taxa:—Twenty-three new sequences we

taxa:—Twenty-three new sequences were obtained. Sequence lengths of partial ITS region and trnL intron were 617
bp and 497 bp, respectively. The combined alignment of partial ITS region and trnL intron was 1114 bp. Because
the partition homogeneity test for the nrDNA ITS region and cpDNA trnL intron data showed character congruence
(P = 1.00), we combined partial ITS region and trnL intron to obtain 16 combined sequences (including outgroup
taxa) revealing 10 haplotypes (Table 1) for the phylogenetic analyses. A chi-square test indicates that there was no
significant compositional heterogeneity of bases among these haplotypes (chi-square = 46.81, df = 27, P > 0.01), and
thus the biasing effects on the phylogenetic analyses could be eliminated (Jermiin et al. 2004).
Phylogenetic analyses:—The Bayesian and MP analyses based on the combination of partial ITS regions and trnL
intron resulted in almost identical tree topologies, and the posterior probability (PP) values from the Bayesian analysis
were all higher than the bootstrap (BS) values from the MP analysis. Figure 2 showed the partitioned Bayesian tree
along with the PP and BS values obtained by MP methods. All haplotypes from A. erythronioides, A. wanzhensis, and
A. edulis formed a single moderately supported clade (PP = 0.93, BS = 67), while the haplotype corresponding to A.
anhuiensis (Hap9) was found to be outgroup of this clade. All haplotypes from A. erythronioides formed a monophyletic
group (PP = 0.99, BS = 92), while all haplotypes from A. wanzhensis formed another monophyletic group (PP = 1.00,
BS = 93). A. erythronioides and A. wanzhensis were reciprocally monophyletic, and these two species formed a clade
(PP = 0.95, BS = 79) that was sister to A. edulis from which all haplotypes formed a monophyletic group (PP = 1.00,
BS = 95). Phylogenetic relationships estimated using BI and MP methods were almost identical, and both methods
suggested that A. wanzhensis is an independent lineage, distinct from A. wanzhensis.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

taxa: — ยี่สิบสามลำดับใหม่ได้รับการ ลำดับความยาวของบางส่วนของภูมิภาคและ trnL intron ถูก 617bp และ 497 bp ตามลำดับ การจัดตำแหน่งรวมของบางส่วนของภูมิภาคและ trnL intron ถูก 1114 bp. เนื่องจากทดสอบ homogeneity พาร์ติชัน nrDNA ภูมิภาคและ cpDNA trnL intron ข้อมูลพบว่าลงตัวอักขระ(P = 1.00), เรารวมบางส่วนของภูมิภาคและ trnL intron ลำดับรวม 16 (outgroup รวมทั้งได้รับtaxa) haplotypes 10 (ตารางที่ 1) สำหรับวิเคราะห์ phylogenetic เปิดเผย การทดสอบ chi-square บ่งชี้ว่า มีไม่heterogeneity compositional สำคัญฐานระหว่าง haplotypes เหล่านี้ (chi-square = 46.81, df = 27, P > 0.01), และดังนั้น การวิเคราะห์ phylogenetic ผล biasing อาจจะตัดออก (Jermiin et al. 2004)วิเคราะห์ phylogenetic: — วิเคราะห์ทฤษฎีและ MP ตามบางส่วนของภูมิภาคและ trnLintron ให้โทเหมือนกับต้นไม้ และค่าความน่าเป็นหลัง (PP) จากการวิเคราะห์ทฤษฎีมีทั้งหมดสูงกว่าค่า bootstrap (BS) จากการวิเคราะห์ของ MP รูปที่ 2 แสดงให้เห็นว่าต้นทฤษฎี partitionedพร้อมกับ PP และ BS ค่า MP วิธีการ ทั้งหมด haplotypes จาก A. erythronioides, A. wanzhensis และA. edulis เกิดเป็น clade สนับสนุนค่อนข้างเดียว (PP = 0.93, BS = 67), ขณะ haplotype ที่สอดคล้องกับอ.anhuiensis (Hap9) ถูกพบเป็น outgroup ของ clade นี้ ทั้งหมด haplotypes จาก A. erythronioides รูปแบบ monophyleticกลุ่ม (PP = 0.99, BS = 92), ใน ขณะที่กลุ่มอื่น monophyletic เกิดขึ้นทั้งหมด haplotypes จาก A. wanzhensis (PP = 1.00BS = 93) A. erythronioides และ A. wanzhensis ได้ reciprocally monophyletic และชนิดที่สองเหล่านี้เกิดขึ้นเป็น clade(PP = 0.95, BS = 79) ที่เป็นน้องสาวไปซึ่งทั้งหมด haplotypes ก่อตั้งกลุ่ม monophyletic edulis A. (PP = 1.00BS = 95) ความสัมพันธ์ phylogenetic ประเมินโดยใช้วิธี BI และ MP ได้เกือบเหมือนกัน และทั้งสองวิธีแนะนำที่ wanzhensis A. จะเป็นอิสระลินเนจ แตกต่างจาก A. wanzhensis

