Fig. 6 |JAK–STAT is required for AR

Fig. 6 |JAK–STAT is required for AR therapy resistance of heterogenous subclones. a–c, UMAP plots of single-cell transcriptomic profiles of LNCaP/ARcells transduced by annotated CRISPR guide RNAs and treated with vehicle (DMSO) or 10 μM Enz for 5 d; sgNT (Veh, n= 14,268 cells; Enz, n= 15,149 cells;a); sgTP53/RB1 (Veh, n= 12,267 cells; Enz, n= 9,850 cells; b); sgTP53/RB1/JAK1 (Veh, n= 25,200 cells; Enz, n= 11,096 cells; c). Cells on the left are coloredaccording to sample origin, while cells on the right are colored by predicted cell cycle phase. d, Bar plot presenting the percent distribution of single cellsin different cell cycle phases in each sample. The numbers of cells (n) are the same as in a–c. P values were calculated by two-sided Fisher’s exact test.e, Single-cell profile of LNCaP/AR cells based on clustering. A UMAP plot of single cells colored by unsupervised clustering of six subsets is presented; cluster0 (C0), n= 26,944 cells; C1, n= 15,994 cells; C2, n= 14,029 cells; C3, n= 14,278 cells; C4, n= 10,025 cells; C5, n= 6,560 cells. f, Single-cell profile of LNCaP/ARcells based on subclustering. A UMAP plot of single cells colored by unsupervised clustering of 13 subclusters is presented; C0, n= 26,944 cells; C1, n= 15,994cells; C2-1, n= 9,513 cells; C2-2, n= 2,402 cells; C2-3, n= 2,114 cells; C3-1, n= 2,578 cells; C3-2, n= 6,079 cells; C3-3, n= 5,621 cells; C4-1, n= 3,680 cells; C4-2,n= 3,459 cells; C4-3, n= 2,886 cells; C5-1, n= 4,775 cells; C5-2, n= 1,785 cells. g, Single-cell profile of LNCaP/AR cells transduced with annotated CRISPR guideRNAs and treated with vehicle or Enz. A UMAP plot of single cells colored by samples is represented. The area and number of clusters in e are highlighted withcolored circles. h, Single-cell profile of LNCaP/AR cells based on cell cycle states. A UMAP plot of single cells colored by cell cycle prediction is presented. Thearea and number of clusters in e are highlighted with colored circles. i, Bar plot presenting the percent distribution of single cells in different cell cycle phases ineach of the six clusters. The number of cells (n) in each sample is the same as in e. P values were calculated by two-sided Fisher’s exact test.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

