As seen in Figure 1 we can conclude that the pgg1 and
pgg2 genes exist as single copies in the P. griseoroseum genome
since there are no internal restriction sites for the enzymes
EcoRI, SacI, and XbaI. Single copies have been
demonstrated for other PG genes including the clpg1 and
clpg2 genes of Colletotrichum lindemuthianum, pg1 and
pg2 of P. olsonii, and bcpg1 of Botrytis cinerea (Centis et
al. 1996; Centis et al. 1997; ten Have et al. 1998; Wagner et
al. 2000). It also seems that pgg1 and pgg2 are present in
the same copy number and that the differential levels of expression
reported for these genes by Ribon et al. (2002) are
probably due to gene position in the genome. The possibility
that they are controlled by different cis-acting factors is
now under investigation.
Occurrence of corresponding PG genes in other
Penicillium species
The presence of DNA sequences homologous to
endoPG genes was investigated throughout the Penicillium
species under low stringency hybridization (Figure 2). All
species tested have at least one endoPG gene. However,
most of them showed two strongly hybridizing bands, although
with some length polymorphism, that may correspond
to homologous genes. As opposed to Penicillium,
gene families consisting of at least five PG members have
been detected in Aspergillus niger, B. cinerea, and
490 Ribon et al.
Figure 1 - Southern blot analysis of total DNA from Penicillium
griseoroseum. Total DNA was digested with BamHI (1), ClaI (2), EcoRI
(3), EcoRV (4), HindIII (5), SacI (6), SalI (7), and XbaI (8), analyzed on
0.8% agarose gel, and transferred to nylon membrane. A 420-bp DNA
fragment corresponding to a conserved domain observed in the endoPG
genes from P. griseoroseum was radiolabelled and employed as a probe.
Hybridization was carried out at 60 °C. DNA from phage λ cleaved with
HindIII (kb).
Sclerotinia sclerotiorum (Fraissinet-Tachet et al. 1995;
Parenicová et al. 1998, Wubben et al. 1999). Wagner et al.
(2000) characterized two PG genes in P. olsonii that
showed significant homology to endoPG of other filamentous
fungi and suggested the presence of at least one more
gene in the fungus genome.
The same hybridization pattern seen in P. griseoroseum,
P. expansum, P. italicum, and P. purpurogenum
suggests that their PG genes have a similar global organization
in the genome segment in which they are found. The
same pattern observed for P. charlesii and P. citrinum could
also suggest that these fungi are closely related although
more studies are needed. Molecular characterization of ten
Penicillium species by random amplified polymorphic DNA
(RAPD) and restriction fragment length polymorphism
(RFLP) of the internal transcribed spacer region of rDNA
done in our laboratory revealed no difference between P.
griseoroseum, P. expansum, and P. purpurogenum indicating
once more a close phylogenetic relationship, and morphological
and physiological characteristics confirm that
they are different species (Pereira et al. 2002).
Comparison of the structural units of PG genes from
Penicillium species
Although Penicillium can also be considered an important
fungal model, no compilation of gene organization
data from these organisms has been performed until now
that could reveal important sequences for gene expression
as already reported for Neurospora and Aspergillus. Here
we present a comparison of the seven PG genes from P.
griseoroseum, P. expansum, P. digitatum, P. janthinellum,
and P. olsonii retrieved from the GenBank and EMBL databases.
Their nucleotide and amino acid sequences were
compared for general features such as number, length,
splice sites, and position of introns, consensus sequences
flanking the translation initiation codon, and codon usage.
All polypeptides started invariantly with AUG. It was
not possible to define a consensus sequence surrounding
the initiation codon due to the small number of PG genes
available from Penicillium. However, there is a preference
for purines (Pu) before ATG (Pu57Pu100Pu71ATG), with an
A always located at -3. Ballance (1986) described the sequence
TCACAATGGC as the consensus for the AUG environment
while CAMMATGGCT (M = C, A) was defined
on comparison of 88 genes from Neurospora (Edelmann
and Staben 1994). The three stop codons were used at least
once.
