Results Similarity in sequence and

Results
Similarity in sequence and expression of SPL10 ,
SPL11 and SPL2
SPL10 shows 78 % amino acid sequence identity with SPL11
( Cardon et al. 1999 ). In addition to the similarity in the
coding sequences, the 5 ′ -untranslated regions are also highly
conserved over a 1 kb region 5 ′ to the translation initiation
codon. These data suggest that SPL10 and SPL11 are
duplicate genes. Note that SPL10 and SPL11 are arranged
in tandem with a tail-to-tail orientation in the genome
(Supplementary Fig. S1). SPL2 is also related to SPL10 and
SPL11, with 40 and 36 % sequence identity, respectively.
SPL10, SPL11 and SPL2 have three conserved domains in the
N-terminal region (Supplementary Fig. S2). One is an AHAlike
motif predicted to function as a transcriptional activation
domain ( Döring et al. 2000 , Riese et al. 2007 ). The other
two conserved domains are a serine-rich region and a RTYF
motif whose functions are unknown. These three domains
are conserved in other putative SPL10-like proteins in many
plants species (Supplementary Fig. S2), implying that these
proteins have important functions in plant development.
We analyzed the RNA expression patterns of SPL10 , SPL11
and SPL2 in wild-type plants by semi-quantitative reverse
transcription–PCR (RT–PCR). Their mRNA was detected in
all tissues examined and showed similar expression patterns
(Fig. 1A ). In addition, the ATTED-II database, which provides
information on co-expressed genes deduced from microarray
data ( http://www.atted.bio.titech.ac.jp ; Obayashi et al.
2007 ), estimated that the expression profi le of SPL10 was

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ผลลัพธ์ ความคล้ายคลึงกันในลำดับและค่าของ SPL10SPL11 และ SPL2 SPL10 แสดง 78% กรดอะมิโนลำดับข้อมูลประจำตัว SPL11(Cardon et al. 1999) นอกจากความคล้ายคลึงกันในการรหัสลำดับ 5 ′-untranslated ภูมิภาคยังมีสูงตั้งอยู่เหนือ′ภูมิภาค 5 1 kb เป็นการเริ่มต้นแปลรหัสพันธุกรรม ข้อมูลเหล่านี้แนะนำว่า SPL10 และ SPL11 เป็นยีนที่ซ้ำกัน หมายเหตุว่า SPL10 และ SPL11 จัดคือการวางหางหางในกลุ่มนี้(เสริมฟิก S1) SPL2 ยังเกี่ยวข้องกับ SPL10 และSPL11, 40 และ 36% ลำดับรหัสประจำตัว ตามลำดับSPL10, SPL11 และ SPL2 มี 3 โดเมนที่นำในการN-สถานีภูมิภาค (ฟิกเสริม S2) หนึ่งคือ AHAlike เป็นสาระสำคัญที่คาดว่า จะเป็นการเปิดใช้งาน transcriptionalโดเมน (Döring et al. 2000, Riese et al. 2007) อื่น ๆนำสองโดเมนมีภูมิภาคแถริชและเป็น RTYFแปลนที่ฟังก์ชันจะไม่รู้จัก โดเมนเหล่านี้สามมีอยู่ในโปรตีนอื่น ๆ เช่น SPL10 putative ในพืชพันธุ์ (ฟิกเสริม S2), หน้าที่ที่เหล่านี้โปรตีนมีหน้าที่สำคัญในการพัฒนาโรงงานเราวิเคราะห์รูปแบบนิพจน์ของอาร์เอ็นเอของ SPL10, SPL11และ SPL2 ในพืชชนิดป่าโดยย้อนกลับเชิงกึ่งปริมาณtranscription – PCR (RT – PCR) พบ mRNA ของพวกเขาในเนื้อเยื่อทั้งหมดตรวจสอบ และแสดงให้เห็นรูปแบบนิพจน์ที่คล้ายกัน(Fig. 1A) นอกจากนี้ ฐานข้อมูล ATTED II ซึ่งช่วยให้ข้อมูลเกี่ยวกับยีนร่วมแสดง deduced จาก microarrayข้อมูล (ส่วน http://www.atted.bio.titech.ac.jp Obayashi et alประมาณ 2007), เลอรับนิพจน์ของ SPL10 ถูก

