Base frequencies for heterozygous s

Base frequencies for heterozygous sites were inferred from filtered Samtools pile-up results. For each predicted heterozygous site, the number of each of the four possible alternative sites over the read coverage of this base was determined and rounded to the second decimal place by a custom Perl script. Base frequencies were binned into 101 categories of 0.01 each (0–1.00), and an approximate distribution of base frequencies for each chromosome of L. braziliensis and L. mexicana was plotted in Excel (Supplemental Fig. S3). Frequencies of zero were not included in the plot.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ความถี่พื้นฐานสำหรับไซต์เฮเทอโรไซกัสถูกอนุมานจากผลลัพธ์การกองซ้อนของ Samtools ที่ถูกกรอง สำหรับแต่ละไซต์เฮเทอโรไซกัสที่คาดการณ์ไว้ จำนวนของแต่ละไซต์ทางเลือกที่เป็นไปได้สี่แห่งเหนือความครอบคลุมการอ่านของฐานนี้ถูกกำหนดและปัดเศษเป็นทศนิยมตำแหน่งที่สองด้วยสคริปต์ Perl แบบกำหนดเอง ความถี่พื้นฐานถูกแบ่งออกเป็น 101 หมวดหมู่ หมวดละ 0.01 (0–1.00) และการกระจายความถี่ฐานโดยประมาณสำหรับแต่ละโครโมโซมของ L. Brazilianiensis และ L. mexicana ถูกพล็อตใน Excel (รูปที่เสริม S3) ความถี่ของศูนย์ไม่รวมอยู่ในโครงเรื่อง

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ความถี่พื้นฐานของไซต์เบ็ดเตล็ดนั้นอนุมานได้จากผลการสะสมของ Samtools สำหรับไซต์ไฮบริดที่คาดการณ์ไว้แต่ละจุดภายในขอบเขตการอ่านของฐานนี้จะมีการกำหนดจำนวนไซต์ทางเลือกที่เป็นไปได้สี่แห่งและปัดเศษเป็นทศนิยมที่สองด้วยสคริปต์ Perl ที่กำหนดเอง แบ่งความถี่พื้นฐานออกเป็น 101 คลาส 0.01 (0 - 1.00) และวางแผนที่การกระจายความถี่พื้นฐานโดยประมาณของโครโมโซมแต่ละโครโมโซมของ Lactobacterium brazilla และ Lactobacterium mexican ใน Excel (รูปเสริม S3) ความถี่เป็นศูนย์ไม่ได้รวมอยู่ในภาพวาด

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ความถี่พื้นฐานของไซต์ไฮบริดถูกอนุมานจากผลการสะสมของSamtoolsที่กรองไว้ สําหรับแต่ละจุดไฮบริดที่คาดการณ์ไว้จํานวนของสี่ตําแหน่งทางเลือกที่เป็นไปได้ในขอบเขตการอ่านของฐานจะถูกกําหนดโดยสคริปต์Perlที่กําหนดเองและปัดเศษเป็นทศนิยมที่สอง ความถี่พื้นฐานแบ่งออกเป็น101ประเภทโดยมีค่า0.01 (0-1.00 )แต่ละประเภทและการกระจายความถี่พื้นฐานโดยประมาณของแต่ละโครโมโซมของlactobacillus brasilianและlactobacillus mexicanจะถูกวาดในexcel (เสริมรูปที่3 ) ความถี่เป็นศูนย์ไม่รวมอยู่ในแผนที่