However, the generality of the sequence-structure-function paradigm was challenged by the observation (Karush, 1950) that the binding site of bovine serum albumin adopts a large number of configurations with similar energy levels. Upon interacting with a substrate, the best-fitting configuration was selected from the structural ensemble of bovine serum albumin, which was called configurational adaptability. Koshland further proposed this configurational adaptability as induced-fit process (Koshland, 1958), indicating that protein conformational changes are responsible for its function. At the time induced-fit was proposed, it was unclear whether the process of binding induced a new conformation or
resulted in selection of the best-fit alternative from an ensemble of structures in equilibrium. The induced-fit theory was further supported by the fact that protein domains are capable of moving upon substrate binding, which were firstly observed in binding of glucose to yeast hexokinase and following numerous protein crystal structures (Bennett and Steitz, 1978; McDonald et al., 1979). One example of latter comes from crystal structures of folylpolyglutamate synthetase (FPGS) with and without substrates, a crucial enzyme to retain folic acids for normal cell growth (Sheng et al., 2000; Sun et al., 1998). An ATP-bound FPGS is activated by binding of folate as the second substrate, triggering a large closing movement of domains of FPGS that enables the enzyme to adopt a form for binding the third substrate, L-glutamate, and effect the addition of a polyglutamate tail to the folate (Sun et al., 2001). Thus, the induced-fit hypothesis not only covers structural accommodations within the binding pocket for binding a diverse set of related but structurally distinct molecules but also includes large domain movements upon ligand binding to gain deeper
understanding of structure-function relationship of proteins (Koshland, 1994). The inducedfit mechanisms of protein binding are obviously involved in protein conformational changes with either small rearrangements of few interacting groups or larger domain-domain rearrangements between alternative 3D structures in multi-domain proteins.
อย่างไรก็ตาม generality ของกระบวนทัศน์ลำดับโครงสร้างฟังก์ชันถูกท้าทาย โดยการสังเกต (Karush, 1950) ว่า กรมผูกวัว serum albumin adopts ค่าระดับพลังงานคล้ายกันเป็นจำนวนมาก เมื่อโต้ตอบกับกับพื้นผิว การกำหนดค่าที่ดีเหมาะสมถูกเลือกจากวงดนตรีโครงสร้างของวัว serum albumin ซึ่งมีเรียก configurational หลากหลาย Koshland หลากหลายนี้ configurational เป็นกระบวนการเกิดพอดี (Koshland, 1958), เสนอเพิ่มเติมระบุว่า โปรตีน conformational แปลงรับผิดชอบในหน้าที่ เวลา พอดีเกิดถูกเสนอ ก็ชัดเจนว่ากระบวนการในการผูกเกิด conformation ใหม่ หรือ
ผลในการเลือกทางเลือกที่พอดีดีที่สุดจากวงดนตรีมีโครงสร้างในสมดุล พอดีทำให้เกิดทฤษฎีเพิ่มเติมได้รับการสนับสนุนความจริงที่ว่าโดเมนโปรตีนจะสามารถย้ายตามพื้นผิวรวม ซึ่งประการแรกสุภัคผูกของกลูโคสกับยีสต์ hexokinase และต่อมากมายโปรตีนผลึกโครงสร้าง (เบนเนตและ Steitz, 1978 แมคโดนัลด์ et al., 1979) ตัวอย่างหนึ่งของหลังมาจากโครงสร้างผลึกของ folylpolyglutamate synthetase (FPGS) มี และไม่ มีพื้น ผิว เอนไซม์สำคัญรักษากรดโฟลิคสำหรับการเติบโตของเซลล์ปกติ (Sheng et al., 2000 ซันและ al., 1998) FPGS การผูกกับ ATP เรียก โดยรวมของโฟเลตเป็นพื้นผิวที่สอง เรียกการเคลื่อนไหวใหญ่ปิดโดเมนของ FPGS ที่ช่วยให้เอนไซม์นี้จะนำมาใช้รูปแบบการผูกสามพื้นผิว L glutamate และผลแห่งการ polyglutamate หางให้โฟเลต (ซันและ al., 2001) ดังนั้น สมมติฐานพอดีเกิดไม่เพียง ครอบคลุมพักโครงสร้างภายในกระเป๋าผูกสำหรับผูกชุดหลากหลายของโมเลกุลที่เกี่ยวข้อง แต่ structurally หมด แต่ยัง รวมถึงการย้ายโดเมนใหญ่เมื่อลิแกนด์ผูกรับลึก
เข้าใจความสัมพันธ์ฟังก์ชันโครงสร้างของโปรตีน (Koshland, 1994) กลไก inducedfit ของโปรตีนรวมได้อย่างชัดเจนที่เกี่ยวข้องในการเปลี่ยนแปลงของโปรตีน conformational rearrangements ใดขนาดเล็กของกลุ่มการโต้ตอบบางหรือใหญ่โดเมนโดเมน rearrangements ระหว่างโครงสร้าง 3D อื่นในโดเมนหลายโปรตีน
การแปล กรุณารอสักครู่..

