A 1004 bp PCR product from the 16S

A 1004 bp PCR product from the 16S rDNA was amplified for all of the strains. Following digestion, different banding patterns were obtained for each of the restriction enzymes tested. The results of ARDRA analysis resolved by agarose gel electrophoresis were almost identical to the predicted fragments based on the nucleotide sequence data. DdeI, HaeIII, HindI, HpaII, MboII, and TaqI enzymes achieved the discrimination among streptococci and the other bacteria (for example Fig. 2, HpaII restriction profiles). Differentiation to the genus level was achieved using MwoI, as the digestion of the amplicon generated three different specific patterns, one for Streptococcus, one for Lactobacillus and one for Bifidobacteria ( Fig. 3). Only the MwoI enzyme provides different restriction profiles for lactobacilli, streptococci and bifidobacteria ( Fig. 3); thus, streptococci exhibited three molecular bands (molecular weights 180, 200 and 550 bp, Fig. 3, lines 1 and 2), lactobacilli generated six bands (molecular weights 200, 250, 300, 350, 500 and 700 bp, Fig. 3, lines 3 and 4) whereas for bifidobacteria only three bands were observed (molecular weights 150, 200 and 400 bp, Fig. 3, lines 5 and 6). Finally, no differences among the three lactic acid bacteria were observed using AcsI, BstII and HindIII restriction enzymes. Numerical analysis of the band patterns produced a dendrogram in which all strains isolated from commercial products were grouped at a 54.5% similarity level (data not shown). The ARDRA technique using only one PCR reaction and one restriction enzyme has allowed us to discriminate among bacteria isolated from fermented milks with bifidobacteria at genus levels. This technique allows us a quick and accurate differentiation among bacteria contained in fermented milk products belonging to S. thermophilus, L. delbrueckii. and B. animalis. These techniques allowed for the discrimination among these three related genus with only one restriction enzyme; therefore it can be a simple, rapid and useful method for routine identification.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ผลิตภัณฑ์ PCR bp 1004 จาก 16S rDNA ถูกขยายสำหรับสายพันธุ์ ต่อการย่อยอาหาร รูปแบบ banding ได้รับสำหรับแต่ละทดสอบเอนไซม์จำกัด ผลลัพธ์ของการวิ ARDRA แก้ไข โดย agarose เจ electrophoresis ได้เกือบเหมือนกับชิ้นส่วนที่เคลื่อนที่ตามข้อมูลลำดับนิวคลีโอไทด์ DdeI, HaeIII ฮินดี HpaII, MboII และ TaqI เอนไซม์ได้แบ่งแยก streptococci