The effect of UV radiation on viral

The effect of UV radiation on viral inactivation was modelled using linear regression analysis to predict the UV fluences necessaryto achieve 90 (D90, corresponding to1-log) to 99.99% (D99.99, cor-responding to 4-log) reductions. In addition, measured infectivity data were compared to estimated infectivity using the qPCR-based approach developed by Pecson et al. (2011). The mathematicalapproach used in these experiments has been applied to sev-eral other viruses (e.g., Human Adenovirus, JC Polyomavirus and MS2 bacteriophage) to calculate estimated inactivation, which hasshown a good correlation with actual results (Calgua et al., 2014).The formula applied to estimate the infectivity of HEV from qRT-PCR data was as follows:log(Nt/N0)infectivity = c * log(Nt/N0)qRT-PCR,where c is a measure of the lesion rate in the targeted genomeregion relative to the inactivation rate of the virus. Basically, by analysing experimentally derived measurements of infectivity andqRT-PCR decay, we can calculate the value c. Then, as long as thesame genome region is used, we can estimate infectivity from qRT-PCR data with this parameter in future experiments.To analyse the efficiency of the FCS preparations, the water sam-ples were measured pre- and post-treatment in duplicate for eachcondition and for each virus. Log Reduction Values (LRVs) werecalculated using the following formula:LRV = log(pre-treatment)-log(post-treatment).Statistical analysis were performed to compare LRV between methods by ANOVA. All analyses were performed using the R software program (version 3.0.2).

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ผลของรังสีในการยกเลิกการเรียกไวรัสจำลองแบบมาใช้วิเคราะห์การถดถอยเชิงเส้นจะทำนายได้อีกด้วย UV ที่ necessaryto บรรลุ 90 (D90 สอดคล้อง to1-ล็อก) 99.99% (D99.99 เกือบ ตอบสนองการเข้าสู่ระบบ 4) การลดการ นอกจากนี้ วัด infectivity ข้อมูลนำมาเปรียบเทียบเพื่อประเมิน infectivity ใช้วิธีตาม qPCR พัฒนาโดย Pecson et al. (2011) Mathematicalapproach ที่ใช้ในการทดลองนี้ได้รับการนำไปใช้กับ sev eral ไวรัสอื่น ๆ (เช่น มนุษย์ Adenovirus, JC Polyomavirus และ MS2 แบคที) ในการคำนวณโดยประมาณเลิก hasshown ซึ่งความสัมพันธ์ที่ดีกับผลที่เกิดขึ้นจริง (Calgua et al. 2014) สูตรที่ใช้ประมาณ infectivity ของชนิดจาก qRT PCR ข้อมูลเป็นดังนี้: log(Nt/N0) infectivity = c * ล็อก (Nt/N0) qRT-PCR โดยที่ c คือ ตัวชี้วัดของอัตราแผลใน genomeregion เป้าหมายสัมพันธ์กับอัตราการยกเลิกการเรียกไวรัส โดยทั่วไป โดยวิเคราะห์ได้มาทดลองวัดผุ andqRT PCR infectivity เราสามารถคำนวณค่า c จากนั้น ตราบเท่าที่มีใช้ในกลุ่มภูมิภาคเดียวกัน เราสามารถประมาณ infectivity จากข้อมูล qRT PCR โดยใช้พารามิเตอร์นี้ในการทดลองในอนาคต ในการวิเคราะห์ประสิทธิภาพของการเตรียม FCS น้ำสาม-ples ถูกวัดก่อน และหลังการรักษาในซ้ำ สำหรับ eachcondition และไวรัสแต่ละ เข้าสู่ระบบ werecalculated ลดค่า (LRVs) โดยใช้สูตรต่อไปนี้: LRV = log(pre-treatment)-log(post-treatment) ดำเนินการวิเคราะห์ทางสถิติเพื่อเปรียบ LRV โดย ANOVA วิเคราะห์ทั้งหมดถูกดำเนินการโดยใช้โปรแกรม R (รุ่น 3.0.2)

