In molecular biology, a hybridizati

In molecular biology, a hybridization probe is a fragment of DNA or RNA of variable length (usually 100-1000 bases long) which is used in DNA or RNA samples to detect the presence of nucleotide sequences (the DNA target) that are complementary to the sequence in the probe. The probe thereby hybridizes to single-stranded nucleic acid (DNA or RNA) whose base sequence allows probe-target base pairing due to complementarity between the probe and target. The labeled probe is first denatured (by heating or under alkaline conditions such as exposure to sodium hydroxide) into single stranded DNA (ssDNA) and then hybridized to the target ssDNA (Southern blotting) or RNA (Northern blotting) immobilized on a membrane or in situ.

To detect hybridization of the probe to its target sequence, the probe is tagged (or "labeled") with a molecular marker of either radioactive or (more recently) fluorescent molecules; commonly used markers are 32P (a radioactive isotope of phosphorus incorporated into the phosphodiester bond in the probe DNA) or Digoxigenin, which is a non-radioactive, antibody-based marker. DNA sequences or RNA transcripts that have moderate to high sequence similarity to the probe are then detected by visualizing the hybridized probe via autoradiography or other imaging techniques. Normally, either X-ray pictures are taken of the filter, or the filter is placed under UV light. Detection of sequences with moderate or high similarity depends on how stringent the hybridization conditions were applied — high stringency, such as high hybridization temperature and low salt in hybridization buffers, permits only hybridization between nucleic acid sequences that are highly similar, whereas low stringency, such as lower temperature and high salt, allows hybridization when the sequences are less similar. Hybridization probes used in DNA microarrays refer to DNA covalently attached to an inert surface, such as coated glass slides or gene chips, to which a mobile cDNA target is hybridized.

Depending on the method, the probe may be synthesized using the phosphoramidite method, or it can be generated and labeled by PCR amplification or cloning (both are older methods). In order to increase the in vivo stability of the probe RNA is not used, instead RNA analogues may be used, in particular morpholino- derivatives. Molecular DNA- or RNA-based probes are now routinely used in screening gene libraries, detecting nucleotide sequences with blotting methods, and in other gene technologies, such as nucleic acid and tissue microarrays.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ในอณูชีววิทยา การโพรบ hybridization เป็นส่วนของดีเอ็นเอหรืออาร์เอ็นเอความยาวผันแปร (ปกติ 100-1000 ฐานยาว) ที่ใช้ในตัวอย่างดีเอ็นเอหรืออาร์เอ็นเอเพื่อตรวจหาลำดับนิวคลีโอไทด์ (เป้าหมายดีเอ็นเอ) ที่เป็นส่วนเสริมซึ่งลำดับในการโพรบ โพรบ hybridizes ทำการควั่นเดียวกรดนิวคลีอิก (ดีเอ็นเอหรืออาร์เอ็นเอ) ลำดับที่ฐานช่วยให้โพรบเป้าหมายฐานจับคู่จาก complementarity ระหว่างโพรบและเป้าหมาย โพรบป้ายแรก denatured (ด้วยความร้อน หรือสภาวะด่างเช่นสัมผัสกับโซเดียมไฮดรอกไซด์) ในดีเอ็นเอตกค้างเดียว (ssDNA) และนั้น เป็นเป้าหมาย ssDNA (blotting วิธีภาคใต้) หรืออาร์เอ็นเอ (blotting วิธีเหนือ) ใน situ หรือเอนไซม์บนเมมเบรนการ hybridization ของโพรบลำดับของเป้าหมาย โพรบติดแท็ก (หรือ "ชื่อ") ด้วยเครื่องหมายโมเลกุลของโมเลกุลกัมมันตรังสี หรือเรืองแสง (เพิ่งขึ้น) เครื่องหมายที่ใช้กันทั่วไปเป็น P 32 (เป็นกัมมันตรังสีไอโซโทปของฟอสฟอรัสรวมเป็นพันธะ phosphodiester ในดีเอ็นเอโพรบ) หรือ Digoxigenin ซึ่งเป็นเครื่องหมายที่ไม่มีกัมมันตรังสี ใช้แอนติบอดี ลำดับดีเอ็นเอหรือใบแสดงผลอาร์เอ็นเอที่มีลำดับปานกลางถึงสูงคล้ายกับโพรบแล้วตรวจพบ โดยแสดงผลโพรบเป็น autoradiography หรือเทคนิคการถ่ายภาพอื่น ๆ โดยปกติ ถ่ายรูปภาพเอ็กซ์เรย์ของตัวกรอง หรือตัวกรองอยู่ภายใต้แสง UV ตรวจสอบลำดับด้วยมิใช่น้อยปานกลาง หรือสูงขึ้นอยู่กับวิธีเข้มงวดเงื่อนไข hybridization ใช้ — stringency สูง อุณหภูมิสูง hybridization และเค็มในบัฟเฟอร์ hybridization อนุญาตให้เฉพาะ hybridization ระหว่างลำดับกรดนิวคลีอิกที่คล้ายกันมาก ในขณะที่ stringency ต่ำ อุณหภูมิต่ำและเกลือสูง ช่วยให้ hybridization เมื่อลำดับที่คล้ายคลึงกันน้อย คลิปปากตะเข้ hybridization ใช้ใน DNA microarrays หมายถึง covalently แนบกับผิว inert เช่นเคลือบกระจกสไลด์หรือยีนชิป ซึ่งเคลื่อน cDNA เป้าหมายจะเป็นดีเอ็นเอวิธี อาจสังเคราะห์โพรบใช้วิธี phosphoramidite หรือสามารถสร้าง และกำหนดป้ายชื่อ โดยขยาย PCR หรือโคลน (ทั้งวิธีเก่า) เพื่อเพิ่มความเสถียรในสัตว์ทดลองของโพรบที่ไม่มีใช้อาร์เอ็นเอ แทน analogues อาร์เอ็นเอสามารถใช้ ในการ morpholino-อนุพันธ์ คลิปปากตะเข้โมเลกุลดีเอ็นเอ หรืออาร์เอ็นเอใช้ตอนนี้เป็นประจำใช้ ในไลบรารีของยีน ลำดับของนิวคลีโอไทด์กับ blotting วิธีวิธีตรวจคัดกรอง และ เทคโนโลยีอื่น ๆ ยีน กรดนิวคลีอิกและ microarrays เนื้อเยื่อ

