Bacillus megaterium (Bm) was used a

Bacillus megaterium (Bm) was used as allochthonous bacteria
for reference. It was selected from a semiarid soil in a previous
experiment because when compared to other drought-adapted
bacterial isolates, it was the most effective under drought conditions
(Marulanda et al., 2009). It was isolated from a similar
semiarid soil as this zone.
Pseudomonas putida (Psp) (BIRD-1 PSC-367), a commercial
strain, was used as a reference PGPR in this study. This strain is
particularly efficient as a phosphate solubilizing cultivable bacteria
(Maillet et al., 2011; Matilla et al., 2011; Vyas and Gulati, 2009).
It is able to adhere to plant roots and colonizes the rhizosphere
of plants to high cell densities in soil with only 2% moisture. This
property seems to be linked to its ability to synthesize trehalose. In
addition Psp overproduces indole-acetic acid through convergent
pathways which influences its ability to stimulate plant growth.
These autochthonous microorganisms were isolated from rhizosphere
of plants naturally grown in the experimental semiarid
soils. Bacterial strains were isolated following serial soil dilutions,
1 g of homogenized rhizosphere soil was suspended in 100 mL
of sterile water (dilution 10−2) and this suspension was further
diluted to reach dilution 10−4–10−7. These dilutions were plated
in agar nutrient broth Difco medium (8 g L−1) and cultivated for
48 h at 28 ◦C. We selected the most abundant autochthonous bacterial
strain (based on morphological characteristics) as well as the
allochthonous assayed (Bm and Psp) and each one was separately
grown in the corresponding 250-mL flasks containing 50 mL of this
nutrient broth medium, in shake culture for 24 h at 28 ◦C for inocula
production.
Autochthonous AM inoculum also was isolated from the rhizosphere
of plants growing in this semiarid area. Spores, hyphae and
mycorrhizal root fragments were multiplied in an open pot culture
of maize and Trifolium repens for ten months. After this time, the
AM inoculum from this stock culture, as consortia ofindigenous AM
fungi having spores, hyphae and AM root fragments were obtained.
Similarly, the inoculum of the allochthonous mycorrhizal fungus
Rhizophagus intraradices (accession no. EEZ 195) was prepared. It
also consisted of spores, hyphae and AM root fragments.
The identification of autochthonous bacteria was done by
sequencing the 16S rDNA gene. Bacterial cells were extracted,
diluted, lysed, and directly used as a template in the PCR reactions.
All reactions were conducted using a 25 L volume containing
PCR buffer 10×, 50 mM MgCl2, 10 M each primers
27FA (AGAGTTTGATCCTGGCTCAG) and 1492RA (GGTTACCTTGTTACGACTT),
5 U/L of Taq polymerase (Platinum, Invitrogen).
The PCR was performed in a thermal cycle with the following
conditions: 5 min at 95 ◦C, followed by 30 cycles of 45 s at 95 ◦C,
45 s at 44 ◦C and 2 min at 72 ◦C, and finally, one cycle of 10 min
at 72 ◦C. The products of PCR were analyzed by 1% agarose gel
electrophoresis.
For extraction of DNA bacterial we used a QIAquick Gel
extraction kit (QUIAGEN). Each sequence was compared with the
database of 16S rDNA, the NCBI/BLAST and EMBL-EBI program.
Database searches for 16S rDNA sequence similarity unambiguously
identify the bacterium as Bacillus thuringiensis (Accession NR
043403.1, similarity 98%).
Autochthonous spores found in the autochthonous AM inoculum
were morphologically similar to Septoglomus constrictum
(EEZ 198), Diversispora aunantia (EEZ 199), Archaeospora trappei
(EEZ 200), Glomus versiforme (EEZ 201) and Paraglomus ocultum
(EEZ 202) compared to those from our current EEZ collection.
The AM inoculums applied consisted of a mixture of
them.