และแบคทีเรียตัวอื่น (ตัวอย่าง Fig. 2, HpaII โพรไฟล์จำกัด) สร้างความแตกต่างในระดับสกุลสำเร็จโดยใช้ MwoI ย่อยอาหาร amplicon สร้างสามแตกต่างกันเฉพาะรูปแบบ สำหรับอุณหภูมิ สำหรับแลคโตบาซิลลัส และสำหรับ Bifidobacteria (Fig. 3) เฉพาะเอนไซม์ MwoI ให้โพรไฟล์จำกัดแตกต่างกันสำหรับ lactobacilli, streptococci และ bifidobacteria (Fig. 3); ดังนั้น streptococci จัดแสดงสามวงระดับโมเลกุล (โมเลกุลน้ำหนัก 180, 200 และ 550 bp, Fig. 3 บรรทัดที่ 1 และ 2) lactobacilli สร้างวงหก (น้ำหนักโมเลกุล 200, 250, 300, 350, 500 และ 700 bp, Fig. 3 สาย 3 และ 4) ในขณะที่สำหรับ bifidobacteria เพียงสามวงถูกสังเกต (น้ำหนักโมเลกุล 150, 200 และ 400 bp, Fig. 3 บรรทัดที่ 5 และ 6) สุดท้าย ไม่มีความแตกต่างระหว่างแบคทีเรียกรดแลคติสามถูกสังเกตโดยใช้เอนไซม์จำกัด AcsI, BstII และ HindIII การวิเคราะห์เชิงตัวเลขของรูปแบบวงดนตรีผลิต dendrogram ซึ่งทุกสายพันธุ์ที่แยกต่างหากจากผลิตภัณฑ์ทางการค้าถูกจัดกลุ่มในระดับคล้าย 54.5% (ข้อมูลไม่แสดง) เทคนิค ARDRA ที่ใช้เอนไซม์จำกัดหนึ่งเดียวปฏิกิริยา PCR มีให้เราเหยียดระหว่างแบคทีเรียที่แยกต่างหากจาก milks หมักโดย bifidobacteria ในระดับสกุล เทคนิคนี้ช่วยให้เราสร้างความแตกต่างที่ถูกต้อง และรวดเร็วระหว่างแบคทีเรียที่มีอยู่ในผลิตภัณฑ์นมหมักของ S. thermophilus, L. delbrueckii และเกิด animalis เทคนิคเหล่านี้ได้แบ่งแยกระหว่างสกุลที่เกี่ยวข้องเหล่านี้สามมีเพียงเอนไซม์จำกัด ดังนั้น มันสามารถเป็นวิธีที่ง่าย รวดเร็ว และมีประโยชน์สำหรับรหัสประจำ

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ผลิตภัณฑ์ PCR 1004 bp จาก 16S rDNA ถูกขยายสำหรับทุกสายพันธุ์ ต่อไปนี้การย่อยอาหารรูปแบบที่แตกต่างกันรวมตัวที่ไ​​ด้รับในแต่ละข้อ จำกัด ของเอนไซม์ที่ผ่านการทดสอบ ผลของการวิเคราะห์ ARDRA แก้ไขได้โดยข่าวคราว agarose เกือบจะเหมือนกันกับชิ้นส่วนที่คาดการณ์บนพื้นฐานของข้อมูลลำดับเบส DdeI, HaeIII, ภาษาฮินดี, HpaII, MboII และเอนไซม์ Taqi ประสบความสำเร็จในการเลือกปฏิบัติในหมู่ streptococci และแบคทีเรียอื่น ๆ (เช่นรูป. 2 HpaII โปรไฟล์ข้อ จำกัด ) ความแตกต่างในระดับสกุลก็ประสบความสำเร็จโดยใช้ MwoI เช่นการย่อย amplicon สร้างสามรูปแบบเฉพาะที่แตกต่างกันหนึ่งสำหรับ Streptococcus หนึ่งสำหรับแลคโตบาซิลลัสและหนึ่งสำหรับไบฟิโดแบคทีเรีย (รูปที่. 3) เฉพาะเอนไซม์ MwoI ให้โปรไฟล์ข้อ จำกัด ที่แตกต่างกันสำหรับแลคโต streptococci และ bifidobacteria (รูปที่ 3.); จึง streptococci แสดงวงดนตรีสามโมเลกุล (น้ำหนักโมเลกุล 180, 200 และ 550 bp, รูป. 3 เส้นที่ 1 และ 2), แลคโตสร้างวงดนตรีที่หก (น้ำหนักโมเลกุล 200, 250, 300, 350, 500 และ 700 bp, รูปที่ 3. เส้นที่ 3 และ 4) ในขณะที่สำหรับ bifidobacteria เพียงสามวงดนตรีที่ถูกตั้งข้อสังเกต (น้ำหนักโมเลกุล 150, 200 และ 400 bp, รูป. 3, สายที่ 5 และ 