Using 454 Pyrosequencing and Pure C

Using 454 Pyrosequencing and Pure Cultures Three genera of actinobacteria, Mycobacterium, Rhodococcus and Streptomyces were detected using 454 pyrosequencing and pure cultivation from the two lichens at the same time. Twelve genera detected from Lepraria yunnaniana with 454 pyrosequencing did not isolated. Sixteen genera detected from Punctelia borreri with 454 pyrosequencing did not isolated. The Sequence based on OUT (operational taxonomic unit) from the two lichens by 454 pyrosequencing was Pseudonocardia 368, Nocardioides 236, Streptomyces 214, Actinomycetospora 212, Promicromonospora 170, Rhodococcus 152, Kribbella 134; sequences by pure culture strain was Streptomyces 55, Nocardia 27, Rhodococcus 21. Eleven genera of pure cultures identified in the two lichens were not detected by 454 pyrosequencing. It shown that resolving power of 454 pyrosequencing was not enough at the genus level (Table 3).

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ใช้ 454 Pyrosequencing และวัฒนธรรมบริสุทธิ์สามสกุลของ actinobacteria มัยโคแบคทีเรีย Rhodococcus และ Streptomyces พบใช้ pyrosequencing 454 และเพาะปลูกบริสุทธิ์จาก lichens สองในเวลาเดียวกัน สิบสองสกุลที่ตรวจพบจาก yunnaniana Lepraria กับ 454 pyrosequencing ไม่ไม่แยก สิบหกจำพวกที่ตรวจพบจาก borreri Punctelia กับ 454 pyrosequencing ไม่ไม่แยก ลำดับจากบนออก (งานหน่วยอนุกรมวิธาน) จาก lichens สอง โดย 454 pyrosequencing ถูก Pseudonocardia 368, Nocardioides 236, Streptomyces 214, Actinomycetospora 212, Promicromonospora 170, Rhodococcus 152, Kribbella 134 ลำดับ โดยวัฒนธรรมบริสุทธิ์สายพันธุ์ถูก Streptomyces 55, Nocardia 27, Rhodococcus 21 ไม่พบสกุลสิบเอ็ดใน lichens สองวัฒนธรรมบริสุทธิ์ โดย 454 pyrosequencing มันแสดงว่า ของ 454 pyrosequencing ไม่เพียงพอในระดับสกุล (ตาราง 3)

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ใช้ 454 pyrosequencing บริสุทธิ์และวัฒนธรรมสามจำพวก actinobacteria, Mycobacterium, Rhodococcus และ Streptomyces ถูกตรวจพบโดยใช้ 454 pyrosequencing และการเพาะปลูกบริสุทธิ์จากทั้งสองไลเคนในเวลาเดียวกัน สิบสองจำพวกที่ตรวจพบจาก Lepraria yunnaniana กับ 454 pyrosequencing ไม่ได้โดดเดี่ยว สิบหกจำพวกที่ตรวจพบจาก Punctelia borreri กับ 454 pyrosequencing ไม่ได้โดดเดี่ยว ลำดับขึ้นอยู่กับ OUT (หน่วยอนุกรมวิธานการปฏิบัติงาน) จากทั้งสองโดยไลเคน 454 pyrosequencing เป็น Pseudonocardia 368, 236 Nocardioides, Streptomyces 214 Actinomycetospora 212 Promicromonospora 170, Rhodococcus 152, Kribbella 134; ลำดับโดยสายพันธุ์เชื้อบริสุทธิ์เป็น Streptomyces 55, Nocardia 27 Rhodococcus 21. สิบเอ็ดจำพวกของวัฒนธรรมบริสุทธิ์ที่ระบุไว้ในไลเคนสองไม่ได้ถูกตรวจพบโดย 454 pyrosequencing มันแสดงให้เห็นว่าการแก้ไขอำนาจของ 454 pyrosequencing ก็ไม่มากพอในระดับสกุล (ตารางที่ 3)

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

การใช้เชื้อบริสุทธิ์และ 454 ไพโรซีเควนซิงสามสกุลเชื้อแอคติโนมัยสีท , และ , rhodococcus Streptomyces ถูกตรวจพบใช้ 454 ไพโรซีเควนซิงและการเพาะปลูกบริสุทธิ์จากสองไลเคนในเวลาเดียวกัน สิบสองสกุลที่พบ lepraria yunnaniana กับคุณไพโรซีเควนซิงไม่ได้แยก 16 สกุลที่พบ punctelia borreri กับคุณไพโรซีเควนซิงไม่ได้แยก ลําดับที่ยึดออก ( หน่วยปฏิบัติการอนุกรมวิธาน ) จากสองไลเคนโดย 454 ไพโรซีเควนซิงเป็น pseudonocardia 368 , nocardioides 236 , Streptomyces actinomycetospora 212 , 214 , promicromonospora 170 , rhodococcus 152 , 134 kribbella ลำดับ โดยเชื้อบริสุทธิ์สายพันธุ์ Streptomyces 55 โนคาร์เดีย 27 , 21 rhodococcus . 11 สกุลเชื้อบริสุทธิ์ที่ระบุไว้ในทั้งสองไม่พบไลเคนโดย 454 ไพโรซีเควนซิง . มันเป็นอำนาจการตัดสินใจของคุณไพโรซีเควนซิงไม่เพียงพอในระดับสกุล ( ตารางที่ 3 )