Discussion
Metagenomic sequencing of DNA extracted from human oropharyngeal samples identified sequences homologous to chlorovirus ATCV-1 in 14 of 33 (42.4%) individuals from a cohort of adults without a known psychiatric disorder or physical illness who were living in an urban area in the United States. DNA sequences found in study individuals mapped to many sites on the ATCV-1 genome and included many viral genes (Fig. 1). The finding of ATCV-1 sequences by metagenomic sequencing was confirmed by a sequence-specific (gene z100l) qPCR assay that detected ATCV-1 sequences in oropharyngeal samples from 40 of 92 (43.5%) individuals from the same study cohort. There were no differences between individuals, with or without ATCV-1 sequences, with respect to demographic variables, such as age, sex, race, socioeconomic status, cigarette smoking, travel history, or place of birth.
As noted in the introduction, ATCV-1 is a member of the genus Chlorovirus, family Phycodnaviridae. Viruses in the phycodnavirus family, together with those in the Poxviridae, Iridoviridae, Ascoviridae, Asfarviridae, Mimiviridae, and Marseilleviridae, are proposed to have a common evolutionary ancestor and are often referred to as nucleocytoplasmic large DNA viruses (24–26). Chloroviruses have large dsDNA genomes (290–370 kb) that encode up to 410 proteins and many tRNAs (13). Chloroviruses infect certain unicellular, eukaryotic, exsymbiotic chlorella-like green algae, called zoochlorellae. Zoochlorellae are associated with the protozoan Paramecium bursaria, the coelenterate Hydra viridis, the heliozoon A. turfacea, and other freshwater and marine invertebrates and protozoans
(27, 28). Three such zoochlorellae are Chlorella NC64A (renamed
สนทนาMetagenomic ลำดับของดีเอ็นเอที่สกัดจากตัวอย่าง oropharyngeal มนุษย์ระบุลำดับเซทจะมีโครโมโซมไป chlorovirus ATCV-1 ใน 14 ของบุคคล (42.4%) 33 จากกลุ่มรุ่นของผู้ใหญ่โดยไม่ทราบความผิดปกติทางจิตเวชหรือโรคทางกายภาพที่อยู่ในเมืองในสหรัฐอเมริกา ลำดับดีเอ็นเอที่พบในการศึกษาบุคคลที่ถูกแมปไปเว็บไซต์จำนวนมากบนจีโน ATCV-1 และรวมยีนไวรัสจำนวนมาก (รูปที่ 1) ยืนยันการลำดับเฉพาะ (ยีน z100l) ค้นพบของ ATCV-1 ลำดับโดยลำดับ metagenomic qPCR ทดสอบที่ตรวจพบ ATCV 1 ลำดับในตัวอย่าง oropharyngeal จาก 40 92 (43.5%) บุคคลจากงานการศึกษาเดียวกัน ไม่มีความแตกต่างระหว่างบุคคล มี หรือไม่ มี ลำดับ ATCV 1 เกี่ยวกับตัวแปรของประชากร เช่นอายุ เพศ การแข่งขัน สถานะ socioeconomic สูบบุหรี่ ประวัติท่องเที่ยว หรือสถานเกิดได้ดังที่ระบุไว้ในการแนะนำ ATCV-1 เป็นสมาชิกของสกุล Chlorovirus ครอบครัว Phycodnaviridae ไวรัสในครอบครัว phycodnavirus กับผู้ใน Poxviridae, Iridoviridae, Ascoviridae, Asfarviridae, Mimiviridae และ Marseilleviridae มีการนำเสนอจะมีบรรพบุรุษเป็นวิวัฒนาการทั่วไป และมักจะเรียกว่าเป็นไวรัสดีเอ็นเอขนาดใหญ่ nucleocytoplasmic (24-26) Chloroviruses มีขนาดใหญ่ dsDNA genomes (290 – 370 kb) ที่เข้ารหัสโปรตีนที่ 410 และหลาย tRNAs (13) Chloroviruses ติดเชื้อบางอย่าง exsymbiotic unicellular, eukaryotic สาหร่ายเช่นสาหร่ายสีเขียว เรียกว่า zoochlorellae Zoochlorellae จะเกี่ยวข้องกับ protozoan พารามีเซียม bursaria, coelenterate viridis ไฮดรา heliozoon A. turfacea และปลาน้ำจืด และทะเลไม่มีกระดูกสันหลังอื่น ๆ และโปรโตซัว(27, 28) คลอเรลล่า NC64A (เปลี่ยนชื่อเป็นสาม zoochlorellae ดังกล่าว
การแปล กรุณารอสักครู่..
อภิปรายลำดับ Metagenomic ดีเอ็นเอที่สกัดจากตัวอย่าง oropharyngeal มนุษย์ระบุลำดับคล้ายคลึงกัน chlorovirus ATCV-1 ใน 14 จาก 33 (42.4%) บุคคลจากการศึกษาของผู้ใหญ่โดยไม่เป็นโรคทางจิตเวชที่รู้จักกันหรือเจ็บป่วยทางกายที่อาศัยอยู่ในเขตเมืองในประเทศ สหรัฐอเมริกา
ลำดับดีเอ็นเอที่พบในการศึกษาบุคคลแมปไปยังเว็บไซต์จำนวนมากบนจีโนม ATCV-1 รวมยีนไวรัสจำนวนมาก (รูปที่ 1). การค้นพบของ ATCV-1 ลำดับโดยลำดับ Metagenomic รับการยืนยันโดยลำดับที่เฉพาะเจาะจง (ยีน z100l) ทดสอบ qPCR ตรวจพบว่าลำดับ ATCV-1 ในตัวอย่าง oropharyngeal จาก 40 92 (43.5%) บุคคลจากการศึกษาการศึกษาเดียวกัน มีความแตกต่างระหว่างบุคคลไม่มีหรือไม่มี ATCV-1 ลำดับที่เกี่ยวกับตัวแปรทางด้านประชากรศาสตร์เช่นอายุเพศเชื้อชาติสถานะทางสังคมและเศรษฐกิจ, การสูบบุหรี่, ประวัติการเดินทางหรือสถานที่เกิด. ดังที่ระบุไว้ในบทนำ, ATCV -1 เป็นสมาชิกของสกุล Chlorovirus ครอบครัว Phycodnaviridae ไวรัสในครอบครัว phycodnavirus ร่วมกับผู้ที่อยู่ใน Poxviridae, Iridoviridae, Ascoviridae, Asfarviridae, Mimiviridae และ Marseilleviridae จะเสนอให้มีการวิวัฒนาการบรรพบุรุษร่วมกันและมักจะเรียกว่า nucleocytoplasmic ไวรัสดีเอ็นเอขนาดใหญ่ (24-26) Chloroviruses มีจีโนม dsDNA ขนาดใหญ่ (290-370 กิโลไบต์) ที่เข้ารหัสได้ถึง 410 โปรตีนและ tRNAs จำนวนมาก (13) Chloroviruses ติดเชื้อจุลินทรีย์บาง, ยูคาริโอ, exsymbiotic Chlorella เหมือนสาหร่ายสีเขียวที่เรียกว่า zoochlorellae Zoochlorellae เกี่ยวข้องกับโปรโตซัว Paramecium bursaria, coelenterate ไฮดรา viridis ที่ heliozoon เอ turfacea และน้ำจืดและสัตว์ไม่มีกระดูกสันหลังอื่น ๆ ทางทะเลและโปรโตซัว(27, 28) สาม zoochlorellae ดังกล่าวมีคลอเรลล่า NC64A (เปลี่ยนชื่อ
การแปล กรุณารอสักครู่..