S

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ใช้เป็น allochthonous แบคทีเรีย bacillus megaterium (Bm)สำหรับการอ้างอิง มันได้รับเลือกจากดินแล้งในก่อนทดลองเนื่องจากเมื่อเปรียบเทียบกับ อื่น ๆ ภัยแล้งดัดแปลงแบคทีเรียที่แยกได้ มันเป็นที่มีประสิทธิภาพมากที่สุดภายใต้สภาวะภัยแล้ง(Marulanda et al. 2009) ถูกแยกจากคล้ายดินแล้งโซนนี้Pseudomonas putida (Psp) (นก-1 PSC-367), ทางการค้าความเครียด ใช้เป็นการอ้างอิง PGPR ในการศึกษานี้ สายพันธุ์นี้เป็นมีประสิทธิภาพโดยเฉพาะอย่างยิ่งเป็นฟอสเฟตที่ solubilizing cultivable แบคทีเรีย(Maillet et al. 2011 Matilla et al. 2011 Vyas และ Gulati, 2009)สามารถยึดพืชราก และอาณานิคมในไรโซสเฟียร์ของพืชเพื่อความหนาแน่นของเซลล์สูงในดินมีความชื้น 2% เท่านั้น นี้คุณสมบัติที่ดูเหมือนจะเชื่อมโยงกับความสามารถในการสังเคราะห์ trehalose ในนอกจากนี้ Psp overproduces กรดอะซิติกอินโดลผ่านองค์กรทางเดินซึ่งมีอิทธิพลต่อความสามารถในการกระตุ้นการเจริญเติบโตของพืชจุลินทรีย์เหล่านี้ autochthonous ถูกแยกได้จากไรโซสเฟียร์ของพืชที่ปลูกตามธรรมชาติในการทดลองแล้งดิน สายพันธุ์แบคทีเรียที่แยกต่ออนุกรมดินเจือจาง1 กรัมของดินไรโซสเฟียร์ homogenized ถูกระงับใน 100 มล.น้ำหมัน (เจือจาง 10−2) และระบบกันสะเทือนนี้แก้ไขเพิ่มเติมเจือจางถึงเจือจาง 10−4 – 10−7 เจือจางเหล่านี้ถูกชุบในสารอาหารซุปวุ้น Difco ขนาดกลาง (8 กรัม L−1) และปลูกฝังมา48 ชั่วโมงที่ 28 ◦C เราเลือกแบคทีเรีย autochthonous สุดสายพันธุ์ (ตามลักษณะสัณฐาน) ตลอดจนการallochthonous assayed (Bm และ Psp) และแต่ละคนถูกแยกต่างหากปลูกในเบ้า 250 มิลลิลิตรสอดคล้องที่ประกอบด้วยนี้ 50 mLน้ำสารอาหารปานกลาง สั่นวัฒนธรรมสำหรับ 24 ชั่วโมงที่ 28 ◦C สำหรับ inoculaการผลิตAutochthonous AM inoculum ยังถูกแยกจากตัวไรโซสเฟียร์ของพืชที่เจริญเติบโตในพื้นที่แล้งนี้ Hyphae สปอร์ และส่วนของราก mycorrhizal ถูกคูณในวัฒนธรรมการเปิดหม้อข้าวโพดและดอกชมพู Trifolium สิบเดือน หลังจากนี้ การน. inoculum จากวัฒนธรรมนี้สต็อก เป็นกลุ่มร่วมค้าระดับ ofindigenous AMเชื้อที่มีสปอร์ hyphae และรากน.เศษได้รับในทำนองเดียวกัน inoculum ของเชื้อรา mycorrhizal allochthonousRhizophagus intraradices (ทะเบียนไม่ มีการจัดทำเขตเศรษฐกิจจำเพาะที่ 195) มันนอกจากนี้ยัง ประกอบด้วยสปอร์ hyphae และ AM รากเศษรหัสของแบคทีเรีย autochthonous ทำโดยจัดลำดับยีน 16S rDNA เซลล์แบคทีเรียที่ถูกสกัดเจือจาง นาทีที่ 37uc และโดยตรงใช้เป็นแม่แบบในปฏิกิริยา PCRปฏิกิริยาทั้งหมดถูกดำเนินการโดยใช้ปริมาตร 25 L ที่ประกอบด้วยPCR buffer 10 × 50 มม. MgCl2, 10 เมตรละไพรเมอร์27FA (AGAGTTTGATCCTGGCTCAG) และ 1492RA (GGTTACCTTGTTACGACTT),5 U/L ของพอลิเมอเรส Taq (แพลทินัม Invitrogen)การ PCR ได้ดำเนินการในวงจรความร้อนดังนี้เงื่อนไข: 5 นาทีที่ 95 ◦C ตาม ด้วยรอบ 30 45 s ที่ 95 ◦C45 ที่ ◦C และ 2 นาทีที่ 72 ◦C และสุดท้าย รอบหนึ่ง 10 นาที 44 sที่ 72 ◦C ผลิตภัณฑ์ของ PCR ถูกวิเคราะห์ โดย 1% agarose