By "ความเหมือน" is meant a property

By "ความเหมือน" is meant a property of sequences that measures their similarity or relationship. ความเหมือน is measured by dividing the number of identical residues by the total number of residues and multiplying the product by 100. As two illustrative examples, the มิวทีน of the SEQ ID NO: 3 has a sequence ความเหมือน of 82.28% with the amino acid sequence of ไลโปคาลิน น้ำตามนุษย์ เต็มวัย, and the มิวทีน of the SEQ ID NO: 7 has an amino acid sequence ความเหมือน of 83.54% with ไลโปคาลิน น้ำตามนุษย์ เต็มวัย.

[0039) "Gaps" are spaces in an alignment that are the result of additions or deletions of amino acids. Thus, two copies of exactly the same sequence have 100% ความเหมือน, but sequences that are less highly conserved, and have deletions, additions, or replacements, may have a lower degree of ความเหมือน. Those skilled in the art will recognize that several computer
programs are available for determining sequence ความเหมือน using standard parameters, for example Blast (Altschul, et al. (1997) Nucleic Acids Res. 25, 3389-3402), Blast2 (Altschul, et al. (1990)J. Mo!. Biol. 215, 403-410), and Smith-Waterman (Smith, et al. (1981) J. Mol. Biol.
147, 195-197).


[0040] The term "mutated" or "มิวทีน" in reference to a nucleic acid or a โพลีเปปไทด์ of the การเปิดเผย refers to the exchange, deletion, or insertion of one or more nucleotides or amino acids, respectively, compared to the naturally occurring nucleic acid or โพลีเปปไทด์. A มิวทีน of the การเปิดเผยนี้ รวมถึง at least three substitutions in comparison to the corresponding native ไลโปคาลินนุนุ.

[0041] ในบางรุรุ, a มิวทีน of human tear ไลโปคาลิน according to the การเปิดเผย รวมถึง at least 2 ที่รวมถึง 3, 4, 5, 6, 8, 10, 12, 14, 15, 16, 17 or 18 mutated amino acid residues at any one of the sequence positions 26-34, 56-58, 80, 83, 104-106 and 108 of the linear โพลีเปปไทด์ sequence of mature human tear ไลโปคาลิน (SEQ ID NO: 1). The positions 26-34 are รวมถึงd in the AB loop, the positions 56-58 are รวมถึงd in the CD loop. The position 80 is located in a a-helical บริเวณ. Position 83 is a single loop-defining amino acid between this a-helical บริเวณ and a beta-sheet (/3F). The positions 104-106 and 108 are รวมถึงd in the GH loop in the binding ตำแหน่ง at the open end of the /3-barrel structure of tear ไลโปคาลิน. The definition of these บริเวณs is used herein in accordance with Flower (Flower,
1996, supra, Flower, et al., 2000, supra) and Breustedt et al. (2005, supra).


[0042] ในบางรุรุ, a human ไลโปคาลิน มิวทีน according to the การเปิดเผย may further รวมถึง an amino acid substitution of a native ซิสเทอีน residue at positions 61 and/or 153 by a serine residue. In this context it is noted that it has been found that removal of the structural disulfide bond (on the level of a respective native nucleic acid library) of ไลโปคาลิน น้ำตามนุษย์ เต็มวัย that is formed by the ซิสเทอีน residues 61 and 153 (cf. Breustedt, et al.,
2005, supra) provides ไลโปคาลินนุนุ มิวทีน that are not only stably folded but in addition are also able to ยึดเกาะa given non-natural ลิแกนด์ with high แอฟฟินิตี้. Without wishing to be bound by theory, it is also believed that the elimination of the structural disulfide bond provides the further advantage of allowing for the (spontaneous) generation or deliberate introduction of non-natural artifical disulfide bonds into มิวทีน of the การเปิดเผย (see Examples), thereby increasing the stability of the มิวทีน, for example. However, ไลโปคาลินนุนุ มิวทีน that ยึดเกาะ PCSK.9and that have the disulfide bond formed between Cys 61 and Cys 153 are also part of the present การเปิดเผย.
[0043] ในบางรุรุ, a ไลโปคาลินนุนุ มิวทีน of the การเปิดเผย รวมถึง the amino acid substitutions Cys 61 -7 Ala, Phe, Lys, Arg, Thr, Asn, Tyr, Met, Ser, Pro or Trp and/or Cys 153 -7 Ser or Ala.