PG-encoding genes from the Penicillium species
compared in this study have intervening sequences conserved
in the same positions, although there was no conservation
of their nucleotide sequences. The highest identity
(42.1%) was found between the second introns of P.
griseoroseum and P. digitatum. The average length of the
introns was 61 bp and the largest one (88 bp) was observed
in the PG gene from P. janthinellum. The pepg1 gene from
P. expansum and the pg2 from P. olsonii showed an additional
intron conserved at the same position, while the only
intron detected in the pg1 gene of P. olsonii was placed
with the second intron of the other genes. Conservation of
the intron position, but not sequence, is usually seen be-
Organization of PG genes 49
เท่าที่เห็นในรูปที่ 1 เราสามารถสรุปได้ว่า pgg1 และ
ยีน pgg2 อยู่เล่มเดียวในพี griseoroseum จีโนม
เนื่องจากไม่มีข้อ จำกัด เว็บไซต์ภายในสำหรับเอนไซม์
EcoRI, saci และ xbai เล่มเดียวที่ได้รับการแสดงให้เห็นถึง
ยีน PG อื่น ๆ รวมทั้ง clpg1 และ
ยีน clpg2 ของ lindemuthianum Colletotrichum, PG1 และ
PG2 ของพี olsonii และ bcpg1 Botrytis cinerea ของ (Centis เอ
อัล 1996; Centis ตอัล 1997; สิบมีตอัล 1998; วากเนอร์และรหัส
อัล 2000) ก็ยังดูเหมือนว่า pgg1 และ pgg2 มีอยู่ใน
จำนวนสำเนาเดียวกันและที่ระดับความแตกต่างของการแสดงออก
รายงานยีนเหล่านี้โดย Ribon ตอัล (2002) เป็น
อาจเป็นเพราะตำแหน่งของยีนในจีโนม ความเป็นไปได้ว่าพวกเขา
จะถูกควบคุมโดยปัจจัยที่ถูกต้องทำหน้าที่แตกต่างกันคือ
ตอนนี้อยู่ภายใต้การตรวจสอบ.
การเกิดขึ้นของยีนที่เกี่ยวข้อง PG ในสายพันธุ์อื่น ๆ
Penicillium การแสดงตนของ dna ลำดับคล้ายคลึงกันกับยีน
endopg ถูกตรวจสอบตลอด Penicillium
สายพันธุ์ภายใต้การผสมข้ามพันธุ์เข้มงวดต่ำ (รูปที่ 2)
ทุกชนิดมีการทดสอบยีน endopg อย่างน้อยหนึ่ง แต่
ส่วนใหญ่ของพวกเขาแสดงให้เห็นว่าสองวงขอ hybridizing แม้ว่า
กับบางความแตกต่างความยาวที่อาจสอดคล้อง
ยีนคล้ายคลึงกัน ตรงข้ามกับการ Penicillium,
ครอบครัวยีนประกอบด้วยอย่างน้อยห้าสมาชิก PG
ได้รับการตรวจพบในไนเจอร์, Aspergillus ข ซีเนเรียและ
490 Ribon et al,
รูปที่ 1 -. การวิเคราะห์ดวงทางตอนใต้ของ dna รวมจาก Penicillium
griseoroseum dna รวมถูกย่อยด้วย (1) BamHI, clai (2), EcoRI
(3), ecorv (4), HindIII (5) saci (6), sali (7) และ xbai (8), การวิเคราะห์บน
08% เจล agarose และโอนไปยังเมมเบรนไนลอน 420-bp dna
ส่วนที่เกี่ยวข้องกับโดเมนป่าสงวนตั้งข้อสังเกตใน endopg
ยีนจากพี griseoroseum ถูกรังสีและจ้างมาเป็นสอบสวน.