เจลอิสำหรับสกัด DNA แบคทีเรีย ที่เราใช้เจล QIAquickแยกชุด (QUIAGEN) แต่ละลำดับการเปรียบเทียบการฐานข้อมูลของ 16S rDNA, NCBI/ระเบิด และโปรแกรม EMBL เอะฐานข้อมูลค้นหาลำดับ 16S rDNA ความคล้ายคลึงกันอย่างชัดเจนว่าระบุแบคทีเรีย Bacillus thuringiensis (NR ภาคยานุวัติเป็น043403.1 ความคล้ายคลึงกัน 98%)Autochthonous สปอร์พบใน inoculum AM autochthonousถูก morphologically คล้ายกับ Septoglomus constrictum(เขตเศรษฐกิจจำเพาะ 198), Diversispora aunantia (เขตเศรษฐกิจจำเพาะ 199), Archaeospora trappei(เขตเศรษฐกิจจำเพาะ 200), Paraglomus ocultum และ versiforme Glomus (เขตเศรษฐกิจจำเพาะ 201)(เขตเศรษฐกิจจำเพาะ 202) เมื่อเทียบกับจากเขตเศรษฐกิจจำเพาะของเราปัจจุบันนี้AM inoculums ใช้ consisted ของส่วนผสมของพวกเขาS

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

Bacillus megaterium (Bm) ถูกใช้เป็นเชื้อแบคทีเรีย allochthonous
สำหรับการอ้างอิง มันได้รับเลือกจากดินแห้งแล้งในก่อนหน้านี้
การทดลองเพราะเมื่อเทียบกับภัยแล้งที่ปรับอื่น ๆ
แบคทีเรียมันเป็นที่มีประสิทธิภาพมากที่สุดภายใต้ภาวะภัยแล้ง
(Marulanda et al., 2009) มันถูกแยกออกจากที่คล้าย
ดินแห้งแล้งเป็นโซนนี้.
Pseudomonas putida (PSP) (นก 1 PSC-367) เชิงพาณิชย์
ความเครียดถูกใช้เป็น PGPR อ้างอิงในการศึกษานี้ สายพันธุ์นี้เป็น
ที่มีประสิทธิภาพโดยเฉพาะอย่างยิ่งเป็นฟอสฟอรัสแบคทีเรียที่เพาะปลูก
(Maillet et al, 2011;. Matilla et al, 2011;. Vyas และ Gulati 2009).
มันสามารถที่จะเป็นไปตามรากพืชและอาณานิคมบริเวณราก
ของพืชไปยังเซลล์สูง ความหนาแน่นในดินที่มีความชื้นเพียง 2% นี้
คุณสมบัติที่ดูเหมือนว่าจะมีการเชื่อมโยงกับความสามารถในการสังเคราะห์ทรีฮาโล ใน
นอกจาก PSP ของ overproduces กรดอะซิติก indole-ผ่านมาบรรจบ
ทางเดินที่มีอิทธิพลต่อความสามารถในการกระตุ้นการเจริญเติบโตของพืช.
จุลินทรีย์ autochthonous เหล่านี้ถูกแยกออกจากบริเวณราก
ของพืชที่ปลูกตามธรรมชาติในการทดลองแห้งแล้ง
ดิน สายพันธุ์ของเชื้อแบคทีเรียที่แยกได้ต่อไปเจือจางดินแบบอนุกรม
1 กรัมของดินบริเวณรากหดหายถูกระงับใน 100 มล
ของน้ำหมัน (เจือจาง 10-2) และการระงับนี้เกิดต่อไป
เจือจางไปถึงการลดสัดส่วน 10-4-10-7 เจือจางเหล่านี้ถูกชุบ
ในน้ำซุปสารอาหารวุ้นกลาง Difco (8 กรัม L-1) และปลูกฝังมานาน
48 ชั่วโมงวันที่ 28 ◦C เราเลือกมากที่สุด autochthonous แบคทีเรีย
สายพันธุ์ (ขึ้นอยู่กับลักษณะทางสัณฐานวิทยา) เช่นเดียวกับ
allochthonous assayed (Bm และ PSP) และแต่ละคนถูกแยก
ปลูกในที่สอดคล้องขวด 250 มิลลิลิตรมี 50 มลนี้
กลางน้ำซุปสารอาหารในวัฒนธรรมสั่น เป็นเวลา 24 ชั่วโมงวันที่ 28 ◦Cสำหรับ inocula
ผลิต.
autochthonous นหัวเชื้อยังถูกแยกออกจากบริเวณราก
ของการปลูกพืชในพื้นที่แห้งแล้งนี้ สปอร์ hyphae และ
เศษราก mycorrhizal ถูกคูณในวัฒนธรรมหม้อเปิด
ของข้าวโพดและ Trifolium repens สิบเดือน หลังจากเวลานี้
หัวเชื้อมาจากวัฒนธรรมหุ้นนี้เป็นไพรี ofindigenous AM
เชื้อรามีสปอร์ hyphae และ AM เศษรากที่ได้รับ.