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

แท็กซ่า: -Twenty สามลำดับใหม่ที่ได้รับ ความยาวลำดับของบางส่วนภูมิภาคและ trnL intron เป็น 617
bp และ 497 bp ตามลำดับ การจัดตำแหน่งรวมของภูมิภาคบางส่วนและ trnL intron เป็น 1,114 bp เพราะการทดสอบความสม่ำเสมอของพาร์ทิชันสำหรับ nrDNA ภูมิภาคและข้อมูล cpDNA trnL intron ITS แสดงให้เห็นความสอดคล้องกันของตัวละคร (p = 1.00) เรารวมบางส่วนในภูมิภาคและ trnL intron ที่จะได้รับ 16 ลำดับรวม (รวม outgroup แท็กซ่า) เปิดเผย 10 haplotypes (ตารางที่ 1) สำหรับ วิเคราะห์สายวิวัฒนาการ การทดสอบไคสแควร์แสดงให้เห็นว่าไม่มีความแตกต่าง compositional อย่างมีนัยสำคัญของฐานกลุ่มคนเหล่านี้ haplotypes (ไคสแควร์ = 46.81, DF = 27 P> 0.01) และทำให้ผลกระทบที่biasing การวิเคราะห์สายวิวัฒนาการอาจจะตัดออก (Jermiin et al, .. 2004) Phylogenetic วิเคราะห์: -The เบย์และ MP วิเคราะห์บนพื้นฐานของการรวมกันของบางส่วนภูมิภาคและ trnL intron ส่งผลให้เหมือนกันเกือบโครงสร้างต้นไม้และน่าจะเป็นหลัง (PP) ค่าจากการวิเคราะห์แบบเบย์ทุกคนที่สูงกว่าบูต( BS) ค่าจากการวิเคราะห์ MP รูปที่ 2 แสดงให้เห็นว่าต้นไม้คชกรรมแบ่งพาร์ติชันพร้อมกับค่า PP และ BS ได้รับโดยวิธีการส haplotypes ทั้งหมดจาก erythronioides เอเอ wanzhensis และเอ edulis ที่เกิดขึ้นได้รับการสนับสนุนในระดับปานกลางเดียว clade (PP = 0.93, BS = 67) ในขณะที่ haplotype ที่สอดคล้องกับเอanhuiensis (Hap9) ถูกพบว่าเป็น outgroup ของ clade นี้ haplotypes ทั้งหมดจากเอ erythronioides กลายเป็นไฟย์เลติกลุ่ม(PP = 0.99, BS = 92) ในขณะที่ haplotypes จากเอ wanzhensis เกิดขึ้นอีกกลุ่มไฟย์เลติน (PP = 1.00, BS = 93) A. erythronioides และ wanzhensis A. เป็นไฟย์เลติซึ่งกันและกันและทั้งสองสายพันธุ์ที่เกิดขึ้น clade (PP = 0.95, BS = 79) ที่เป็นน้องสาวของเอ edulis ที่ haplotypes ทั้งหมดกลายเป็นกลุ่มไฟย์เลติน (PP = 1.00, BS = 95 ) ความสัมพันธ์ทางวิวัฒนาการประมาณโดยใช้วิธีการ BI และ MP เหมือนกันเกือบและวิธีการทั้งสองบอกว่าwanzhensis A. เป็นเชื้อสายอิสระแตกต่างจากเอ wanzhensis

