Sequence acquisitionAll fish gut ba

Sequence acquisition
All fish gut bacterial 16S rRNA sequences were obtained from GenBank except for the
guppy (Poecilia reticulata) library, which were generated through cloning and sequencing
(See Supporting information for details). All nonguppy data sets were identified through
Entrez queries using targeted search terms, or through a review of the published literature on
fish and their gut microbes. Sequences from each of these studies had been similarly
generated via Sanger sequencing from PCR products that were amplified with ‘universal’
bacterial primers as stated by the authors of the studies. Within a particular study, all
sequences from one fish species were counted as a single library when acquired by the same
method (i.e. culture-dependent or culture-independent techniques). However, in cases where
the study specified that individuals came from different fish populations, sequences from
separate populations were analysed separately as distinct libraries (exceptions are noted in
Supporting information).

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ลำดับการซื้อทั้งหมดปลาลำไส้แบคทีเรีย 16S rRNA ลำดับที่ได้รับจาก GenBank ยกเว้นการปลาหางนกยูง (ปลา reticulata) ห้องสมุด ที่สร้างขึ้นผ่านการโคลนและการจัดลำดับ(ดูข้อมูลสนับสนุนสำหรับรายละเอียด) ระบุชุดข้อมูลทั้งหมดที่ nonguppy ผ่านสอบถาม Entrez ที่ใช้คำค้นหาเป้าหมาย หรือ ผ่านการสอบทานเอกสารตีพิมพ์ในปลาและจุลินทรีย์ของพวกเขา ลำดับจากการศึกษาเหล่านี้ได้ในทำนองเดียวกันโดย Sanger จัดลำดับจากผลิตภัณฑ์ PCR ที่ถูกขยาย ด้วย 'สากล'ไพรเมอร์ที่แบคทีเรียตามที่ระบุไว้โดยผู้เขียนของการศึกษา ในการศึกษาโดยเฉพาะอย่างยิ่ง ทั้งหมดลำดับจากปลาหนึ่งนับเป็นคลังเดียวเมื่อซื้อ โดยตรงวิธีการ (เช่นขึ้นอยู่ กับวัฒนธรรม หรือวัฒนธรรมอิสระเทคนิค) อย่างไรก็ตาม ในกรณีที่การศึกษาระบุว่า บุคคลที่มาจากประชากรปลาที่แตกต่างกัน ลำดับจากประชากรแยกมาวิเคราะห์แยกเป็นไลบรารีแตกต่างกัน (ยกเว้นระบุอยู่ในสนับสนุนข้อมูล)

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

การเข้าซื้อกิจการลำดับ
ทั้งหมดไส้ปลาลำดับ 16S rRNA แบคทีเรียที่ได้รับจาก GenBank ยกเว้น
ปลาหางนกยูง (Poecilia reticulata) ห้องสมุดซึ่งถูกสร้างขึ้นผ่านการโคลนและการจัดลำดับ
(ดูข้อมูลสนับสนุนสำหรับรายละเอียด) ชุดข้อมูลทั้งหมด nonguppy ถูกระบุผ่าน
แบบสอบถาม Entrez ใช้คำค้นหาเป้าหมายหรือผ่านการทบทวนวรรณกรรมการตีพิมพ์ใน
ปลาและจุลินทรีย์ในลำไส้ของพวกเขา ลำดับจากแต่ละการศึกษาเหล่านี้ได้รับการในทำนองเดียวกัน
ที่สร้างผ่านแซงเจอร์ลำดับจากผลิตภัณฑ์ PCR ที่ถูกขยายด้วย 'สากล'
ไพรเมอร์ของเชื้อแบคทีเรียดังกล่าวโดยผู้เขียนของการศึกษาที่ ภายในการศึกษาโดยเฉพาะอย่างยิ่งทุก
ลำดับจากหนึ่งในสายพันธุ์ปลานับเป็นห้องสมุดเดียวเมื่อได้มาโดยเดียวกัน
วิธีการ (เช่นวัฒนธรรมขึ้นหรือวัฒนธรรมที่เป็นอิสระเทคนิค) อย่างไรก็ตามในกรณีที่มี
การศึกษาที่ระบุว่าบุคคลที่มาจากประชากรปลาที่แตกต่างกันลำดับจาก
ประชากรแยกวิเคราะห์แยกเป็นห้องสมุดที่แตกต่างกัน (ยกเว้นมีการระบุไว้ใน
ข้อมูลสนับสนุน)