พันธุ์ได้ดำเนินการที่ 60 องศาเซลเซียส . dna จาก phage λตัดด้วย
HindIII (กิโลไบต์)
Sclerotinia sclerotiorum (Fraissinet tachet-et al, 1995;...
parenicová et al, 1998 Wubben et al, 1999)วากเนอร์และอัล.
(2000) ลักษณะสองยีน PG ในพี
olsonii ที่แสดงให้เห็นว่าคล้ายคลึงกันอย่างมีนัยสำคัญที่จะ endopg ของเชื้อราใย
อื่น ๆ และข้อเสนอแนะที่มีอย่างน้อยอีกหนึ่ง
ยีนในจีโนมของเชื้อรา.
รูปแบบการผสมข้ามพันธุ์เดียวกันที่เห็นในพี griseoroseum
พี expansum พี Italicum และพี purpurogenum
แสดงให้เห็นว่ายีนของพวกเขา PG มีองค์กรระดับโลกที่คล้ายกัน
ในส่วนของจีโนมที่พวกเขาจะพบ
รูปแบบเดียวกันตั้งข้อสังเกตสำหรับ p charlesii และพี citrinum อาจ
นอกจากนี้ยังชี้ให้เห็นว่าเชื้อราเหล่านี้จะเกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดถึงแม้ว่าการศึกษา
มีความจำเป็นมากขึ้น ลักษณะโมเลกุลของสิบ
Penicillium ชนิดโดยสุ่ม dna ขยาย polymorphic
(rapd) และข้อ จำกัด ส่วนระยะเวลาใน polymorphism
(RFLP) ของภูมิภาค spacer ภายในคัดลอกของ rDNA
ทำในห้องปฏิบัติการของเราเผยให้เห็นความแตกต่างระหว่างพีไม่มี.
griseoroseum พี expansum และพี purpurogenum แสดง
อีกครั้งความสัมพันธ์ที่ใกล้ชิดสายวิวัฒนาการและลักษณะทางสัณฐานวิทยาและสรีรวิทยา
ยืนยันว่าพวกเขาจะ
สายพันธุ์ที่แตกต่างกัน (ราเอตอัล. 2002).
เปรียบเทียบของหน่วยโครงสร้างของยีนจาก PG
Penicillium ชนิดแม้ว่า Penicillium ยังสามารถได้รับการพิจารณารูปแบบที่สำคัญ
เชื้อราสะสมขององค์กรไม่มียีน
ข้อมูลจากสิ่งมีชีวิตเหล่านี้ได้รับการดำเนินการจนถึงขณะนี้
ที่สามารถเปิดเผยลำดับความสำคัญสำหรับการแสดงออกของยีน
ตามที่รายงานไปแล้วสำหรับ Neurospora และ Aspergillus
ที่นี่เรานำเสนอการเปรียบเทียบในเจ็ดยีน PG จากพี.
griseoroseum พี expansum พี digitatum พี janthinellum
p และolsonii เรียกข้อมูลจาก genbank และฐานข้อมูล EMBL.
เบื่อหน่ายและกรดอะมิโนลำดับของพวกเขาถูกเมื่อเทียบ
สำหรับคุณสมบัติทั่วไปเช่นจำนวนยาว
เว็บไซต์ประกบและตำแหน่งของ introns เอกฉันท์ลำดับ
ขนาบ codon เริ่มต้นการแปลและการใช้งาน codon
ปไทด์ทั้งหมดที่ตั้ง invariantly ด้วยสิงหาคม
มันเป็นไปไม่ได้ที่จะกำหนดลำดับฉันทามติรอบ
เริ่มต้น codon เนื่องจากมีจำนวนเล็ก ๆ ของพิโคยีน
จาก Penicillium แต่มีการตั้งค่าเพื่อ
พิวรีน (ปู) ก่อนที่จะ atg (pu57pu100pu71atg) กับ
อยู่เสมอที่ -3 ที่ ballance (1986) อธิบายลำดับ
tcacaatggc เป็นเอกฉันท์สำหรับสภาพแวดล้อมสิงหาคม
ขณะ cammatggct (m = C,) ถูกกำหนด
การเปรียบเทียบ 88 ยีนจาก Neurospora (Edelmann
และ Staben 1994)สาม codons หยุดถูกนำมาใช้อย่างน้อยหนึ่งครั้ง
.