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ในอณูชีววิทยาสอบสวนพันธุ์เป็นส่วนของดีเอ็นเอหรืออาร์เอ็นเอของความยาวตัวแปร (ปกติ 100-1000 ฐานยาว) ซึ่งถูกนำมาใช้ใน DNA หรือ RNA ตัวอย่างเพื่อตรวจสอบสถานะของลำดับเบส (เป้าหมายดีเอ็นเอ) ที่มีประกอบกับ ลำดับสอบสวน สอบสวนจึง hybridizes กรดนิวคลีอิกเดียวควั่น (DNA หรือ RNA) ที่มีฐานลำดับช่วยให้การจับคู่ฐานสอบสวนเป้าหมายเนื่องจาก complementarity ห่างระหว่างการสอบสวนและเป้าหมาย สอบสวนระบุว่าเป็นครั้งแรกเอทิลแอลกอฮอล์ (ด้วยความร้อนหรือภายใต้เงื่อนไขที่อัลคาไลน์เช่นการสัมผัสกับโซเดียมไฮดรอกไซ) ลงในดีเอ็นเอเกลียวเดี่ยว (ssDNA) และไฮบริดไปยังเป้าหมาย ssDNA (ซับใต้) หรืออาร์เอ็นเอ (ซับเหนือ) ตรึงบนเมมเบรนหรือ แหล่งกำเนิดในการตรวจสอบการผสมข้ามพันธุ์ของหัวเพื่อเป้าหมายลำดับของการสืบสวนที่มีการติดแท็ก (หรือ "ป้าย") กับโมเลกุลของโมเลกุลเรืองแสงทั้งกัมมันตรังสีหรือ (เมื่อเร็ว ๆ นี้) เครื่องหมายที่ใช้กันทั่วไปมี 32P (ไอโซโทปกัมมันตรังสีของฟอสฟอรัสรวมเข้าไปในพันธบัตร phosphodiester ใน DNA สอบสวน) หรือ digoxigenin ซึ่งเป็นที่ไม่ใช่กัมมันตรังสีเครื่องหมายแอนติบอดีที่ใช้ ลำดับดีเอ็นเอหรืออาร์เอ็นเอยีนที่มีความคล้ายคลึงกันในระดับปานกลางลำดับสูงในการสอบสวนมีการตรวจพบแล้วโดยการแสดงความคิดเห็นผ่านทางไฮบริดออหรือเทคนิคการถ่ายภาพอื่น ๆ โดยปกติทั้งภาพ X-ray จะถูกนำของตัวกรองหรือตัวกรองจะอยู่ภายใต้แสงยูวี การตรวจหาลำดับที่มีความคล้ายคลึงกันในระดับปานกลางหรือสูงขึ้นอยู่กับเงื่อนไขที่เข้มงวดพันธุ์ถูกนำไปใช้ - ความเข้มงวดสูงเช่นพันธุ์อุณหภูมิสูงและเกลือต่ำในบัฟเฟอร์ผสมพันธุ์อนุญาตให้ผสมข้ามพันธุ์ระหว่างลำดับกรดนิวคลีอิกที่มีความคล้ายคลึงกันอย่างมากในขณะที่ความเข้มงวดต่ำเช่น เมื่ออุณหภูมิลดลงและเกลือสูงช่วยให้การผสมข้ามพันธุ์เมื่อลำดับที่มีความคล้ายคลึงน้อย ยานสำรวจพันธุ์ที่ใช้ในการ microarrays ดีเอ็นเอหมายถึงดีเอ็นเอที่ติด covalently เพื่อผิวเฉื่อยเช่นเคลือบกระจกสไลด์หรือชิปยีนซึ่งเป้าหมาย cDNA มือถือไฮบริดขึ้นอยู่กับวิธีการสอบสวนอาจจะใช้วิธีการสังเคราะห์ PHOSPHORAMIDITE หรือ มันสามารถสร้างและติดป้ายโดยการขยาย PCR หรือโคลน (ทั้งเป็นวิธีการเก่า) เพื่อเพิ่มความมั่นคงในร่างกายของอาร์เอ็นเอสอบสวนไม่ได้ใช้แทน analogues RNA อาจจะถูกใช้ในการซื้อขายสัญญาซื้อขายล่วงหน้า morpholino- โดยเฉพาะอย่างยิ่ง โมเลกุล DNA- หรือตรวจ RNA ที่ใช้อยู่ในขณะนี้ใช้เป็นประจำในห้องสมุดยีนการตรวจคัดกรองตรวจสอบลำดับเบสด้วยวิธีการซับและในเทคโนโลยีของยีนอื่น ๆ เช่นกรดนิวคลีอิกและ microarrays เนื้อเยื่อ

