Sequence sourcesThe EST data was do

Sequence sources
The EST data was downloaded from the TIGR Plant
Transcript Assemblies database (http://plantta.jcvi.
org/), providing 117 Mbp of sugarcane sequences.
The sugarcane tissue used to make the EST library
was obtained from the varieties SP70-1143, SP80-
3280, SP80-87432, PB5211 9 P57150-4, CB47-89,
RB855205, RB845298, and RB805028 (Vettore et al.
2003).
To increase the number of available SSRs, we made
reduced representation libraries from S. officinarum
LA Purple (LAP) and S. robustum Molakai (Mol)
6081 using the 650- to 850-bp size fractions obtained
after a double digest with HinP1I and NcoI. HinP1I is a
methylation-sensitive enzyme and NcoI cuts at CATG
sites, including the start codon ATG, to enrich the
coding sequences. The libraries were sequenced using
Titanium 454 and assembled using GS Assembler
from Roche Diagnostics. A total of 188,672 contigs
were produced for LAP and 203,282 contigs for Mol
6081, yielding 69.1 and 76.8 Mbp of sequences
respectively.
Sequences were obtained

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ลำดับแหล่งข้อมูล EST ดาวน์โหลดจากพืช TIGR ฐานข้อมูลประกอบ Transcript (http:. //plantta.jcvi org /) ให้ 117 Mbp ลำดับอ้อย. เนื้อเยื่ออ้อยใช้ในการทำห้องสมุด EST ที่ได้รับจากพันธุ์ SP70- 1143, SP80- 3280, SP80-87432, PB5211 9 P57150-4, CB47-89, RB855205, RB845298 และ RB805028 (Vettore et al. 2003). ในการเพิ่มจำนวนของ SSRs ที่มีอยู่เราทำให้ลดห้องสมุดตัวแทนจากเอส officinarum LA สีม่วง (LAP) และ S. robustum Molakai (Mol) 6081 ใช้ 650- ขนาด 850 bp เศษส่วนที่ได้รับหลังจากการย่อยคู่กับHinP1I และ NcoI HinP1I เป็นเอนไซม์methylation ที่มีความอ่อนไหวและตัด NcoI ที่ CATG เว็บไซต์รวมทั้งการเริ่มต้น ATG codon เพื่อเสริมสร้างลำดับการเข้ารหัส ห้องสมุดมีลำดับขั้นตอนโดยใช้ไททาเนียม 454 และประกอบการใช้ GS ประกอบจากการวินิจฉัยของโรช รวม 188,672 contigs ถูกผลิตสำหรับ LAP และ 203,282 contigs สำหรับ Mol 6081 ผลผลิต 69.1 และ 76.8 Mbp ลำดับตามลำดับ. ลำดับที่ได้รับ

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

แหล่งข้อมูลและลำดับ
ถูกดาวน์โหลดจาก tigr พืช
หลักฐานประกอบฐานข้อมูล ( http : / / plantta . jcvi .
8 ) ให้ 117 MBP อ้อยลำดับ .
อ้อยเนื้อเยื่อให้
ห้องสมุด EST ได้จากพันธุ์ sp70-1143 sp80 , - ปฏิบัติการ sp80-87432 pb5211 9
, , p57150-4 cb47-89 rb855205 rb845298
, , , , และ rb805028 ( เวททอเร et al 2003
.
)การเพิ่มจำนวนของ ssrs ที่มีอยู่ ทำให้เราลดห้องสมุดเป็นตัวแทนจาก S .

ลาพันธุ์สีม่วง ( ตัก ) และ S . robustum molakai ( กระทรวงแรงงาน )
6081 ใช้ 650 - 850 คู่ขนาดเศษส่วนได้
หลังจากย่อยและคู่กับ hinp1i ncoi . hinp1i เป็น
จากเอนไซม์และการตัดที่ละเอียดอ่อน ncoi catg
เว็บไซต์ รวมทั้งรหัสพันธุกรรมเริ่มต้น ATG เพื่อเพิ่ม
นะครับ ลำดับห้องสมุดเป็นลำดับการใช้
ไทเทเนียมและประกอบใช้ GS ประกอบ
จากโรชวินิจฉัย . รวม 188672 สูง
ถูกผลิตสำหรับตักและ 203282 สูงสำหรับแรงงาน
6081 ผลผลิต และโดย 76.8 MBP ของลำดับ

ลำดับได้ตามลำดับ