ในทำนองเดียวกันเชื้อของ allochthonous mycorrhizal เชื้อรา
intraradices Rhizophagus (ภาคยานุวัติ no. 195 EEZ) ถูกจัดทำขึ้น มัน
ยังประกอบด้วยสปอร์ hyphae และรากนเศษ.
บัตรประจำตัวของเชื้อแบคทีเรีย autochthonous ทำโดย
ลำดับยีน 16S rDNA เซลล์แบคทีเรียถูกสกัด
เจือจาง lysed และโดยตรงใช้เป็นแม่แบบในปฏิกิริยา PCR ก.
ปฏิกิริยาทั้งหมดถูกดำเนินการโดยใช้ปริมาณ 25 ลิตรมี
PCR บัฟเฟอร์ 10 × 50 มิลลิ MgCl2, 10 M แต่ละไพรเมอร์
27FA (AGAGTTTGATCCTGGCTCAG) และ 1492RA ( GGTTACCTTGTTACGACTT)
5. U / L ของ Taq โพลิเมอร์ (แพ, Invitrogen)
PCR ที่ได้ดำเนินการในรอบความร้อนมีดังต่อไป
เงื่อนไข: 5 นาทีที่ 95 ◦Cตามด้วย 30 รอบของ 45 s ที่ 95 ◦C,
45 s 44 ◦Cและ 2 นาทีที่ 72 ◦Cและสุดท้ายหนึ่งรอบ 10 นาที
ที่ 72 ◦C ผลิตภัณฑ์ของ PCR ถูกวิเคราะห์โดย 1% agarose เจล
อิเลค.
สำหรับการสกัดดีเอ็นเอของแบคทีเรียเราใช้เจล QIAquick
ชุดสกัด (QUIAGEN) ลำดับแต่ละคนเมื่อเทียบกับ
ฐานข้อมูลของ 16S rDNA ที่ NCBI / ระเบิด EMBL-EBI โปรแกรม.
ค้นหาฐานข้อมูลสำหรับ 16S rDNA ลำดับความคล้ายคลึงกันอย่างไม่น่าสงสัย
ระบุแบคทีเรียเช่นเชื้อ Bacillus thuringiensis (Accession NR
043,403.1 คล้ายคลึงกัน 98%).
สปอร์ autochthonous พบใน autochthonous นหัวเชื้อ
มีสัณฐานคล้ายกับ Septoglomus constrictum
(EEZ 198) Diversispora aunantia (EEZ 199) Archaeospora trappei
(EEZ 200) Glomus versiforme (EEZ 201) และ Paraglomus ocultum
(EEZ 202) เมื่อเทียบกับผู้ที่มาจากคอลเลกชันเขตเศรษฐกิจจำเพาะของเราในปัจจุบัน
หัวเชื้อแบคทีเรีย AM ที่นำมาใช้ประกอบไปด้วยส่วนผสมของ
พวกเขา.
S

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

Bacillus megaterium ( BM ) ถูกใช้เป็น allochthonous แบคทีเรียสำหรับการอ้างอิง มันถูกเลือกจากดิน semiarid ในก่อนหน้านี้การทดลองเพราะเมื่อเทียบกับอื่น ๆปรับแล้งแบคทีเรียไอโซเลท มันมีประสิทธิภาพมากที่สุดภายใต้สภาพแล้ง( เ มารูลันดา et al . , 2009 ) มันถูกแยกจากที่คล้ายกันsemiarid ดินเป็นโซนนี้Pseudomonas enrichment ( PSP ) ( bird-1 psc-367 ) , พาณิชย์ความเครียด คือใช้เป็นอ้างอิงมีแนวโน้มในการ สายพันธุ์นี้คือโดยเฉพาะอย่างยิ่งประสิทธิภาพเป็นเพาะปลูกแบคทีเรียละลายฟอสเฟต( เมลเล็ต et al . , 2011 ; matilla et al . , 2011 ; Vyas และ gulati , 2009 )มันสามารถยึดติด colonizes รากรากพืชและของพืชในดินที่มีความหนาแน่นเซลล์สูงเพียง 2 % ความชื้น นี้คุณสมบัติที่ดูเหมือนจะเชื่อมโยงกับความสามารถในการสังเคราะห์ทรีฮาโลส . ในนอกจากนี้ PSP overproduces เทพทองผ่านลู่เข้าทางเดินที่มีอิทธิพลต่อความสามารถในการกระตุ้นการเจริญเติบโตของพืชเชื้อจุลินทรีย์ที่แยกได้จากราก autochthonous เหล่านี้พืชที่ปลูกตามธรรมชาติใน semiarid ทดลองดิน แบคทีเรียในดินตามวิธีการอนุกรม1 กรัม บดดินบริเวณรากถูกระงับใน 100 มล.