานคู่ให้มาก ความยาวพิเศษของโมเลกุลยีสต์เนื่องจากจำนวนแทรกในส่วนของโดเมน โดยเฉพาะอย่างยิ่งในโดเมนที่สองได้ โดเมน VI ซึ่งมีมากอยู่ เป็นอาจจะเป็นไซต์ ribosomal มา อัลฟา-Sarcin ซึ่งเห็นได้ชัดว่าช่วยยับยั้งการรวมขึ้นกับ EF-1 ของ aminoacyl ป้องกันสลาย ทำให้เกิดความแตกแยกในระหว่างตำแหน่ง 3025 และ 3026 ในโครงสร้างวนรอบภัต นอกโดเมน VI เกือบทั้งหมดของกลุ่มเมธิลอยู่ เช่นใน E. coli ที่มีอยู่ในโดเมน II, V และ VI และคลัสเตอร์ในระดับหนึ่งส่วนใหญ่ในภูมิภาคที่มีโครงสร้างหลักการอนุรักษ์อย่างยิ่ง กลุ่มเมธิลเพียงสามของ 26S rRNA ซึ่งจะนำมาใช้ในระหว่างการประมวลผลค่อนข้างช้าอยู่ในลูปตกค้างที่เดียวในโดเมนที่ VI ใกล้กับตำแหน่งที่ได้รับการแสดงใน E. coli 23S rRNA ที่อินเทอร์เฟซของไรโบโซม

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

เรานำเสนอลำดับของ 26S rRNA ของ Saccharomyces ยีสต์ carlsbergensis เป็นอนุมานจากลำดับยีน โมเลกุลที่เป็นนิวคลีโอ 3393 ยาวและประกอบด้วย 48% G + C; 30 ของกลุ่มเมธิล 43 จะอยู่ในลำดับ เริ่มต้นจากโครงสร้างที่เสนอเมื่อเร็ว ๆ นี้ของเชื้อ E. coli 23S rRNA (ดูโทษ. 25) เราสร้างแบบจำลองโครงสร้างรองสำหรับยีสต์ 26S rRNA โครงสร้างนี้ประกอบด้วย 7 โดเมนปิดโดยระยะยาวฐานการจับคู่เป็นคู่ n แบคทีเรีย โดเมนส่วนใหญ่แสดงการอนุรักษ์มากของโครงสร้างโดยรวม; ภูมิภาค unpaired แสดงขยายคล้ายคลึงลำดับและภูมิภาคฐานจับคู่ประกอบด้วยฐานชดเชยการเปลี่ยนแปลงหลายคู่ ความยาวพิเศษของโมเลกุลยีสต์เป็นเพราะจำนวนของการแทรกในส่วนของโดเมนโดยเฉพาะอย่างยิ่งในโดเมนที่สอง โดเมน VI ซึ่งเป็นป่าสงวนมากอาจจะเป็นส่วนหนึ่งของไรโบโซมเอเว็บไซต์ อัลฟา Sarcin ซึ่งเห็นได้ชัดยับยั้ง EF-1 ขึ้นอยู่กับผลผูกพันของ aminoacyl-tRNA ทำให้เกิดความแตกแยกระหว่างตำแหน่งที่ 3025 และ 3026 ในโครงสร้างห่วงอนุรักษ์เพียงนอกโดเมน VI เกือบทั้งหมดของกลุ่มเมธิลอยู่เหมือนใน E. coli, ที่มีอยู่ในโดเมนที่สองวีวีและคลัสเตอร์และในระดับหนึ่งส่วนใหญ่ในภูมิภาคท​​ี่มีโครงสร้างหลักของการอนุรักษ์อย่างยิ่ง เพียงสามกลุ่มเมธิลของ 26S rRNA ซึ่งจะนำมาค่อนข้างดึกระหว่างการประมวลผลที่มีการพบในลูปควั่นเดียวในโดเมน VI มากใกล้เคียงกับตำแหน่งที่ได้รับการแสดงใน E. coli 23S rRNA จะเป็นที่อินเตอร์เฟซของไรโบโซมที่

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

เราได้นำเสนอลำดับของ rRNA 26 ของยีสต์ Saccharomyces carlsbergensis เป็นค่าที่ได้จากยีน ลำดับ โมเลกุลที่เป็น 3393 คู่ยาวและประกอบด้วย 48 % G + C ; 30 : 43 กลุ่มจะอยู่ในลำดับ เริ่มจากล่าสุดเสนอโครงสร้างของ E . coli 23s rRNA ( ดู 25 ) ) เราสร้างโครงสร้างทุติยภูมิแบบ rRNA 26 ยีสต์ โครงสร้างนี้ประกอบด้วย 7 โดเมนถูกปิดโดยการจับคู่ฐานระยะยาวเป็น n คู่ แบคทีเรีย โดเมนแสดงการอนุรักษ์มากที่สุดของโครงสร้างโดยรวม ; ภูมิภาค Unpaired แสดงลำดับลำดับฐานคู่และขยายฐานการชดเชยภูมิภาคมีหลายคู่ ความยาวพิเศษของยีสต์โมเลกุลเนื่องจากจำนวนครั้งในส่วนของโดเมนโดยโดเมน 2 โดเมนที่ 6 ซึ่งเป็นสิ่งรักษา อาจเป็นส่วนหนึ่งของไรโบโซมเป็นเว็บไซต์ อัลฟา sarcin ซึ่งเห็นได้ชัดยับยั้ง ef-1 ขึ้นอยู่กับการจับ aminoacyl การเมารถทำให้ความแตกแยกระหว่างตำแหน่งและเวลา 3026 ในป่าสงวนโครงสร้างวง นอกโดเมนไทยเกือบทั้งหมดตั้งอยู่ในกลุ่มเมธิล เช่น E . coli , อยู่ในเมน 2 , 5 และ 6 และ การจัดกลุ่มเพื่อขอบเขตบางอย่างส่วนใหญ่ในภูมิภาคด้วย อย่างยิ่งการรักษาโครงสร้าง เพียงสามเมทิลกลุ่ม 26 rRNA ที่แนะนำค่อนข้างช้า ในระหว่างการประมวลผล พบในเดียวติดลูปในเมน 6 ใกล้ตำแหน่งซึ่งแสดงใน E . coli 23s rRNA เป็นอินเตอร์เฟซของไรโบโซม .