The biogeography, chromosome number evolution, pollination biology and evolutionary history of the
plant family Araceae have recently become much clearer (Cabrera et al., 2008; Chartier et al., 2013;
Cusimano et al., 2011, 2012; Nauheimer et al., 2012). However, phylogenetic ambiguity near the root
of the tree precludes answering questions about the early evolution of the family. We use Illumina
sequencing technology and reference based assembly to resolve the remaining questions in the deep
phylogeny of Araceae. We sampled 32 genera and obtained 7 from GenBank (including an outgroup),
representing 42 of 44 major clades described in Cusimano et al. (2011). A subsequent phylogenomic
analysis based on mitochondrial data was performed to test congruence between plastid and mitochondrial
data for phylogenetic inference. Plastid sequences produced strongly supported phylogenies. In
contrast, mitochondrial phylogenies were weakly supported and incongruent with chloroplast data
(Templeton test, p 6 0.0001), although several smaller clades were recovered. New strongly-supported
clades seen here are: (1) Anubias and Montrichardia, excluding Calla, form a clade that is sister to the
Zantedeschia clade; (2) the South African genus Zantedeschia is sister to the Old World Anchomanes clade;
and (3) within the Zantedeschia clade, Philodendron is sister to the rest. Calla and Schismatoglottis form a
clade at the base of one of two major clades in Aroideae based on complete chloroplast sequences.
Although statistical support is weak, morphological and cytological features support this topology.
Biogeography โครโมโซมหมายเลขวิวัฒนาการ ชีววิทยา pollination และประวัติวิวัฒนาการของการเมื่อเร็ว ๆ นี้เป็นชัดเจนมากพืชตระกูล Araceae (Cabrera et al., 2008 Chartier et al., 2013Cusimano et al., 2011, 2012 Nauheimer et al., 2012) อย่างไรก็ตาม ย่อ phylogenetic ใกล้รากต้นไม่สามารถตอบคำถามเกี่ยวกับวิวัฒนาการช่วงของครอบครัว เราใช้ Illuminaเทคโนโลยีจัดลำดับและอ้างอิงแอสเซมบลีเพื่อแก้ไขคำถามที่เหลือในลึกตามphylogeny ของ Araceae เราตัวอย่างสกุล 32 และรับ 7 จาก GenBank (รวมเป็น outgroup),แสดง 42 44 clades หลักอธิบายไว้ใน Cusimano et al. (2011) Phylogenomic ตามมาทำการวิเคราะห์ตามข้อมูล mitochondrial เพื่อทดสอบลงตัว ระหว่างพลาสติด และ mitochondrialข้อมูลสำหรับข้อ phylogenetic พลาสติดลำดับผลิต phylogenies ขอสนับสนุน ในความคมชัด mitochondrial phylogenies ขึ้น weakly สนับสนุน และ incongruent ข้อมูลคลอโรพลาสต์(ทดสอบเทมเปิลตัน p 6 มาก 0.0001), แม้ ว่า clades หลายขนาดเล็กถูกกู้คืน ใหม่ขอสนับสนุนclades ที่เห็นนี่เป็น: Anubias (1) และ Montrichardia ไม่รวมคาลลา ฟอร์ม clade ที่น้องต้องการZantedeschia clade (2 สกุล Zantedeschia)แอฟริกาใต้เป็นพี่น้องกับ clade Anchomanes โลกเก่าและ (3) ภายใน Zantedeschia clade, Philodendron เป็นน้องสาวไปยัง คาลลาและ Schismatoglottis การclade ที่ clades สองหลักที่ Aroideae อย่างใดอย่างหนึ่งตามลำดับคลอโรพลาสต์ที่สมบูรณ์แม้ว่าสถิติสนับสนุนอ่อน สัณฐาน และ cytological สนับสนุนโทโพโลยีนี้
การแปล กรุณารอสักครู่..
ววิวัฒนาการจำนวนโครโมโซมชีววิทยาผสมเกสรและประวัติศาสตร์วิวัฒนาการของ
พืชตระกูล Araceae เมื่อเร็ว ๆ นี้ได้กลายเป็นที่ชัดเจนมากขึ้น (Cabrera et al, 2008;. Chartier et al, 2013;.