PG-เข้ารหัสยีนจากสายพันธุ์ Penicillium
เปรียบเทียบในการศึกษาครั้งนี้มีการแทรกแซงลำดับอนุรักษ์
ในตำแหน่งเดียวกันแม้จะมีการอนุรักษ์ไม่มี
ของลำดับเบสของพวกเขา เอกลักษณ์สูงสุด
(42.1%) พบระหว่าง introns ที่สองของพี.
griseoroseum และพี digitatum ความยาวเฉลี่ยของ
introns 61 bp และหนึ่งที่ใหญ่ที่สุด (88 bp) พบในยีน
PG จากพี janthinellum ยีน pepg1 จาก
พี expansum และ PG2 จากพี olsonii พบ intron เพิ่มเติม
อนุรักษ์ในตำแหน่งเดียวกันในขณะที่เพียง
intron ตรวจพบในยีนของ PG1 พี olsonii ถูกวาง
กับ intron ที่สองของยีนอื่น ๆ การอนุรักษ์
ตำแหน่ง intron แต่ไม่ลำดับมักจะเห็นแด่-
องค์กรของยีน PG 49
การแปล กรุณารอสักครู่..
เท่าที่เห็นในรูปที่ 1 เราสามารถสรุปที่ pgg1 การ และ
pgg2 ยีนอยู่เป็นสำเนาเดียวในจีโนม P. griseoroseum
เนื่องจากมีเว็บไซต์ไม่จำกัดภายในสำหรับเอนไซม์
EcoRI, SacI และ XbaI สำเนาเดียวได้
สาธิตสำหรับยีน PG อื่น ๆ รวมถึงการ clpg1 และ
clpg2 ยีนของ Colletotrichum lindemuthianum, pg1 และ
pg2 ของ P. olsonii และ bcpg1 ของ Botrytis cinerea (Centis et
al. 1996 Centis et al. 1997 มีสิบเอ็ด al. 1998 วากเนอร์ร้อยเอ็ด
al. 2000) มันยังดูเหมือนว่า pgg1 และ pgg2 อยู่ใน
เหมือนคัดลอกหมายเลขและที่ระดับแตกต่างของนิพจน์
รายงานโดย Ribon et al. (2002) ยีนเหล่านี้จะ
ท่องตำแหน่งยีนในกลุ่ม โอกาส
ว่า พวกเขาถูกควบคุม โดยปัจจัยทำหน้าที่ cis เป็น
ใต้สอบสวน
ของยีน PG ที่สอดคล้องกันในอีก
พันธุ์ Penicillium
ของดีเอ็นเอลำดับ homologous กับ
endoPG ยีนถูกสอบสวนตลอด Penicillium
พันธุ์ภายใต้ stringency ต่ำ hybridization (รูปที่ 2) ทั้งหมด
พันธุ์ทดสอบมียีน endoPG น้อย อย่างไรก็ตาม,
ส่วนใหญ่จะพบสองขอ hybridizing วง แม้ว่า
กับโพลิมอร์ฟิซึมยาวบาง ที่อาจตรง
การยีน homologous จำกัด Penicillium,
มียีนครอบครัวประกอบด้วยสมาชิก PG น้อยห้า
ถูกตรวจพบในไนเจอร์ Aspergillus, cinerea เกิด และ
490 Ribon et al.
รูปที่ 1 - คืนในตาภาคใต้วิเคราะห์ดีเอ็นเอรวมจาก Penicillium
griseoroseum ดีเอ็นเอทั้งหมดถูกต้อง BamHI (1), ClaI (2) EcoRI
(3), EcoRV (4), HindIII (5), SacI (6), สลี่ (7), และ XbaI (8), วิเคราะห์บน
08% agarose เจล และโอนย้ายไปเยื่อไนลอน DNA 420-bp
แยกส่วนจะนำโดเมนใน endoPG
radiolabelled และลูกจ้างเป็นโพรบยีนจาก P. griseoroseum
Hybridization เป็นดำเนินที่ 60 องศาเซลเซียส ดีเอ็นเอจาก phage λแหวกกับ
HindIII (kb) .