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ความสูง : 20 สามลำดับใหม่ที่ได้รับ ลำดับความยาวของบางส่วนของภูมิภาคและ trnl iNtRON จำนวน 617
BP และ 497 คู่เบส ตามลำดับ การรวมกันของบางส่วนของภูมิภาคและ trnl iNtRON คือรายการ บีพี เนื่องจากการทดสอบความสม่ำเสมอ
พาร์ทิชันสำหรับ nrdna ของภูมิภาคและ cpdna trnl iNtRON ข้อมูลแสดงให้เห็นความสอดคล้องกัน
( p = 1.00 )เรารวมบางส่วนของภูมิภาคและ trnl iNtRON ให้ได้ 16 ลำดับรวม ( รวมทั้งกลุ่ม
แทกซา ( 10 ) เปิดเผยผลตารางที่ 1 ) เพื่อวิเคราะห์วิวัฒนาการ . การทดสอบไคสแควร์ พบว่าไม่มีความสามารถของฐานของส่วนประกอบ
haplotypes เหล่านี้ ( Chi square = 46.81 , df = 27 , p < 0.01 ) และ
ดังนั้นการขยายผลในการวิเคราะห์ ซึ่งสามารถกำจัด ( jermiin et al . 2004 ) .
: - การวิเคราะห์ phylogenetic แบบ MP และการวิเคราะห์บนพื้นฐานของการรวมกันของบางส่วนของภูมิภาคและ trnl
iNtRON ส่งผลให้เกิดโครงสร้างต้นไม้เกือบจะเหมือนกันและความน่าจะเป็นภายหลัง ( PP ) ค่าจาก
การวิเคราะห์เชิงเบส์ทั้งหมดสูงกว่าบู ( BS ) ค่าจากการวิเคราะห์ MPรูปที่ 2 แสดงการแบ่งแบบต้นไม้
พร้อมกับ PP และ BS ได้ด้วยวิธี MP ผลทั้งหมดจาก erythronioides อ. wanzhensis และ
. ตับเต่ารูปแบบที่เดียวในการสนับสนุน clade ( PP = 0.93 , BS = 67 ) ในขณะที่พบสอดคล้องกับ A .
anhuiensis ( hap9 ) พบว่า มีกลุ่มของ clade นี้ ผลจาก erythronioides รูปแบบที่ monophyletic
Aกลุ่ม ( PP = 0.99 , BS = 92 ) ในขณะที่ผลทั้งหมดจาก wanzhensis เกิดขึ้นอีก monophyletic GROUP ( PP = 1.00 ,
BS = 93 ) 1 . erythronioides และ A . wanzhensis เป็น monophyletic ซึ่งกันและกัน และสองชนิดนี้รูปแบบที่ clade
( PP = 0.95 , BS = 79 ) ซึ่งเป็นน้องสาวของต. ตับเต่าซึ่งทั้งหมดที่แฮปก่อตั้งกลุ่ม monophyletic ( PP = 1.00 ,
BS = 95 )ความสัมพันธ์ ซึ่งประเมินโดยใช้บีและวิธีการ MP เกือบจะเหมือนกันและทั้งสองวิธี พบว่า A .
wanzhensis เป็นเชื้อสายอิสระที่แตกต่างจาก อ. wanzhensis .