ResultsAssemblages of endophytic ba

Results
Assemblages of endophytic bacteria in chili pepper
A total of 283 endophytic bacteria were isolated from leaf, stem
and root samples of 45 chili pepper plants. Total 900 tissue
segments were plated where 300 tissue segments were plated in
every tissue samples. The general isolation frequency was 0.31.
However, the IR and IF in leaf, stem and root samples were
4.9%, 44.9% & 50.2% and 0.05, 0.42 & 0.47, respectively
(Table 1). Maximum number of isolates was recovered from
root samples, whereas leaf samples showed lower endophytic
bacterial assemblages. According to the macromorphological
characteristics, endophytic bacteria were grouped into 44
morpho-groups and representative isolates were assigned to the
genus or species level based on 16S rDNA gene sequence
analysis. Fourteen distinctive bacterial genotypes were detected
at a >97% sequence similarity threshold (Table 2). A
comparison of these sequences with the databases of valid
species by using the EzTaxon server showed a very high
sequence similarity to the type strains of the corresponding
species. The isolate CNU082012 showed 100% sequence
similarity with the sequences of bacteria Bacillus
methylotrophicus CBMB205T. This GenBank strain is type
strain. Many isolates showed 99-100% sequence similariy with
the type strain Pseudomonas aeruginosa LMG 1242T and the
isolates were CNU082120, CNU082123, CNU082135,
CNU082137, CNU082140, CNU082141 and CNU082142 (Fig.
2). Isolates CNU082015, CNU082021, CNU082022,
CNU082025 and CNU082026 were 99% identical to the type
strain Bacillus aryabhattai B8W22T. The isolate CNU082036
showed 96.1% sequence similarity with its reference strains. In
some cases, the sequence similarity below 97% is not
acceptable for the identification of bacteria. But the
phylogenetic tree showed high bootstrap value (92%) which
supported that the isolate would be Pantoea anthophila (Fig. 3).
Results showed that the most abundant genus was
Pseudomonas followed by Bacillus and Burkholderia. A
diverse range of other bacterial taxa were isolated and
identified, including isolates of the genera Actinobacter,
Arthrobacter, Enterobacter, Escherichia, Kitasatospora,
Pandoraea, Pantoea, Rhizobium, Ralstonia, Paenibacillus and
Serratia.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ผลลัพธ์Assemblages ของแบคทีเรีย endophytic ในพริกจำนวน 283 endophytic แบคทีเรียถูกแยกต่างหากจากใบ เกิดและรากของพืชพริก 45 รวม 900 เนื้อเยื่อเซกเมนต์ถูกชุบ 300 เนื้อเยื่อส่วนที่ถูกชุบในตัวอย่างเนื้อเยื่อทุก ความถี่ทั่วไปแยกเป็น$ 0.31อย่างไรก็ตาม IR และถ้าในตัวอย่างก้าน ใบ และรากมี4.9%, 44.9% และ 50.2 สา% และ 0.05, 0.42 และ 0.47 ตามลำดับ(ตาราง 1) จำนวนแยกถูกกู้คืนจากรากตัวอย่าง ในขณะที่ตัวอย่างใบไม้ที่แสดงให้เห็นว่าล่าง endophyticassemblages แบคทีเรีย ตาม macromorphologicalลักษณะ แบคทีเรีย endophytic ถูกแบ่งออกเป็น 44morpho กลุ่มและแยกพนักงานถูกกำหนดให้กับการระดับสกุลหรือชนิดตามลำดับยีน rDNA 16Sวิเคราะห์ พบศึกษาจีแบคทีเรียเด่นสิบสี่โนไทป์ที่เป็น > 97% ลำดับคล้ายจำกัด (ตารางที่ 2) Aเปรียบเทียบลำดับเหล่านี้กับฐานข้อมูลของที่ถูกต้องพันธุ์ โดยการใช้เซิร์ฟเวอร์ EzTaxon ที่แสดงให้เห็นว่าสูงมากลำดับคล้ายกับสายพันธุ์ชนิดของให้สอดคล้องกับสายพันธ์ CNU082012 แยกแสดงลำดับ 100%ความคล้ายคลึงกันกับลำดับของแบคทีเรียคัดmethylotrophicus CBMB205T ชนิดนี้ต้องใช้ GenBank คือต้องใช้ หลายแยก similariy ลำดับแสดง 99-100% ด้วยชนิดสายพันธุ์ Pseudomonas aeruginosa LMG 1242T และแยกได้ CNU082120, CNU082123, CNU082135CNU082137, CNU082140, CNU082141 และ CNU082142 (ฟิก2) การแยก CNU082015, CNU082021, CNU082022CNU082025 และ CNU082026 ได้ 99% เหมือนกับชนิดสายพันธุ์คัด aryabhattai B8W22T CNU082036 แยกพบ 96.1% ลำดับคล้ายกับสายพันธุ์ของอ้างอิง ในบางกรณี เฉพาะลำดับต่ำกว่า 97% ไม่ได้ยอมรับได้สำหรับรหัสของแบคทีเรีย แต่ค่าเริ่มต้นระบบสูง (92%) แสดงให้เห็นว่า phylogenetic tree ซึ่งสนับสนุนว่าการแยกจะเป็น Pantoea anthophila (Fig. 3)ผลลัพธ์ที่แสดงให้เห็นว่า ตระกูลนี้อุดมสมบูรณ์มากที่สุดคือลีตามคัดและ Burkholderia Aหลากหลาย taxa แบคทีเรียอื่น ๆ ถูกแยก และระบุ รวมทั้งแยกของสกุล ActinobacterArthrobacter, Enterobacter, Escherichia, KitasatosporaPandoraea, Pantoea ไรโซเบียม Ralstonia, Paenibacillus และSerratia

