Environmental detection and applica

Environmental detection and application of the speciesspecific
primers
The application of the primer sets was demonstrated by air
sampling and environmental detection of Chrysogenum
complex fungi in London and the Underground. 430 Penicillium
isolates collected from air sampling were tested by PCR using
two of the designed primer sets detecting P. chrysogenum or the
‘Fleming species’. Species distributions between locations
were statistically analysed in Microsoft Excel using the Chisquare
test for independence, analysis of variance (ANOVA)
and the TukeyeKramer test, to significance p < 0.05.

Mating-type frequencies observed were tested against the
null hypothesis of a 1:1 ratio using the Chi-square test for
goodness-of-fit, to significance p < 0.05.

Fungal diversity was recorded from DG18 air sample plates
at 9 d by counting total fungal colonies (Fig 1), Penicillium colonies,
Cladosporium colonies, Aspergillus colonies, other genus
colonies and yeast colonies. Genera counts were performed
and repeated by a mycologist and an undergraduate.

Determination of mating type
46 of the isolates collected were screened for mating type
using MAT1-1 (MAT-1-f, MAT-1-r) and MAT1-2 (MAT-2-f,
MAT-2-r) primer sets (Hoff et al. 2008). Following electrophoresis,
isolates were assigned to either mating type if the
expected amplicon band was detected exclusively in one of
the primer sets (Hoff et al. 2008).

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ตรวจสอบสิ่งแวดล้อมและการประยุกต์ใช้ของ speciesspecificไพรเมอร์การประยุกต์ใช้ชุดพื้นถูกแสดง โดยเครื่องบินตรวจ Chrysogenum sampling และสิ่งแวดล้อมเชื้อราที่ซับซ้อนในลอนดอนและรถไฟใต้ดิน 430 penicilliumแยกจากเครื่องสุ่มตัวอย่างทดสอบ โดย PCR โดยใช้สองพื้นออกแบบชุดตรวจ P. chrysogenum หรือ'สายพันธ์เฟลมมิง' การกระจายพันธุ์ระหว่างที่ตั้งทางสถิติได้ analysed ใน Microsoft Excel โดยใช้การ Chisquareทดสอบความเป็นอิสระ การวิเคราะห์ผลต่างของ (การวิเคราะห์ความแปรปรวน)และ ทดสอบ TukeyeKramer ให้ความสำคัญ p < 0.05สังเกตความถี่ในการผสมพันธุ์ชนิดทดสอบกับการสมมติฐานว่างเป็นอัตราส่วน 1:1 ใช้ทดสอบ Chi-squareความดีของที่เหมาะสม ความสำคัญ p < 0.05ความหลากหลายของเชื้อราถูกบันทึกจากแผ่นตัวอย่างอากาศ DG18ที่ d 9 โดยนับรวมเชื้อราอาณานิคม (ฟิก 1), อาณานิคม PenicilliumCladosporium อาณานิคม Aspergillus อาณานิคม สกุลอื่น ๆอาณานิคมและยีสต์อาณานิคม ดำเนินการตรวจนับในสกุลและซ้ำ mycologist เป็นทางการระดับปริญญาตรีกำหนดชนิดการผสมพันธุ์46 ของการแยกเก็บได้ฉายสำหรับชนิดการผสมพันธุ์ใช้ MAT1-1 (พรม-1-f พรม-1-r) และ MAT1-2 (แผ่น 2 fMAT-2-r) (Hoff et al. 2008) ตั้งพื้น Electrophoresis ดังต่อไปนี้แยกได้ถูกกำหนดให้กับชนิดติดสัดจะแถบคาด amplicon พบเฉพาะในหนึ่งพื้นที่ตั้ง (Hoff et al. 2008)