Sclerotinia sclerotiorum (Fraissinet Tachet et al. 1995;
Parenicová et al. ปี 1998, Wubben et al. 1999) วากเนอร์ et al.
(2000) ลักษณะสองยีน PG ใน P. olsonii ที่
พบ homology สำคัญเพื่อ endoPG ของอื่น ๆ filamentous
เชื้อรา และแนะนำก็ยิ่งน้อย
ยีนในเชื้อรากลุ่ม
รูป hybridization เหมือนที่เห็นใน P. griseoroseum,
P. expansum, P. italicum และ P. purpurogenum
แนะนำว่า ของยีน PG มีองค์กรสากลที่คล้ายกัน
ในส่วนกลุ่มที่จะพบ
สามารถรูปแบบเดียวกันสังเกตการ P. charlesii P. citrinum
ยัง แนะนำว่า เชื้อราเหล่านี้จะสัมพันธ์อย่างใกล้ชิดแม้ว่า
ต้องการศึกษาเพิ่มเติมได้ คุณสมบัติระดับโมเลกุลของสิบ
พันธุ์ Penicillium DNA
(RAPD) polymorphic เอาต์สุ่มและจำกัดแยกส่วน polymorphism
(RFLP) ความยาวของภูมิภาคเป็นตัวเว้นวรรคทับภายในของ rDNA
เปิดในห้องปฏิบัติการของเราเผยไม่มีความแตกต่างระหว่าง P.
griseoroseum, P. expansum และบ่งชี้ P. purpurogenum
ครั้งปิด phylogenetic สัมพันธ์ และสัณฐาน
และสรีรวิทยาลักษณะยืนยันว่า
มีสายพันธุ์ต่าง ๆ (Pereira et al. 2002) .
เปรียบเทียบหน่วยโครงสร้างของยีน PG
พันธุ์ Penicillium
แม้ Penicillium สามารถได้รับการพิจารณาเป็นสำคัญ
รุ่นเชื้อรา การคอมไพล์ของยีนองค์กร
ข้อมูลจากสิ่งมีชีวิตเหล่านี้ได้ดำเนินการจนถึงขณะนี้
ที่ไม่เปิดเผยลำดับสำคัญสำหรับยีน
เป็นรายงานสำหรับ Neurospora และ Aspergillus ที่นี่
เราแสดงการเปรียบเทียบของยีน PG เจ็ดจาก P.
griseoroseum, P. expansum, P. digitatum, P. janthinellum,
และ P. olsonii ดึงจาก GenBank และ EMBL ฐานข้อมูล
ลำดับของนิวคลีโอไทด์และกรดอะมิโนถูก
เปรียบเทียบคุณลักษณะทั่วไปเช่นจำนวน ความยาว,
ไซต์ประกบ และตำแหน่งของ introns มติลำดับ
flanking รหัสพันธุกรรมเริ่มต้นแปล การใช้รหัสพันธุกรรม
เปปไทด์ทั้งหมดเริ่มต้น invariantly กับ AUG มัน
ไม่สามารถกำหนดเป็นมติลำดับรอบ
รหัสพันธุกรรมเริ่มต้นจากหมายเลขขนาดเล็กของยีน PG
จาก Penicillium อย่างไรก็ตาม มีความสนใจ
สำหรับ purines (Pu) ก่อน ATG (Pu57Pu100Pu71ATG), กับการ
เสมอตั้งอยู่ที่ -3 Ballance (1986) กล่าวถึงลำดับ
TCACAATGGC เป็นการช่วยสิ่งแวดล้อม AUG
ขณะ CAMMATGGCT (M = C, A) ถูกกำหนด
ในการเปรียบเทียบยีน Neurospora 88 (Edelmann
และ Staben 1994) Codons หยุดสามใช้น้อย
ครั้ง.
