Virological analysisConjunctival sw

Virological analysis
Conjunctival swabs were sent to the laboratory of virology
at the Marseille University Hospital. A real-time PCR
assay detecting human enteroviruses was performed
as described previously [6] and enterovirus RNA was
detected (cycle threshold: n=34). Virus isolation was
attempted using Vero, BGM and MA104 cells and is
still in progress, and molecular typing (nested RT-PCR)
was performed as previously described [7], using the
nucleic acid extract of the initial sample. The nested
PCR allowed amplification of a 327 bp partial sequence
of the VP1 gene. Direct sequencing of the amplicon
provided the definitive identification of coxsackievirus
A24 variant (CV-A24v) via BLAST analysis [8]. The
partial sequence obtained was aligned for comparison
with other homologous CV-A24v virus sequences using
Clustal X [9]. Phylogenetic analysis was performed
using neighbour-joining method (Jukes–Cantor algorithm)
in MEGA 5.0 software [10] and confirmed that
the virus detected is CV-A24v (Figure). The sequence
has been deposited in GenBank under accession number
JX196594**.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

การวิเคราะห์ virologicalConjunctival swabs ถูกส่งไปห้องปฏิบัติการของวิทยาไวรัสที่โรงพยาบาลมหาวิทยาลัยปารีส PCR แบบเรียลไทม์ทำการวิเคราะห์ตรวจสอบมนุษย์ enterovirusesตามที่อธิบายไว้ก่อนหน้านี้ [6] และเอนเทอโรไวรัสอาร์เอ็นเอตรวจพบ (ขีดจำกัดรอบ: n = 34) แยกไวรัสได้พยายามใช้เซลล์ Vero, BGM และ MA104 และเป็นยังอยู่ ในระหว่าง ดำเนินการ และโมเลกุลพิมพ์ (ซ้อน RT-PCR)ทำการอธิบายไว้ก่อนหน้านี้ [7], การใช้สารสกัดจากกรดนิวคลีอิกของตัวอย่างเริ่มต้น ที่ซ้อนกันPCR ได้ขยายลำดับ 327 bp บางส่วนของยีน VP1 ลำดับ amplicon โดยตรงให้รหัส coxsackievirus ทั่วไปตัวแปร A24 (CV-A24v) ผ่านวิเคราะห์ระเบิด [8] ที่ลำดับบางส่วนได้ถูกจัดตำแหน่งเปรียบเทียบกับอื่น ๆ homologous CV A24v ไวรัสลำดับโดยใช้Clustal X [9] ทำการวิเคราะห์ phylogeneticใช้วิธีรวมเพื่อนบ้าน (Jukes – คันทอร์อัลกอริทึม)ในซอฟแวร์ MEGA 5.0 [10] และยืนยันว่าไวรัสที่ตรวจพบคือ CV-A24v (รูป) ลำดับที่ฝากเงินใน GenBank ภายใต้หมายเลขทะเบียนJX196594 **

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

การวิเคราะห์ไวรัส
swabs เยื่อถูกส่งไปยังห้องปฏิบัติการไวรัสวิทยา
ที่มาร์เซย์โรงพยาบาลมหาวิทยาลัย เรียลไทม์ PCR
ทดสอบการตรวจสอบ enteroviruses มนุษย์ได้ดำเนินการ
ตามที่ระบุไว้ก่อนหน้านี้ [6] และเอนเทอโรอาร์เอ็นเอได้รับการ
ตรวจพบ (เกณฑ์วงจร: n = 34) การแยกเชื้อไวรัสได้รับการ
พยายามใช้เวโร, BGM และเซลล์ MA104 และ
ยังคงอยู่ในความคืบหน้าและการพิมพ์โมเลกุล (ซ้อน RT-PCR)
ได้ดำเนินการตามที่ระบุไว้ก่อนหน้านี้ [7] โดยใช้
สารสกัดจากกรดนิวคลีอิกของกลุ่มตัวอย่างเริ่มต้น ที่ซ้อนกัน
PCR ได้รับอนุญาตให้ขยายของ 327 bp ลำดับบางส่วน
ของยีน VP1 ลำดับโดยตรงของ amplicon
ให้การระบุที่ชัดเจนของ coxsackievirus
A24 ตัวแปร (CV-A24v) ผ่านการวิเคราะห์ระเบิด [8]
ลำดับบางส่วนที่ได้รับสอดคล้องสำหรับการเปรียบเทียบ
กับคล้ายคลึงกันอื่น ๆ CV-A24v ลำดับไวรัสโดยใช้
Clustal X [9] การวิเคราะห์วิวัฒนาการได้ดำเนินการ
โดยใช้วิธีการเพื่อนบ้านเข้า (อัลกอริทึมจุกส์-แคนเทอร์)
ใน MEGA 5.0 ซอฟแวร์ [10] และยืนยันว่า
ไวรัสที่ตรวจพบคือ CV-A24v (รูป) ลำดับที่
ได้รับการฝากใน GenBank ภายใต้หมายเลขภาคยานุวัติ
JX196594 **

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

การวิเคราะห์การ swabs ไวรัสวิทยา
ถูกส่งไปยังห้องปฏิบัติการไวรัสวิทยา
ที่โรงพยาบาล Marseille มหาวิทยาลัย จริง การทดสอบ PCR ตรวจหามนุษย์ enteroviruses า

ตามที่อธิบายไว้ก่อนหน้านี้ [ 6 ] และเอนเทอโรไวรัส RNA ถูกตรวจพบ ( วงจรประตู :
n = 34 ) การแยกเชื้อไวรัส
พยายามใช้ความจริง , และเพลง ma104 เซลล์และ
ยังอยู่ในความคืบหน้าและโมเลกุลพิมพ์ดีด ( ซ้อนกัน 4 )
ได้ดำเนินการตามที่อธิบายไว้ก่อนหน้านี้ [ 7 ] , การใช้
กรดนิวคลีอิก สารสกัดจากตัวอย่างเบื้องต้น ที่ซ้อนกัน (
) อนุญาตของคุณบางส่วนของ vp1
ลำดับเบสของยีน จัดลำดับโดยตรงและมีการแตกหักของคอกซากี่ไวรัส

a24 ตัวแปร ( cv-a24v ) ผ่านการวิเคราะห์ระเบิด [ 8 ]
ส่วนลำดับได้รับชิดเปรียบเทียบ
กับอื่น ๆ cv-a24v เปรียบเทียบลำดับการใช้ clustal ไวรัส
x [ 9 ] การวิเคราะห์การใช้เพื่อนบ้านเข้าร่วม ซึ่ง
วิธี ( จูกส์–ดนูขั้นตอนวิธี )
ในเมกา 5.0 ซอฟต์แวร์ [ 10 ] และได้รับการยืนยันว่า ไวรัสที่ตรวจพบ คือ cv-a24v
( รูป ) ลำดับ
ได้รับฝากไว้บริเวณใต้เข้าเบอร์
jx196594 * *