[0044] In some embodiments, a human tear ไลโปคาลิน มิวทีน according to the การเปิดเผย รวมถึง an amino acid substitution of a native ซิสเทอีน residue at position 101 by a serine residue. Further, ในบางรุรุ, a ไลโปคาลินนุนุ มิวทีน according to the การเปิดเผย รวมถึง an amino acid substitution of a native arginine residue at positions 111 by a proline residue. ในบางรุรุ, a human tear ไลโปคาลิน มิวทีน according to the การเปิดเผย รวมถึง an amino acid substitution of a native lysine residue at positions 114 by a tryptophan residue.

[0045] ในบางรุรุ, a ไลโปคาลินนุนุ มิวทีน of the การเปิดเผย รวมถึง at least one amino acid substitution, which may be an additional amino acid substitution, selected from Arg 111 -7 Pro and Lys 114 -7 Trp. A ไลโปคาลินนุนุ มิวทีน of the การเปิดเผย may further รวมถึง the ซิสเทอีน at position 101 of the sequence of ไลโปคาลิน น้ำตามนุษย์ เต็มวัย substituted by another amino acid. This substitution may, for example, be the mutation Cys 101 -7 Ser or Cys 101 -7 Pro.

[0046] ในบางรุรุ a ไลโปคาลินนุนุ มิวทีน of the การเปิดเผย รวมถึง one or more of the following amino acid substitutions in comparison to ไลโปคาลิน น้ำตามนุษย์ เต็มวัย: Arg 26 -7 Ser, Phe, Trp, His or Thr, Glu 34 -7 Asn, Thr, Arg or Gly, Leu 56 -7 Met, Ser, Gln, Phe, His or Asn and Ser 58 -7 Lys, Ala, Arg, Trp or Pro.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

