ResultsScreening for Salt Resistanc

Results
Screening for Salt Resistance and Plant Growth
Promoting (PGP) Traits
A total of 130 bacteria were isolated from the rhizosphere
soil of wheat growing in the salt affected soils of Varanasi,
Mau, Ballia, and Gorakhpur districts of UP. The number of
isolates obtained on different media viz., nutrient agar,
King’s B, Jensen’s N-free, soil extract agar, and trypticase
soy agar were 55, 16, 26, 17, and 16, respectively. All the
isolates were screened for salt tolerance at graded concentrations
(2, 4, 6, and 8%) of NaCl. Out of the 130
isolates, 42 isolates were able to tolerate NaCl stress up to
8% (data not shown). Further screening of these isolates for
the production of PGP traits at high salt concentrations
revealed that 24 isolates produced IAA, 10 isolates solubilized
phosphorus, eight produced siderophore, six produced
gibberellins, while only three showed the production
of ACC deaminase (Table 1).
Amplification of 16S rDNA and PCR–RFLP Analysis
The 16S rDNA of all the 24 isolates were amplified with
the primers pA and pH. Gel electrophoresis of undigested
PCR products revealed that all isolates produced a single
band of about 1540 bp (Fig. 1). The RFLP analysis
revealed large variations among the isolates. The sum of
the estimated sizes of the digested fragments of the
amplified product was close to that of the full size, i.e.,
1540 bp. The restriction patterns obtained after digestion
of the amplified 16S rDNA fragment with HaeIII revealed
14 restriction patterns (Fig. 2a). The fragments with
HaeIII, 650, 450, 250, and 150 bp were common in
SU17, SU18, and SU10 strains. Digestion of 16S rDNA
product with Alu1 gave 17 restriction patterns (Fig. 2b).
Msp1 was the least discriminatory among the three
endonucleases and gave a total of nine restriction patterns
(Fig. 2c). Again a DNA band of 600 and 350 bp were
common in SU24 and SU30 strains in Msp1 digestion.
Isolates SU17, SU24, and SU28 were clustered together
with restriction endonucleases AluI and MspI, however,
SU17 was segregated from the cluster when clustered
with HaeIII.
Dendrogram was derived from the distance matrix by
the UPGMA, a total of 22 different combinations of
restriction patterns were recorded among 24 isolates
(Fig. 3). A critical analysis of the results shows a major
division into two clusters at 27% similarity coefficient
value. The cluster I comprised of 19 isolates whereas
cluster II has only five isolates (Fig. 3).
On the basis of phylogenetic analysis of 16S rDNA
(1.5 Kb) of 10 highly salt tolerant bacterial strains were
identified as SU3 and SU10 were Bacillus pumilus, SU8
and SU44 were B. aquimaris, SU13 was B. arsenicus,
SU16 was B. sporothermodurances, SU18 was Arthrobacter
sp., SU24 was B. cereus, SU40 was Pseudomonas
medicona and SU47 was B. subtilis (Table 1). Phylogenetic
analyses of the strains based on the NJ method with 1000
bootstrap sampling were resulted into three major clusters
S. K. Upadhyay et al.: Genetic Diversity of PGPR 491
12