Cusimano et al, 2011, 2012;. Nauheimer et al, 2012) แต่ความคลุมเครือสายวิวัฒนาการใกล้ราก
ของต้นไม้ติ๊ดตอบคำถามเกี่ยวกับวิวัฒนาการในช่วงต้นของครอบครัว เราใช้ Illumina
เทคโนโลยีลำดับและการชุมนุมตามการอ้างอิงในการแก้ไขคำถามที่เหลืออยู่ในลึก
เชื้อชาติของ Araceae เราเก็บตัวอย่าง 32 จำพวกและได้รับ 7 จาก GenBank (รวม outgroup)
เป็นตัวแทนของ 42 จาก 44 clades ที่สำคัญที่อธิบายไว้ใน Cusimano et al, (2011) ต่อมา phylogenomic
การวิเคราะห์บนพื้นฐานของข้อมูลยลได้ดำเนินการในการทดสอบความสอดคล้องกันระหว่าง plastid ยลและ
ข้อมูลสำหรับการอนุมานสายวิวัฒนาการ ลำดับ plastid ผลิตการสนับสนุนอย่างมาก phylogenies ใน
ทางตรงกันข้าม phylogenies ยลที่ไม่ค่อยได้รับการสนับสนุนและสอดคล้องกันกับข้อมูล chloroplast
(Templeton ทดสอบพี 6 0.0001) แม้หลาย clades ขนาดเล็กหาย ใหม่ขอสนับสนุน
clades เห็นนี่คือ (1) Anubias และ Montrichardia ไม่รวม Calla รูปแบบ clade ที่เป็นน้องสาวของ
Zantedeschia clade; (2) ประเภทแอฟริกาใต้ Zantedeschia เป็นน้องสาวของโลกเก่า Anchomanes clade;
และ (3) ภายใน clade Zantedeschia, Philodendron เป็นน้องสาวที่เหลือ Calla และ Schismatoglottis รูปแบบ
clade ที่ฐานของหนึ่งในสอง clades ที่สำคัญใน Aroideae ขึ้นอยู่กับลำดับ chloroplast สมบูรณ์.
แม้ว่าการสนับสนุนทางสถิติที่อ่อนแอทางสัณฐานวิทยาเซลล์วิทยาและคุณสมบัติที่สนับสนุนโครงสร้างนี้
การแปล กรุณารอสักครู่..
การว การศึกษาวิวัฒนาการของโครโมโซมหมายเลขการชีววิทยาและประวัติศาสตร์วิวัฒนาการของพืชวงศ์ Araceae
ได้รับเมื่อเร็ว ๆนี้กลายเป็นที่ชัดเจนมาก ( ชอบแล้ว et al . , 2008 ; chartier et al . , 2013 ;
คูซิมาโน่ et al . , 2011 , 2012 ; nauheimer et al . , 2012 ) อย่างไรก็ตาม ยืนยันความใกล้รากของต้นไม้
precludes การตอบคำถามเกี่ยวกับวิวัฒนาการ แรก ของ ครอบครัว เราใช้ Illumina
การใช้เทคโนโลยีและอ้างอิงประกอบเพื่อแก้ไขคำถามที่เหลือในระบบเชื้อชาติลึก
ของเกราะ . เราเก็บตัวได้ 7 จาก 32 สกุลและขนาด ( รวมถึงกลุ่ม ) ,
แทน 42 44 สาขา clades อธิบายไว้ในคูซิมาโน่ et al . ( 2011 ) ตามมา phylogenomic
การวิเคราะห์ข้อมูลการทำการทดสอบความสอดคล้องระหว่างพลาสติดยล
และข้อมูลสำหรับการอนุมานชนิด . พลาสติดลำดับผลิตขอสนับสนุน phylogenies . ในการ phylogenies
ความคมชัดเป็นอย่างอ่อนและการสนับสนุนซึ่งไม่ลงรอยกันกับคลอข้อมูล
( Templeton test , p = 6 ) , แม้ว่า clades เล็กหลาย ๆถูกกู้คืน ใหม่ขอสนับสนุน
clades เห็นที่นี่ ( 1 ) และ montrichardia เบียส ยกเว้นคาร่า ฟอร์ม clade ที่น้องสาว
zantedeschia clade ; ( 2 ) zantedeschia สกุลแอฟริกาใต้คือพี่สาวกับ anchomanes โลกเก่า clade ;
( 3 ) ภายใน zantedeschia clade ฟิโลเดนดร , น้องสาวเพื่อพักผ่อน a
clade ที่ฐานของหนึ่งในสองสาขา clades ใน aroideae ตามลำดับและแบบฟอร์มสมบูรณ์คลอโรพลาสต์ คาล่า schismatoglottis .
ถึงแม้ว่าการสนับสนุนสถิติที่อ่อนแอลักษณะทางสัณฐานวิทยาและสามารถสนับสนุนโครงสร้างนี้
.
การแปล กรุณารอสักครู่..