โดย "ความเหมือน" จะหมายถึง คุณสมบัติของลำดับที่วัดความคล้ายคลึงกันหรือความสัมพันธ์ของพวกเขา ความเหมือนวัด โดยการหารจำนวนตกค้างเหมือนกันโดยจำนวนตกค้าง และผลิตภัณฑ์คูณ 100 เป็นตัวอย่างแสดง มิวทีนของเลขรหัสลำดับ: ความเหมือนลำดับ 82.28% ลำดับกรดอะมิโนของไลโปคาลินน้ำตามนุษย์เต็มวัย และมิวทีนของเลขรหัสลำดับมี 3:7 มีความเหมือนลำดับกรดอะมิโนเป็น 83.54% กับไลโปคาลินน้ำตามนุษย์เต็มวัย[0039) "ช่องว่าง" ไว้ช่องว่างในการจัดที่เป็นผลของการเพิ่มหรือลบของกรดอะมิโน ดังนั้น สำเนาตรงลำดับเดียวกันมีความเหมือน 100% ได้ลำดับที่น้อยมาก อยู่ และมีลบ เพิ่ม หรือแทน อาจเป็นระดับล่างของความเหมือน ผู้เชี่ยวชาญในศิลปะจะรู้จักที่คอมพิวเตอร์หลายโปรแกรมมีกำหนดลำดับความเหมือนโดยใช้พารามิเตอร์การมาตรฐาน ตัวอย่างระเบิด (Altschul, et al. (1997) กรดนิวคลีอิกทรัพยากร 25, 3389-3402), Blast2 (Altschul, et al. (1990) Mo เจ! Biol. 215, 403 410), และสมิธ-Waterman (Smith, Biol. Mol. J. et al. (1981)147, 195-197)[0040] ระยะ "กลาย" หรือ "มิวทีน" อ้างอิงถึงกรดนิวคลีอิกหรือโพลีเปปไทด์เป็นของการเปิดเผยหมายถึงการแลกเปลี่ยน การลบ การแทรกหนึ่ง หรือเพิ่มเติมนิวคลีโอไทด์ หรือ กรดอะมิโน ตามลำดับ เมื่อเทียบกับเอ็นเอเกิดขึ้นตามธรรมชาติหรือโพลีเปปไทด์ มิวทีนของการเปิดเผยนี้รวมถึงน้อย 3 แทน โดยไลโปคาลินนุนุพื้นเมืองสอดคล้องกัน[0041] ในบางรุรุ มิวทีนของไลโปคาลินน้ำตามนุษย์ตามการเปิดเผยรวมถึงน้อย 2 ที่รวมถึง 3, 4, 5, 6, 8, 10, 12, 14, 15, 16, 17 หรือกรดอะมิโน 18 กลายตกที่หนึ่งลำดับตำแหน่ง 26-34, 56-58, 80, 83, 104-106 และ 108 ลำดับเชิงเส้นโพลีเปปไทด์มนุษย์ผู้ใหญ่ไลโปคาลิน (ลำดับ ID ไม่ฉีกขาด : 1) ตำแหน่ง 26-34 รวมถึงd ในวง AB, 56-58 ตำแหน่งเป็น รวมถึงd วนซ้ำซีดี ตำแหน่ง 80 ตั้งอยู่ในบริเวณที่เป็น-helical ตำแหน่ง 83 อยู่ตัวเดียววนกำหนดกรดอะมิโนระหว่างบริเวณนี้ a-helical และแผ่นเบต้า (/ 3F) ตำแหน่ง 104-106 และ 108 เป็น รวมถึงd ในลูป GH ในตำแหน่งผูกที่ปลายเปิดของโครงสร้าง /3-barrel ของไลโปคาลินฉีกขาด คำนิยามของ บริเวณs เหล่านี้จะใช้นี้ตามดอกไม้ (ดอกไม้1996, supra ดอกไม้ และ al., 2000, supra) และ Breustedt et al. (2005, supra)ในบางรุรุ [0042] มิวทีนไลโปคาลินมนุษย์ตามการเปิดเผยอาจเพิ่มเติมรวมถึงแทนกรดอะมิโนเป็นของตกค้างเป็นซิสเทอีนที่ตำแหน่ง 61 / 