MCoTI-I and MCoTI-II (short for Mom

MCoTI-I and MCoTI-II (short for Momordica cochinchinensisTrypsin Inhibitor-I and -II, respectively) are attractive candidates for developing novel intracellular-targeting drugs because both are exceptionally stable and can internalize into cells. These seed-derived cystine knot peptides are examples of how natural product discovery efforts can lead to biomedical applications. However, discovery efforts are sometimes hampered by the limited availability of seed materials, highlighting the need for efficient extraction methods. In this study, we assessed five extraction methods using M. cochinchinensis seeds, a source of well-characterized cystine knot peptides. The most efficient extraction of nine known cystine knot peptides was achieved by a method based on acetonitrile/water/formic acid (25:24:1), followed by methods based on sodium acetate (20 mM, pH 5.0), ammonium bicarbonate (5 mM, pH 8.0), and boiling water. On average, the yields obtained by these four methods were more than 250-fold higher than that obtained using dichloromethane/methanol (1:1) extraction, a previously applied standard method. Extraction using acetonitrile/water/formic acid (25:24:1) yielded the highest number of reconstructed masses within the majority of plant-derived cystine knot peptide mass range but only accounted for around 50% of the total number of masses, indicating that any single method may result in under-sampling. Applying acetonitrile/water/formic acid (25:24:1), boiling water, and ammonium bicarbonate (5 mM, pH 8.0) extractions either successively or discretely significantly increased the sampling number. Overall, acetonitrile/water/formic acid (25:24:1) can facilitate efficient extraction of cystine-knot peptides from M. cochinchinensis seeds but for discovery purposes the use of a combination of extraction methods is recommended where practical.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

MCoTI-MCoTI- ดาว (สั้นสำหรับสมุนไพร cochinchinensisTrypsin เตอร์- - ดาว ตามลำดับ) มีผู้สมัครที่น่าสนใจสำหรับการพัฒนายาเป้าหมาย intracellular นวนิยาย เพราะทั้งสองมีล้ำมีเสถียรภาพ และสามารถ internalize ลงในเซลล์ เปปไทด์ปม cystine มาเมล็ดเหล่านี้เป็นตัวอย่างของความพยายามวิธีธรรมชาติผลิตภัณฑ์ค้นพบสามารถนำไปประยุกต์ทางชีวการแพทย์ อย่างไรก็ตาม ความพยายามค้นหาอยู่บางครั้งขัดขวาง โดยพร้อมจำกัดวัสดุเมล็ด เน้นความต้องการสำหรับวิธีการสกัดที่มีประสิทธิภาพ ในการศึกษานี้ เราประเมินวิธีสกัดห้าใช้ม.ปักเป้าดำเมล็ดพันธุ์ แหล่งที่มาของเปปไทด์ cystine characterized แห่งปม มีประสิทธิภาพสูงสุดสกัดเปปไทด์ปม cystine รู้จักเก้าสำเร็จ โดยวิธีตาม acetonitrile/น้ำ/formic กรด (25:24:1), ตามวิธีตามโซเดียม acetate (20 มม. pH 5.0), แอมโมเนียมไบคาร์บอเนต (5 มม. pH 8.0), และน้ำเดือด โดยเฉลี่ย อัตราผลตอบแทนที่ได้รับ โดยวิธีการสี่เหล่านี้ได้มากกว่า 250-fold สูงกว่าที่รับใช้สกัด dichloromethane/เม ทานอล (1:1) วิธีการมาตรฐานที่ใช้ก่อนหน้านี้ แยกใช้ acetonitrile/น้ำ/formic กรด (25:24:1) หาจำนวนมวลชนที่สร้างขึ้นใหม่ภายในส่วนใหญ่ของพืชมา cystine ปมเพปไทด์โดยรวมช่วงสูงสุด แต่เพียง คิดประมาณ 50% ของจำนวนมวลชน การบ่งชี้ว่า มีวิธีเดียวอาจส่งผลในการสุ่มตัวอย่างน้อย ใช้ acetonitrile/น้ำ/formic กรด (25:24:1), ต้มน้ำ และสกัดแอมโมเนียมไบคาร์บอเนต (5 มม. pH 8.0) หรือติด ๆ กัน หรือนี่เพิ่มหมายเลขสุ่ม โดยรวม acetonitrile/น้ำ/formic กรด (25:24:1) สามารถช่วยสกัดเปปไทด์ cystine ปมมีประสิทธิภาพจากม.ปักเป้าดำเมล็ด แต่สำหรับการค้นหา การใช้การรวมกันของวิธีการสกัดแนะนำที่ปฏิบัติ

