Sequencing of PCR amplified fragmen

Sequencing of PCR amplified fragment and sequence analysis

One of the PCR amplified fragments, generated from a macaque from Laos with P. knowlesi-specific primers, was sequenced using the Sanger dideoxy sequencing method [33] and analyzed on the ABI 3730 Capillary Electrophoresis Genetic Analyzer. The DNA sequences were aligned by Clustal W and analysed using DNASTAR software (Lasergene, USA) and DnaSP version 4.10.8. The phylogenetic analysis was inferred by the Neighbor-joining method [34] with Kimura 2-parameter, including transitions and transversions, using MEGA version 3.1. The reliability of the internal nodes of the tree was assessed by the bootstrap method after 1000 replicates.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ลำดับของ PCR ขยายส่วนและลำดับวิเคราะห์ส่วน PCR ขยาย สร้างขึ้นจากน้ำจากลาวกับ P. knowlesi เฉพาะไพรเมอร์ อย่างใดอย่างหนึ่งถูกเรียงลำดับโดยใช้ dideoxy Sanger จัดลำดับวิธีการ [33] และวิเคราะห์บนตัว ABI 3730 ฝอยอิพันธุกรรมวิเคราะห์ ลำดับดีเอ็นเอที่สอดคล้อง โดย Clustal W และวิเคราะห์โดยใช้ซอฟต์แวร์ DNASTAR (Lasergene สหรัฐอเมริกา) และ DnaSP รุ่น 4.10.8 การวิเคราะห์ผลคือสรุป โดยรวมเพื่อนบ้านวิธี [34] ด้วยระ 2-พารามิเตอร์ transversions ใช้ MEGA เวอร์ชัน 3.1 และเปลี่ยน ความน่าเชื่อถือของโหนภายในของต้นไม้ถูกประเมิน โดยวิธีการเริ่มต้นระบบหลังจากที่ 1000 replicates

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ลำดับ PCR ขยายชิ้นส่วนและลำดับการวิเคราะห์

หนึ่งในชิ้นส่วนขยาย PCR สร้างขึ้นจากลิงจากประเทศลาวด้วยไพรเมอร์พี knowlesi เฉพาะได้รับการจัดลำดับโดยใช้วิธีการแซงเจอร์ลำดับ dideoxy [33] และวิเคราะห์ใน ABI 3730 ฝอย Electrophoresis พันธุกรรมวิเคราะห์ . ลำดับดีเอ็นเอถูกจัดชิดโดย Clustal W และวิเคราะห์โดยใช้ซอฟแวร์ DNASTAR (Lasergene, สหรัฐอเมริกา) และรุ่น DnaSP 4.10.8 การวิเคราะห์สายวิวัฒนาการที่ถูกอ้างถึงโดยเพื่อนบ้านเข้าสู่วิธีการ [34] กับคิมูระ 2 พารามิเตอร์รวมถึงการเปลี่ยนและ transversions ใช้รุ่น MEGA 3.1 ความน่าเชื่อถือของโหนดภายในของต้นไม้ที่ได้รับการประเมินโดยวิธีบูตหลังจาก 1000 ซ้ำ

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

การหาลำดับเบสของดีเอ็นเอ amplified fragment และลำดับการวิเคราะห์หนึ่งในชิ้นส่วนของดีเอ็นเอที่สร้างขึ้นจากลิงจากลาวด้วยไพร์เมอร์จำเพาะหน้า knowlesi เป็นลำดับแซงเจอร์ dideoxy โดยใช้วิธีการจัดลำดับ [ 33 ] และวิเคราะห์เกี่ยวกับ ABI 940 ผู้ชมทางพันธุกรรมวิเคราะห์ ดีเอ็นเอลำดับ ชิด โดย clustal W และวิเคราะห์โดยใช้ซอฟต์แวร์ dnastar ( lasergene , USA ) และ dnasp รุ่น 4.10.8 . การวิเคราะห์ phylogenetic ถูกสรุปโดยเพื่อนบ้านร่วม [ 34 ] กับคิมูระสองวิธี ได้แก่ การ transversions ใช้ Mega เวอร์ชั่น 3.1 . ความน่าเชื่อถือของโหนดภายในของต้นไม้ได้ถูกประเมิน โดยวิธีบูตสแตรปหลัง 1000 ซ้ํา