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ผลกระทบของรังสียูวีในการยับยั้งไวรัสถูกจำลองโดยใช้การวิเคราะห์การถดถอยเชิงเส้นที่จะคาดการณ์ fluences ยูวี necessaryto บรรลุ 90 (D90 สอดคล้อง to1-log) 99.99% (D99.99 คอร์ตอบสนองถึง 4-log) ลดลง นอกจากนี้ข้อมูลการติดเชื้อวัดถูกเมื่อเทียบกับการติดเชื้อประมาณโดยใช้วิธีการ qPCR ตามที่พัฒนาโดย Pecson et al, (2011) mathematicalapproach ที่ใช้ในการทดลองเหล่านี้ได้ถูกนำไปใช้ไวรัสอื่น ๆ SEV-eral (เช่นมนุษย์ Adenovirus, JC Polyomavirus และ MS2 bacteriophage) เพื่อคำนวณการใช้งานโดยประมาณที่ hasshown ความสัมพันธ์ที่ดีกับผลที่เกิดขึ้นจริง (Calgua et al., 2014) ได้โดยง่าย สูตรที่ใช้ในการประมาณการติดเชื้อของ HEV จากข้อมูล qRT-PCR เป็นดังนี้: เข้าสู่ระบบ (NT / N0) การติดเชื้อ = C เข้าสู่ระบบ * (NT / N0) qRT-PCR ที่ C เป็นตัวชี้วัดอัตราแผลใน genomeregion เป้าหมาย เมื่อเทียบกับอัตราการใช้งานของไวรัส โดยทั่วไปโดยการวิเคราะห์การวัดที่ได้มาทดลองของการติดเชื้อ andqRT-PCR ผุเราสามารถคำนวณค่า C แล้วตราบใดที่ภูมิภาคจีโนมเดิมที่จะใช้เราสามารถประเมินการติดเชื้อจากข้อมูล qRT-PCR ด้วยพารามิเตอร์นี้ในอนาคตอัน experiments.To วิเคราะห์ประสิทธิภาพของการเตรียมการ FCS ที่น้ำ Sam-Ples วัดก่อนและหลังการรักษาใน ที่ซ้ำกันสำหรับ eachcondition และสำหรับแต่ละไวรัส เข้าสู่ระบบค่าลด (LRVs) werecalculated โดยใช้สูตรต่อไปนี้: LRV = เข้าสู่ระบบ (การรักษาก่อน) -log (หลังการรักษา) การวิเคราะห์ .Statistical ได้ดำเนินการเพื่อเปรียบเทียบ LRV ระหว่างวิธีการโดยการวิเคราะห์ความแปรปรวน การวิเคราะห์ทั้งหมดถูกดำเนินการโดยใช้โปรแกรม R ซอฟแวร์ (เวอร์ชั่น 3.0.2)

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ผลของรังสี UV ในการยับยั้งไวรัสคือจำลองโดยใช้การวิเคราะห์การถดถอยเชิงเส้นเพื่อทำนาย fluences UV กระบวนการบรรลุ 90 ( d90 สอดคล้อง to1 เข้าสู่ระบบ ) 99.99% ( d99.99 , สี ตอบสนอง 4-log ) ลด นอกจากนี้ ข้อมูลการวัดเปรียบเทียบเพื่อประเมินการติดเชื้อการติดเชื้อโดยใช้ qpcr ตามวิธีการที่พัฒนาโดย pecson et al . ( 2011 ) การ mathematicalapproach ใช้ในการทดลองนี้ได้ใช้กับ sev ไวรัสอื่น ๆที่ เช่น มนุษย์ อะดีโนไวรัส JC polyomavirus MS2 และโรงพยาบาล ) เพื่อคำนวณเมื่อประมาณ ซึ่ง hasshown ความสัมพันธ์ที่ดีกับผลที่เกิดขึ้นจริง ( calgua et al . , 2010 ) . สูตรที่ใช้ในการประมาณการการติดเชื้อของข้าพเจ้าซึ่งปลูกจากข้อมูล ดังนี้ : บันทึก ( NT / NO ) การติดเชื้อ = C * บันทึก ( NT / NO ) ข้าพเจ้า PCR ที่ C เป็นวัดของแผลคะแนนในเป้าหมาย genomeregion เทียบกับอัตราการยับยั้งของไวรัส โดยทั่วไป โดยการวิเคราะห์ผลการวัดและการติดเชื้อของ andqrt PCR ผุ เราสามารถคำนวณหาค่า C แล้ว ตราบใดที่มีจีโนมภูมิภาคใช้ เราสามารถประเมินการติดเชื้อจากข้าพเจ้าตรวจข้อมูลกับพารามิเตอร์นี้ในการทดลองในอนาคต เพื่อวิเคราะห์ประสิทธิภาพของ FCS การเตรียม น้ำ ples สามวัดก่อนและหลังในแต่ละซ้ำสำหรับ eachcondition และไวรัส การบันทึกค่า ( lrvs ) werecalculated โดยใช้สูตรต่อไปนี้ : เข้าสู่ระบบ lrv = ( ผล ) - บันทึก ( หลัง ) สถิติที่ใช้ในการวิเคราะห์ข้อมูล การเปรียบเทียบระหว่างวิธี lrv โดย ANOVA ทั้งหมดที่วิเคราะห์ข้อมูลโดยใช้โปรแกรมซอฟต์แวร์ R ( ฉบับดาวน์โหลด )