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

การตรวจสอบด้านสิ่งแวดล้อมและการประยุกต์ใช้ speciesspecific ไพรเมอร์การประยุกต์ใช้ชุดไพรเมอร์ที่ได้รับการแสดงให้เห็นถึงทางอากาศการเก็บตัวอย่างและการตรวจสอบด้านสิ่งแวดล้อมของChrysogenum เชื้อราที่ซับซ้อนในกรุงลอนดอนและใต้ดิน 430 Penicillium แยกเก็บรวบรวมจากการเก็บตัวอย่างอากาศได้รับการทดสอบโดยวิธี PCR โดยใช้ทั้งสองได้รับการออกแบบชุดไพรเมอร์การตรวจสอบchrysogenum พีหรือ'ชนิดเฟลมมิ่ง' การกระจายสายพันธุ์ระหว่างสถานที่ที่ได้มาวิเคราะห์ทางสถิติใน Microsoft Excel โดยใช้ค่าไคสแควทดสอบความเป็นอิสระของการวิเคราะห์ความแปรปรวน(ANOVA) และทดสอบ TukeyeKramer ที่จะมีนัยสำคัญ p <0.05. ความถี่ผสมพันธุ์ชนิดที่สังเกตได้มีการทดสอบกับสมมติฐานของ 1: 1 อัตราการใช้การทดสอบไคสแควร์สำหรับความดีของพอดีความสำคัญp <0.05. ความหลากหลายของเชื้อราได้รับการบันทึกจากแผ่นตัวอย่างอากาศ DG18 ที่ 9 d โดยการนับโคโลนีของเชื้อรารวม (รูปที่ 1) อาณานิคม Penicillium, อาณานิคม Cladosporium อาณานิคม Aspergillus สกุลอื่น ๆอาณานิคมและอาณานิคมยีสต์ นับจำพวกได้ดำเนินการและทำซ้ำโดยพฤกษศาสตร์เห็ดราและระดับปริญญาตรี. การกำหนดประเภทการผสมพันธุ์46 ของเชื้อที่เก็บรวบรวมได้รับการคัดเลือกสำหรับประเภทการผสมพันธุ์โดยใช้MAT1-1 (MAT-1-ฉ, MAT-1-R) และ MAT1-2 (MAT -2-ฉ, MAT-2-R) ชุดไพรเมอร์ (ฮอฟฟ์ et al. 2008) ต่อไปนี้อิเล็ก, สายพันธุ์ได้รับมอบหมายให้ประเภทผสมพันธุ์ทั้งถ้าวง amplicon คาดว่าได้รับการตรวจพบเฉพาะในหนึ่งชุดไพรเมอร์(ฮอฟฟ์ et al. 2008)

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

การตรวจสอบด้านสิ่งแวดล้อม และการใช้ไพรเมอร์ speciesspecific

ใช้ไพรเมอร์ชุด ) โดยการสุ่มตัวอย่างและการตรวจสอบสิ่งแวดล้อมอากาศ

ที่ซับซ้อนของเก๊กฮวยเชื้อราในลอนดอน และใต้ดิน 430 Penicillium
ไอโซ จากการเก็บตัวอย่างอากาศ ทดสอบโดยวิธี PCR โดยใช้ไพรเมอร์ที่ออกแบบ
2 ชุดตรวจหาหน้าเก๊กฮวยหรือ
'fleming ชนิด 'ชนิดการกระจายระหว่างสถานที่
ถูกวิเคราะห์ใน Microsoft Excel โดยใช้ไคสแควร์
ทดสอบความเป็นอิสระ การวิเคราะห์ความแปรปรวน ( ANOVA ) และการทดสอบ tukeyekramer
, .

p < . 05 ) ประเภทคู่ความถี่ทดสอบกับ
สมมติฐานโมฆะของอัตราส่วนเป็น 1 : 1 โดยใช้ไคสแควร์ทดสอบ
ความดีของพอดี ให้ความสำคัญ , p < 0.05 .

ความหลากหลายของราถูกบันทึกจาก dg18 ตัวอย่างอากาศแผ่น
9 D โดยการนับจำนวนโคโลนีของเชื้อรา ( ตารางที่ 1 ) , Penicillium อาณานิคม
พฤติกรรมโคโลนีเชื้อรา Aspergillus อาณานิคม อาณานิคมสกุล
และโคโลนีของยีสต์ สกุลนับจำนวน
ซ้ำโดยผู้ศึกษาเกี่ยวกับเชื้อราและเห็ด และมีนักศึกษา

กำหนดประเภทคู่
46 ของไอโซคัดกรองประเภทคู่
การใช้ mat1-1 ( mat-1-f mat-1-r , ) และ mat1-2 ( mat-2-f
, mat-2-r ) ชุดไพรเมอร์ ( ฮอฟ et al . 2008 ) ดังต่อไปนี้ electrophoresis
ไอโซเลท ได้รับทั้งประเภทคู่ถ้า
คาดว่าและพบเฉพาะในกลุ่มหนึ่งของ
ไพรเมอร์ชุด ( ฮอฟ et al . 2008 )