Scientists have developed a GPS too

Scientists have developed a GPS tool that doesn't tell you where you're at right now, but it can tell you where your ancestors lived a thousand years ago. The new algorithm accurately pinpoints your geographic origin using just bits of your genetic data -- narrowing it down to the country, and in some cases, even the exact village.

In terms of populations, genetic information has been useful for inferring human migrations in the past: beginning with the out-of-Africa event, followed by when humans ventured into Asia for the first time, and then the origin of modern Europeans. But using DNA to pinpoint where modern individuals originated has been limited. Current biogeographical algorithms have an accuracy of 700 kilometers in Europe, and they’ve been even less accurate elsewhere. (On some continents, that margin of error can include at least a couple countries.)

To develop a more precise test for genetic ancestry, a team led by Eran Elhaik from the University of Sheffield, UK, created the Geographical Population Structure algorithm. (Yes, GPS.) It relies on genetic admixture, which occurs when people from different populations start interbreeding and creating new gene pools that represent a mixture of the founder pools. This happened a lot in history, basically whenever someone moves to a new place and starts hanging out with locals. The resulting blend of traits can be used to gauge the distance from home.

“What we have discovered,” Elhaik says in a news release, “is a way to find not where you were born -- as you have that information on your passport -- but where your DNA was formed up to 1,000 years ago by modelling these admixture processes.”

They developed the admixture algorithm using genetic and geographical information from 54 participants recruited through the Genographic Project. And then they tested their GPS tool with 600 genetic samples composed of 98 global subpopulations. Using DNA sequences, GPS can accurately place individuals in their country of origin 83 percent of time.

When they analyzed data from 10 villages in Sardinia and 20 or so islands in Oceania, the team was able to trace a quarter of the Sardinians to their home village and most of the remaining participants within 50 kilometers of their village. For the subjects from Oceania, they were successful at pinpointing their island of origin 90 percent of the time. That's a significant improvement over alternatives that have placed Oceanians in India, Elhaik says.

Knowing where the gene pools that created your DNA were last mixed has huge implications for personalized medicine. An estimated one million people in the U.S. already have their DNA genotyped by companies like 23andme or ancestry.com. The team has developed a website that makes GPS publicly accessible, so if you’ve ever had your DNA genotyped, you can upload your results to find your ancestral home.

The work was published in Nature Communications this week.

Read more at http://www.iflscience.com/health-and-medicine/dna-gps-maps-where-your-ancestors-lived#gMKLiefwHUSIwHSE.99

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

นักวิทยาศาสตร์ได้พัฒนาเครื่องมือ GPS ที่ไม่บอกคุณที่คุณอยู่ในขณะนี้ แต่มันสามารถบอกคุณที่บรรพบุรุษของคุณอยู่เป็นหมื่นปี อัลกอริทึมใหม่ pinpoints กำเนิดของภูมิศาสตร์ที่ใช้บิตเพียงแค่ข้อมูลทางพันธุกรรม - จำกัดให้แคบลงก็ เพื่อประเทศ และ ในบาง กรณี แม้แต่หมู่บ้านแน่นอนอย่างถูกต้อง

ในแง่ของประชากร ข้อมูลทางพันธุกรรมมีประโยชน์สำหรับ inferring ตั้งมนุษย์ในอดีต: เริ่มต้น ด้วยเหตุการณ์ออกของแอฟริกา ตามด้วยเมื่อมนุษย์ ventured ในเอเชียครั้งแรก แล้วจุดเริ่มต้นของยุโรปสมัยนั้น แต่ใช้ดีเอ็นเอเพื่อระบุที่ใดของบุคคลทันสมัยถูกจำกัด อัลกอริทึม biogeographical ปัจจุบันมีความถูกต้องของยุโรป 700 กิโลเมตร และพวกเขาได้รับแม้กระทั่งเทียบอื่น (ในบางทวีป ที่ขอบของข้อผิดพลาดสามารถมีน้อยไม่กี่ประเทศ)

การพัฒนาทดสอบอย่างละเอียดสำหรับพันธุวงศ์ ทีมนำ โดย Eran Elhaik จากมหาวิทยาลัยเชฟฟิลด์ UK สร้างอัลกอริทึมโครงสร้างประชากรภูมิศาสตร์ (ใช่ จีพีเอส) มันใช้ในงานผลิตทางพันธุกรรม ซึ่งเกิดขึ้นเมื่อคนจากประชากรที่แตกต่างกัน interbreeding และสร้างสระว่ายน้ำใหม่ของยีนที่แสดงถึงส่วนผสมของกลุ่มผู้ก่อตั้งที่เริ่มต้น เกิดขึ้นมากในประวัติศาสตร์ โดยทั่วไปทุกคนย้ายไปใหม่ และเริ่มห้อยออกกับชาวบ้าน สามารถใช้ผสมได้ลักษณะจะวัดระยะห่างจากบ้าน

