Although colonic microbiota is relatively stable throughout the life of an adult, age-related changes in the gastrointestinal (GI) tract, as well as changes in diet and immune system reactivity, inevitably affect microbiota [20]. The differences in composition of gut microbiota, related to ovo-lacto-vegetarian, vegan or omnivore diets have been reported extensively, but studies on large cohorts are generally lacking [21–25]. The classical microbiological methods employed for the analysis of fecal microbiota offer a partial representation of the impact on the gut ecosystem, because it has been estimated that more than 60% of fecal bacteria cannot be cultured, due to their fastidious requirements for anaerobiosis and nutritional needs [12]. Molecular techniques, based on the 16S rRNA sequence, such as fluorescent in situ hybridization (FISH), terminal restriction fragment length polymorphism (T-RFLP), denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE), quantitative PCR (qPCR) and, more recently, high-throughput sequencing technologies (HTS), are also used to characterize human gut microbiota [11,25,26]. Although DNA based fingerprint procedures provide a picture of the global community, they do not reflect the metabolic activity of the populations, because the DNA could originate from living active cells, living dormant cells, lysed cells, or even dead cells. RNA-based approaches can help overcome this limitation, since they can describe the microbiota, focusing on live bacteria [27]. A clear difference between DNA and RNA based DGGE fingerprints on the predominant fecal bacterial populations has been reported [28,29].
In the present study, the fecal microbiota of 153 healthy volunteers, recruited from different regions in Italy, who followed omnivore, ovo-lacto-vegetarian or vegan diets, has been investigated by means of molecular methods (DNA and RNA-based-DGGE), and using conventional enumeration of the main microbial groups on selective agar plates, with the final goal of describing the impact of the diet regime on the composition of the fecal populations.
แม้ว่า colonic microbiota จะค่อนข้างมั่นคงตลอดชีวิตของผู้ใหญ่ ยุคเปลี่ยนแปลงในระบบทางเดิน (GI) รวมทั้งในอาหารและการเกิดปฏิกิริยาของระบบภูมิคุ้มกัน การเปลี่ยนแปลงย่อมส่งผลกระทบต่อ microbiota [20] ความแตกต่างในองค์ประกอบของไส้ microbiota เกี่ยวข้องกับ ovo-lacto-เจ อาหารมังสวิรัติหรือ omnivore มีการรายงานอย่างกว้างขวาง แต่การศึกษา cohorts ขนาดใหญ่โดยทั่วไปไม่มี [21-25] การคลาสสิกทางจุลชีววิทยาวิธีการสำหรับวิเคราะห์ fecal microbiota นำเสนอการแสดงบางส่วนของผลกระทบต่อระบบนิเวศของลำไส้ เนื่องจากมันมีการประมาณว่า มากกว่า 60% ของแบคทีเรีย fecal ไม่มี cultured เนื่องจากความต้องการของพวกเขา fastidious anaerobiosis และโภชนาการจำเป็น [12] เทคนิคโมเลกุล ตาม 16S rRNA ลำดับที่ เช่นเรืองแสงใน situ hybridization (ปลา), เทอร์มินัลจำกัดส่วนความยาวโพลีมอร์ฟิซึม (T-RFLP) denaturing ไล่ระดับสีเจ electrophoresis (DGGE), PCR เชิงปริมาณ (qPCR) และ เมื่อเร็ว ๆ นี้ อัตราความเร็วสูงลำดับเทคโนโลยี (เมอร์), ยังใช้ลักษณะของลำไส้มนุษย์ microbiota [11,25,26] แม้ว่าใช้ดีเอ็นเอ ลายนิ้วมือตอนให้รูปของประชาคมโลก จะไม่สะท้อนกิจกรรมการเผาผลาญของประชากร เนื่องจากดีเอ็นเอได้มาจากเซลล์ที่ใช้งานอยู่นั่งเล่น นั่งเล่นเฉย ๆ เซลล์ เซลล์ lysed หรือเซลล์ที่ตายแล้วแม้ วิธีใช้อาร์เอ็นเอจะช่วยให้เอาชนะข้อจำกัดนี้ เนื่องจากพวกเขาสามารถอธิบาย microbiota เน้นสดแบคทีเรีย [27] ความแตกต่างที่ชัดเจนระหว่างดีเอ็นเอและอาร์เอ็นเอโดยใช้ DGGE ลายนิ้วมือบนประชากรแบคทีเรีย fecal กันแล้วรายงาน [28,29]ในการศึกษาปัจจุบัน microbiota fecal ของ 153 สุขภาพอาสาสมัคร คัดจากภูมิภาคต่าง ๆ ในอิตาลี ที่ omnivore, ovo-lacto-เจ หรือมังสวิรัติอาหาร มีการตรวจสอบ โดยวิธีการระดับโมเลกุล (ดีเอ็นเอและอาร์เอ็นเอใช้-DGGE), และใช้การแจงนับแบบเดิมของกลุ่มจุลินทรีย์หลักบนแผ่น selective agar โดยมีเป้าหมายสุดท้ายเพื่ออธิบายผลกระทบของระบอบอาหารในองค์ประกอบของประชากร fecal
การแปล กรุณารอสักครู่..