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ผลResults
assemblages Assemblages of endophytic bacteria in chili pepper
ของเชื้อแบคทีเรียเอนโดไฟท์ในพริกรวม283 A total of 283 endophytic bacteria were isolated from leaf, stem
แบคทีเรียเอนโดไฟท์ที่แยกได้จากใบลำต้นและรากของกลุ่มตัวอย่าง45 รวม and root samples of 45 chili pepper plants. Total 900 tissue
เนื้อเยื่อส่วนถูกชุบที่300 segments were plated where 300 tissue segments were plated in
ส่วนเนื้อเยื่อถูกชุบในทุกตัวอย่างเนื้อเยื่อ ความถี่ในการแยกทั่วไป every tissue samples. The general isolation frequency was 0.31.
อย่างไรก็ตาม However, the IR and IF in leaf, stem and root samples were
4.9%, 44.9% 4.9%, 44.9% & 50.2% and 0.05, 0.42 & 0.47, respectively
( จำนวนสูงสุดของสายพันธุ์ได้รับการกู้คืนจากตัวอย่างรากในขณะที่กลุ่มตัวอย่างที่แสดงให้เห็นว่าใบที่ต่ำกว่าเอนโดไฟท์assemblages ตามที่ ลักษณะแบคทีเรียเอนโดไฟท์ที่ถูกแบ่งออกเป็น Morpho กลุ่มไอโซเลทและตัวแทนได้รับมอบหมายให้ระดับประเภทหรือชนิดขึ้นอยู่กับยีน16S rDNA ลำดับการวิเคราะห์ (Table 1). Maximum number of isolates was recovered from
root samples, whereas leaf samples showed lower endophytic
bacterial assemblages. According to the macromorphological
characteristics, endophytic bacteria were grouped into 44
morpho-groups and representative isolates were assigned to the
genus or species level based on 16S rDNA gene sequence
analysis. Fourteen distinctive bacterial genotypes were detected
at a >97% sequence similarity threshold (Table 2). A
comparison of these sequences with the databases of valid
species by using the EzTaxon server showed a very high
sequence similarity to the type strains of the corresponding
species. The isolate CNU082012 showed 100% sequence
similarity with the sequences of bacteria Bacillus
methylotrophicus CBMB205T. This GenBank strain is type
strain. Many isolates showed 99-100% sequence similariy with
the type strain Pseudomonas aeruginosa LMG 1242T and the
isolates were CNU082120, CNU082123, CNU082135,
CNU082137, CNU082140, CNU082141 and CNU082142 (Fig.
2). Isolates CNU082015, CNU082021, CNU082022,
CNU082025 and CNU082026 were 99% identical to the type
strain Bacillus aryabhattai B8W22T. The isolate CNU082036
showed 96.1% sequence similarity with its reference strains. In
some cases, the sequence similarity below 97% is not
acceptable for the identification of bacteria. But the
phylogenetic tree showed high bootstrap value (92%) which
supported that the isolate would be Pantoea anthophila (Fig. 3).
Results showed that the most abundant genus was
Pseudomonas followed by Bacillus and Burkholderia. A
diverse range of other bacterial taxa were isolated and
identified, including isolates of the genera Actinobacter,
Arthrobacter, Enterobacter, Escherichia, Kitasatospora,
Pandoraea, Pantoea, Rhizobium, Ralstonia, Paenibacillus and
Serratia.