"ที่เราได้ค้นพบ"Elhaik กล่าวว่า ในการปล่อยข่าว "เป็นวิธีการค้นหาไม่ซึ่งคุณเกิด - เท่าที่คุณมีข้อมูลหนังสือของคุณ — แต่ที่ดีเอ็นเอของคุณก่อขึ้นไป 1000 ปี โดยสร้างแบบจำลองกระบวนการผลิตเหล่านี้"

จะพัฒนาอัลกอริทึมผลิตโดยใช้ข้อมูลทางพันธุกรรม และทางภูมิศาสตร์จาก 54 ร่วมพิจารณาผ่านโครงการ Genographic แล้ว ก็ทดสอบเครื่องมือ GPS ของพวกเขากับ 600 ตัวอย่างพันธุกรรมประกอบด้วยโลก subpopulations 98 ใช้ลำดับดีเอ็นเอ จีพีเอสสามารถแม่นยำวางบุคคลในประเทศของตนร้อยละ 83 จุดเริ่มต้นของเวลา

เมื่อจะวิเคราะห์ข้อมูลจาก 10 หมู่บ้านใน Sardinia และ 20 หรือให้เกาะในโอเชียเนีย ทีมงานได้ติดตามสี่ Sardinians หมู่บ้านของพวกเขาและส่วนใหญ่ของผู้เข้าร่วมเหลือ 50 กิโลเมตรของหมู่บ้านของพวกเขา สำหรับวิชาจากโอเชียเนีย พวกเขาได้ประสบความสำเร็จใน pinpointing เกาะของพวกเขากำเนิดร้อยละ 90 ของเวลา Elhaik กล่าวว่า เป็นการปรับปรุงอย่างมีนัยสำคัญมากกว่าทางเลือกที่ทำ Oceanians ในอินเดีย

รู้ที่ล่าสุดรวบรวมกลุ่มของยีนที่สร้างดีเอ็นเอของคุณมีผลใหญ่สำหรับยาส่วนบุคคล มีคนหนึ่งล้านโดยประมาณในสหรัฐอเมริกามี DNA ของพวกเขา genotyped โดยบริษัทเช่น 23andme หรือ ancestry.com ทีมงานได้พัฒนาเว็บไซต์ที่ทำให้ GPS ทั่วไปสามารถเข้าถึงได้ ดังนั้นถ้าคุณเคยพบว่าดีเอ็นเอของคุณ genotyped คุณสามารถอัปโหลดผลการค้นหาบ้านโบราณ

งานถูกเผยแพร่ในสื่อสารธรรมชาติสัปดาห์นี้

อ่านเพิ่มเติมที่ http://www.iflscience.com/health-and-medicine/dna-gps-maps-where-your-ancestors-lived #gMKLiefwHUSIwHSE.99