PG เข้ารหัสยีนสายพันธุ์ Penicillium
เปรียบเทียบในการศึกษานี้มีลำดับอยู่ระหว่างกลางที่อาศัย
ในตำแหน่งเดียวกัน แม้จะไม่อนุรักษ์
ลำดับของนิวคลีโอไทด์ Identity
(42.1%) สูงสุดพบระหว่าง introns สองของ P.
griseoroseum P. digitatum และ ความยาวเฉลี่ยของการ
introns ถูก 61 bp และใหญ่ที่สุด (88 bp) ได้สังเกต
ในยีน PG จาก P. janthinellum ยีน pepg1 จาก
P. expansum และ pg2 จาก P. olsonii พบเพิ่มเติม
intron อยู่ที่ตำแหน่งเดียวกัน ในขณะเดียว
intron ที่พบในยีน pg1 ของ P. olsonii ถูกวาง
มี intron สองของยีนอื่น ๆ อนุรักษ์
intron ตำแหน่ง แต่ไม่ลำดับ มักจะเห็นมี-
องค์กร PG ยีน 49
การแปล กรุณารอสักครู่..
ดังที่เห็นในรูปที่ 1 เราจะสามารถสรุปได้ว่ายีน 1 และ
pgg 2 pgg ที่มีอยู่ในชุดเดียวในยีน griseoroseum p .
เนื่องจากไม่มีสถานที่จำกัด ภายใน สำหรับเอ็นไซม์
ecori ที่ saci และ xbai ชุดเดียวได้รับการ
ซึ่งจะช่วยแสดงให้เห็นถึงการอื่นๆรวมถึงที่ PG ยีน clpg 1 และ
clpg 2 ยีนของ colletotrichum lindemuthianum , PG 1 และ
PG 2 ของ P . olsonii ,และ bcpg 1 ของ botrytis อีลุ้ม( centis เอ็ด
Al . 1996 centis et al . 1997 สิบมี et al . 1998 วากเนอร์ et al .
2000 ) นอกจากนั้นโรงแรมยังมีที่ pgg pgg 1 และ 2 จะมีอยู่ใน
หมายเลขชุดเดียวและว่าระดับที่แตกต่างในการแสดงออกของยีน
รายงานเหล่านี้ได้โดย ribon et al . ( 2002 )มี
อาจจะเนื่องจากตำแหน่งยีนในยีน ความเป็นไปได้ที่จะ
ซึ่งจะช่วยให้พวกเขาได้ถูกควบคุมโดยปัจจัยประเทศเครือรัฐเอกราช - การกระทำที่แตกต่างเป็น
ขณะนี้กำลังอยู่ระหว่างการสืบสวนสอบสวน.
การเกิดขึ้นของยีนที่เกี่ยวข้องในสายพันธุ์ PG
penicillium อื่นๆการมีอยู่ของซีเควนซ์ของดีเอ็นเอซึ่งมีตำแหน่งอย่างเดียวกันกับยีน
endopg เป็นการสอบสวนตลอดทั่วทั้งสายพันธุ์ penicillium
ตามต่ำ(กฎ hybridization (รูปที่ 2 )
พันธุ์ไม้ทั้งหมดได้รับการทดสอบแล้วจะมีอย่างน้อยหนึ่ง endopg ยีน แต่ถึงอย่างไรก็ตาม
ส่วนใหญ่ของพวกเขาแสดงให้เห็นสองคลื่นความถี่ hybridizing อย่างรุนแรงแม้ว่า
ด้วย polymorphism ความยาวบางอย่างที่อาจตรง
การตัดต่อยีนซึ่งมีตำแหน่งอย่างเดียวกัน. ไม่เหมือนกับ penicillium ครอบครัว
ยีนซึ่งประกอบไปด้วยอย่างน้อยห้าสมาชิก PG มี
ซึ่งจะช่วยการตรวจพบในไนเจอร์ aspergillus อีลุ้ม B และ
490 ribon et al .
