3.4. Population genetic structureNo

3.4. Population genetic structure
No statistically significant FST values were observed in all pairwise comparisons for COI gene (P > 0.05) (Table 5). Pairwise
FST values were negative, so no genetic divergence was detected among populations. Nm values were all infinite, indicating
very huge gene flow among these localities. The same pattern was found in 16S gene data (Table 6). Pairwise values of FST
ranged from
0.01409 to 0.10289, and Nm ranged from 4.35970 to infinite. No genetic divergence was found statistically
significant among populations (P > 0.05).
The AMOVA test of P. viridis based on haplotype frequencies revealed that the genetic variation occurred within populations
was
2.03% for the COI gene and 4.23% for the 16S rRNA gene, and among populations was 102.3% for the COI gene
and 95.77% for the 16S rRNA gene (Table 7). The test for overall population genetic structuring within and among populations
was not statistically significant (P > 0.05).
Phylogenetic relationship of P. viridis haplotypes was determined using COI and 16S rRNA gene sequences of Perna perna
(AB265682.1) and Perna canaliculus (AB265681.1) as out-group taxa (Fig. 3). Two UPGMA trees showed that no genealogical
branches or clusters corresponded to the sampling sites. In the COI tree, P. viridis was clustered with P. canaliculus and
separated from P. perna, while in the 16S rRNA tree, P. canaliculus and P. perna were grouped together and separated from P.
viridis.
4. Discussion
Results from COI gene sequence data showed high levels of haplotype diversity and low levels of nucleotide diversity
(h ¼ 0.737e0.816; p ¼ 0.00392e0.00457). In the 16S rRNA gene data, a lower level of genetic variation was detected
(h ¼ 0.312e0.372; p ¼ 0.00111e0.00137), which may be due to short sequences and a small number of haplotypes.
Genetic methods are frequently used to assess population connectivity which is defined as the degree of gene flow
affecting evolutionary processes (Lowe and Allendorf, 2010). Researchers often use FST to infer gene flow; lower values of FST
indicate low genetic divergence. FST values below 0.05 indicate negligible genetic divergence (Kalinowski, 2002). When FST

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

3.4. ประชากรโครงสร้างทางพันธุกรรมข้อสังเกตในการเปรียบเทียบทั้งหมดที่แพร์ไวส์สำหรับยีน COI ไม่ FST ค่านัยสำคัญทางสถิติ (P > 0.05) (ตาราง 5) PairwiseFST ค่าได้ค่าลบ เพื่อ divergence ไม่มีพันธุกรรมที่พบในหมู่ประชากร ค่า nm ได้ไม่สิ้นสุดทั้งหมด การแสดงกระแสของยีนขนาดใหญ่มากในท้องถิ่นเหล่านี้ รูปแบบเดียวกันพบในข้อมูลยีน 16S (ตาราง 6) ค่าแพร์ไวส์ของ FSTอยู่ในช่วงจาก 0.01409 เพื่อ 0.10289 และ Nm อยู่จาก 4.35970 ไปไม่สิ้นสุด ไม่ divergence พันธุกรรมพบทางสถิติสำคัญในประชากร (P > 0.05)การทดสอบ AMOVA ของ P. viridis อิงความถี่ haplotype เปิดเผยว่า การเปลี่ยนแปลงทางพันธุกรรมที่เกิดขึ้นในกลุ่มประชากร2.03% สำหรับยีน COI และ 4.23% สำหรับยีน 16S rRNA และในหมู่ประชากร 102.3% สำหรับยีน COIและ 95.77% สำหรับยีน 16S rRNA (ตาราง 7) การทดสอบสำหรับประชากรโดยรวมพันธุกรรมจัดโครงสร้างภายใน และใน หมู่ประชากรไม่มีนัยสำคัญทางสถิติ (P > 0.05)กำหนดความสัมพันธ์ phylogenetic ของ P. viridis haplotypes COI และ 16S rRNA ลำดับยีนของ Perna perna(AB265682.1) และ Perna canaliculus (AB265681.1) เป็น out-group แท็กซ่า (รูป 3) ต้นไม้ UPGMA สองที่แสดงให้เห็นว่าไม่เกี่ยวกับวงศ์ตระกูลสาขาหรือกลุ่มผูกพันสุ่มตัวอย่าง ในต้นไม้ COI, P. viridis clustered กับ P. canaliculus และแยกจาก P. perna ในขณะที่ต้นไม้ 16S rRNA, P. canaliculus และ P. perna จัดกลุ่ม และแยกออกจาก P.viridis4. สนทนาผลลัพธ์จากข้อมูลลำดับยีน COI พบว่า haplotype หลากหลายในระดับสูงและระดับต่ำของความหลากหลายของนิวคลีโอไทด์(h ¼ 0.737e0.816; p ¼ 0.00392e0.00457) ตรวจพบข้อมูลยีน 16S rRNA ระดับต่ำของการเปลี่ยนแปลงทางพันธุกรรม(h ¼ 0.312e0.372; p ¼ 0.00111e0.00137), ซึ่งอาจเกิดจากการสั้นลำดับและจำนวน haplotypes ขนาดเล็กวิธีการทางพันธุกรรมมักใช้ในการประเมินการเชื่อมต่อของประชากรซึ่งถูกกำหนดเป็นระดับของการไหลของยีนส่งผลกระทบต่อกระบวนการวิวัฒนาการ (Lowe และ Allendorf, 2010) นักวิจัยมักใช้ FST เพื่อสรุปยีนไหล ค่าที่ต่ำกว่าของ FSTระบุ divergence พันธุกรรมต่ำ FST ค่าต่ำกว่า 0.05 แสดงว่า divergence พันธุกรรมเล็กน้อย (Kalinowski, 2002) เมื่อ FST