อย่างไรก็ตาม สภาพทั่วไปของโครงสร้างลำดับฟังก์ชันกระบวนทัศน์ถูกท้าทายโดยการสังเกต ( karush 1950 ) ที่เว็บไซต์ผูกพันของอัลบูมินใช้จำนวนมากของการกำหนดค่ากับระดับพลังงานที่คล้ายคลึงกัน เมื่อกระทบกับพื้นผิว , การตั้งค่าที่เหมาะสมที่ดีที่สุดคือเลือกจากโครงสร้างของอัลบูมินวงดนตรี ,ซึ่งถูกเรียกว่าเปลี่ยนคอนฟิกุเรชันพร้อม คอชแลนด์เสนอต่อไปพร้อมเปลี่ยนคอนฟิกุเรชันนี้เกิดจากกระบวนการพอดี ( คอชแลนด์ , 1958 ) ระบุว่า การเปลี่ยนแปลงโครงสร้างของโปรตีนรับผิดชอบในหน้าที่ของมัน ในการเสนอเวลาพอดี มันก็ชัดเจนว่ากระบวนการของการทำให้โครงสร้างใหม่หรือ
ผลในการเลือกทางเลือกที่เหมาะสมที่สุดจากการรวมวงของโครงสร้างสมดุล พอดีเกิดทฤษฎีการสนับสนุนเพิ่มเติมโดยความจริงที่ว่าโดเมนโปรตีนที่สามารถเคลื่อนที่บนพื้นผิวผูก ซึ่งมีวัตถุประสงค์ในการตรวจสอบกลูโคสยีสต์และต่อไปนี้ hexokinase โครงสร้างผลึกโปรตีนมากมาย ( เบนเน็ตต์ และสติตส์ , 1978 ; McDonald et al . , 1979 )ตัวอย่างหนึ่งของหลังมาจากโครงสร้างผลึกของ folylpolyglutamate เทส ( fpgs ) มีพื้นผิวเป็นเอนไซม์สำคัญเพื่อรักษากรดโฟลิคสำหรับการเจริญเติบโตของเซลล์ปกติ ( Sheng et al . , 2000 ; Sun et al . , 1998 ) การเปิดใช้งานโดย fpgs เอทีพีผูกพันผูกพันของโฟเลตเป็นสารอาหาร 2กระตุ้นการเคลื่อนไหวปิดขนาดใหญ่ของโดเมนของ fpgs ที่ช่วยให้เอนไซม์อุปการะแบบฟอร์มสําหรับผูกสามของพื้นผิว และมีผลต่อการเพิ่มของพอลิกลูทาเมตหางกับโฟเลต ( Sun et al . , 2001 ) ดังนั้นสมมติฐานการเหนี่ยวนำพอดีไม่เพียง แต่ครอบคลุมทุกโครงสร้างภายในกระเป๋าผูกให้ผูกเป็นชุดหลากหลายของโครงสร้างโมเลกุลที่เกี่ยวข้อง แต่แตกต่างกัน แต่ยังรวมถึงการเคลื่อนไหวบนลิแกนด์ผูกพันขนาดใหญ่โดเมน เพื่อให้ได้รับความเข้าใจลึกของความสัมพันธ์ของโปรตีนโครงสร้างฟังก์ชัน
( คอชแลนด์ , 1994 )การ inducedfit กลไกของโปรตีนที่เกี่ยวข้องกับการเปลี่ยนแปลงที่เห็นได้ชัดในโปรตีนที่มีขนาดเล็กหรือขนาดใหญ่ rearrangements ไม่โต้ตอบกลุ่มโดเมนโดเมน rearrangements ระหว่างโครงสร้าง 3D ทางเลือกในหลายโดเมนโปรตีน
การแปล กรุณารอสักครู่..