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ผลการตรวจคัดกรองสำหรับความต้านทานเกลือและเจริญเติบโตของพืชส่งเสริม(PGP) ลักษณะรวม130 แบคทีเรียที่แยกได้จากบริเวณรากดินของข้าวสาลีที่กำลังเติบโตในเกลือได้รับผลกระทบดินพาราณ สี, เมา Ballia และหัวเมืองของแอวู UP จำนวนของสายพันธุ์ที่ได้รับในการที่แตกต่างกันกล่าวคือสื่อ. วุ้นสารอาหารของพระบาทสมเด็จพระเจ้าอยู่หัวB, เซ่น N-ฟรีดินสารสกัดจากอาหารเลี้ยงเชื้อและ trypticase วุ้นถั่วเหลืองเท่ากับ 55, 16, 26, 17, และ 16 ตามลำดับ ทุกสายพันธุ์ที่ได้รับการคัดกรองทนเค็มที่ระดับความเข้มข้นช้า(2, 4, 6, และ 8%) ของโซเดียมคลอไรด์ ออกจาก 130 สายพันธุ์ 42 สายพันธุ์ก็สามารถที่จะทนต่อความเครียดโซเดียมคลอไรด์ถึง8% (ไม่ได้แสดงข้อมูล) การตรวจคัดกรองเพิ่มเติมของเชื้อเหล่านี้สำหรับการผลิตของลักษณะ PGP ที่ระดับความเข้มข้นของเกลือสูงเปิดเผยว่า24 แยกผลิต IAA 10 แยกละลายฟอสฟอรัสsiderophore แปดผลิตหกผลิตเรลลิขณะที่มีเพียงสามแสดงให้เห็นว่าการผลิตของdeaminase แม็ก (ตารางที่ 1). ขยาย ของ 16S rDNA และ PCR-RFLP วิเคราะห์16S rDNA ทั้งหมด 24 สายพันธุ์ถูกขยายด้วยไพรเมอร์และพีเอชpA ข่าวคราวของไม่ได้แยกแยะผลิตภัณฑ์ PCR เปิดเผยว่าไอโซเลททั้งหมดที่ผลิตเดียววงประมาณ1,540 bp (รูปที่ 1). การวิเคราะห์ RFLP เปิดเผยรูปแบบที่มีขนาดใหญ่ในหมู่เชื้อ ผลรวมของขนาดโดยประมาณของชิ้นส่วนย่อยของสินค้าที่ขยายได้ใกล้เคียงกับที่ของขนาดเต็มคือ1,540 bp รูปแบบการ จำกัด ได้รับหลังจากการย่อยอาหารของชิ้นส่วน16S rDNA ขยาย HaeIII เปิดเผยกับ14 รูปแบบการ จำกัด (รูป. 2a) ชิ้นส่วนที่มีHaeIII, 650, 450, 250, และ 150 bp เป็นเรื่องปกติในSU17, SU18 และสายพันธุ์ SU10 การย่อยอาหารของ 16S rDNA ผลิตภัณฑ์ที่มี Alu1 ให้ 17 รูปแบบการ จำกัด (รูป. 2b). Msp1 เป็นอย่างน้อยการเลือกปฏิบัติในสามendonucleases และให้รวมเป็นเก้าข้อ จำกัด รูปแบบ(รูป. 2c) อีกครั้งกับวงดนตรีดีเอ็นเอ 600 และ 350 bp เป็นเรื่องธรรมดาในสายพันธุ์SU24 และ Su30 ในการย่อยอาหาร Msp1. แยก SU17, SU24 และ SU28 ถูกคลัสเตอร์ร่วมกันกับข้อจำกัด endonucleases AluI และ MspI แต่SU17 ถูกแยกจากคลัสเตอร์เมื่อคลัสเตอร์กับHaeIII dendrogram ได้มาจากเมทริกซ์ระยะทางโดยUPGMA รวมเป็น 22 ชุดที่แตกต่างกันของรูปแบบข้อจำกัด ที่ถูกบันทึกไว้ในหมู่ 24 ไอโซเลท(รูปที่. 3) การวิเคราะห์ที่สำคัญของผลที่ได้แสดงให้เห็นที่สำคัญแบ่งออกเป็นสองกลุ่มที่มีค่าสัมประสิทธิ์ความคล้ายคลึงกัน 27% ค่า กลุ่มที่ฉันประกอบด้วย 19 แยกขณะที่กลุ่มที่สองมีเพียงห้าไอโซเลท(รูปที่. 3). บนพื้นฐานของการวิเคราะห์สายวิวัฒนาการของ 16S rDNA (1.5 Kb) 10 สูงเกลือสายพันธุ์แบคทีเรียใจกว้างถูกระบุว่าเป็นSU3 และ SU10 เป็น pumilus Bacillus, SU8 และ SU44 เป็นบี aquimaris, SU13 เป็นบี arsenicus, SU16 เป็น sporothermodurances บี SU18 เป็น Arthrobacter sp. SU24 เป็นเชื้อ B. cereus, SU40 เป็น Pseudomonas medicona และ SU47 เป็น subtilis บี (ตารางที่ 1) Phylogenetic วิเคราะห์สายพันธุ์ตามวิธีนิวเจอร์ซีย์ 1000 สุ่มตัวอย่างบูตเป็นผลออกเป็นสามกลุ่มใหญ่เอส เค Upadhyay et al .: ความหลากหลายทางพันธุกรรมของ PGPR 491 12

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ผลการตรวจความต้านทานต่อเกลือ