รูปที่ 6 | JAK – STAT จำเป็นสำหรับการต้านทานการบำบัดด้วย AR ของโคลนย่อยที่ต่างกัน a – c, พล็อต UMAP ของโปรไฟล์ transcriptomic เซลล์เดียวของเซลล์ LNCaP / AR ที่แปลงโดย RNAs คู่มือ CRISPR ที่มีคำอธิบายประกอบและบำบัดด้วยยานพาหนะ (DMSO) หรือ 10 μM Enz เป็นเวลา 5 วัน; sgNT (Veh, n= 14,268 เซลล์; Enz, n= 15,149 เซลล์; a); sgTP53/RB1 (Veh, n= 12,267 เซลล์; Enz, n= 9,850 เซลล์; b); sgTP53/RB1/JAK1 (Veh, n= 25,200 เซลล์; Enz, n= 11,096 เซลล์; c) เซลล์ทางด้านซ้ายจะมีสีตามแหล่งกำเนิดของตัวอย่าง ในขณะที่เซลล์ทางด้านขวาจะมีสีตามเฟสวัฏจักรของเซลล์ที่คาดการณ์ไว้ d กราฟแท่งแสดงเปอร์เซ็นต์การกระจายของเซลล์เดี่ยวในเฟสวัฏจักรของเซลล์ที่แตกต่างกันในแต่ละตัวอย่าง จำนวนเซลล์ (n) เหมือนกับใน a–c ค่า P คำนวณโดยการทดสอบที่แน่นอนของฟิชเชอร์สองด้าน e โปรไฟล์เซลล์เดียวของเซลล์ LNCaP/AR ตามการจัดกลุ่ม นำเสนอพล็อต UMAP ของเซลล์เดี่ยวที่มีสีโดยการจัดกลุ่มหกชุดย่อยที่ไม่ได้รับการดูแล คลัสเตอร์0 (C0), n= 26,944 เซลล์; C1, n= 15,994 เซลล์; C2, n= 14,029 เซลล์; C3, n= 14,278 เซลล์; C4, n= 10,025 เซลล์; C5, n= 6,560 เซลล์ f, โปรไฟล์เซลล์เดียวของเซลล์ LNCaP / AR ตามการจัดกลุ่มย่อย นำเสนอพล็อต UMAP ของเซลล์เดี่ยวที่มีสีโดยการจัดกลุ่มแบบไม่ได้รับการดูแลของ 13 คลัสเตอร์ย่อย C0, n= 26,944 เซลล์; C1, n= 15,994 เซลล์; C2-1, n= 9,513 เซลล์; C2-2, n= 2,402 เซลล์; C2-3, n= 2,114 เซลล์; C3-1, n= 2,578 เซลล์; C3-2, n= 6,079 เซลล์; C3-3, n= 5,621 เซลล์; C4-1, n= 3,680 เซลล์; C4-2, n= 3,459 เซลล์; C4-3, n= 2,886 เซลล์; C5-1, n= 4,775 เซลล์; C5-2, n= 1,785 เซลล์ g โปรไฟล์เซลล์เดี่ยวของเซลล์ LNCaP / AR ที่แปลงด้วยRNAs นำทาง CRISPR ที่มีคำอธิบายประกอบและบำบัดด้วยยานพาหนะหรือ Enz พล็อต UMAP ของเซลล์เดี่ยวที่มีสีตามตัวอย่างจะถูกนำเสนอ พื้นที่และจำนวนกระจุกใน e จะถูกเน้นด้วยวงกลมสี h โปรไฟล์เซลล์เดียวของเซลล์ LNCaP/AR ตามสถานะวัฏจักรของเซลล์ นำเสนอพล็อต UMAP ของเซลล์เดี่ยวที่มีสีโดยการทำนายวัฏจักรของเซลล์ พื้นที่และจำนวนกระจุกใน e จะถูกเน้นด้วยวงกลมสี i กราฟแท่งแสดงเปอร์เซ็นต์การกระจายของเซลล์เดี่ยวในเฟสวัฏจักรของเซลล์ที่แตกต่างกันในแต่ละหกคลัสเตอร์ จำนวนเซลล์ (n) ในแต่ละตัวอย่างจะเหมือนกับใน e ค่า P คำนวณโดยการทดสอบที่แน่นอนของฟิชเชอร์สองด้าน

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

รูปที่ 6› JAK – STAT เป็นสิ่งจำเป็นสำหรับ Subclone AR ที่แตกต่างกันในการรักษาความต้านทาน. แผนภูมิ UMAP ของสเปกตรัมกลุ่มการถอดรหัสเซลล์เดียวสำหรับ a-c, LNCap/AR
เซลล์ที่นำไปสู่การถ่ายโอน RNA ด้วย CRISPR ของความคิดเห็นและการรักษาด้วย Carrier (DMSO) หรือ 10 μm Enz เป็นเวลา 5 วัน sgNT (Veh, n = 14,268 เซลล์; Enz, n = 15,149 เซลล์;
a） ； sgTP53 / RB1 (Veh, n = 12267 เซลล์; Enz, n = 9850 เซลล์; b); sgTP53 / RB1 / JAK1 (Veh, n = 25200 เซลล์; Enz, n = 11096 เซลล์; c) เซลล์ด้านซ้ายเป็นสี
จากแหล่งที่มาของตัวอย่าง เซลล์ด้านขวาจะถูกย้อมสีตามระยะวัฏจักรของเซลล์ที่คาดการณ์ไว้ d แผนภูมิแท่งแสดงการกระจายเปอร์เซ็นต์ของเซลล์แต่ละเซลล์
ในช่วงวัฏจักรของเซลล์ที่แตกต่างกันในแต่ละตัวอย่าง จำนวนเซลล์ (n) เท่ากับจำนวนเซลล์ใน a-c ค่า P คำนวณโดยการตรวจสอบฟิชเชอร์สองด้านได้อย่างแม่นยำ
อี แผนที่เซลล์เดียวของเซลล์ LNCAP / AR ที่ใช้กลุ่ม แผนภาพ UMAP ของเซลล์เดียวที่ทำสีโดยกลุ่มย่อยหกชุดจะได้รับ คลัสเตอร์
0 (C0), n = 26,944 เซลล์; C1, n = 15,994 เซลล์; C2, n = 14029 เซลล์

