Communities derived from TPW enrich

Communities derived from TPW enrichments were characterized
by 454 pyrosequencing of the bacterial 16S rRNA gene
(Fig. 5), in order to provide a more in-depth view of the bacterial
communities present in selected samples. Amplified DNAs from
triplicate samples were pooled (as replicates had very similar
DGGE profiles [see Fig. S2A in the supplemental material]). Clus-
tering of quality-controlled sequences at the 95% similarity level,
and comparison of OTUs representing3% of the total community
were performed to identify the main changes in bacterial
community composition. All incubations were analyzed by 454
pyrosequencing, but the numbers of reads were low (100) in Pyr
samples and the no-added-PAH planktonic control, so they were
not included in the analysis.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

มีลักษณะชุมชนที่มาจาก TPW enrichmentsโดย pyrosequencing 454 ของยีนแบคทีเรีย 16S rRNA(5 รูป), เพื่อให้มุมมองเชิงลึกที่แบคทีเรียชุมชนที่อยู่ในตัวอย่างเลือก ขยายดีเอ็นเอจากตัวอย่างตสแควร์ถูกพู (เป็นเหมือนกับได้คล้ายกันมาก[ดูรูปโปรไฟล์ของ DGGE S2A ในวัสดุเสริม]) Clus-tering ควบคุมคุณภาพลำดับที่ระดับความเหมือน 95%และเปรียบเทียบ OTUs คิดเป็น 3% ของชุมชนทั้งหมดดำเนินการเพื่อระบุการเปลี่ยนแปลงหลักในแบคทีเรียองค์ประกอบของชุมชน Incubations ทั้งหมดได้วิเคราะห์ โดย 454pyrosequencing แต่ตัวเลขอ่านได้ต่ำ Pyr ใน (100)ตัวอย่างและการไม่มีเพิ่มป้า planktonic ควบคุม เพื่อการไม่รวมอยู่ในการวิเคราะห์

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ชุมชนที่ได้มาจาก enrichments TPW มีลักษณะ
โดย 454 pyrosequencing ของแบคทีเรียยีน 16S rRNA
(รูปที่. 5) ในการสั่งซื้อเพื่อให้มุมมองในเชิงลึกมากขึ้นของแบคทีเรีย
ชุมชนอยู่ในกลุ่มตัวอย่างที่เลือก DNAs ขยายจาก
ตัวอย่างเพิ่มขึ้นสามเท่าถูกรวบรวม (รวมทั้งที่มีการทำซ้ำที่คล้ายกันมาก
โปรไฟล์ DGGE [ดูรูป. S2A ในวัสดุเสริม]) Clus-
tering ของลำดับการควบคุมคุณภาพในระดับที่คล้ายคลึงกัน 95%
และเปรียบเทียบ Otus คิดเป็น 3% ของชุมชนทั้งหมด
ได้ดำเนินการในการระบุการเปลี่ยนแปลงหลักในแบคทีเรีย
องค์ประกอบชุมชน ฟักตัวของเชื้อทั้งหมดมาวิเคราะห์โดย 454
pyrosequencing แต่ตัวเลขของการอ่านอยู่ในระดับต่ำ (100) ใน Pyr
ตัวอย่างและไม่มีการเพิ่ม-PAH ควบคุม planktonic ดังนั้นพวกเขาจึง
ไม่ได้รวมอยู่ในการวิเคราะห์

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ชุมชนที่ได้มาจาก tpw enrichments เป็นลักษณะโดยคุณไพโรซีเควนซิงของแบคทีเรีย 16S rRNA ยีน( ภาพที่ 5 ) เพื่อให้มุมมองเชิงลึกเพิ่มเติมของแบคทีเรียชุมชนปัจจุบันในการเลือกตัวอย่าง ขยายแถบจากตัวอย่างทำสำเนาสามฉบับถูกรวม ( แบบมีมากเหมือนกันการทดลอง [ ดูรูปโปรไฟล์ s2a ในวัสดุ ] เสริม ) clus -tering ของลำดับควบคุมคุณภาพที่ 95% ความเหมือนระดับและเปรียบเทียบใน representing3 % ของชุมชนทั้งหมดการระบุการเปลี่ยนแปลงหลักในแบคทีเรียส่วนประกอบของชุมชน incubations ทั้งหมดวิเคราะห์โดย 454ไพโรซีเควนซิง แต่ตัวเลขของอ่านต่ำ ( 100 ) ใน pyrตัวอย่าง และไม่เพิ่มป่าควบคุมสิ่งมีชีวิตขนาดเล็กมากในน้ำ ดังนั้นพวกเขาไม่รวมอยู่ใน การวิเคราะห์