Li et al. (2007). The sequences obt

Li et al. (2007). The sequences obtained were compared
with available 16S rRNA gene sequences of cultured species
from GenBank via the BLAST program and the EzTaxon-e
server (http://eztaxon-e.ezbiocloud.net/; Kim et al. 2012).
Multiple alignments with sequences of the most closely
related taxa and calculations of levels of sequence similarities
were carried out by using CLUSTAL_X (Thompson
et al. 1997). Phylogenetic analyses were performed by using
the software packages MEGA version 5.0 (Tamura et al.
2011) with three algorithms, the neighbour-joining (Saitou
and Nei 1987), maximum-likelihood (Felsenstein 1981) and
maximum-parsimony (Fitch 1971) methods. Kimura’s two
parameter model was used to calculate evolutionary distance
matrices of the neighbour-joining method (Kimura
1980). Bootstrap analysis (1,000 resampling) was used to
evaluate the topology of phylogenetic trees (Felsenstein
1985). DNA–DNA reassociations were performed according
to the fluorometric micro-well method (Ezaki et al.
1989; Christensen et al. 2000), and the hybridizations were
performed with eight replications. Determinations of the
genomic DNA G + C contents were performed by HPLC
(SPD-10AV; Shimadzu) as described by Mesbah et al

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

Li et al. (2007) มีการเปรียบเทียบลำดับที่ได้รับมีว่าง 16S rRNA ยีนลำดับพันธุ์อ่างจาก GenBank ผ่านโปรแกรมระเบิดและอี EzTaxonเซิร์ฟเวอร์ (http://eztaxon-e.ezbiocloud.net/; คิม et al. 2012)จัดแนวหลาย มีลำดับของที่สุดtaxa ที่เกี่ยวข้องและคำนวณระดับของลำดับความเหมือนได้ดำเนินการโดย CLUSTAL_X (ทอมป์สันร้อยเอ็ด al. 1997) วิเคราะห์ phylogenetic ดำเนินโดยซอฟต์แวร์แพคเกจร็อคเวอร์ชัน 5.0 (Tamura et al2011) มี 3 อัลกอริทึม เพื่อนบ้านรวม (Saitouและ Nei 1987), สูงสุดโอกาส (Felsenstein 1981) และวิธีสูงสุด-parsimony (ฟิทช์ 1971) คิมุระโยของสองรูปแบบพารามิเตอร์ถูกใช้เพื่อคำนวณระยะทางวิวัฒนาการเมทริกซ์วิธีรวมเพื่อนบ้าน (คิมุระโย1980) การวิเคราะห์เริ่มต้นระบบ (1000 เปลี่ยนความละเอียดของ) ที่ใช้ในการประเมินโครงสร้างของต้นไม้ phylogenetic (Felsensteinปี 1985) . reassociations ดีเอ็นเอดีเอ็นเอได้ดำเนินการตามวิธีดีไมโคร fluorometric (Ezaki et al1989 คริสเตนเซ่นและ al. 2000), และ hybridizations ที่ดำเนินการกับระยะแปด Determinations ของการgenomic DNA G + C เนื้อหาถูกดำเนินการ โดย HPLC(SPD-10AV Shimadzu) ตามที่อธิบายไว้โดย Mesbah et al

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

Li et al, (2007) ลำดับที่ได้ถูกนำมาเปรียบเทียบ
กับที่มีอยู่ 16S rRNA ลำดับยีนของสายพันธุ์ที่เพาะเลี้ยง
จาก GenBank ผ่านโปรแกรม BLAST และ EzTaxon อี
เซิร์ฟเวอร์ (http://eztaxon-e.ezbiocloud.net/; คิม et al, 2012.).
การจัดแนวหลายด้วย ลำดับของอย่างใกล้ชิดที่สุด
แท็กซ่าที่เกี่ยวข้องและการคำนวณของระดับความคล้ายคลึงกันของลำดับ
ได้ดำเนินการโดยใช้ CLUSTAL_X (ธ อมป์สัน
et al. 1997) Phylogenetic วิเคราะห์ได้ดำเนินการโดยใช้
ซอฟแวร์รุ่น MEGA 5.0 (ทามูระ et al.
2011) มีสามขั้นตอนวิธีเพื่อนบ้านเข้า (Saitou
และ Nei 1987), โอกาสสูงสุด (Felsenstein 1981) และ
สูงสุดประหยัด (ฟิทช์ 1971) วิธีการ . คิมูระสอง
รูปแบบพารามิเตอร์ถูกใช้ในการคำนวณระยะทางวิวัฒนาการ
ของการฝึกอบรมวิธีการเพื่อนบ้านเข้า (คิมูระ
1980) การวิเคราะห์ Bootstrap (1,000 resampling) ถูกใช้ในการ
ประเมินโครงสร้างของต้นไม้ (Felsenstein
1985) reassociations ดีเอ็นเอดีเอ็นเอได้ดำเนินการตาม
วิธีการที่จะไมโครดีฟลูออโร (ซากิ et al.
1989; คริ et al, 2000.) และ hybridizations ถูก
ดำเนินการกับแปดซ้ำ การตรวจวัดของ
ดีเอ็นเอ G + C ได้รับการดำเนินการโดยวิธี HPLC
(SPD-10AV; Shimadzu) ตามที่อธิบายไว้โดย Mesbah และคณะ

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

Li et al . ( 2007 ) การเปรียบเทียบลำดับเบส 16S rRNA ยีน
พร้อมลำดับของการเพาะเลี้ยงชนิด
จากระเบิดขนาดผ่านโปรแกรมและ eztaxon-e
Server ( http://eztaxon-e.ezbiocloud.net/ ; Kim et al . 2012 ) .
แนวร่วมหลายกับลำดับของความสูงและการคำนวณที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดที่สุด

มีความคล้ายคลึงกันของลำดับของระดับการใช้ clustal_x ( ทอมป์สัน
et al .1997 ) การวิเคราะห์ ซึ่งได้ใช้แพคเกจซอฟต์แวร์ที่เมกา
รุ่น 5.0 ( ทามูระ et al .
2011 ) สามขั้นตอนวิธีการเพื่อนบ้านร่วม ( ไซโตะ
เนยและ 1987 ) ความน่าจะเป็นสูงสุด ( felsenstein 1981 ) และสูงสุด ( 1971
ตระหนี่ ( ) วิธีการ คิมูระสอง
พารามิเตอร์ของแบบจำลองสำหรับคำนวณค่าระยะทางที่เมทริกซ์ของวิวัฒนาการ
เพื่อนบ้านร่วมวิธี ( คิมูระ
1980 )การวิเคราะห์บู ( 1000 สุ่มซ้ำ ) ถูกใช้เพื่อประเมินโครงสร้างของต้นไม้ phylogenetic
( felsenstein
1985 ) ดีเอ็นเอ ( DNA reassociations มีการปฏิบัติตามเพื่อ fluorometric วิธีดี
ไมโคร ( เอซากิ et al .
1989 ; Christensen et al . 2000 ) , และมีการ hybridizations
8 ซ้ำ รวมทั้ง
genomic DNA G C เนื้อหาได้ 2
( spd-10av ;Shimadzu ) ตามที่อธิบายไว้โดย mesbah et al