153 โดยตกค้างการแถ ในบริบทนี้ มันจะสังเกตว่า จะพบที่เอาของพันธะไดซัลไฟด์ที่โครงสร้าง (ในระดับของกรดนิวคลีอิกดั้งเดิมแต่ละไลบรารี) ของเต็มวัยน้ำตามนุษย์ไลโปคาลินที่เป็นรูปแบบ โดยตกซิสเทอีน 61 และ 153 (cf. Breustedt, et al.,2005, supra) ให้มิวทีนไลโปคาลินนุนุที่จะไม่พับเท่า stably แต่นอกจากนี้ ยังสามารถกำหนดไม่ใช่ธรรมชาติลิแกนด์ มีแอฟฟินิตี้สูง ยึดเกาะa โดยไม่ประสงค์ที่จะให้ทฤษฎี นอกจากนี้ยังเชื่อว่า ตัดออกของพันธะไดซัลไฟด์ที่โครงสร้างให้ประโยชน์เพิ่มเติมของการอนุญาตให้สร้าง (ขาด) หรือเกี่ยวกับเจตนาของพันธบัตรไม่ธรรมชาติไดซัลไฟด์ artifical มิวทีนของการเปิดเผย (ดูตัวอย่าง), ซึ่งช่วยเพิ่มเสถียรภาพของมิวทีน ตัวอย่าง อย่างไรก็ตาม ไลโปคาลินนุนุมิวทีนยึดเกาะที่ PCSK.9and ที่มีพันธะไดซัลไฟด์เกิดขึ้นระหว่าง Cys 61 Cys 153 เป็นส่วนหนึ่งของการเปิดเผยอยู่ [0043] ในบางรุรุ มิวทีนไลโปคาลินนุนุการเปิดเผยรวมถึงของการทดแทนกรดอะมิโนอลา Cys 61 -7 เพ Lys อาร์กิวเมนต์ของค่า Thr, Asn, Tyr, Met, Ser, Pro หรือ Trp หรือ Ser Cys 153 -7 หรือ Ala.[0044] ในบาง embodiments มนุษย์ฉีกมิวทีนไลโปคาลินตามการเปิดเผยรวมถึงทดแทนกรดอะมิโนที่เป็นสารตกค้างซิสเทอีนเจ้าที่ตำแหน่ง 101 โดยตกค้างยังแถ เพิ่มเติม ในบางรุรุ มิวทีนไลโปคาลินนุนุรวมถึงการเปิดเผยทดแทนกรดอะมิโนเป็นของตกค้างเป็นอาร์จินีนที่ตำแหน่ง 111 โดยมีสารตกค้าง proline ตาม ในบางรุรุ มิวทีนไลโปคาลินเป็นน้ำตามนุษย์ตามรวมถึงการเปิดเผยทดแทนของตกค้างเป็นไลซีนที่ตำแหน่ง 114 โดยตกค้างทริปโตเฟนเป็นกรดอะมิโนที่[0045] ในบางรุรุ ไลโปคาลินนุนุมิวทีนของการเปิดเผยรวมถึง ที่กรดอะมิโนทดแทน ซึ่งอาจเป็นการทดแทนกรดอะมิโนเพิ่มเติม เลือกจากอาร์กิวเมนต์ของค่า 111 -7 Pro Lys 114 -7 Trp. มิวทีนไลโปคาลินนุนุของการเปิดเผยอาจเพิ่มเติมรวมถึงซิสเทอีนที่ตำแหน่ง 101 ลำดับของไลโปคาลินน้ำตามนุษย์เต็มวัยแทน ด้วยกรดอะมิโนอื่นได้ ทดแทนนี้ เช่น อาจจะกลายพันธุ์ Ser Cys 101 -7 หรือ Cys 101 -7 Pro[0046] ในบางรุรุมิวทีนไลโปคาลินนุนุรวมถึงการเปิดเผย น้อยของการทดแทนกรดอะมิโนดังต่อไปนี้โดยไลโปคาลินน้ำตามนุษย์เต็มวัยของ: Ser อาร์กิวเมนต์ของค่า 26 -7 เพ Trp เขา หรือ Thr, Asn Glu 34 -7, Thr อาร์กิวเมนต์ของค่า หรือ Gly เม็ทลัว 56 -7, Ser, Gln เพ เขา หรือ Asn และ Ser 58 -7 Lys อลา อาร์กิวเมนต์ของค่า Trp หรือ Pro