รูปที่ 1 - ภาค ใต้ทำให้เสียไปรวมการวิเคราะห์ของดีเอ็นเอจาก griseoroseum penicillium
ดีเอ็นเอเป็นบ้างนิดหน่อยด้วย bamhi ( 1 ) clai ( 2 ) ecori
( 3 ) ecorv ( 4 ) hindiii ( 5 ) saci ( 6 )สา( 7 )และ xbai ( 8 )วิเคราะห์บน
08% agarose เจลและจะพาท่านไปส่งถึงยังเยื่อไนลอน ที่ 420 - BP ดีเอ็นเอ
ซึ่งจะช่วยในการแยกส่วนที่เกี่ยวข้องที่รักษาไว้ซึ่งสังเกตเห็นในโดเมนที่ endopg
ยีนจาก p . griseoroseum เป็น radiolabelled และใช้เป็นอุปกรณ์ตรวจสอบ.
hybridization เป็นการกระทำที่ 60 ° C ดีเอ็นเอจาก phage Λติดด้วย
hindiii ( KB ) sclerotiorum
sclerotinia ( fraissinet-tachet et al . 1995
parenicová et al . 1998 wubben et al . 1999 )Wagner et al .
( 2000 )ลักษณะสอง PG ยีนใน p . olsonii ที่
ซึ่งจะช่วยแสดงให้เห็นอย่างมีนัยสำคัญลักษณะซึ่งเทียบเคียงกันได้เพื่อ endopg ของอื่นๆ filamentous
เห็ดและที่แนะนำให้มีที่อย่างน้อยอีกหนึ่ง
ยีนในเห็ดหูหนูยีน.
ที่เดียวกัน hybridization รูปแบบเห็นใน griseoroseum ,
p . expansum , p . italicum ,และ p . purpurogenum
ชี้ให้เห็นว่าของเขา PG ยีนมีความเหมือนโลกองค์กร
ในส่วนของตลาดยีนที่อยู่ในที่ซึ่งพวกเขาจะพบได้. รูปแบบเดียวกันกับที่
ซึ่งจะช่วยสังเกตเห็นสำหรับ p . p . citrinum charlesii และไม่ขอแนะนำให้ว่าเห็ดเหล่านี้มีความเกี่ยวข้องกับการศึกษาอย่างใกล้ชิดแม้ว่า
มีความต้องการมากขึ้นนอกจากนั้นยัง ระดับโมเลกุลแสดงลักษณะของสิบ
penicillium สายพันธุ์โดยการสุ่มแอมพลิฟายด้วยดีเอ็นเอ
( rapd )และการจำกัดความยาวสักเท่าไหร่ polymorphism
( rflp )ของที่ถอดสคริปต์ spacer graphic ภายใน เขตพื้นที่ของ rdna
ทำในห้องปฏิบัติการของเราเปิดเผยไม่มีความแตกต่างระหว่าง p .
griseoroseum , p . p . expansum ,และ p . purpurogenum แสดง
อีกครั้งที่อยู่ใกล้ phylogenetic ความสัมพันธ์และเกี่ยวกับวิชาว่าด้วยรูปร่างลักษณะ
และในทางสรีรศาสตร์ลักษณะยืนยันว่า
พวกเขามีความแตกต่างกันสายพันธุ์(เปเรย์รา et al . 2002 )..