6) ในที่สุดความแตกต่างระหว่างสามแบคทีเรียกรดแลคติกที่ถูกตั้งข้อสังเกตการใช้ ACSI, BstII และ HindIII เอนไซม์ข้อ จำกัด การวิเคราะห์เชิงตัวเลขของรูปแบบวงดนตรีที่ผลิต dendrogram ซึ่งทุกสายพันธุ์ที่แยกได้จากผลิตภัณฑ์ในเชิงพาณิชย์ที่ถูกจัดกลุ่มอยู่ในระดับ 54.5% คล้ายคลึงกัน (ไม่ได้แสดงข้อมูล) เทคนิค ARDRA ใช้เพียงหนึ่งปฏิกิริยา PCR และเอนไซม์ จำกัด หนึ่งมีให้เราเห็นความแตกต่างในหมู่เชื้อแบคทีเรียที่แยกได้จากนมหมักด้วย bifidobacteria ในระดับสกุล เทคนิคนี้ช่วยให้เราสามารถสร้างความแตกต่างได้อย่างรวดเร็วและถูกต้องในหมู่เชื้อแบคทีเรียที่มีอยู่ในผลิตภัณฑ์นมหมักที่เป็นเอส thermophilus ลิตร delbrueckii และ B animalis เทคนิคเหล่านี้ได้รับอนุญาตให้การเลือกปฏิบัติในหมู่ทั้งสามประเภทที่เกี่ยวข้องกับเอนไซม์ จำกัด เพียงหนึ่ง; ดังนั้นจึงอาจจะเป็นวิธีที่ง่ายรวดเร็วและมีประโยชน์สำหรับประชาชนประจำ

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

เป็น 1004 BP ดีเอ็นเอผลิตภัณฑ์จาก 16S rDNA ถูกขยายทั้งหมดของสายพันธุ์ ติดตามการย่อยอาหารที่แตกต่างกันแถบลวดลายได้ทั้งเอนไซม์ทดสอบ ผลของการวิเคราะห์ ardra แก้ไขโดยเจลอิเล็กเกือบจะเหมือนกันกับทำนายการกระจายตัวตามลำดับนิวคลีโอไทด์ของข้อมูล ddei haeiii , ภาษาฮินดี , hpaii mboii , , ,ได้รับการ taqi และเอนไซม์ของเชื้อและแบคทีเรียอื่น ๆ ( เช่น รูปที่ 2 hpaii จำกัดโปรไฟล์ ) ความแตกต่างในระดับจีนัสก็ทำได้โดยการ mwoi เป็นการย่อยอาหารของและสร้างรูปแบบเฉพาะสามที่แตกต่างกันสำหรับเดือนมีนาคมสำหรับแลคโตบาซิลลัสและหนึ่งสำหรับไบฟิโดแบคทีเรีย ( รูปที่ 3 )เพียง mwoi เอนไซม์มีข้อจำกัดที่แตกต่างกันสำหรับเชื้อแลคโตบาซิลไลโปรไฟล์ , และ ไบฟิโดแบคทีเรีย ( รูปที่ 3 ) ; ดังนั้น ครั้งมี 3 วง โมเลกุล ( โมเลกุลน้ำหนัก 180 , 200 และ 550 / รูปที่ 3 บรรทัดที่ 1 และ 2 ) , แลคโตบาซิลัสสร้าง 6 วง ( น้ำหนักโมเลกุล 200 , 250 , 300 , 350 , 500 และ 700 คู่เบสรูปที่ 3 ,บรรทัดที่ 3 และ 4 ) และไบฟิโดแบคทีเรีย พบว่ามีเพียงสามวง ( น้ำหนักโมเลกุล 150 , 200 และ 400 BP , รูปที่ 3 บรรทัดที่ 5 และ 6 ) สุดท้าย ไม่มีความแตกต่างระหว่างสามแบคทีเรียกรดแลคติกจาก ACSI bstii - ใช้ , และเอนไซม์ .การวิเคราะห์เชิงตัวเลขของวงดนตรีรูปแบบผลิตพันธุกรรม ซึ่งทุกสายพันธุ์ที่แยกได้จากผลิตภัณฑ์เชิงพาณิชย์ถูกจัดกลุ่มระดับความเหมือน 54.5 % ( ข้อมูลไม่แสดง ) เทคนิค ardra โดยใช้เพียงหนึ่งโดยหนึ่งและปฏิกิริยาเอนไซม์ ได้อนุญาติให้เราแบ่งแยกระหว่างแบคทีเรียที่แยกได้จากการหมักนมกับบิฟิโดแบคทีเรียในจีนัสระดับเทคนิคนี้ช่วยให้เราอย่างรวดเร็ว และถูกต้อง ความแตกต่างระหว่างแบคทีเรียที่มีอยู่ในนมหมักผลิตภัณฑ์ของเอสเทอร์มอฟิลัส L delbrueckii . และ สัตว์ . เทคนิคเหล่านี้ได้รับอนุญาตสำหรับการเลือกปฏิบัติระหว่างเหล่านี้สามชนิดที่เกี่ยวข้องกับเพียงหนึ่งเอนไซม์ ดังนั้นสามารถง่าย รวดเร็ว และประโยชน์ วิธีการกำหนดตามปกติ