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

3.4 โครงสร้างทางพันธุกรรมของประชากร
ไม่มีนัยสำคัญทางสถิติค่า FST อย่างมีนัยสำคัญในการเปรียบเทียบจากจำนวนทั้งหมด COI ยีน (p> 0.05) (ตารางที่ 5) คู่
ค่า FST เป็นลบจึงไม่มีความแตกต่างทางพันธุกรรมที่พบในหมู่ประชากร นิวตันเมตรมีค่าอนันต์ทั้งหมดแสดงให้เห็น
การไหลของยีนขนาดใหญ่มากในหมู่ท้องถิ่นเหล่านี้ รูปแบบเดียวกันที่พบใน 16S ข้อมูลยีน (ตารางที่ 6) ค่าคู่ของ FST
ตั้งแต่? 0.01409-.10289 และนิวตันเมตรตั้งแต่ 4.35970 ไปไม่มีที่สิ้นสุด ไม่มีความแตกต่างทางพันธุกรรมก็พบทางสถิติ
อย่างมีนัยสำคัญในหมู่ประชากร (p> 0.05).
การทดสอบ AMOVA พีดิสขึ้นอยู่กับความถี่ haplotype เปิดเผยว่าการเปลี่ยนแปลงทางพันธุกรรมเกิดขึ้นภายในประชากร
ถูก? 2.03% สำหรับยีน COI และ 4.23% สำหรับการแสดงออกของยีน 16S rRNA และในหมู่ประชากรเป็น 102.3% สำหรับยีน COI
และ 95.77% สำหรับการแสดงออกของยีน 16S rRNA (ตารางที่ 7) สำหรับการทดสอบโครงสร้างทางพันธุกรรมของประชากรโดยรวมภายในและระหว่างประชากร
ไม่มีนัยสำคัญทางสถิติ (p> 0.05).
ความสัมพันธ์ทางวิวัฒนาการของพี viridis haplotypes ถูกกำหนดโดยใช้ COI และ 16S rRNA ลำดับยีนของ Perna Perna
(AB265682.1) และ Perna Canaliculus (AB265681 0.1) ในขณะที่ออกจากกลุ่มแท็กซ่า (รูปที่. 3) ต้นไม้สองต้น UPGMA แสดงให้เห็นว่าไม่มีวงศ์
สาขาหรือกลุ่มตรงไปยังเว็บไซต์การสุ่มตัวอย่าง ในทรี COI, P. viridis ถูกคลัสเตอร์กับพี Canaliculus และ
แยกออกจากพี Perna ในขณะที่ต้นไม้ 16S rRNA, P. Canaliculus พี Perna ถูกจัดกลุ่มเข้าด้วยกันและแยกออกจากพี
viridis.
4 การอภิปราย
ผลการค้นหาจากข้อมูลลำดับยีน COI แสดงให้เห็นระดับสูงของความหลากหลาย haplotype และระดับต่ำของความหลากหลายเบื่อหน่าย
(h ¼ 0.737e0.816; P ¼ 0.00392e0.00457) ในข้อมูลของยีน 16S rRNA ซึ่งเป็นระดับที่ต่ำกว่าของการเปลี่ยนแปลงทางพันธุกรรมที่ตรวจพบ
(¼ 0.312e0.372 เอช; P ¼ 0.00111e0.00137). ซึ่งอาจจะเป็นเพราะลำดับในระยะสั้นและขนาดเล็กจำนวน haplotypes
วิธีทางพันธุกรรมที่ใช้บ่อย เพื่อประเมินการเชื่อมต่อประชากรซึ่งถูกกำหนดให้เป็นระดับของการไหลของยีน
ที่มีผลต่อกระบวนการวิวัฒนาการ (โลว์และ Allendorf 2010) นักวิจัยมักจะใช้ FST เพื่อสรุปการไหลของยีน; ค่าที่ต่ำกว่าของ FST
บ่งบอกถึงความแตกต่างทางพันธุกรรมต่ำ ค่า FST ด้านล่าง 0.05 แสดงให้เห็นความแตกต่างทางพันธุกรรมเล็กน้อย (Kalinowski, 2002) เมื่อ FST