การเปรียบเทียบหน่วยโครงสร้างของยีน PG จากสายพันธุ์
penicilliumแม้ว่า penicillium สามารถได้รับการพิจารณาให้รุ่น
เชื้อราที่สำคัญยังไม่มีองค์กรรวบรวมของยีน
ข้อมูลจากสิ่งมีชีวิตเหล่านี้ได้รับการดำเนินการแล้วจนบัดนี้
ที่ไม่สามารถแสดงให้เห็นถึงความสำคัญลำดับสำหรับการแสดงออกทางความคิดเห็นยีน
เป็นรายงานไปแล้วสำหรับ neurospora aspergillus และ ที่นี่
ซึ่งจะช่วยเราในปัจจุบันการเปรียบเทียบที่เจ็ดของยีน PG จาก p .
griseoroseum expansum p . p . p . digitatum janthinellum
และ P .olsonii เรียกดูได้จากที่เลี้ยงดูและ embl ฐานข้อมูล.
ของพวกเขา nucleotide และกรดอะมิโนเป็นลำดับ
เมื่อเทียบกับทั่วไปสำหรับคุณลักษณะเช่นหมายเลข,ความยาว,
เกลียวไซต์และตำแหน่งของ introns ,ฉันทามติซีเควนซ์
ขนาบข้างที่แปลเริ่ม codon ,และการใช้งาน codon .
ทั้งหมด polypeptides เริ่ม invariantly ด้วยส.ค. มันเป็น
ไม่ได้เป็นไปได้ที่จะกำหนดลำดับความเห็นที่โอบล้อมไปด้วย
ตามมาตรฐานcodon เริ่มเนื่องจากมีจำนวนขนาดเล็กของยีน PG
ซึ่งจะช่วยให้บริการจาก penicillium . แต่ถึงอย่างไรก็ตามยังมีการตั้งค่าที่
สำหรับ purines (ปู)ก่อน ATG ( 57 ปู 100 ปู 71 ATG )พร้อมด้วย
ซึ่งจะช่วยให้อยู่เสมอตั้งอยู่ที่ 3 ballance ( 1986 )ตามที่อธิบายไว้ tcacaatggc ตามลำดับ
ซึ่งจะช่วยให้เป็นมติของส.ค.บรรยากาศ
ซึ่งจะช่วยในขณะที่ cammatggct ( M = C :)
ซึ่งจะช่วยถูกกำหนดในการเปรียบเทียบ 88 ยีนจาก neurospora ( edelmann
และ staben 1994 )สาม codons หยุดได้ถูกใช้อย่างน้อย
เมื่อ.ยีน
PG - การเข้ารหัสจากสายพันธุ์ penicillium
ซึ่งจะช่วยได้เมื่อเทียบกับในการศึกษานี้มีลำดับเข้าแทรกแซงสงวน
ในตำแหน่งเดียวกันกับที่แม้ว่าจะไม่มีการอนุรักษ์
ของซีเควนซ์ nucleotide ของพวกเขา รหัสประจำตัวสูงสุด
( 42.1% )พบระหว่าง introns ที่สองของ P .
griseoroseum และ p . digitatum ความยาวโดยเฉลี่ยของ
ตามมาตรฐานintrons เป็น 61 BP และมีขนาดใหญ่ที่สุด( 88 BP )พบว่ายีน
ซึ่งจะช่วยในระบบผลิตไฟฟ้าจาก janthinellum P . ที่ pepg 1 ยีนจาก
, p . expansum และที่ PG 2 จาก p . olsonii แสดงให้เห็นที่เพิ่มเติม
intron สงวนไว้ในที่เดียวกันกับตำแหน่งในขณะที่เท่านั้น
intron ตรวจพบในที่ PG 1 ยีนของ P . olsonii ถูกวางไว้ที่สองพร้อมด้วย
intron ของยีน. การอนุรักษ์ของตำแหน่ง intron
ซึ่งจะช่วยได้แต่ไม่ใช่ตามลำดับมีการพบเห็นมี
องค์กรของยีนโดยปกติแล้ว PG 49
การแปล กรุณารอสักครู่..