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

โดย "ความเหมือน" มีความหมายทรัพย์สินของลำดับที่มาตรการคล้ายคลึงกันหรือสัมพันธ์ของพวกเขา ความเหมือนที่วัดโดยการหารจำนวนของสารตกค้างที่เหมือนกันด้วยจำนวนของสารตกค้างและผลิตภัณฑ์คูณด้วย 100 ในฐานะที่เป็นตัวอย่างที่สองเป็นตัวอย่างที่มิวทีนของ ID SEQ NO: 3 มีลำดับความเหมือนของ 82.28% โดยมี ลำดับกรดอะมิโนของไลโปคาลินน้ำตามนุษย์เต็มวัยและมิวทีนของ ID SEQ NO: 7. มีกรดอะมิโนลำดับความเหมือนของ 83.54% และไลโปคาลินน้ำตามนุษย์เต็มวัย[ 0039) "ช่องว่าง" เป็นช่องว่างในการจัดตำแหน่งที่มีผลมาจากการเพิ่มเติมหรือลบของกรดอะมิโน ดังนั้นสองฉบับว่าลำดับเดียวกันมี 100% ความเหมือน แต่ลำดับที่ป่าสงวนน้อยมากและมีการลบเพิ่มหรือเปลี่ยนอาจมีระดับที่ลดลงของความเหมือน ผู้ที่มีฝีมือในงานศิลปะจะรับรู้ว่าคอมพิวเตอร์หลายโปรแกรมที่มีอยู่ในการพิจารณาความเหมือนลำดับโดยใช้พารามิเตอร์มาตรฐานเช่นระเบิด (Altschul, et al. (1997) นิวคลีอิกกรด Res. 25, 3389-3402) Blast2 (Altschul, และ al. (1990) เจ. โม !. Biol. 215, 403-410) และสมิ ธ ฝีพาย (สมิ ธ , et al. (1981) เจ Mol. Biol. 147, 195-197). [0040] คำว่า "กลายพันธุ์" หรือ "มิวทีน" ในการอ้างอิงถึงกรดนิวคลีอิกหรือโพลีเปปไทด์ของการเปิดเผยหมายถึงการแลกเปลี่ยนการลบหรือแทรกหนึ่งหรือนิวคลีโอหรือกรดอะมิโนตามลำดับเมื่อเทียบกับ กรดนิวคลีอิกเกิดขึ้นตามธรรมชาติหรือโพลีเปปไทด์ มิวทีนของการเปิดเผยนี้รวมถึงอย่างน้อยสามแทนในการเปรียบเทียบกับชาวพื้นเมืองที่สอดคล้องไลโปคาลินนุนุ. [0041] ในบางรุรุเป็นมิวทีนของการฉีกขาดของมนุษย์ไลโปคาลิน ตามการเปิดเผยรวมถึงอย่างน้อย 2 ที่รวมถึง 3, 4, 5, 6, 8, 10, 12, 14, 15, 16, 17 หรือ 18 กลายพันธุ์กรดอะมิโนที่คนใดคนหนึ่งของตำแหน่งลำดับ 26-34 , 56-58, 80, 83, 104-106 และ 108 ของเชิงเส้นโพลีเปปไทด์ลำดับของการฉีกขาดของมนุษย์ที่เป็นผู้ใหญ่ไลโปคาลิน (SEQ ID NO: 1) ตำแหน่งเป็น 26-34 รวมถึง d ในวง AB, ตำแหน่งเป็น 56-58 รวมถึง d ในวงซีดี 80 ตำแหน่งตั้งอยู่ในที่บริเวณลาน- ตำแหน่งที่ 83 เป็นห่วงกำหนดเดียวกรดอะมิโนระหว่างนี้บริเวณลาน-และเบต้าแผ่น (/ 3F) ตำแหน่ง 104-106 และ 108 รวมถึง d ในวง GH ในตำแหน่งที่มีผลผูกพันที่ปลายเปิดของ / โครงสร้าง 3 ถังฉีกขาดไลโปคาลิน ความหมายของบริเวณ s เหล่านี้จะใช้ในที่นี้สอดคล้องกับดอกไม้ (Flower, 1996, ประชาชน, ดอกไม้, et al., 2000 ประชาชน) และ Breustedt et