น้ำหมัน ( เจือจาง 10 − 2 ) และช่วงล่างนี้เพิ่มเติมเมื่อไปถึงระดับ 10 − 4 – 10 − 7 วิธีการเหล่านี้ได้ถูกชุบใน difco NUMB3RS broth medium ( 8 G L − 1 ) และแหวนสำหรับ48 ชั่วโมง 28 ◦ C . เราเลือกชุกชุมมากที่สุด autochthonous แบคทีเรียความเครียด ( ขึ้นอยู่กับลักษณะสัณฐานวิทยา ) เช่นเดียวกับallochthonous ml ( BM และ PSP ) และแต่ละคนต่างหากปลูกในที่สอดคล้องกัน 250 ml . ขวดนี้ผสม 50 มิลลิลิตรกลางน้ำสารอาหารในวัฒนธรรมเขย่าเป็นเวลา 24 ชั่วโมงที่อุณหภูมิ 28 องศาเซลเซียส inocula ◦การผลิตautochthonous เป็นเชื้อที่แยกได้จากรากคือของพืชที่ขึ้นในพื้นที่ semiarid นี้ สปอร์ ) , และเศษรากไมโคไรซาทวีมากขึ้นในหม้อเปิดวัฒนธรรม( ทริโฟเลียมรีเพน ประมาณ 10 เดือน หลังจากครั้งนี้เป็นสายพันธุ์จากหุ้นวัฒนธรรม เป็น ofindigenous consortia คือสปอร์เชื้อรามี , และราก ) เป็นชิ้นส่วนที่ได้รับพบว่า ปริมาณของเชื้อราไมโคไรซา allochthonousrhizophagus intraradices ( หนังสือไม่ไม่มี 195 ) ที่เตรียมไว้ มันยังประกอบด้วยสปอร์ ) , และเศษรากการพิสูจน์เอกลักษณ์ของแบคทีเรีย autochthonous เสร็จสิ้นแล้วการจัดลำดับช่วง 16S rDNA ยีน เซลล์แบคทีเรียได้ แยกเมื่อ lysed และโดยตรง ที่ใช้เป็นแม่แบบในการตรวจปฏิกิริยาเกิดปฏิกิริยาการใช้ปริมาตร 25 ลิตร ที่มีPCR buffer ชุด 10 × 50 มม. , 10 M แต่ละชนิด27fa ( agagtttgatcctggctcag ) และ 1492ra ( ggttaccttgttacgactt )5 u / L ของทัค พอลิเมอเรส ( แพลทินัม Invitrogen )ร่วมแสดงในวัฏจักรความร้อน มีดังต่อไปนี้เงื่อนไข : 5 นาทีที่ 95 ◦ C ตามด้วย 30 รอบ 45 S 95 ◦ C45 วินาทีที่ 44 ◦ C และ 2 นาทีที่ 72 ◦ C และสุดท้าย 1 รอบ 10 นาที72 ◦ซี. ผลิตภัณฑ์ PCR โดยใช้ 1% เจลเรสการสกัดดีเอ็นเอจากแบคทีเรียที่เราใช้ qiaquick เจลชุดสกัด ( quiagen ) แต่ละลำดับ คือ เมื่อ เทียบ กับฐานข้อมูลของ 16S rDNA , ncbi / ระเบิดและโปรแกรม embl-ebi .ฐานข้อมูลการค้นหา 16S rDNA sequence ความเหมือนกันระบุแบคทีเรีย Bacillus thuringiensis ( เปลี่ยนยางเป็น043403.1 ความเหมือน 98% , )สปอร์ autochthonous พบใน autochthonous เป็นเชื้อได้จาก septoglomus constrictum คล้ายกับ( ไม่มี 198 ) diversispora aunantia ( ไม่มี archaeospora trappei 199 )( ไม่มี 200 ) , Glomus versiforme ( ไม่มี 201 ) และ paraglomus ocultum( ไม่มี 202 ) เมื่อเทียบกับผู้ที่ไม่มีจากคอลเลกชันของเราในปัจจุบันAM 18 ชั่วโมงใช้ประกอบด้วยส่วนผสมพวกเขาs