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

นักวิทยาศาสตร์ได้พัฒนาเครื่องมือจีพีเอสที่ไม่ได้บอกคุณที่คุณอยู่ที่ในขณะนี้ แต่ก็สามารถบอกคุณได้ที่บรรพบุรุษของคุณมีชีวิตอยู่อีกพันกว่าปีที่ผ่านมา ขั้นตอนวิธีการใหม่อย่างถูกต้อง pinpoints แหล่งกำเนิดทางภูมิศาสตร์ของคุณโดยใช้เพียงบิตของข้อมูลทางพันธุกรรมของคุณ - ลดมันลงไปยังประเทศและในบางกรณีแม้หมู่บ้านที่แน่นอนในแง่ของประชากรข้อมูลทางพันธุกรรมที่ได้รับประโยชน์ในการอนุมานของมนุษย์ในการโยกย้าย ผ่านมา: เริ่มต้นด้วยเหตุการณ์ออกจากทวีปแอฟริกาตามด้วยเมื่อมนุษย์เข้าไปในเอเชียเป็นครั้งแรกและจากนั้นที่มาของชาวยุโรปที่ทันสมัย แต่การใช้ดีเอ็นเอเพื่อหาบุคคลที่ทันสมัยมาได้ถูก จำกัด ขั้นตอนวิธีการ biogeographical ปัจจุบันมีความถูกต้องของ 700 กิโลเมตรในยุโรปและพวกเขาได้รับได้ถูกต้องน้อยกว่าที่อื่น ๆ (ในทวีปบางขอบของข้อผิดพลาดที่สามารถรวมอย่างน้อยประเทศคู่.) เพื่อพัฒนาแบบทดสอบที่มีความแม่นยำมากขึ้นสำหรับบรรพบุรุษพันธุกรรมนำทีมโดย Eran Elhaik จากมหาวิทยาลัยเชฟฟิลด์, สหราชอาณาจักรขั้นตอนวิธีการสร้างโครงสร้างประชากรทางภูมิศาสตร์ (ใช่จีพีเอส.) มันอาศัยส่วนผสมทางพันธุกรรมซึ่งเกิดขึ้นเมื่อผู้คนจากประชากรที่แตกต่างกันเริ่มต้นการผสมข้ามพันธุ์และการสร้างสระว่ายน้ำของยีนใหม่ที่เป็นตัวแทนของส่วนผสมของสระว่ายน้ำผู้ก่อตั้ง เรื่องนี้เกิดขึ้นมากในประวัติศาสตร์โดยทั่วไปเมื่อใดก็ตามที่มีคนย้ายไปยังสถานที่ใหม่และเริ่มห้อยออกกับชาวบ้าน การผสมผสานที่เกิดขึ้นในลักษณะที่สามารถใช้ในการวัดระยะทางจากบ้าน"สิ่งที่เราได้ค้นพบ" Elhaik กล่าวว่าในข่าวประชาสัมพันธ์ "เป็นวิธีที่จะหาไม่ได้ที่คุณเกิด - ที่คุณมีที่ข้อมูลเกี่ยวกับหนังสือเดินทางของคุณ - แต่ที่ดีเอ็นเอของคุณถูกสร้างขึ้นถึง 1,000 ปีที่ผ่านมาโดยการสร้างแบบจำลองกระบวนการผสมเหล่านี้ ". พวกเขาพัฒนาขั้นตอนวิธีการผสมโดยใช้ข้อมูลทางพันธุกรรมและทางจาก 54 ผู้เข้าร่วมรับการคัดเลือกผ่านโครงการ Genographic และแล้วพวกเขาก็ผ่านการทดสอบเครื่องมือจีพีเอสของพวกเขาด้วย 600 ตัวอย่างพันธุกรรมประกอบด้วย 98 ประชากรทั่วโลก ใช้ดีเอ็นเอจีพีเอสอย่างถูกต้องสามารถวางบุคคลในประเทศของพวกเขาที่มา 83 เปอร์เซ็นต์ของเวลาเมื่อพวกเขาวิเคราะห์ข้อมูลจาก 10 หมู่บ้านในซาร์ดิเนียและ 20 หรือดังนั้นหมู่เกาะโอเชียเนียในทีมก็สามารถที่จะติดตามในสี่ของ Sardinians ไปที่บ้านของพวกเขา หมู่บ้านและส่วนใหญ่ของผู้เข้าร่วมที่เหลือภายใน 50 กิโลเมตรจากหมู่บ้านของพวกเขา สำหรับอาสาสมัครจากโอเชียเนียที่พวกเขาประสบความสำเร็จใน pinpointing เกาะมา 90 เปอร์เซ็นต์ของเวลาของพวกเขา นั่นคือการปรับปรุงที่สำคัญกว่าทางเลือกที่มีอยู่ Oceanians ในอินเดีย Elhaik กล่าวว่ารู้ที่สระว่ายน้ำของยีนที่สร้างดีเอ็นเอของคุณได้ผ่านการผสมมีความหมายอย่างมากสำหรับยาเฉพาะบุคคล ประมาณหนึ่งล้านคนในสหรัฐอเมริกามีดีเอ็นเอของพวกเขา genotyped โดย บริษัท เช่น 23andMe หรือ ancestry.com ทีมงานได้มีการพัฒนาเว็บไซต์ที่ทำให้จีพีเอสที่สาธารณชนสามารถเข้าถึงดังนั้นหากคุณเคยได้ดีเอ็นเอของคุณ genotyped คุณสามารถอัปโหลดผลของคุณเพื่อหาบ้านของบรรพบุรุษของคุณทำงานได้รับการตีพิมพ์ในธรรมชาติการสื่อสารในสัปดาห์นี้อ่านเพิ่มเติมได้ที่

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

นักวิทยาศาสตร์ได้พัฒนาเครื่องมือ GPS ที่ไม่ได้บอกเธอในตอนนี้ แต่มันสามารถบอกคุณได้ว่าบรรพบุรุษของคุณอยู่พันกว่าปีมาแล้ว ขั้นตอนวิธีการใหม่ที่ถูกต้องตรงจุดกำเนิดทางภูมิศาสตร์ของคุณโดยใช้เพียงบิตของข้อมูลทางพันธุกรรม . . . . . . ลดลง ประเทศและในบางกรณีแม้หมู่บ้านแน่นอน