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ผลคล้ายคลึงกันในลำดับและการแสดงออกของ SPL10, SPL11 และ SPL2 SPL10 แสดงให้เห็นถึงตัวตนลำดับกรดอะมิโน 78% กับ SPL11 (Cardon et al. 1999) นอกจากความคล้ายคลึงกันในการลำดับการเข้ารหัสที่ 5 'ภูมิภาค -untranslated สูงนอกจากนี้ยังมีป่าสงวนกว่าภูมิภาค1 กิโล 5' ที่จะเริ่มต้นการแปลcodon ข้อมูลเหล่านี้ชี้ให้เห็นว่า SPL10 และ SPL11 มียีนที่ซ้ำกัน โปรดทราบว่า SPL10 และ SPL11 จะจัดควบคู่กับหางไปหางวางแนวทางในจีโนม(เสริมรูป. S1) SPL2 ที่เกี่ยวข้องยัง SPL10 และSPL11, 40 และลำดับบัตร 36% ตามลำดับ. SPL10, SPL11 และ SPL2 มีสามโดเมนอนุรักษ์ในภูมิภาคn- ขั้ว (เสริมรูป. S2) หนึ่งเป็น AHAlike บรรทัดฐานคาดว่าจะทำงานเป็นการเปิดใช้งานการถอดรหัสโดเมน (Döring et al. 2000 Riese et al. 2007) อีกสองโดเมนอนุรักษ์เป็นภูมิภาคที่อุดมไปด้วยซีรีนและ RTYF บรรทัดฐานที่มีฟังก์ชั่นเป็นที่รู้จัก ทั้งสามโดเมนป่าสงวนโปรตีนสมมุติ SPL10 เหมือนคนอื่น ๆ ในหลายสายพันธุ์พืช(เสริมรูป. S2) หมายความว่าสิ่งเหล่านี้โปรตีนที่มีหน้าที่สำคัญในการพัฒนาโรงงาน. เราวิเคราะห์รูปแบบการแสดงออกอาร์เอ็นเอของ SPL10 ที่ SPL11 และ SPL2 อยู่ในป่าชนิด พืชกึ่งเชิงปริมาณกลับถอดความ-PCR (RT-PCR) mRNA ของพวกเขาถูกตรวจพบในเนื้อเยื่อตรวจสอบและแสดงให้เห็นรูปแบบการแสดงออกที่คล้ายกัน(รูป. 1A) นอกจากนี้ฐานข้อมูล ATTED-II ซึ่งให้ข้อมูลเกี่ยวกับยีนร่วมแสดงความdeduced จาก microarray ข้อมูล (http://www.atted.bio.titech.ac.jp. โอบายาชิ et al, 2007) ประมาณว่ากำาแสดงออก le ของ SPL10 เป็น

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ผลลัพธ์
ความเหมือนในลำดับและการแสดงออกของ spl10 spl2

spl11 , และ spl10 แสดงลำดับกรดอะมิโนตัว 78 % spl11
( คาร์ดอน et al . 1999 ) นอกจากความเหมือนใน
นะครับ ดับ 5 ’ - ภูมิภาคนี่ยังสูงเกิน 1 กิโล
อนุรักษ์ เขต 5 ได้รับการส่งเสริมเพื่อการแปล
. ข้อมูลเหล่านี้ชี้ให้เห็นว่า spl10 spl11
และเป็นยีนที่ซ้ำกันทราบว่า spl10 spl11 และจะจัด
ควบคู่กับหางหางปฐมนิเทศในจีโนม
( เพิ่มเติมรูปที่ S1 ) spl2 ยังเกี่ยวข้องกับ spl10 และ
spl11 , 40 และ 36% ตามลำดับตัว ตามลำดับ spl10 spl11
, spl2 มีสามโดเมนและอนุรักษ์ในภูมิภาค ( รูป S2
กรดอะมิโนเสริม ) หนึ่งคือ ahalike
แม่ลายพยากรณ์การทำงานเป็น particle
กระตุ้นโดเมน ( D öแหวน et al . 2000 , รีเซ่ et al . 2007 ) อีกสองปี โดเมนเป็นซีรี
เศรษฐีและ rtyf
แม่ลายที่มีฟังก์ชั่นที่ไม่รู้จัก เหล่านี้สามโดเมน
อนุรักษ์ในอื่น ๆ นอกจากนี้ spl10 เช่นโปรตีนในพืชชนิดหลาย
( เพิ่มเติมรูป S2 ) แสดงว่าโปรตีนเหล่านี้มีหน้าที่สำคัญในการพัฒนาพืช
.
เราวิเคราะห์การแสดงออกของยีนแบบ spl10 spl11
, และผลิตโดย spl2 ในพืชกึ่งปริมาณย้อนกลับ
ถอดความ– PCR ( RT - PCR ) การแสดงออกของพวกเขาถูกตรวจพบในเนื้อเยื่อทุกรูปแบบตรวจสอบและพบ

( รูปที่ 1A การแสดงออกที่คล้ายกัน ) นอกจากนี้ atted-ii ฐานข้อมูลซึ่งมี
ข้อมูล Co แสดงออกยีนลงความเห็นจากข้อมูล microarray
( http://www.atted.bio.titech.ac.jp ;โอบายาชิ et al .
2007 ) ประมาณว่า การแสดงออกของ spl10 คือ Profi เลอ