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ในอณูชีววิทยา , hybridization probe คือชิ้นส่วนของ DNA หรือ RNA ของความยาวแปรได้ ( โดยปกติในระบบฐานยาว ) ซึ่งถูกใช้ในตัวอย่างดีเอ็นเอ หรืออาร์เอ็นเอ เพื่อตรวจสอบสถานะของลำดับนิวคลีโอไทด์ ( เป้าหมาย DNA ) ที่ประกอบกับลำดับในการสอบสวนการสอบสวนจึง hybridizes เดียวควั่นกรดนิวคลีอิก ( DNA หรือ RNA ) ที่มีลำดับฐานให้สอบสวนฐานเป้าหมายคู่เนื่องจากข้อมูลระหว่างการสอบสวน และเป้าหมายการติดป้ายตัวแรกเกิด ( โดยความร้อน หรือภายใต้เงื่อนไขที่เป็นด่างเช่นแสงโซเดียม ไฮดรอกไซด์ ) เป็นเดี่ยวเกลียวดีเอ็นเอ ( ssdna ) แล้วสามารถไป ssdna เป้าหมาย ( Southern blotting ) หรือ RNA ( Northern blotting ) ที่ถูกตรึงบนเยื่อหุ้มเซลล์หรือใน situ

เพื่อตรวจหาสารลำดับเป้าหมายของมัน ,การสอบสวนเป็นแท็ก ( หรือ " ข้อความ " ) ด้วยเครื่องหมายโมเลกุลของสารกัมมันตรังสี หรือ ( เมื่อเร็วๆนี้ ) โมเลกุลเรืองแสง ; มักใช้เครื่องหมายเป็น 32p ( ไอโซโทปกัมมันตรังสีของธาตุฟอสฟอรัสรวมอยู่ในฟ โฟไดเ เตอร์ บอนด์ในดีเอ็นเอ ) หรือติด ซึ่งไม่ใช่กัมมันตรังสีจากเครื่องหมายตามลำดับ DNA หรือ RNA transcripts นั้นมีความเหมือนลำดับสูงกับการสอบสวนอยู่แล้วที่ตรวจพบโดยการตรวจสอบดีเอ็นเอผ่านเก้าอี้รับแขกหรือเทคนิคการถ่ายภาพอื่น ๆ ปกติ ทั้งเอ็กซเรย์ภาพถ่ายของตัวกรองหรือตัวกรองอยู่ภายใต้แสงยูวีการตรวจหาลำดับปานกลางหรือสูงเหมือนกัน ขึ้นอยู่กับว่าเข้มงวดเงื่อนไข ( เป็น stringency สูงที่ใช้ - เช่นอุณหภูมิสูงและต่ำในเกลือสารบัฟเฟอร์ ( อนุญาตเฉพาะลูกผสมระหว่างลำดับกรดนิวคลีอิกที่คล้ายคลึงกันอย่างมาก ในขณะที่ stringency ต่ำ เช่น อุณหภูมิต่ำและเกลือสูง