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

รูปที่6ความต้านทานต่อการรักษาด้วยย่อยโคลนallogenicต้องใช้JAK-STAT a-c,LNCaP/ARแผนภาพUMAPของสเปกตรัมการถอดรหัสเซลล์เดียว
แนะนําการถ่ายโอนRNAด้วยCRISPRที่อธิบายไว้และรักษาเซลล์ด้วยผู้ให้บริการ( DMSO )หรือEnz 10ไมครอนเป็นเวลา5วัน sgnt (วี, n=14,268 เซลล์; เอนซ์,n=15,149เซลล์;
ก ่ อน ) ; sgtp53 / rb1 (วี,n=12,267เซลล์; เอนซ์,n=9,850เซลล์; ข ) ; sgtp53/rb1/jak1 (วี,n=25,200เซลล์; เอนซ์,n = 11,096 เซลล์; c ). เซลล์ด้านซ้ายเป็นสี
ขึ้นอยู่กับแหล่งที่มาของตัวอย่างในขณะที่เซลล์ด้านขวาถูกทําสีโดยขั้นตอนของวัฏจักรเซลล์ที่คาดการณ์ไว้ dแสดงการกระจายตัวของเซลล์เดี่ยว
ในแต่ละขั้นตอนของวัฏจักรเซลล์ที่แตกต่างกัน จํานวนเซลล์(n)เหมือนกับในa-c ค่าpคํานวณโดยการทดสอบFisherแบบทวิภาคี
eโปรไฟล์เซลล์เดี่ยวของLNCaP/ARตามการจัดกลุ่ม มีการเสนอแผนภาพUMAPของเซลล์เดี่ยวที่ย้อมสีโดยการจัดกลุ่มที่ไม่ได้รับการควบคุมโดยชุดย่อยหกชุด สตริง
0 (c0),n= 26,944 เซลล์; c1,n=15,994เซลล์; c2,n = 14,029 เซลล์; c3,n=14,278เซลล์; c4,n = 10,025 เซลล์; c5,n= 6,560 เซลล์. f,LNCaP/ARโปรไฟล์เซลล์เดียว
หน่วยตามการจัดกลุ่มย่อย มีแผนภาพUMAPของเซลล์เดียวที่ย้อมสีโดยการจัดกลุ่มที่ไม่ได้รับการควบคุมโดยกลุ่มย่อย13กลุ่ม c0,n = 26,944 เซลล์; c1 , n=15,994
เซลล์ c2-1,n=9,513เซลล์; c2-2 , n = 2,402 เซลล์; c2 - 3,n = 2,114 เซลล์; c3-1,n = 2,578 เซลล์; c3-2,n=6,079เซลล์; c3-3,n=5,621เซลล์; c4-1,n=3,680เซลล์; หมายเลข c42,
n = 3,459 เซลล์; c4 - 3,n = 2,886 เซลล์; c5-1,n = 4,775 เซลล์; c5-2 n = 1,785 เซลล์. gการกระจายเซลล์เดียวของเซลล์LNCaP/ARที่ถ่ายทอดด้วยคําแนะนําCRISPRที่อธิบายไว้
RNAและประมวลผลโดยผู้ให้บริการหรือEnz แสดงแผนภาพUMAPของเซลล์เดียวที่ถูกย้อมสีโดยตัวอย่าง พื้นที่และจํานวนเอนโทรปีในeจะถูกเน้น
วงกลมสี สเปกตรัมเซลล์เดี่ยวของเซลล์LNCaP/ARขึ้นอยู่กับสถานะของวัฏจักรเซลล์ มีการเสนอแผนภาพUMAPของเซลล์เดียวที่ทํานายด้วยวัฏจักรเซลล์ นี่
พื้นที่และจํานวนเฟรมในeจะถูกเน้นด้วยวงกลมสี I,แผนภูมิคอลัมน์แสดงการกระจายตัวของเซลล์เดียวในขั้นตอนต่างๆของวัฏจักรเซลล์
แต่ละกลุ่มในหกกลุ่ม จํานวนเซลล์ในแต่ละตัวอย่าง( n )เหมือนกับในe ค่าpคํานวณโดยการทดสอบFisherแบบทวิภาคี