CLUMPP v.1.1.1 (Jakobsson and Rosen

CLUMPP v.1.1.1 (Jakobsson and Rosenberg, 2007)was applied to average
cluster membership using the Large K Greedy algorithm. Output
from CLUMPP was visualised in Distruct v. 1.1 (Roseneberg, 2004).
With the method of Evanno (Evanno et al., 2005) implemented in the
STRUCTURE HARVESTER programme (Earl and vonHoldt, 2012),
ΔK was calculated to estimate the appropriate K value. Principal
coordinates analysis (PCoA) was conducted in GenAlex (Peakall and
Smouse, 2006, 2012) and the neighbour-joining (NJ) phylogenetic
tree was constructed based on pairwise FST distance matrix in Mega
5.2 software (Tamura et al., 2011).



Test of assignment was performed with Rannala and Mountain's (1997) Bayesian individual assignment method, implemented in GeneClass (Piry et al., 2004), to determine
the most probable sources for all 95 tested individuals (assignment
threshold of scores= 0.05).

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ใช้การหาค่าเฉลี่ย v.1.1.1 CLUMPP (Jakobsson และ Rosenberg, 2007)เป็นสมาชิกของคลัสเตอร์โดยใช้อัลกอริทึมตะกละมาก K ผลผลิตจาก CLUMPP เป็น visualised ใน Distruct v. 1.1 (Roseneberg, 2004)ด้วยวิธีการของ Evanno (Evanno et al., 2005) ที่นำมาใช้ในการเก็บเกี่ยวโครงสร้างหลักสูตร (เอิร์ลและ vonHoldt, 2012),ΔK มีคำนวณเพื่อประมาณค่า K ที่เหมาะสม หลักวิธีการวิเคราะห์พิกัด (PCoA) ใน GenAlex (Peakall และSmouse, 2006, 2012) และเพื่อนบ้านรวม (NJ) phylogeneticแผนภูมิถูกสร้างขึ้นตามเมตริกซ์จาก FST แพร์ไวส์ในเมกา5.2 ซอฟต์แวร์ (Tamura et al., 2011) ทำการทดสอบกำหนด ด้วย Rannala และของภูเขา (1997) ทฤษฎีแต่ละวิธีการกำหนด ดำเนินการใน GeneClass (Piry et al., 2004), การตรวจสอบแหล่งบุคคลผ่านการทดสอบทั้งหมด 95 (กำหนดน่าเป็นที่สุดขีดจำกัดของคะแนน = 0.05)

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

CLUMPP v.1.1.1 (Jakobsson และโรเซ็นเบิร์ก 2007) ถูกนำมาใช้โดยเฉลี่ย
สมาชิกคลัสเตอร์ที่ใช้อัลกอริทึมที่มีขนาดใหญ่ K โลภ เอาท์พุท
จาก CLUMPP ได้รับการมองเห็นใน Distruct v. 1.1 (Roseneberg, 2004).
ด้วยวิธีการ Evanno (Evanno et al., 2005) นำมาใช้ใน
โปรแกรม HARVESTER โครงสร้าง (เอิร์ลและ vonHoldt, 2012),
ΔKที่คำนวณได้ในการประเมินที่เหมาะสม ค่า K เงินต้น
วิเคราะห์พิกัด (PCoA) ได้ดำเนินการใน Genalex (Peakall และ
Smouse, 2006, 2012) และเพื่อนบ้านเข้า (NJ) phylogenetic
ต้นไม้ถูกสร้างขึ้นบนพื้นฐานของคู่เมทริกซ์ระยะ FST ในเมกะ
5.2 ซอฟแวร์ (ทามูระ et al., 2011) การทดสอบที่ได้รับมอบหมายได้ดำเนินการกับ Rannala และภูเขา (1997) วิธีการมอบหมายบุคคลคชกรรมดำเนินการใน GeneClass (Piry et al., 2004) เพื่อตรวจสอบแหล่งที่มาน่าจะเป็นที่สุดสำหรับทุก 95 บุคคลที่ผ่านการทดสอบ (การกำหนดเกณฑ์ของคะแนน = 0.05)

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

clumpp v.1.1.1 ( jakobsson และโรเซนเบิร์ก , 2007 ) มาประยุกต์ใช้ในการเป็นสมาชิกกลุ่มเฉลี่ย
ใช้ขั้นตอนวิธีแบบละโมบมาก K . ผลผลิต
จาก clumpp ถูกมองเห็นใน distruct v . 1.1 ( roseneberg , 2004 ) .
ด้วยวิธี evanno ( evanno et al . , 2005 ) ที่ใช้ในโครงสร้างหลักสูตร
เก็บเกี่ยว ( เอิร์ลและ vonholdt , 2012 ) ,
Δ K มีค่าประมาณค่า K ที่เหมาะสม ครูใหญ่
การวิเคราะห์พิกัด ( pcoa ) ทำการศึกษาใน genalex ( peakall และ
smouse , 2006 , 2012 ) และเพื่อนบ้านร่วม ( NJ ) phylogenetic ต้นไม้
ถูกสร้างขึ้นตามระยะทางที่เมทริกซ์ในเมกาคู่ f
5.2 ซอฟต์แวร์ ( ทามูระ et al . , 2011 )



ทดสอบของงานคือการ rannala และภูเขา ( 1997 ) แต่ละแบบกำหนดวิธีดำเนินการใน geneclass ( piry et al . , 2004 )เพื่อตรวจสอบ
แหล่งน่าจะเป็นทั้งหมด 95 การทดสอบบุคคล ( งาน
เกณฑ์ของคะแนน = 0.05 )