ในส่วนของประชากรข้อมูลทางพันธุกรรมที่ได้รับประโยชน์สำหรับมนุษย์ migrations ในอดีต : เริ่มต้นด้วยเหตุการณ์ของแอฟริกา รองลงมา คือ เมื่อมนุษย์ ventured ลงในเอเชียเป็นครั้งแรก และจากนั้น จุดเริ่มต้นของสมัยใหม่ชาวยุโรป แต่การใช้ดีเอ็นเอเพื่อระบุบุคคลที่ทันสมัยขึ้นได้จำกัด ขั้นตอนวิธี biogeographical ปัจจุบันมีความถูกต้องถึง 700 กิโลเมตรในยุโรปและพวกเขาได้รับแม้แต่ความถูกต้องน้อยกว่าที่อื่น ( ในบางทวีป ที่ขอบของข้อผิดพลาดสามารถรวมอย่างน้อยสองประเทศ )

เพื่อพัฒนาทดสอบความแม่นยำสำหรับเชื้อสายทางพันธุกรรม , ทีมที่นำโดย จึง elhaik จากมหาวิทยาลัยเชฟฟิลด์ สหราชอาณาจักร สร้างโครงสร้างทางภูมิศาสตร์ ประชากร ขั้นตอนวิธีการ ( ใช่ , GPS ) มันขึ้นอยู่กับพันธุกรรม สารผสมซึ่งเกิดขึ้นเมื่อบุคคลจากประชากรเริ่มต้นการผสมข้ามสายพันธุ์ และการสร้างใหม่ของยีนสระที่เป็นตัวแทนของส่วนผสมของผู้ก่อตั้งสระ นี้เกิดขึ้นมากมายในประวัติศาสตร์ โดยทั่วไปเมื่อมีการย้ายไปยังสถานที่ใหม่และเริ่มห้อยออกกับชาวบ้าน ผลลัพธ์ผสมของลักษณะที่สามารถใช้เพื่อวัดระยะทางจากบ้าน

" สิ่งที่เราได้ค้นพบ" elhaik กล่าวว่าในข่าวปล่อย " เป็นวิธีที่จะหาไม่ว่าคุณเกิดที่ไหน ที่คุณมีข้อมูลเกี่ยวกับหนังสือเดินทางของคุณ -- แต่ที่ดีเอ็นเอของคุณก่อตั้งขึ้นถึง 1 , 000 ปีมาแล้ว โดยการสร้างแบบจำลองกระบวนการผสมเหล่านี้ . "

เขาพัฒนาอัลกอริทึมพันธุกรรมและการผสมข้อมูลทางภูมิศาสตร์จาก 54 ผู้เข้าร่วมคัดเลือกผ่าน การเปลี่ยนแปลง .แล้วพวกเขาใช้เครื่องมือ GPS กับ 600 พันธุกรรมจำนวน 98 โลกแต่ละ . การลำดับดีเอ็นเอ , GPS สามารถบอกสถานที่บุคคลในประเทศต้นกําเนิดของ 83 เปอร์เซ็นต์ของเวลา

เมื่อพวกเขาวิเคราะห์ข้อมูลจาก 10 หมู่บ้านในซาร์ดิเนียและ 20 หรือดังนั้น หมู่เกาะในมหาสมุทรทีมก็สามารถที่จะติดตามรายไตรมาสของ sardinians หมู่บ้านที่บ้านของพวกเขาและส่วนใหญ่ของผู้เข้าร่วมที่เหลือภายใน 50 กิโลเมตรจากหมู่บ้านของพวกเขา สําหรับวิชาจากโอเชียเนีย พวกเขาประสบความสำเร็จใน pinpointing เกาะต้นกําเนิดของ 90 เปอร์เซ็นต์ของเวลา นั่นคือการปรับปรุงอย่างมีนัยสำคัญมากกว่าทางเลือกที่ได้วางไว้ oceanians ในอินเดีย elhaik กล่าว

รู้ว่ายีนสระว่ายน้ำที่สร้างดีเอ็นเอของคุณสุดท้ายผสมมีผลกระทบขนาดใหญ่สำหรับการแพทย์ส่วนบุคคล ประมาณหนึ่งล้านคนในสหรัฐอเมริกามีดีเอ็นเอของพวกเขา genotyped โดย บริษัท เช่น 23andme หรือ ancestry.com . ทีมงานได้พัฒนาเว็บไซต์ที่ทำให้ GPS ที่สาธารณชนสามารถเข้าถึงได้ ดังนั้น หากคุณเคยมี genotyped DNA ของคุณ ,คุณสามารถอัปโหลดผลลัพธ์ของคุณเพื่อหาบ้านของบรรพบุรุษของคุณ

งานสื่อสารธรรมชาติถูกตีพิมพ์ในสัปดาห์นี้

อ่านเพิ่มเติมที่ http : / / www.iflscience . com / สุขภาพและการแพทย์ / ดีเอ็นเอแผนที่ GPS ซึ่งบรรพบุรุษของคุณอยู่# gmkliefwhusiwhse.99