2.4. Species identification using shortened primers
As a possible strategy to lower LOD of the multiplex PCR method,
severalnucleotides in the 50 endof the primerswere deleted to design
the truncated primers, which were 18e20 bp in length (Fig. 1). The
shortened primer sequences were as follows: forward common
primer SIM2 (50-AACATCTCATCATGATGAAA-30), mutton primer M2
(50-TGCTGTGGCTATTGTCGC-30), chicken primer C2 (50-GATGAA
GAAGAATGAGGCG-30), beef primer B2 (50-GTGTAAGACCCGTAATA
TAAG-30), and pork primer P2 (50-GTAGATTTGTGATGACCGTA-30).
Firstly, the PCR reactionwas run under the sameconditions as Section
2.3, and the products were electrophoresed on 2% agarose gel with
0.5 mg/ml ethidium bromide. Then, the optimal conditions of multiplex
PCR were investigated by adjusting the annealing temperature
and ratio of primers. The expected size of the amplified fragments for
chicken, beef, mutton and pork were 201 bp, 248 bp, 306 bp and
373 bp, respectively.
2.4 ใช้ระบุชนิดลดลงไพรเมอร์
เป็นกลยุทธ์ได้ลงลอดของวิธีการ multiplex PCR,
severalnucleotides ใน endof 50 primerswere ลบออกแบบ
สังกะสี การตัดวัสดุ bp 18e20 ยาว (Fig. 1) ซึ่ง ใน
พื้นย่อลำดับได้ดังนี้: ไปข้างหน้าร่วม
พื้น SIM2 (50-AACATCTCATCATGATGAAA-30), mutton รองพื้น M2
(50-TGCTGTGGCTATTGTCGC-30) ไก่รองพื้น C2 (50-GATGAA
GAAGAATGAGGCG-30), เนื้อรองพื้น B2 (50-GTGTAAGACCCGTAATA
taag บิน-30), และหมูพื้น p 2 (50-GTAGATTTGTGATGACCGTA-30) .
แรก ที่ PCR reactionwas รันภายใต้ sameconditions เป็นส่วน
2.3 และผลิตภัณฑ์ถูก electrophoresed ในเจ 2% agarose กับ
0.5 mg/ml โบรไมด์ ethidium แล้ว เงื่อนไขดีที่สุดของล็ก
PCR ถูกตรวจสอบ โดยการปรับอุณหภูมิหลอม
และอัตราส่วนของไพรเมอร์ ขนาดที่คาดไว้ของชิ้นส่วนเอาต์สำหรับ
ไก่ เนื้อ mutton และหมู 201 bp, 248 bp, 306 bp และ
373 bp ตามลำดับ.
การแปล กรุณารอสักครู่..