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

MCoTI-I และ MCoTI-II (ย่อมาจากมะระ cochinchinensisTrypsin ยับยั้ง-I และ -II ตามลำดับ) มีผู้สมัครที่น่าสนใจสำหรับการพัฒนายาเสพติดการกำหนดเป้​​าหมายภายในเซลล์นวนิยายเพราะทั้งสองมีความพิเศษที่มีเสถียรภาพและสามารถ internalize เข้าสู่เซลล์ เปปไทด์เหล่านี้ปมซีสตีนเมล็ดที่ได้มาเป็นตัวอย่างของวิธีการที่ผลิตภัณฑ์ธรรมชาติที่ค้นพบความพยายามที่จะนำไปสู่​​การใช้งานทางการแพทย์ อย่างไรก็ตามความพยายามที่จะขัดขวางการค้นพบบางครั้งโดยมีจำนวน จำกัด ของวัสดุเมล็ดเน้นความจำเป็นในการวิธีการสกัดที่มีประสิทธิภาพ ในการศึกษานี้เราประเมินห้าวิธีการสกัดโดยใช้เอ็มเมล็ด cochinchinensis แหล่งที่มาของความโดดเด่นในซีสตีนเปปไทด์ปม การสกัดที่มีประสิทธิภาพมากที่สุดของเก้าที่รู้จักกันในซีสตีนเปปไทด์ปมก็ประสบความสำเร็จด้วยวิธีการขึ้นอยู่กับ acetonitrile / น้ำ / กรด (25: 24: 1) ตามด้วยวิธีการขึ้นอยู่กับ acetate โซเดียม (20 มิลลิค่า pH 5.0), แอมโมเนียมไบคาร์บอเนต (5 มิลลิค่า pH 8.0) และน้ำเดือด โดยเฉลี่ยอัตราผลตอบแทนที่ได้จากการเหล่านี้สี่วิธีการมากกว่า 250 เท่าสูงกว่านั้นได้ใช้ไดคลอโรมีเทน / เมทานอล (1: 1) การสกัดที่ใช้ก่อนหน้านี้วิธีการมาตรฐาน การสกัดโดยใช้ acetonitrile / น้ำ / กรด (25: 24: 1) ให้ผลจำนวนมากที่สุดของมวลสร้างขึ้นใหม่ภายในส่วนใหญ่ของพืชที่ได้มาจากซีสตีนปมช่วงมวลเปปไทด์ แต่คิดเป็นประมาณ 50% ของจำนวนเสียงทั้งหมดของมวลชนแสดงให้เห็นว่า ใด ๆ วิธีการเดียวอาจส่งผลในภายใต้การสุ่มตัวอย่าง การใช้ acetonitrile / น้ำ / กรด (25: 24: 1) น้ำเดือดและแอมโมเนียมไบคาร์บอเนต (5 มิลลิค่า pH 8.0) การสกัดสารอย่างใดอย่างหนึ่งต่อเนื่องหรือ discretely เพิ่มขึ้นอย่างมากจำนวนการสุ่มตัวอย่าง โดยรวม, acetonitrile / น้ำ / กรด (25: 24: 1) สามารถอำนวยความสะดวกในการสกัดที่มีประสิทธิภาพของเปปไทด์ซีสตีนจากปมเอ็ม cochinchinensis เมล็ด แต่สำหรับวัตถุประสงค์การค้นพบการใช้งานของการรวมกันของวิธีการสกัดที่จะแนะนำการปฏิบัติที่

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

และ mcoti-i mcoti II ( สั้นสำหรับสมุนไพร cochinchinensistrypsin inhibitor-i และ - 2 ตามลำดับ ) มีผู้สมัครที่น่าสนใจสำหรับการพัฒนายาใหม่ในเซลล์เป้าหมาย เพราะทั้งสองจะมั่นคงเป็นพิเศษและสามารถขึ้นลงในเซลล์ เมล็ดเหล่านี้ได้มาซีสตีนปมเปปไทด์ที่เป็นตัวอย่างของวิธีการในการค้นพบผลิตภัณฑ์ธรรมชาติสามารถนำไปสู่การประยุกต์ใช้ชีวการแพทย์ . อย่างไรก็ตามความพยายามบางครั้งก็เป็น hampered โดยการใช้เมล็ดพันธุ์ จำกัด วัสดุเน้นความต้องการสำหรับการสกัดด้วยวิธีที่มีประสิทธิภาพ ในการศึกษานี้เราประเมิน 5 วิธีการสกัดโดยใช้ม. cochinchinensis เมล็ดเป็นแหล่งดีลักษณะปมซีสทีนเปปไทด์การสกัดที่มีประสิทธิภาพมากที่สุดของเก้ารู้จักซีสทีนเปปไทด์เป็นปมได้โดยวิธีการตามไน / น้ำ / กรด ( 25:24:1 ) ตามด้วย โดยวิธีโซเดียมอะซิเตต ( 20 มม. , pH 5.0 ) , แอมโมเนียมไบคาร์บอเนต ( 5 มิลลิโมลาร์ pH 8.0 ) และต้ม เฉลี่ย ผลผลิตที่ได้จากวิธีการเหล่านี้สี่มากกว่า 250 พับที่สูงกว่าที่ได้รับโดยใช้ไดคลอโรมีเทน / เมทานอล ( 11 ) การสกัด ก่อนหน้านี้ใช้วิธีการมาตรฐาน . การสกัดโดยใช้ไน / น้ำ / กรด ( 25:24:1 ) คือจำนวนสูงสุดของข้อมูลมวลภายในส่วนใหญ่ของพืชซึ่งซีสตีนปมเปปไทด์ช่วงมวล แต่คิดเป็นประมาณ 50% ของจำนวนทั้งหมดของมวลชน ระบุว่า วิธีการใด ๆเดียวอาจส่งผลในการสุ่มตัวอย่างการใช้ไน / น้ำ / กรด ( 25:24:1 ) ต้มน้ำ และ แอมโมเนียม ไบคาร์บอเนต ( 5 มิลลิโมลาร์ pH 8.0 ) การสกัดด้วยอย่างต่อเนื่องหรือเพิ่มขึ้นได้ 2 เบอร์ โดยรวม , ไน / น้ำ / กรด ( 25:24:1 ) สามารถช่วยในการสกัดที่มีประสิทธิภาพของซิสทีนเปปไทด์จากปมม.cochinchinensis เมล็ด แต่สำหรับวัตถุประสงค์ของการค้นพบการใช้การรวมกันของวิธีการสกัดแนะนําที่ปฏิบัติ