The promoter regions (1 kb upstream

The promoter regions (1 kb upstream sequences) of 45,836 annotated genes of rice were analyzed for the presence of OsMYB4 binding sites using a Perl program algorithm. Based on the homotypic clustering concept, 113 promoters were found to have more than 4 binding site motifs. Among the downstream genes of these promoters, five genes which are known to have a role in disease resistance were selected and the binding capacity of OsMYB4 protein in the promoter regions was analyzed by docking studies. Expression level of these genes was analyzed by RT-PCR in Rhizoctonia solani infected rice seedlings. Upon pathogen challenge, higher expression of aminotransferase, ankyrin and WRKY 12 genes was observed corresponding to higher expression of Osmyb4. Over-expression of Osmyb4 cDNA in rice leaf tissues by agro-infection failed to result in similar over-expression of aminotransferase, ankyrin and WRKY 12 as expected. Although the role of OsMYB4 in sheath blight resistance was found to be definitive based on our initial results, artificial over-expression of this TF was observed to be insufficient in regulating the disease resistance related genes.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ภูมิภาคโปรโมเตอร์ (1 kb ลำดับขั้นต้นน้ำ) ของยีน 45,836 ประกอบของข้าวได้วิเคราะห์สำหรับสถานะของ OsMYB4 ผูกไซต์โดยใช้ขั้นตอนวิธีในการโปรแกรมภาษาเพิร์ล ตามแนวคิดระบบคลัสเตอร์ homotypic, 113 ก่อพบมีมากกว่า 4 ผูกลงเว็บไซต์ ระหว่างยีนปลายน้ำของเหล่าก่อ เลือกยีนห้าซึ่งทราบว่ามีบทบาทในการต้านทานโรค และกำลังการผลิตรวมของโปรตีน OsMYB4 ในภูมิภาคโปรโมเตอร์ถูกวิเคราะห์ โดยเทียบการศึกษา นิพจน์ระดับของยีนเหล่านี้ถูกวิเคราะห์ โดย RT-PCR ใน Rhizoctonia solani ติดข้าวกล้าไม้ เมื่อศึกษาความท้าทาย ค่าสูงของ aminotransferase, ankyrin และยีน WRKY 12 ถูกตรวจสอบที่สอดคล้องกับค่าสูงของ Osmyb4 ค่าเปอร์เซ็นต์ของ cDNA Osmyb4 ในเนื้อเยื่อของใบข้าวจากการติดเชื้อเกษตรล้มเหลวเพื่อทำให้นิพจน์มากกว่าคล้าย ของ aminotransferase, ankyrin 12 WRKY ตามที่คาดไว้ แม้ว่าบทบาทของ OsMYB4 ในการต้านทานโรคไหม้ sheath พบได้ทั่วไปตามผลของเราเริ่มต้น ค่าเกินเทียมของรหัสนี้ถูกสังเกตจะไม่เพียงพอในการควบคุมความต้านทานโรคยีนที่เกี่ยวข้อง

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ภูมิภาคโปรโมเตอร์ (1 กิโลไบต์ลำดับต้นน้ำ) ของยีน 45836 ข้อเขียนของข้าวที่ไ​​ด้มาวิเคราะห์การปรากฏตัวของ OsMYB4 เว็บไซต์ผูกพันโดยใช้อัลกอริทึมโปรแกรม Perl ตามแนวคิดการจัดกลุ่ม homotypic 113 ก่อการพบว่ามีมากกว่า 4 ลวดลายเว็บไซต์ที่มีผลผูกพัน ท่ามกลางยีนปลายน้ำของโปรโมเตอร์เหล่านี้ห้ายีนซึ่งเป็นที่รู้จักที่จะมีบทบาทในการต้านทานโรคได้รับการคัดเลือกและกำลังการผลิตที่มีผลผูกพันของโปรตีน OsMYB4 ก่อการในภูมิภาคได้รับการวิเคราะห์โดยการศึกษาเชื่อมต่อ ระดับการแสดงออกของยีนเหล่านี้ได้รับการวิเคราะห์โดย RT-PCR ใน Rhizoctonia solani ติดเชื้อต้นกล้าข้าว เมื่อความท้าทายเชื้อโรค, การแสดงออกที่สูงขึ้นของ aminotransferase, ankyrin และ WRKY 12 ยีนที่พบว่าสอดคล้องกับการแสดงออกที่สูงขึ้นของ Osmyb4 กว่าการแสดงออกยีน Osmyb4 ในเนื้อเยื่อใบข้าวเกษตรติดเชื้อล้มเหลวที่จะส่งผลในการที่คล้ายกันมากกว่าการแสดงออกของ aminotransferase, ankyrin WRKY และ 12 ตามที่คาดไว้ แม้ว่าบทบาทของ OsMYB4 ในการต่อต้านโรคกาบใบแห้งพบว่าเป็นที่ชัดเจนบนพื้นฐานของผลครั้งแรกของเรา, เทียมมากกว่าการแสดงออกของ TF นี้เป็นข้อสังเกตที่จะไม่เพียงพอในการควบคุมความต้านทานโรคของยีนที่เกี่ยวข้อง

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

โปรโมเตอร์ภูมิภาค ( 1 KB - ลำดับ ) แบบแสดงยีนของข้าววิเคราะห์สถานะของเว็บไซต์การใช้โปรแกรม Perl osmyb4 ขั้นตอนวิธี ตาม homotypic การจัดกลุ่มแนวคิด 113 โปรโมเตอร์ พบว่ามีมากกว่า 4 ลวดลายเว็บไซต์ผูกพัน . ในด้านโปรโมเตอร์ยีนเหล่านี้ห้ายีนซึ่งเป็นที่รู้จักที่จะมีบทบาทในการต้านทานโรคได้ถูกเลือก และความจุรวมของ osmyb4 โปรตีนในภูมิภาค โดยใช้การเชื่อมต่อการศึกษา การแสดงออกของยีนในระดับ วิเคราะห์ข้อมูลโดยวิธี RT-PCR ) ในเชื้อรา เชื้อข้าว ต้นกล้า เมื่อท้าทายเชื้อโรคสูง การแสดงออกของ aminotransferase ,และ ankyrin wrky 12 ยีนพบว่าสอดคล้องกับการแสดงออกของ osmyb4 ที่สูง . ผ่านการแสดงออกของยีนใน osmyb4 เนื้อเยื่อใบข้าว โดยการติดเชื้อเกษตรล้มเหลวเพื่อผลในที่คล้ายกันกว่าการแสดงออกของ aminotransferase และ ankyrin wrky 12 ตามที่คาดไว้ แม้ว่าบทบาทของ osmyb4 ต้านทานโรคใบไหม้ในฝัก พบว่า มีการแตกหัก ตามผลลัพธ์ของเราเริ่มต้นเทียมมากกว่าการแสดงออกของ TF นี้ซึ่งจะไม่เพียงพอในการควบคุมความต้านทานโรคที่เกี่ยวข้องกับพันธุกรรม