IntroductionDefinitive identificati

Introduction

Definitive identification of microorganisms, including pathogenic and non-pathogenic bacteria, plays an important role in research and developmental activities. It is required in a wide variety of applications including food safety, environmental studies, bio-terrorism threats, microbial forensics and criminal investigations. In view of such wide applications, identification of different bacterial isolates from various sources is a challenging task. Certain bacteria may be slow growing, while certain other species may turn out to be non-culturable. Obligate parasites may not be identified by conventional methods easily. Therefore, continuous efforts are made by microbiologists and molecular biologists to devise smarter, reliable and faster bacterial detection techniques. Although Fourier Transform Infrared (FTIR) spectroscopy was used as an analytical tool to understand structural features on biomolecules in the 80s [1], it was only in the beginning of 1990s that an attempt was made to identify whole bacterial cells using FTIR [5] and [6]. Subsequently many researchers used this technique for identification and classification of bacteria [3] and [4]. However, rapid progress in many molecular techniques, primarily different PCR based techniques, e.g. multiplex PCR, nested PCR, RTPCR etc made them popular in microbial diagnostics [10], [20] and [8]. Progress in DNA microarray technology also provided yet another powerful tool to the researchers for microbial detection [19] and [21]. However, both PCR-based and microarray-based techniques require advanced laboratory facilities and very well trained hands for elaborate sample preparation. Extreme sensitivity of both the techniques can give rise to accidental false positives. In this study we present the simplicity, sensitivity and usefulness of solid state spectroscopic approach with a wide range of electromagnetic radiation covering UV, visible light, Near Infrared (NIR) and Infrared regions (200 nm–25,000 nm) for detection of a large number of Bacillus sp. These organisms were isolated from the pre-digester chamber of Nisargruna Biogas Plant (NBP) at Anushaktinagar, Mumbai. Nisargruna is a novel biphasic bio-methanation process for treatment of biodegradable waste where a thermophilic aerobic phase is followed by an anaerobic methanogenic phase. It is a zero garbage zero effluent system with economic viability through conversion of waste materials into useful by products viz. biogas and organic manure that can be channelized for versatile use [7]. Therefore identification of the aerobic pre-digester microflora is of immense significance for better understanding of the aerobic predigestion process and overall improvement thereof.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

แนะนำรหัสทั่วไปของจุลินทรีย์ การรวม pathogenic และแบคทีเรียไม่ใช่ pathogenic มีบทบาทสำคัญในการวิจัยและพัฒนากิจกรรม ความต้องการหลากหลายรวมทั้งความปลอดภัยของอาหาร สิ่งแวดล้อมศึกษา ภัยคุกคามการก่อการร้ายทางชีวภาพ จุลินทรีย์นิติ และสอบสวนทางอาญา มุมมองการใช้งานดังกล่าวกว้าง รหัสต่าง ๆ แบคทีเรียที่แยกได้จากแหล่งต่าง ๆ เป็นงานที่ท้าทาย แบคทีเรียบางอย่างได้ช้าเจริญเติบโต ในขณะที่บางชนิดอาจถูกแค่ไหนไม่ใช่ culturable ปรสิต obligate อาจไม่สามารถระบุ โดยวิธีธรรมดาได้อย่างง่ายดาย ความพยายามอย่างต่อเนื่องดังนั้น จะทำ โดย microbiologists และโมเลกุล biologists ประดิษฐ์ฉลาด เชื่อถือได้ และเทคนิคการตรวจจับที่แบคทีเรียได้รวดเร็วขึ้น แม้กฟูรีเยแปลงอินฟราเรด (FTIR) ถูกใช้เป็นเครื่องมือการวิเคราะห์เพื่อให้เข้าใจลักษณะโครงสร้างในชื่อโมเลกุลชีวภาพใน 80s [1], ได้เท่านั้นในการเริ่มต้นของปี 1990 ที่มีความพยายามที่จะระบุเซลล์แบคทีเรียทั้งหมดที่ใช้ FTIR [5] [6] ต่อมานักวิจัยจำนวนมากใช้เทคนิคนี้ในการระบุและจำแนกประเภทของแบคทีเรีย [3] และ [4] อย่างไรก็ตาม ความคืบหน้าอย่างรวดเร็วในหลายโมเลกุลเทคนิค หลัก PCR โดยใช้เทคนิคต่าง ๆ เช่น multiplex PCR ซ้อน PCR, RTPCR ฯลฯ ทำให้พวกเขานิยมในวินิจฉัยจุลินทรีย์ [10], [20] และ [8] ความก้าวหน้าในเทคโนโลยี DNA microarray ให้มือที่มีประสิทธิภาพอีกนักวิจัยสำหรับการตรวจหาจุลินทรีย์ [19] และ [21] อย่างไรก็ตาม เทคนิค ใช้ PCR และ ใช้ microarray ต้องปฏิบัติขั้นสูงสิ่งอำนวยความสะดวกและมือมากเลยสำหรับการเตรียมตัวอย่างประณีต ไวมากทั้งเทคนิคสามารถให้สูงขึ้นเพื่อทำงานผิดพลาดผิดพลาดโดยไม่ตั้งใจ ในการศึกษานี้ เรานำเสนอความเรียบง่าย ความไว และความมีประโยชน์ของวิธีการด้านของแข็งกับรังสีแม่เหล็กไฟฟ้า UV แสงที่มองเห็น ใกล้อินฟราเรด (NIR) และภูมิภาค (200 nm – 25000 nm) อินฟราเรดตรวจคัด sp เป็นจำนวนมาก สิ่งมีชีวิตเหล่านี้ถูกแยกจากหอ digester ก่อนของ Nisargruna ก๊าซชีวภาพโรงงาน (NBP) ที่ Anushaktinagar มุมไบ Nisargruna เป็นกระบวนการทางชีวภาพ methanation biphasic นวนิยายที่ขยะย่อยสลายยากซึ่งตามขั้นตอนแอโรบิกแบบ thermophilic ด้วยระยะ methanogenic ไม่ใช้การ เป็นขยะที่ศูนย์ศูนย์ระบบน้ำทิ้งกับชีวิตทางเศรษฐกิจผ่านการแปลงวัสดุของเสียเป็นประโยชน์โดยก๊าซชีวภาพได้แก่ผลิตภัณฑ์อินทรีย์มูลที่สามารถ channelized ใช้งานได้หลากหลาย [7] ดังนั้น รหัสของ microflora digester ก่อนเต้นแอโรบิกเป็นของสำคัญอันยิ่งใหญ่เพื่อความเข้าใจที่ดีขึ้นของการเต้นแอโรบิก predigestion และปรับปรุงโดยรวมดังกล่าว