และส่งเสริมการเจริญเติบโต ( PGP ) ลักษณะ
รวม 130 แบคทีเรียที่แยกได้จากราก
ดินของข้าวสาลีที่ปลูกในดินเกลือของเมืองพาราณสี
เกี่ยวกับ ballia และโอกามิซังเขตขึ้น จำนวนของเชื้อที่ได้รับ ได้แก่ สื่อต่าง ๆ
. ,
วุ้นสารอาหารของกษัตริย์บี เจนเซ่น n-free วุ้น , สารสกัดจากดิน และ trypticase
วุ้นถั่วเหลือง จำนวน 55 , 16 ,26 , 17 และ 16 ตามลำดับ ทั้งหมดเกลือ
ไอโซเลตจากความอดทนที่ระดับความเข้มข้น
( 2 , 4 , 6 และ 8 % ) เกลือ ออกจาก 130
จำนวน 42 สายพันธุ์สามารถทนความเครียดเกลือขึ้น
8 % ( ข้อมูลไม่แสดง ) เพิ่มเติมการคัดกรองจำนวนสำหรับ
การผลิตของ PGP คุณลักษณะที่ความเข้มข้นเกลือสูง พบว่าไอโซเลตที่ผลิต IAA 24

ซึ่ง 10 ไอโซเลทฟอสฟอรัส , แปดผลิตไซเดอโรฟอร์ หกผลิต
จิบเบอเรลลิน ในขณะที่เพียงสามพบการผลิต
บัญชีอะมิเนส ( ตารางที่ 1 ) .
( ของ 16S rDNA และ PCR –การวิเคราะห์ RFLP
16S rDNA ของทั้งหมด 24 ไอโซเลทของ
ด้วย PA และ pH เจลผลิตภัณฑ์ PCR undigested
เปิดเผยว่า สายพันธุ์ที่ผลิตวงเดียว
ประมาณ 1540 BP ( รูปที่ 1 )โดย : การวิเคราะห์
เปิดเผยรูปแบบขนาดใหญ่ของเชื้อ ผลรวมของ
ประมาณขนาดของชิ้นส่วนย่อยของ
ผลิตภัณฑ์ใกล้เคียงกับอัตราของขนาดเต็ม , I ,
1540 BP . จำกัดรูปแบบได้จากการย่อย
ของเบส 16S rDNA เบสกับ haeiii เปิดเผย
14 ข้อ จำกัด รูปแบบ ( รูปที่ 2A ) เศษด้วย
haeiii , 650 , 450 , 250 ,และ 150 BP อยู่ทั่วไปใน su17 su18
, , และ su10 สายพันธุ์ การย่อยอาหารของ 16S rDNA
ผลิตภัณฑ์กับ alu1 ให้ 17 ข้อ จำกัด รูปแบบ ( รูปที่ 2B ) .
MSP1 น้อยที่สุดในบรรดา 3
ความสงบเงียบและให้มีทั้งหมดเก้าข้อ จำกัด รูปแบบ
( รูปที่ 2 ) อีกครั้งให้แถบดีเอ็นเอของ 600 และ 350 BP เป็น
ทั่วไปใน su24 su30 ในการย่อยอาหารและสายพันธุ์สายพันธุ์ su17 su24 MSP1 .
, ,su28 และมีการจัดกลุ่มเข้าด้วยกัน
ที่มีจำกัดจะสงบเงียบโดยใช้ , อย่างไรก็ตาม ,
su17 คือแยกจากกลุ่มเมื่อจับกลุ่มกับ haeiii
.
พันธุกรรมที่ได้มาจากระยะทางที่เมทริกซ์โดย
วิธี รวม 22 ชุดค่าผสมที่แตกต่างกันของข้อ จำกัด ที่ถูกบันทึกไว้ในรูปแบบ

24 ไอโซเลท ( รูปที่ 3 ) การวิเคราะห์ผลการวิจัยแสดงให้เห็นหลัก
แบ่งเป็นสองกลุ่มที่ค่าสัมประสิทธิ์ความเหมือน 27
% กลุ่มผมประกอบด้วย 19 ไอโซเลท และกลุ่มที่ 2 มีเพียง 5 ไอโซเลท

( รูปที่ 3 ) บนพื้นฐานของการวิเคราะห์วิวัฒนาการของ 16S rDNA
( 1.5 กิโล ) 10 สูงแบคทีเรียสายพันธุ์ทนเค็ม
ระบุเป็น su3 su10 ) และบาซิลลัส พูมิลัส su8
su44 , และเป็น พ. aquimaris su13 คือ , พ. arsenicus
su16 คือ , พ.sporothermodurances su18 คือยา ,
. su24 คือ B . cereus su40 คือ , Pseudomonas และ
medicona su47 คือ B . subtilis ( ตารางที่ 1 )
วิเคราะห์วิวัฒนาการของสายพันธุ์ขึ้นอยู่กับ NJ ด้วยวิธีบูตสแตรป 1000
จำนวนสามหลักให้เข้าไปในกลุ่ม
S . K . upadhyay et al . : ความหลากหลายทางพันธุกรรมของมีแนวโน้ม 491
12