As discussed above, the sites of mi

As discussed above, the sites of mixed alleles in
the PCR product direct sequencing are considered true polymorphisms
because errors introduced by Taq polymerase are
randomly distributed in each individual product, and the
proportion of the random mutation to the initial template
population is small. Consequently, the major sequencing signal
at any one nucleotide will be from the original DNA templates
with no mutations. Among the 57 sites detected from chicken
ZZ24 and HC2, 35 (61.4%) had mixed alleles in PCR product
direct sequencing, which was within the range of the estimated
rate of true differences (,80%) using the enzyme error rate. To
answer the second question, we removed the polymorphic sites in
the individual cloned coxIII sequences not matched with the 35
sites in the sequences of PCR product direct sequencing from
ZZ24 and HC2, creating individual sequences with polymorphic
sites verified by PCR product direct sequencing. We then
performed hierarchical clustering and estimated the genetic
distances between the cloned sequences. We obtained a dendrogram
similar to that in Figure 4A

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ตามที่กล่าวไว้ข้างต้น ไซต์ของ alleles ผสมในจัดลำดับโดยตรงผลิตภัณฑ์ PCR จะถือว่าเป็นความหลากหลายที่แท้จริงเนื่องจากข้อผิดพลาดที่แนะนำ โดยพอลิเมอเรส Taqกระจายแบบสุ่มในแต่ละผลิตภัณฑ์แต่ละ และสัดส่วนของการกลายพันธุ์แบบสุ่มไปยังแม่แบบเริ่มต้นประชากรที่มีขนาดเล็ก ดังนั้น สัญญาณสำคัญลำดับนิวคลีโอไทด์หนึ่งใด ๆ จะจากแม่แบบดีเอ็นเอเดิมมีการกลายพันธุ์ไม่ หนึ่งในไซต์ 57 ที่ตรวจพบจากไก่ZZ24 และ HC2, 35 (61.4%) มีผสม alleles ในผลิตภัณฑ์ PCRลำดับโดยตรง ซึ่งอยู่ในช่วงของการประเมินอัตราความแตกต่างที่แท้จริง ( 80%) โดยใช้อัตราข้อผิดพลาดของเอนไซม์ ถึงตอบคำถามที่สอง เราเอาไซต์ polymorphic ในลำดับที่ coxIII แต่ละโคลนที่ไม่ตรงกับ 35เว็บไซต์ในลำดับที่ของผลิตภัณฑ์ PCR ตรงลำดับจากZZ24 และการสร้างแต่ละลำดับ มี polymorphic, HC2เว็บไซต์ตรวจสอบ โดยผลิตภัณฑ์ PCR โดยตรงลำดับ จากนั้นเราดำเนินการลำดับ clustering และประมาณการทางพันธุกรรมระยะทางระหว่างลำดับที่โคลน เรารับเป็น dendrogramคล้ายกับในรูปที่ 4A

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ตามที่กล่าวไว้ข้างต้นเว็บไซต์ของอัลลีลผสมใน
PCR ลำดับโดยตรงสินค้าที่ได้รับการพิจารณาความหลากหลายจริง
เนื่องจากข้อผิดพลาดในการแนะนำให้รู้จัก Taq โพลิเมอร์มีการ
กระจายแบบสุ่มในแต่ละผลิตภัณฑ์และ
สัดส่วนของการกลายพันธุ์แบบสุ่มไปยังแม่แบบเริ่มต้น
ของประชากรที่มีขนาดเล็ก ดังนั้นสัญญาณที่สำคัญลำดับ
ที่คนใดคนหนึ่งจะเบื่อหน่ายจากแม่แบบดีเอ็นเอเดิม
ที่มีการกลายพันธุ์ที่ไม่มี ในบรรดา 57 เว็บไซต์ที่ตรวจพบจากไก่
ZZ24 และ HC2, 35 (61.4%) มีอัลลีลผสมในผลิตภัณฑ์ PCR
ลำดับตรงซึ่งอยู่ในช่วงของการประมาณการ
อัตราของความแตกต่างที่แท้จริง (80%) โดยใช้อัตราความผิดพลาดการทำงานของเอนไซม์ ที่จะ
ตอบคำถามที่สองเราได้ลบเว็บไซต์ polymorphic ใน
แต่ละโคลนลำดับ coxIII ไม่ได้จับคู่กับ 35
เว็บไซต์ในลำดับของลำดับโดยตรงผลิตภัณฑ์ PCR จาก
ZZ24 และ HC2 สร้างลำดับบุคคลที่มี polymorphic
เว็บไซต์ตรวจสอบโดยวิธี PCR ลำดับโดยตรงสินค้า จากนั้นเราจะ
ดำเนินการจัดกลุ่มและลำดับชั้นโดยประมาณทางพันธุกรรม
ระยะทางระหว่างลำดับโคลน เราได้รับ dendrogram
คล้ายกับว่าในรูป 4A