al, (2005, ซูปรา). [0042] ในบางรุรุมนุษย์ไลโปคาลินมิวทีนไปตามการเปิดเผยอาจต่อไปรวมถึงทดแทนกรดอะมิโนของชาวซิสเทอีนสารตกค้างที่ตำแหน่ง 61 และ / หรือ 153 โดยซีรีนตกค้าง ในบริบทนี้เป็นที่สังเกตว่าจะได้รับพบการกำจัดของพันธบัตรซัลไฟด์ที่มีโครงสร้างที่ (ในระดับของห้องสมุดกรดนิวคลีอิกที่เกี่ยวข้องพื้นเมือง) ของไลโปคาลินน้ำตามนุษย์เต็มวัยที่จะเกิดขึ้นโดยซิสเทอีน ตกค้าง 61 และ 153 (cf Breustedt, et al., 2005 ประชาชน) ให้ไลโปคาลินนุนุมิวทีนที่ไม่เพียง แต่พับเสถียร แต่ในนอกจากนี้ยังสามารถที่จะยึดเกาะที่ได้รับไม่เป็นธรรมชาติลิ แกนด์สูงแอฟฟินิตี้ โดยไม่ประสงค์ที่จะผูกพันตามทฤษฎีก็เป็นที่เชื่อได้ว่าการกำจัดของพันธบัตรซัลไฟด์โครงสร้างให้ประโยชน์ต่อไปของการอนุญาตให้ (ธรรมชาติ) รุ่นหรือแนะนำโดยเจตนาที่ไม่ใช่ธรรมชาติเทียมพันธบัตรซัลไฟด์ลงในมิวทีนของการ เปิดเผย (ดูตัวอย่าง) จึงช่วยเพิ่มความมั่นคงของมิวทีนสำหรับตัวอย่าง อย่างไรก็ตามไลโปคาลินนุนุมิวทีนที่ยึดเกาะ PCSK.9and ที่มีพันธะไดซัลไฟด์ที่เกิดขึ้นระหว่าง Cys 61 และ Cys 153 ยังเป็นส่วนหนึ่งของการเปิดเผยในปัจจุบัน. [0043] ในบางรุรุเป็นไลโป คาลินนุนุมิวทีนของการเปิดเผยรวมถึงแทนกรดอะมิโน 61 Cys -7 Ala, เพลิซ Arg, Thr, Asn, เทอร์, Met, Ser, Pro หรือ Trp และ / หรือ Cys 153 - 7 Ser หรือ Ala. [0044] ในบาง embodiments, การฉีกขาดของมนุษย์ไลโปคาลินมิวทีนไปตามการเปิดเผยรวมถึงทดแทนกรดอะมิโนของชาวซิสเทอีนสารตกค้างที่ตำแหน่ง 101 โดยซีรีน สารตกค้าง นอกจากนี้ในบางรุรุเป็นไลโปคาลินนุนุมิวทีนไปตามการเปิดเผยรวมถึงทดแทนของกรดอะมิโนอาร์จินีกากพื้นเมืองที่ตำแหน่ง 111 โดยโพรลีนตกค้าง ในบางรุรุ, การฉีกขาดของมนุษย์ไลโปคาลินมิวทีนไปตามการเปิดเผยรวมถึงทดแทนกรดอะมิโนของสารตกค้างไลซีนพื้นเมืองที่ตำแหน่ง 114 โดยกากโพรไบโอ. [0045] ในบางรุรุ, ไลโป คาลินนุนุมิวทีนของการเปิดเผยรวมถึงอย่างน้อยหนึ่งทดแทนกรดอะมิโนซึ่งอาจจะเป็นกรดอะมิโนทดแทนเพิ่มเติมเลือกจาก Arg 111 -7 Pro และลิซ 114 -7 Trp ไลโปคาลินนุนุมิวทีนของการเปิดเผยต่อไปอาจรวมถึงซิสเทอีนที่ 101 ตำแหน่งของลำดับของไลโปคาลินน้ำตามนุษย์เต็มวัยแทนจากกรดอะมิโนอีก ทดแทนนี้อาจยกตัวอย่างเช่นจะมีการกลายพันธุ์ Cys 101 -7 Ser หรือ Cys 101 -7 Pro. [0046] ในบางรุรุไลโปคาลินนุนุมิวทีนของการเปิดเผยรวมถึงหนึ่งหรือมากกว่า ต่อไปนี้แทนกรดอะมิโนในการเปรียบเทียบกับไลโปคาลินน้ำตามนุษย์เต็มวัย: Arg 26 -7 Ser, เพ Trp ของเขาหรือที่นั่น, Glu 34 -7 Asn, Thr, Arg หรือ Gly, Leu 56 -7 Met, Ser, Gln, เพเขาหรือ Asn และ Ser 58 -7 ลิซ, Ala, Arg, Trp หรือ Pro

