Amino acids that carry charges on t

Amino acids that carry charges on their side groups can bind to double stranded DNA (dsDNA) and change the strength of the double helix. Measurement of the DNA melting temperature (Tm) confirmed that acidic amino acids (Glu, Asp) weaken the H-bonds between DNA strands, whereas basic amino acids (Arg, Lys) strengthen the interaction between the strands. A rank correlation exists between the amino acid isoelectric points and the observed changes in Tm. A similar dependence of the hyperchromic effect on the isoelectric point of a protein (pepsin, insulin, cortexin, and protamine) was observed for DNA-protein complexes at room temperature. Short peptides (KE, AEDG, and KEDP) containing a mixture of acidic and basic amino acid residues also affect Tm and the stability of the double helix. A model for binding Glu and Lys to dsDNA was explored by a docking simulation. The model shows that Glu, in an untwisted shape, binds to dsDNA in its major groove and disrupts three H-bonds between the strands, thereby destabilizing the double helix. Lys, in an untwisted shape, binds to the external side of the dsDNA and forms two bonds with O atoms of neighboring phosphodiester groups, thereby strengthening the DNA helix.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

กรดอะมิโนที่มีค่าธรรมเนียมด้านความผูกพันของกลุ่มสอง ควั่น DNA (dsDNA) และการเปลี่ยนแปลงความแข็งแรงของเกลียวคู่ วัดดีเอ็นเอที่ละลายอุณหภูมิ (Tm) ยืนยันว่า กรดอะมิโนกรด (Glu, Asp) อ่อนตัวลง H-พันธบัตรระหว่างดีเอ็นเอ strands ในขณะที่กรดอะมิโนพื้นฐาน (อาร์กิวเมนต์ของค่า Lys) เสริมสร้างการโต้ตอบระหว่าง strands ความสัมพันธ์แบบลำดับขั้นอยู่ระหว่างจุด isoelectric กรดอะมิโนและการเปลี่ยนแปลงที่สังเกตใน Tm อาศัยความคล้ายของผล hyperchromic จุด isoelectric โปรตีน (เพพซิน อินซูลิน cortexin และ protamine) ถูกตรวจสอบในสิ่งอำนวยความสะดวกดีเอ็นเอโปรตีนที่อุณหภูมิห้อง ระยะสั้นเปปไทด์ (KE, AEDG และ KEDP) นอกจากนี้ยังประกอบด้วยส่วนผสมของกรดอะมิโนกรด และพื้นฐานตกผล Tm และเสถียรภาพของเกลียวคู่ แบบจำลองสำหรับการผูก Glu และ Lys dsDNA ได้สำรวจ โดยการจำลองเทียบ แบบแสดง Glu รูปการ untwisted, binds ไป dsDNA ในร่องมันใหญ่ และ disrupts 3 H-พันธบัตรระหว่าง strands จึง destabilizing เกลียวคู่ Lys รูปการ untwisted, binds ข้าง dsDNA ภายนอก และรูปแบบพันธบัตรสองกับอะตอม O ของเพื่อนบ้านกลุ่ม phosphodiester จึงเข้มแข็งเกลียวดีเอ็นเอ

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

กรดอะมิโนที่นำค่าใช้จ่ายในกลุ่มด้านของพวกเขาสามารถผูกกับสองครั้งที่ควั่นดีเอ็นเอ (dsDNA) และเปลี่ยนความแข็งแรงของเกลียวคู่ การวัดอุณหภูมิหลอมละลายดีเอ็นเอ (TM) ยืนยันว่าเป็นกรดกรดอะมิโน (Glu, งูเห่า) ลดลงพันธบัตร H-ระหว่างเส้นดีเอ็นเอในขณะที่กรดอะมิโนระดับล่าง (Arg, ลิซ) เสริมสร้างการทำงานร่วมกันระหว่างเส้นที่ ความสัมพันธ์ยศอยู่ระหว่างกรดอะมิโนจุด Isoelectric และการเปลี่ยนแปลงที่สังเกตได้ใน Tm การพึ่งพาอาศัยที่คล้ายกันของผล hyperchromic อยู่บนจุด Isoelectric ของโปรตีน (น้ำย่อยอินซูลิน cortexin และ protamine) เป็นข้อสังเกตสำหรับคอมเพล็กซ์ดีเอ็นเอโปรตีนที่อุณหภูมิห้อง เปปไทด์สั้น (KE, AEDG และ KEDP) ที่มีส่วนผสมของกรดอะมิโนที่เป็นกรดและพื้นฐานยังมีผลต่อ Tm และความมั่นคงของเกลียวคู่ รูปแบบสำหรับผู้หญิงและมีผลผูกพันลิซจะ dsDNA มีการสำรวจโดยการจำลองเทียบท่า รูปแบบที่แสดงให้เห็นว่าผู้หญิงในรูป untwisted, ผูกกับ dsDNA ในร่องที่สำคัญและถ่วงสาม H พันธบัตรระหว่างเส้นจึงทำให้เกิดความวุ่นวายเกลียวคู่ ลิซในรูปร่าง untwisted ผูกไปทางด้านภายนอกของ dsDNA และรูปแบบสองพันธบัตรกับอะตอม O ใกล้เคียงกลุ่ม phosphodiester จึงเสริมสร้างความเข้มแข็งเกลียวดีเอ็นเอ

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

กรดอะมิโนที่มีค่าใช้จ่ายในกลุ่มพวกเขาสามารถผูกกับคู่เกลียวดีเอ็นเอ ( dsdna ) และเปลี่ยนความแข็งแกร่งของเกลียวคู่ . การวัดปริมาณดีเอ็นเออุณหภูมิหลอมเหลว ( TM ) ยืนยันว่า กรดกรดอะมิโน ( GLU , ASP ) ลดลง h-bonds ระหว่างเส้นดีเอ็นเอ ส่วนกรดอะมิโนพื้นฐาน ( arg , Lys ) เสริมสร้างปฏิสัมพันธ์ระหว่างการถักการจัดอันดับสหสัมพันธ์อยู่ระหว่างกรดอะมิโนไอโซอิเล็กทริกจุด และสังเกตการเปลี่ยนแปลงในอู่ซ่อมรถ มีการพึ่งพากันของผล hyperchromic บนจุดไอโซอิเล็กทริกของโปรตีน ( เอนไซม์เปปซิน , อินซูลิน , cortexin และโปรตามีน ) พบว่าดีเอ็นเอ โปรตีนเชิงซ้อนที่อุณหภูมิห้อง สั้น aedg เปปไทด์ ( Ke ,และ kedp ) ที่มีส่วนผสมของกรดและสารพิษตกค้างกรดอะมิโนพื้นฐานยังมีผลต่อ TM และเสถียรภาพของเกลียวคู่ . รูปแบบซึ่งผูกพัน และ . เพื่อ dsdna สำรวจโดยเชื่อมต่อระบบ แบบจำลองแสดงให้เห็นว่า GLU ในรูปร่างคลายกระเพาะผูกกับ dsdna ในร่องใหญ่และปัญหาสาม h-bonds ระหว่างเส้น งบของเกลียวสองชั้น . ,ในรูปร่างคลายกระเพาะผูกกับด้านนอกของ dsdna และสองรูปแบบพันธบัตรกับ O อะตอมเพื่อนบ้านกลุ่มฟ โฟไดเ เตอร์จึงเพิ่มเกลียว DNA