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ผลของแบคทีเรียเอนโดไฟท์ในทะเลของทะเล

เป็นพริกทั้งหมด 283 แบคทีเรียเอนโดไฟท์ที่แยกได้จากใบ ลำต้น และราก
จำนวน 45 พริกพืช รวม 900 เนื้อเยื่อ
ส่วนถูกชุบที่ 300 ส่วนที่เป็นเนื้อเยื่อชุบ
ทุกตัวอย่างเนื้อเยื่อ . แยกทั่วไปความถี่ 0.31 .
แต่ IR และถ้าในใบ ลำต้น และราก จำนวน
4.9 ร้อยละ 44.9 และ& 50.2 % 005 , 0.42 & 0.47 ตามลำดับ
( ตารางที่ 1 ) จำนวนสูงสุดของสายพันธุ์คือหายจาก
ตัวอย่างราก ในขณะที่ตัวอย่างใบแสดงลดรา
แบคทีเรียทะเลของทะเล . ตามลักษณะ macromorphological
, แบคทีเรียเอนโดไฟท์แบ่งตามกลุ่มและเป็นตัวแทนจาก 44
Morpho ได้รับ
สกุลชนิด หรือระดับจากการวิเคราะห์ลำดับยีน 16S rDNA
.ที่ตรวจพบแบคทีเรียพันธุ์ 14
ที่ > 97% ความเหมือนของลำดับ ( ตารางที่ 2 ) เป็นลำดับ
เปรียบเทียบเหล่านี้กับฐานข้อมูลของสายพันธุ์ที่ถูกต้อง
โดยใช้ eztaxon เซิร์ฟเวอร์แสดงความเหมือนลำดับสูง
มากประเภทสายพันธุ์ของชนิดเดียวกัน

แยก cnu082012 พบ 100% ความคล้ายคลึงกับลำดับของการเรียงลำดับ

แบคทีเรียบาซิลลัสmethylotrophicus cbmb205t นี้ขนาดเมื่อยชนิด
เมื่อย หลายสายพันธุ์ พบ 99-100 % ตามลำดับ similariy กับ
ชนิดสายพันธุ์ Pseudomonas aeruginosa lmg 1242t และไอโซเลท cnu082120 cnu082123
,
cnu082137 cnu082140 cnu082135 , , , , และ cnu082141 cnu082142 ( ภาพที่
2 ) สายพันธุ์ cnu082015 cnu082021 cnu082022
, , , และ cnu082025 cnu082026 เป็น 99% เหมือนประเภท
Bacillus สายพันธุ์ aryabhattai b8w22t . แยก cnu082036
พบ 96.1 % ความเหมือนกับลำดับของสายพันธุ์อ้างอิง . ใน
บางกรณี ลำดับความเหมือนข้างล่าง 97% ไม่
ที่ยอมรับได้สำหรับตัวของแบคทีเรีย แต่
phylogenetic ต้นไม้พบค่าบูทสูง ( ร้อยละ 92 ) ซึ่ง
สนับสนุนว่าแยกจะ pantoea anthophila
( รูปที่ 3 )ผลการศึกษาพบว่า ชนิดที่มีมากที่สุดคือส่วนของเชื้อ Burkholderia และตามด้วย
. มีหลากหลายและแบคทีเรียอื่น ๆ

) ที่แยกและระบุ รวมทั้งเชื้อสกุล actinobacter
, ยา , Enterobacter , Escherichia kitasatospora pandoraea pantoea
, , , , ralstonia ไรโซเบียม , และ , paenibacillus
เซอร์ราเทีย .