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

" ความเหมือน " หมายถึงคุณสมบัติของลำดับว่ามาตรการที่คล้ายคลึง หรือความสัมพันธ์ของพวกเขา ความเหมือนเป็นวัด โดยแบ่งจำนวนของสารตกค้างที่เหมือนกัน โดยจำนวนของสารตกค้างผลิตภัณฑ์คูณด้วย 100 เป็นสองตัวอย่างของตัวอย่าง , มิวทีน seq id : 3 มีลำดับความเหมือนของ 8228 % กับลำดับกรดอะมิโนของไลโปคาลินน้ำตามนุษย์เต็มวัยและมิวทีนของ seq id : 7 มีลำดับกรดอะมิโนของความเหมือน 83.54 ด้วยไลโปคาลินน้ำตามนุษย์เต็มวัย

[ ขอบคุณ ) " ช่องว่าง " จะเป็นในแนวว่า เป็นผลจากการเพิ่มหรือลบของกรดอะมิโน ดังนั้นสองสำเนาของตรงลำดับเดียวกันได้ 100% ความเหมือน แต่ลำดับที่น้อยกว่าที่มีการอนุรักษ์ และลบ เพิ่ม หรือ เปลี่ยน อาจมีสาขากว่าความเหมือน . ผู้ชำนาญในศิลปะจะรับรู้ว่าโปรแกรมคอมพิวเตอร์
หลายที่มีอยู่เพื่อกำหนดความเหมือนลำดับการใช้พารามิเตอร์มาตรฐานตัวอย่างเช่นระเบิด ( แอลเชิล et al . ( 1997 ) กรดนิวคลีอิก 25 ศาสตร์ 3389-3402 ) , blast2 ( แอลเชิล et al . ( 1990 ) เจโม . วท บ วท . 215 , 403-410 ) และ Smith Waterman ( Smith , et al . ( 1981 ) เจ. โมล วท บ วท .
147 195-197 )


[ 0040 ] คำว่า " กลายพันธุ์ " หรือ " มิวทีน " ในการอ้างอิงถึงกรดนิวคลีอิกหรือโพลีเปปไทด์ของการเปิดเผยหมายถึงการแลกเปลี่ยน , การลบ ,หรือแทรกหนึ่งหรือมากกว่าหนึ่งนิวคลีโอไทด์หรือกรดอะมิโน ตามลำดับ เมื่อเทียบกับธรรมชาติที่เกิดขึ้นของกรดนิวคลีอิกหรือโพลีเปปไทด์ . เป็นมิวทีนของรวมถึงการเปิดเผยนี้อย่างน้อยสามแทนเปรียบเทียบกับไลโปคาลินนุนุพื้นเมืองเหมือนกัน

[ ] ในบางรุรุ 0041 ,เป็นมิวทีนไลโปคาลินน้ำตาของมนุษย์ตามการรวมถึงการเปิดเผยอย่างน้อย 2 ที่รวมถึง 3 , 4 , 5 , 6 , 8 , 10 , 12 , 14 , 15 , 16 , 17 หรือ 18 กลายพันธุ์กรดอะมิโนกรดตกค้างในหนึ่งของลำดับตำแหน่ง 26-34 56-58 , 80 , 83 104-106 และ 108 ของโพลีเปปไทด์เชิงเส้น ลำดับของผู้ใหญ่ไลโปคาลินฉีกมนุษย์ ( seq id : 1 )ตำแหน่ง 26-34 เป็นรวมถึง D ในวง AB , ตำแหน่ง 56-58 เป็นรวมถึง D ในซีดีวง ตำแหน่ง 80 ตั้งอยู่ในบริเวณ a-helical . ตำแหน่ง 83 เป็นวงเดียวที่กำหนดกรดอะมิโนระหว่างนี้ a-helical บริเวณและเบต้าแผ่น ( ขา )ตำแหน่ง 104-106 และ 108 เป็นรวมถึง D ใน GH ห่วงในตำแหน่งผูกที่ปลายเปิดของ / 3-barrel โครงสร้างของน้ำตาไลโปคาลิน . นิยามของเหล่านี้บริเวณ s ใช้ ในที่นี้ให้สอดคล้องกับดอกไม้ ( ดอกไม้
1996 , Supra , ดอกไม้ , et al . , 2000 , Supra ) และ breustedt et al . ( 2005 , Supra )