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

บทนำ

สรุปการจำแนกชนิดของจุลินทรีย์ รวมทั้งเชื้อโรคและไม่มีเชื้อโรค แบคทีเรีย มีบทบาทสำคัญในการวิจัยและกิจกรรมพัฒนาการ มันเป็นสิ่งจำเป็นในหลากหลายของการใช้งานรวมถึงความปลอดภัย อาหาร การศึกษา สิ่งแวดล้อม เทคโนโลยีชีวภาพ ภัยจากการก่อการร้าย นิติเวชจุลินทรีย์และอาชญากรรม ในมุมมองของ กว้าง โปรแกรมการจำแนกชนิดของเชื้อที่แยกได้จากแหล่งต่าง ๆแตกต่างกันเป็นงานท้าทาย แบคทีเรียบางอาจจะเติบโตช้า ในขณะที่สปีชีส์อื่น ๆบางอย่างอาจเปิดออกเพื่อจะไม่ culturable . หรือปรสิตที่อาจจะระบุวิธีการที่ง่าย ดังนั้น ความพยายามอย่างต่อเนื่องทำให้ microbiologists และอณู biologists ประดิษฐ์ขึ้นเชื่อถือได้และรวดเร็วแบคทีเรียเทคนิคการตรวจจับ แม้ว่าการแปลงฟูรีเยอินฟราเรดสเปกโทรสโกปี ( FTIR ) ถูกใช้เป็นเครื่องมือวิเคราะห์เพื่อเข้าใจลักษณะโครงสร้างโมเลกุลชีวภาพใน 80s [ 1 ] , มันเป็นเพียงจุดเริ่มต้นของยุคนั้นมีความพยายามที่จะระบุเซลล์แบคทีเรียทั้งหมดใช้ FTIR [ 5 ] และ [ 6 ]ต่อมานักวิจัยหลายที่ใช้เทคนิคนี้สำหรับการจำแนกแบคทีเรีย [ 3 ] และ [ 4 ] อย่างไรก็ตาม ความก้าวหน้าอย่างรวดเร็วในเทคนิคโมเลกุลหลายวิธีที่แตกต่างกัน ตามหลักเทคนิค multiplex PCR ที่ซ้อนกันเช่น , PCR , rtpcr ฯลฯ ทำให้พวกเขาเป็นที่นิยมในการวินิจฉัยจุลินทรีย์ [ 10 ] , [ 20 ] และ [ 8 ]ความก้าวหน้าในเทคโนโลยี DNA microarray ยังมีบริการอีกเครื่องมือที่มีประสิทธิภาพเพื่อให้นักวิจัยจุลินทรีย์ตรวจจับ [ 19 ] และ [ 21 ] อย่างไรก็ตาม ทั้งเทคนิคพื้นฐานและเทคนิคขั้นสูง โดยใช้ microarray ห้องปฏิบัติการและสิ่งอำนวยความสะดวกอย่างดีฝึกมือสำหรับการเตรียมสารตัวอย่างที่ซับซ้อน ความสุดโต่งของทั้งสองเทคนิคที่สามารถก่อให้เกิดผลบวกปลอมโดยไม่ตั้งใจในการศึกษานี้เรานำเสนอความเรียบง่าย ความไวและประโยชน์ของของแข็ง spectroscopic วิธีการที่มีช่วงกว้างของคลื่นแม่เหล็กไฟฟ้าครอบคลุม UV , แสงอินฟราเรด อินฟราเรดใกล้ ( NIR ) และภูมิภาค ( 200 nm – 25 , 000 nm ) สำหรับการตรวจสอบของตัวเลขขนาดใหญ่ของ Bacillus sp .สิ่งมีชีวิตเหล่านี้ถูกแยกออกไปจากห้องก่อน โดย nisargruna ระบบผลิตก๊าซชีวภาพ ( NBP ) ที่ anushaktinagar มุมไบ . nisargruna เป็นนวนิยายให้ตายซิ ไบโอ methanation กระบวนการรักษาของเสียย่อยสลาย และแอโรบิกที่เฟสตามระยะจุลินทรีย์แบบไม่ใช้ออกซิเจนมันเป็นขยะเป็นศูนย์ศูนย์บำบัดด้วยระบบชีวิตทางเศรษฐกิจผ่านการแปลงของวัสดุเหลือใช้ให้เป็นประโยชน์ โดยได้แก่ ผลิตภัณฑ์ ก๊าซชีวภาพและปุ๋ยคอกที่สามารถใช้สำหรับหลากหลาย channelized [ 7 ] ดังนั้นการระบุของจุลินทรีย์ โดยก่อนแอโรบิกเป็นสำคัญ อันยิ่งใหญ่ เพื่อความเข้าใจที่ดีขึ้นของแอโรบิกและการปรับปรุงกระบวนการโดยเตส
"