[ ] ในบางรุรุ 0042 ,มนุษย์ไลโปคาลินมิวทีนตามการการเปิดเผยอาจเพิ่มเติมรวมถึงการทดแทนกรดอะมิโนของกากซิสเทอีนพื้นเมือง ที่ตำแหน่งและ / หรือ 153 โดยเซรีนกากในบริบทนี้มันเป็นข้อสังเกตว่า มีการพบว่า การกำจัดของพันธะไดซัลไฟด์โครงสร้าง ( ในระดับของแต่ละพื้นเมืองกรดนิวคลีอิกห้องสมุด ) ไลโปคาลินน้ำตามนุษย์เต็มวัยที่ถูกสร้างขึ้นโดยซิสเทอีนตกค้างและ 153 ( CF . breustedt , et al . ,
2005Supra ) ให้มิวทีนไลโปคาลินนุนุที่ไม่เพียง แต่เสถียรพับแต่นอกจากนี้ยังสามารถยึดเกาะให้ไม่ลิแกนด์ธรรมชาติกับแอฟฟินิตี้สูง โดยไม่คิดจะผูกพันตามทฤษฎีนอกจากนี้ยังเชื่อว่า การของพันธะไดซัลไฟด์โครงสร้างให้ประโยชน์เพิ่มเติมของการอนุญาตให้ ( ธรรมชาติ ) รุ่นหรือเจตนาเบื้องต้นไม่ธรรมชาติเทียมพันธบัตรซัลไฟด์ในมิวทีนของการเปิดเผย ( ดูตัวอย่าง ) จึงช่วยเพิ่มเสถียรภาพของมิวทีนตัวอย่างเช่น อย่างไรก็ตามไลโปคาลินนุนุมิวทีนที่ยึดเกาะ pcsk.9and ที่มีพันธะไดซัลไฟด์ที่เกิดขึ้นระหว่างภาวะ 61 และภาวะที่ยังเป็นส่วนหนึ่งของการเปิดเผยปัจจุบัน 0043
[ ] ในบางรุรุ , ไลโปคาลินนุนุมิวทีนของการเปิดเผยรวมถึงการเปลี่ยนกรดอะมิโน CYS 61 - 7 อ้าว เพ ลีส์ , ไม่ดี , thr , asn , tyr , เจอ เซอร์Pro หรือ TRP และ / หรือภาวะ 153 - 7 เซอร์ หรือ เอ๋

[ 0044 ] ใน embodiments มนุษย์ฉีกไลโปคาลินมิวทีนตามการการเปิดเผยรวมถึงการทดแทนของกรดอะมิโนที่ตำแหน่งของซิสเทอีน 101 โดยเป็นตัวกากกาก ในบางรุรุต่อไป , ,เป็นไลโปคาลินนุนุมิวทีนตามการการเปิดเผยรวมถึงการทดแทนของกรดอะมิโนอาร์จินีนตกค้างพื้นเมืองที่ตำแหน่ง 111 โดยโปรกาก ในบางรุรุ ,มนุษย์ฉีกไลโปคาลินมิวทีนตามการการเปิดเผยรวมถึงการทดแทนกากไลซีนกรดอะมิโนของพื้นเมือง ที่ตำแหน่ง 114 โดยทริปโตเฟน กาก 0045

[ ] ในบางรุรุ , ไลโปคาลินนุนุมิวทีนของรวมถึงการเปิดเผยอย่างน้อยหนึ่งกรดอะมิโนทดแทน ซึ่งอาจจะมีการแทนที่กรดอะมิโนเพิ่มเติมเลือกจากตัน 111 - 7 Pro และ . 114 - 7 TRP เป็นไลโปคาลินนุนุมิวทีนของการเปิดเผยอาจเพิ่มเติมรวมถึงที่ซิสเทอีนที่ตำแหน่ง 101 ของลำดับของไลโปคาลินน้ำตามนุษย์เต็มวัยทดแทนอื่นกรดอะมิโน ทดแทนอาจจะ ตัวอย่าง มีการกลายพันธุ์ CYS 101 - 7 เซอร์ หรือภาวะ 101 - 7

Pro[ 0046 ] ในบางรุรุเป็นไลโปคาลินนุนุมิวทีนของการเปิดเผยรวมถึงหนึ่งหรือมากกว่าของกรดอะมิโนแทนในการเปรียบเทียบกับไลโปคาลินน้ำตามนุษย์เต็มวัยต่อไปนี้ : ARG 26 - 7 ท่าน เพ , TRP , thr ของเขาหรือ GLU 34 - 7 asn , สา , ไม่ดีหรือ GLY ลิว , 56 - 7 พบ เซอร์ gln เพหรือขึ้น , และ 58 - เซอร์ 7 . อ้าว arg , TRP ,
หรือ Pro